83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5196 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_5196  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 161 aa  323  6e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.416383  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3350  transcriptional regulator, MarR family  75.95 
 
 		 164 aa  238  2e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0764351  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4000  MarR family transcriptional regulator  74.53 
 
 		 188 aa  237  4e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.869888 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4639  MarR family transcriptional regulator  73.37 
 
 		 186 aa  236  1e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0875  MarR family transcriptional regulator  73.42 
 
 		 166 aa  226  8e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.445474 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0356  MarR family transcriptional regulator  77.4 
 
 		 193 aa  225  2e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.36145 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4686  MarR family transcriptional regulator  76.71 
 
 		 168 aa  223  7e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000388035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3957  MarR family transcriptional regulator  74.83 
 
 		 165 aa  219  9.999999999999999e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.432771  normal  0.0893513 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3949  transcriptional regulatory protein  65.41 
 
 		 179 aa  209  2e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2388  MarR family transcriptional regulator  48.43 
 
 		 168 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5060  MarR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 149 aa  114  7.999999999999999e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.391119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4344  MarR family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 144 aa  68.9  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.747818  normal  0.0412659 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2302  MarR family transcriptional regulator  40.87 
 
 		 139 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3205  transcriptional regulator, MarR family  40.8 
 
 		 147 aa  65.9  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000109713  hitchhiker  0.00541794 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4123  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 175 aa  65.5  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00388815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1596  transcriptional regulator, MarR family  40.2 
 
 		 148 aa  63.9  0.0000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.665279  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2607  transcriptional regulator, MarR family  37.74 
 
 		 158 aa  61.6  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.116422 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1726  transcriptional regulator, MarR family  47.69 
 
 		 144 aa  60.1  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.108071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6524  transcriptional regulator, MarR family  33.71 
 
 		 146 aa  58.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00893581  normal  0.0928109 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4218  transcriptional regulator, MarR family  37.08 
 
 		 128 aa  57.8  0.00000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.440858  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3964  MarR family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.528609  normal  0.520443 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3890  MarR family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3876  MarR family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.156722 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0682  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 157 aa  53.9  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0862  MarR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 156 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0825  transcriptional regulator, MarR family  30.48 
 
 		 156 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0733  MarR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 156 aa  52  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1589  MarR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 169 aa  52  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0850023  normal  0.119457 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0770  MarR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 156 aa  52  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4001  MarR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 149 aa  50.8  0.000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4471  Transcriptional regulators-like protein  33.33 
 
 		 137 aa  48.9  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.155618  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3061  MarR family transcriptional regulator  29 
 
 		 159 aa  47.8  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5097  transcriptional regulator, MarR family  39.47 
 
 		 151 aa  47.4  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0516  transcriptional regulator, MarR family  37.84 
 
 		 171 aa  47  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.398648 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0962  MarR family transcriptional regulator  48 
 
 		 165 aa  46.6  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.100112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4631  transcriptional regulator, MarR family  29.29 
 
 		 162 aa  47.4  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0697845 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9024  Transcriptional regulators-like protein  43.64 
 
 		 154 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7239  transcriptional regulator, MarR family  44.07 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2297  regulatory protein, MarR  32.71 
 
 		 160 aa  46.2  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0503  transcriptional regulator, MarR family  37.84 
 
 		 171 aa  46.2  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4409  transcriptional regulator, MarR family  23.74 
 
 		 161 aa  45.8  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5023  MarR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 139 aa  45.4  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0800254  normal  0.152298 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8206  MarR family  39.68 
 
 		 156 aa  45.1  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3088  transcriptional regulator, MarR family  41.43 
 
 		 144 aa  45.1  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00891754  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1342  transcriptional regulator, MarR family  42.59 
 
 		 156 aa  45.1  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398816 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3524  transcriptional regulator, MarR family  25.42 
 
 		 158 aa  45.1  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000157721  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3782  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 150 aa  44.7  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 137 aa  44.7  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 149 aa  43.5  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0515  MarR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0136032 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4463  hypothetical protein  32.47 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0202449  hitchhiker  0.00964161 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6119  transcriptional regulator  44.07 
 
 		 138 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.375256  normal  0.316478 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0330  MarR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 173 aa  42.4  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30420  transcriptional regulator  32.5 
 
 		 159 aa  43.1  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147448  normal  0.274535 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2068  MarR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3635  transcriptional regulator, MarR family  42.86 
 
 		 277 aa  42.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00150416  normal  0.0211816 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 162 aa  42.7  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0590  putative transcription regulator protein  35.4 
 
 		 178 aa  42.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6596  transcriptional regulator, MarR family  34.85 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000155903 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2856  transcriptional regulator, MarR family  46.67 
 
 		 193 aa  42.7  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0615  MarR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 147 aa  43.1  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.973636  normal  0.938625 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4070  MarR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 185 aa  42.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6090  transcriptional regulator, MarR family  30.43 
 
 		 155 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.441137  normal  0.170401 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5714  MarR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 153 aa  42.4  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00966957 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15420  transcriptional regulator  30.43 
 
 		 158 aa  42  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.481321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7677  hypothetical protein  28.3 
 
 		 162 aa  41.6  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00437604  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2239  transcriptional regulator, MarR family  38.24 
 
 		 146 aa  41.6  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.222685  normal  0.0457312 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1341  MarR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 156 aa  41.6  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1500  transcriptional regulator, MarR family  24.81 
 
 		 157 aa  41.6  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0606  MarR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 151 aa  41.6  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0747738  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1789  transcriptional regulator, MarR family  30.95 
 
 		 163 aa  41.6  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1996  transcriptional regulator, MarR family  28.81 
 
 		 172 aa  41.6  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2288  transcriptional regulator, MarR family  39.62 
 
 		 140 aa  41.2  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.068173 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4395  MarR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 139 aa  41.2  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5904  transcriptional regulator, MarR family  36.49 
 
 		 172 aa  41.2  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.174555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2650  transcriptional regulator, MarR family  25.2 
 
 		 150 aa  40.8  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000038621  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 142 aa  40.8  0.008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5487  Transcriptional regulators-like protein  37.31 
 
 		 169 aa  40.8  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  0.0138039 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6078  transcriptional regulator, MarR family  34 
 
 		 143 aa  40.8  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 142 aa  40.8  0.008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  31.43 
 
 		 142 aa  40.4  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7275  MarR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 151 aa  40.4  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  31.43 
 
 		 142 aa  40.4  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>