153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5247 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_5247  CHAD domain containing protein  100 
 
 
539 aa  1059    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.0011816  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4030  adenylate cyclase  47.09 
 
 
518 aa  367  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.274894  normal  0.848067 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1449  adenylate cyclase  38.56 
 
 
519 aa  317  3e-85  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00311247  normal  0.531848 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1159  adenylate cyclase  44.36 
 
 
512 aa  293  4e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.964289  normal  0.796776 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3610  adenylate cyclase  41.34 
 
 
498 aa  293  5e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0101894 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1628  adenylate cyclase  33.09 
 
 
518 aa  238  2e-61  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0327322 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1861  adenylate cyclase  32.42 
 
 
518 aa  219  1e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0847952 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5753  CHAD domain-containing protein  41.37 
 
 
291 aa  157  6e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.718185  hitchhiker  0.00000000000775092 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2906  CHAD domain-containing protein  33.07 
 
 
511 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0809303  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2918  adenylate cyclase  31.66 
 
 
508 aa  125  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3275  CHAD domain containing protein  31.81 
 
 
512 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.850491 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3398  CHAD domain containing protein  32.05 
 
 
512 aa  120  7e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.517581  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3081  CHAD domain-containing protein  31.43 
 
 
512 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2069  adenylate cyclase  28.18 
 
 
494 aa  116  7.999999999999999e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1029  CHAD  29.67 
 
 
504 aa  114  5e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.739933  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5361  hypothetical protein  29.22 
 
 
596 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319316  hitchhiker  0.00226049 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4215  CHAD domain containing protein  31.7 
 
 
511 aa  110  6e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248896  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3533  CHAD domain containing protein  28.68 
 
 
520 aa  109  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0421561 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0383  adenylate cyclase  27.21 
 
 
519 aa  109  1e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5441  CHAD domain containing protein  29.56 
 
 
513 aa  108  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1232  CHAD domain-containing protein  30.39 
 
 
508 aa  106  9e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3074  CHAD domain-containing protein  29.72 
 
 
505 aa  103  7e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0601253  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4408  CHAD domain-containing protein  30.21 
 
 
490 aa  100  5e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.38693  normal  0.881049 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4991  CHAD domain-containing protein  28.49 
 
 
508 aa  97.8  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.913323  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4466  CHAD domain-containing protein  29.43 
 
 
508 aa  98.2  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.521313  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2370  adenylate cyclase  29.46 
 
 
514 aa  97.4  6e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3355  adenylate cyclase  26.56 
 
 
487 aa  97.1  7e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.658253  normal  0.866981 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0089  adenylate cyclase  28.39 
 
 
505 aa  94.4  5e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.445935  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1706  CHAD domain-containing protein  26.85 
 
 
510 aa  88.2  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.201862  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004527  adenylate cyclase  29.17 
 
 
510 aa  85.9  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0370  CHAD domain containing protein  33.27 
 
 
512 aa  84  0.000000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0297118  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0379  adenylate cyclase  33.27 
 
 
512 aa  84  0.000000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2018  hypothetical protein  29.83 
 
 
505 aa  83.6  0.000000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000169644  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00864  hypothetical protein  29.7 
 
 
529 aa  83.2  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4624  adenylate cyclase  33.79 
 
 
510 aa  82.4  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.283729  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2024  adenylate cyclase  27.15 
 
 
499 aa  81.6  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374055  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1216  CHAD domain containing protein  31.16 
 
 
509 aa  80.9  0.00000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2702  adenylate cyclase  35.51 
 
 
211 aa  80.5  0.00000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.722773  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4676  CHAD domain-containing protein  25.89 
 
 
521 aa  77.8  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1549  adenylate cyclase  31.72 
 
 
489 aa  72  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00196996 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1874  adenylate cyclase  31.72 
 
 
489 aa  72  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0619  adenylate cyclase  31.19 
 
 
495 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0564  adenylate cyclase  28.32 
 
 
494 aa  72  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3456  adenylate cyclase  34.58 
 
 
433 aa  71.2  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.333438 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3500  adenylate cyclase  36.07 
 
 
208 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.857741  hitchhiker  0.000378229 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1086  adenylate cyclase  32.13 
 
 
540 aa  70.9  0.00000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.394808 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3388  adenylate cyclase  34.58 
 
 
433 aa  71.2  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3558  adenylate cyclase  34.58 
 
 
433 aa  70.9  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.574554  normal  0.228439 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3392  adenylate cyclase  34.58 
 
 
433 aa  70.9  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3560  adenylate cyclase  33.63 
 
 
213 aa  70.9  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.567904  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0832  adenylate cyclase  34.86 
 
 
443 aa  70.5  0.00000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.944566  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3095  adenylate cyclase  27.73 
 
 
508 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.004296  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0529  putative adenylate cyclase  33.63 
 
 
213 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.293065  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3579  adenylate cyclase  32.44 
 
 
215 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.496336  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0457  CyaB/UgiF-like adenylyl cyclase  35.16 
 
 
208 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0648  putative adenylate cyclase  33.63 
 
 
213 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0944  putative adenylate cyclase  33.63 
 
 
213 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3587  adenylate cyclase  32.44 
 
 
215 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1914  putative adenylate cyclase  33.63 
 
 
213 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3842  adenylate cyclase  29.06 
 
 
500 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.023324  hitchhiker  0.0000000503049 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3231  adenylate cyclase  34.58 
 
 
433 aa  68.2  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3346  adenylate cyclase  34.58 
 
 
433 aa  68.2  0.0000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.748086  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02924  predicted adenylate cyclase  34.58 
 
 
433 aa  67.4  0.0000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00492896  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0646  adenylate cyclase  34.58 
 
 
433 aa  67.4  0.0000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000201225  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02874  hypothetical protein  34.58 
 
 
433 aa  67.4  0.0000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00301101  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0645  adenylate cyclase  34.58 
 
 
433 aa  67.4  0.0000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000445512  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3462  adenylate cyclase  33.64 
 
 
433 aa  67  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4365  adenylate cyclase  34.58 
 
 
433 aa  67  0.0000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.456415  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3565  adenylate cyclase  33.03 
 
 
443 aa  66.2  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00255763  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3406  adenylate cyclase  33.49 
 
 
445 aa  65.9  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0100742  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3517  adenylate cyclase  33.64 
 
 
433 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3485  adenylate cyclase  33.64 
 
 
433 aa  65.5  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.832353  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2680  hypothetical protein  24.87 
 
 
505 aa  65.1  0.000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0254729  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3454  adenylate cyclase  28.53 
 
 
508 aa  65.5  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.320835  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3325  CHAD domain containing protein  29.25 
 
 
286 aa  64.7  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000007321  normal  0.186572 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0182  adenylate cyclase  24.3 
 
 
502 aa  64.3  0.000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3457  adenylate cyclase  33.64 
 
 
433 aa  64.3  0.000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00582228  normal  0.325221 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1105  adenylate cyclase  29.86 
 
 
315 aa  64.3  0.000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.807346 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03713  hypothetical protein  29.36 
 
 
501 aa  63.9  0.000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.153655  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0908  adenylate cyclase  28.53 
 
 
498 aa  63.9  0.000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00951496  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0884  adenylate cyclase  28.74 
 
 
508 aa  63.5  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0453465  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0918  adenylate cyclase  28.23 
 
 
508 aa  62.4  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.57743  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2393  adenylate cyclase  36.02 
 
 
321 aa  61.2  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2913  adenylate cyclase  32.44 
 
 
213 aa  60.8  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3769  hypothetical protein  28.1 
 
 
503 aa  60.5  0.00000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0854  adenylate cyclase  28.44 
 
 
503 aa  60.8  0.00000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0014497  normal  0.731285 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3118  adenylate cyclase  28.44 
 
 
503 aa  60.5  0.00000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000370721  normal  0.76725 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0774  adenylate cyclase  32.07 
 
 
286 aa  60.5  0.00000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.146589  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0718  adenylate cyclase  27.48 
 
 
500 aa  60.5  0.00000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00048972  unclonable  0.0000000193925 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1006  hypothetical protein  30.33 
 
 
524 aa  60.1  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.079275 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1189  hypothetical protein  25.94 
 
 
347 aa  59.3  0.0000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4291  adenylate cyclase  31.46 
 
 
435 aa  58.9  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.051247  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3043  hypothetical protein  28.32 
 
 
285 aa  58.5  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000217082  normal  0.186206 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3128  adenylate cyclase  33.77 
 
 
219 aa  58.2  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.352745  normal  0.54028 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0823  adenylate cyclase  27.63 
 
 
503 aa  57.4  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000128674  normal  0.174291 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0670  CHAD domain containing protein  27.24 
 
 
292 aa  57.4  0.0000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.159134  hitchhiker  0.00700724 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2542  adenylate cyclase  27.78 
 
 
328 aa  57  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2332  adenylate cyclase  32.49 
 
 
511 aa  57  0.0000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.440295 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4196  putative adenylate cyclase  31.72 
 
 
535 aa  57  0.0000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3486  adenylate cyclase  27.07 
 
 
495 aa  57  0.0000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00832211  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>