More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5189 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_5189  protein serine/threonine phosphatase  100 
 
 		 266 aa  536  1e-151  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4681  protein serine/threonine phosphatase  52.36 
 
 		 270 aa  265  5.999999999999999e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3941  protein serine/threonine phosphatases  50.61 
 
 		 261 aa  261  6.999999999999999e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0068  serine/threonine specific protein phosphatase (putative)  55.25 
 
 		 269 aa  260  2e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3950  protein phosphatase 2C domain-containing protein  49.8 
 
 		 261 aa  259  4e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0256176 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4678  protein serine/threonine phosphatases  50.6 
 
 		 261 aa  255  5e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.546641 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3389  protein serine/threonine phosphatase  50.6 
 
 		 271 aa  251  8.000000000000001e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.830216  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4044  protein phosphatase 2C domain-containing protein  50.2 
 
 		 271 aa  250  2e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0192  protein serine/threonine phosphatase  51.39 
 
 		 268 aa  236  4e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3360  protein phosphatase 2C-like  46.28 
 
 		 274 aa  204  1e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0952  protein phosphatase 2C-like protein  45.53 
 
 		 276 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0437  protein phosphatase 2C-like  43.24 
 
 		 296 aa  186  4e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.018902 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1750  protein phosphatase 2C domain-containing protein  36.07 
 
 		 247 aa  180  2e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165871  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1066  protein serine/threonine phosphatase  39.66 
 
 		 249 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6773  protein serine/threonine phosphatase  40.08 
 
 		 254 aa  173  2.9999999999999996e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1588  protein serine/threonine phosphatase  40.48 
 
 		 267 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3962  protein phosphatase 2C, family protein  39.92 
 
 		 250 aa  171  9e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1956  protein serine/threonine phosphatase  40.08 
 
 		 252 aa  170  3e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03320  serine/threonine protein phosphatase  42.26 
 
 		 452 aa  167  2e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0159722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1226  serine/threonine phosphatase  37.5 
 
 		 236 aa  166  2e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3905  protein phosphatase 2C, family protein  39.08 
 
 		 250 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3714  protein phosphatase 2C, family protein  39.08 
 
 		 250 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3604  protein phosphatase 2C  39.08 
 
 		 250 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4001  protein phosphatase 2C, family protein  39.08 
 
 		 250 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3911  protein phosphatase 2C, family protein  39.08 
 
 		 250 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00759047  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3877  protein phosphatase 2C, family protein  39.08 
 
 		 250 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.65196e-21 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3622  protein phosphatase 2C  38.66 
 
 		 250 aa  166  5e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1281  protein phosphatase 2C, family protein  39.08 
 
 		 250 aa  165  9e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0174873 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0866  protein serine/threonine phosphatase  41.25 
 
 		 293 aa  162  5.0000000000000005e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.654153 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3817  protein phosphatase 2C-like protein  41.77 
 
 		 256 aa  162  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00358114 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3686  protein serine/threonine phosphatase  39.08 
 
 		 250 aa  161  9e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1534  protein serine/threonine phosphatase  32.93 
 
 		 241 aa  160  1e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5906  protein serine/threonine phosphatase  36.73 
 
 		 257 aa  160  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.615058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2307  protein serine/threonine phosphatase  34.73 
 
 		 238 aa  160  2e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0156  protein serine/threonine phosphatase  39.33 
 
 		 259 aa  159  6e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000223411  normal  0.0165822 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3041  protein serine/threonine phosphatase  39.27 
 
 		 395 aa  158  9e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0530  serine/threonine protein phosphatase, putative  35.1 
 
 		 249 aa  158  1e-37  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.467374  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2515  protein phosphatase 2C-like protein  36.82 
 
 		 250 aa  157  1e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00146848  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0160  protein serine/threonine phosphatase  38.91 
 
 		 259 aa  156  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3382  protein serine/threonine phosphatase  38.49 
 
 		 240 aa  155  5.0000000000000005e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27050  serine/threonine protein phosphatase  38.66 
 
 		 425 aa  154  1e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0909  protein serine/threonine phosphatases  38.82 
 
 		 236 aa  154  2e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0310722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0573  protein serine/threonine phosphatases  34.15 
 
 		 245 aa  153  2e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000179403  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0733  serine/threonine phosphatase  39.16 
 
 		 264 aa  152  4e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.310547  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1682  protein serine/threonine phosphatase  37.25 
 
 		 313 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2083  Serine/threonine protein phosphatase  35.18 
 
 		 258 aa  152  8e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3297  protein serine/threonine phosphatases  34.84 
 
 		 243 aa  150  1e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00780778 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1071  protein serine/threonine phosphatase  38.74 
 
 		 538 aa  150  2e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.821303  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1312  protein serine/threonine phosphatase  37.34 
 
 		 236 aa  150  2e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1589  protein phosphatase 2C domain-containing protein  36.13 
 
 		 237 aa  149  3e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1393  phosphoprotein phosphatase  37.19 
 
 		 245 aa  149  4e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0770  protein serine/threonine phosphatase  39.13 
 
 		 280 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0770  protein serine/threonine phosphatase  39.13 
 
 		 280 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09950  phosphoric monoester hydrolase  35.54 
 
 		 236 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3965  protein serine/threonine phosphatase  36.07 
 
 		 244 aa  147  2.0000000000000003e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2487  protein serine/threonine phosphatase  35.1 
 
 		 241 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00028988  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3691  serine/threonine phosphatase  40.94 
 
 		 256 aa  146  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.221121  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0014  protein serine/threonine phosphatase  40.25 
 
 		 416 aa  146  4.0000000000000006e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5885  protein serine/threonine phosphatase  36.22 
 
 		 259 aa  146  4.0000000000000006e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5893  protein serine/threonine phosphatase  35.41 
 
 		 386 aa  145  5e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.161748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0777  protein phosphatase 2C-like protein  38.67 
 
 		 292 aa  145  8.000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.341218  normal  0.437484 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0763  Serine/threonine protein phosphatase  35.02 
 
 		 250 aa  145  8.000000000000001e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000015661 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3832  protein serine/threonine phosphatase  40.94 
 
 		 256 aa  145  9e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.140812  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3749  protein serine/threonine phosphatase  40.94 
 
 		 256 aa  145  9e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00230331  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1170  protein phosphatase 2C-like protein  35.29 
 
 		 246 aa  144  1e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.325557  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1044  protein serine/threonine phosphatase  33.33 
 
 		 245 aa  144  1e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0099  protein serine/threonine phosphatase  38.06 
 
 		 449 aa  144  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1343  protein serine/threonine phosphatase  36.78 
 
 		 394 aa  144  2e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00740563 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2322  Phosphoprotein phosphatase  34.92 
 
 		 455 aa  144  2e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.384726 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5417  cyclic nucleotide-binding protein  36.89 
 
 		 419 aa  143  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0881735  normal  0.0681678 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3831  cyclic nucleotide-binding protein  36.74 
 
 		 435 aa  142  4e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0387698 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4547  protein phosphatase 2C domain-containing protein  37.5 
 
 		 470 aa  142  6e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0846  protein serine/threonine phosphatase  40.08 
 
 		 234 aa  142  8e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5250  protein serine/threonine phosphatase  38.17 
 
 		 449 aa  140  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.383211 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2087  Phosphoprotein phosphatase  34.88 
 
 		 445 aa  140  1.9999999999999998e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.799207  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10380  serine/threonine protein phosphatase  37.94 
 
 		 255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0515655 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0590  protein phosphatase 2C domain-containing protein  38.93 
 
 		 241 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4212  protein serine/threonine phosphatase  34.94 
 
 		 548 aa  139  3.9999999999999997e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.685502  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1774  serine/threonine protein phosphatase-like  36.93 
 
 		 264 aa  139  4.999999999999999e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0461354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2392  protein serine/threonine phosphatase  36.36 
 
 		 597 aa  139  4.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.685774  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3111  protein serine/threonine phosphatase  39.17 
 
 		 319 aa  139  4.999999999999999e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0426507 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1711  protein phosphatase 2C domain-containing protein  33.06 
 
 		 238 aa  138  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0625  protein serine/threonine phosphatase  34.45 
 
 		 241 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1581  Phosphoprotein phosphatase  36.63 
 
 		 265 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2397  Phosphoprotein phosphatase  36.32 
 
 		 246 aa  137  2e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0221  protein serine/threonine phosphatase  36.59 
 
 		 252 aa  136  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0158982  normal  0.296252 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00790  serine/threonine protein phosphatase  36.14 
 
 		 571 aa  135  5e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0472  protein serine/threonine phosphatase  38.91 
 
 		 320 aa  135  7.000000000000001e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3062  protein phosphatase 2C-like  38.49 
 
 		 474 aa  135  8e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00558874  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0067  protein serine/threonine phosphatase  38.49 
 
 		 540 aa  135  9e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0996  protein phosphatase 2C-like protein  37.31 
 
 		 305 aa  134  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3183  protein phosphatase 2C domain-containing protein  40.25 
 
 		 274 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.07989  normal  0.11146 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02467  protein phosphatase  38.06 
 
 		 234 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2423  protein phosphatase 2C-like  39.84 
 
 		 259 aa  133  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0029  Phosphoprotein phosphatase  37.5 
 
 		 505 aa  133  3e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0024  protein serine/threonine phosphatase  36.25 
 
 		 567 aa  133  3e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00164542 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00400  serine/threonine protein phosphatase  39.24 
 
 		 478 aa  133  3e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.784973 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3345  cyclic nucleotide-binding protein  34.8 
 
 		 417 aa  133  3.9999999999999996e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.254717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0927  protein serine/threonine phosphatase  32.28 
 
 		 273 aa  133  3.9999999999999996e-30  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00103547  hitchhiker  1.35771e-17 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4652  protein serine/threonine phosphatase  30.45 
 
 		 361 aa  132  5e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.195598  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>