More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5173 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_5173  Integral membrane protein TerC  100 
 
 		 249 aa  484  1e-136  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0070  hypothetical protein  80.51 
 
 		 234 aa  375  1e-103  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.693932  normal  0.419682 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0194  integral membrane protein TerC  77.69 
 
 		 247 aa  361  7.0000000000000005e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0857  integral membrane protein TerC  72.8 
 
 		 246 aa  310  1e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121563 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3943  integral membrane protein TerC  72.2 
 
 		 232 aa  309  2e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.209057  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4030  integral membrane protein TerC  72.84 
 
 		 243 aa  308  6.999999999999999e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.958437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3380  Integral membrane protein TerC  72.43 
 
 		 243 aa  306  2.0000000000000002e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3951  integral membrane protein TerC  73.06 
 
 		 233 aa  299  4e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0480576 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4673  integral membrane protein TerC  69.6 
 
 		 250 aa  288  8e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1506  integral membrane protein TerC  73.84 
 
 		 249 aa  280  1e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.110283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0815  TerC family integral membrane protein  58.47 
 
 		 237 aa  260  1e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0978  TerC family integral membrane protein  58.06 
 
 		 270 aa  260  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0445  integral membrane protein TerC  60.67 
 
 		 237 aa  260  2e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.620391 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0819  TerC family integral membrane protein  58.06 
 
 		 270 aa  260  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2677  TerC family integral membrane protein  58.06 
 
 		 237 aa  259  3e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.849406  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0277  TerC family integral membrane protein  58.06 
 
 		 237 aa  259  3e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0012  TerC family integral membrane protein  58.06 
 
 		 237 aa  259  3e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2399  TerC family integral membrane protein  58.06 
 
 		 237 aa  259  3e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.363415  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0648  TerC family integral membrane protein  59.58 
 
 		 237 aa  258  7e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2694  integral membrane protein TerC  59.75 
 
 		 251 aa  254  6e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399731  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0676  hypothetical protein  60.25 
 
 		 234 aa  251  1e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.471158 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3290  Integral membrane protein TerC  59.84 
 
 		 234 aa  248  5e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0586627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2676  integral membrane protein TerC  59.75 
 
 		 234 aa  247  1e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2036  integral membrane protein TerC  59.34 
 
 		 234 aa  246  3e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2647  integral membrane protein TerC  59.34 
 
 		 234 aa  246  3e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6290  Integral membrane protein TerC  52.42 
 
 		 231 aa  246  4e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.06689  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2568  integral membrane protein TerC  60.17 
 
 		 234 aa  245  6e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.831919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2473  integral membrane protein TerC  55.6 
 
 		 243 aa  243  1.9999999999999999e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0655  integral membrane protein TerC  59.83 
 
 		 234 aa  241  9e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.315184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5974  integral membrane protein TerC  58.44 
 
 		 234 aa  219  3e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0621231 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49290  hypothetical protein  53.25 
 
 		 244 aa  214  8e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.608351  normal  0.0100371 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3362  integral membrane protein TerC  58.55 
 
 		 233 aa  209  4e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4210  hypothetical protein  52.23 
 
 		 243 aa  202  3e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2326  integral membrane protein TerC  48.36 
 
 		 246 aa  199  5e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3390  Integral membrane protein TerC  44.49 
 
 		 227 aa  198  6e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.114305  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4045  integral membrane protein TerC  44.49 
 
 		 227 aa  198  7e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0471  integral membrane protein TerC  48.74 
 
 		 231 aa  198  7.999999999999999e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0532  integral membrane protein TerC  48.95 
 
 		 231 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.256747  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4682  integral membrane protein TerC  43.8 
 
 		 228 aa  192  3e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0460  Integral membrane protein TerC  49.15 
 
 		 231 aa  191  1e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.356096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4680  integral membrane protein TerC  45.99 
 
 		 233 aa  187  1e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.506281 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0476  Integral membrane protein TerC  48.72 
 
 		 231 aa  185  7e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1829  integral membrane protein TerC  53.85 
 
 		 236 aa  180  1e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.106378  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1243  hypothetical protein  48.56 
 
 		 224 aa  177  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1110  hypothetical protein  49.01 
 
 		 224 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1086  membrane protein  48.51 
 
 		 224 aa  176  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1201  hypothetical protein  49.01 
 
 		 224 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0242206  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1348  hypothetical protein  49.01 
 
 		 224 aa  177  2e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0643228  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1310  hypothetical protein  49.01 
 
 		 224 aa  176  3e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.869179  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1092  membrane protein  48.51 
 
 		 224 aa  176  3e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1271  hypothetical protein  48.51 
 
 		 224 aa  176  3e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1545  Integral membrane protein TerC  51.79 
 
 		 234 aa  174  9.999999999999999e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.654667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1098  integral membrane protein TerC  47.6 
 
 		 224 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0388  Integral membrane protein TerC  40.51 
 
 		 228 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.10914  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4099  hypothetical protein  48.51 
 
 		 224 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0905  integral membrane protein TerC  43.88 
 
 		 224 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3292  Integral membrane protein TerC  42.46 
 
 		 229 aa  171  7.999999999999999e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000553264  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0867  integral membrane protein TerC  49.25 
 
 		 230 aa  170  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2319  hypothetical protein  40.82 
 
 		 282 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.374311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3371  Integral membrane protein TerC  46.43 
 
 		 233 aa  169  4e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000908977  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1401  Integral membrane protein TerC  40 
 
 		 230 aa  167  1e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0891  Integral membrane protein TerC  43.44 
 
 		 230 aa  167  1e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.927999 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5190  Integral membrane protein TerC  45 
 
 		 228 aa  166  4e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1619  Integral membrane protein TerC  46.88 
 
 		 219 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2290  hypothetical protein  49.48 
 
 		 223 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000535786  hitchhiker  1.74959e-24 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3465  hypothetical protein  45.45 
 
 		 273 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.193178  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0820  Integral membrane protein TerC  46.46 
 
 		 230 aa  160  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2992  hypothetical protein  47.67 
 
 		 224 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000237739  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2950  hypothetical protein  48.19 
 
 		 224 aa  160  3e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000304584  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2687  integral membrane protein  47.67 
 
 		 223 aa  159  4e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  8.99686e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2945  hypothetical protein  47.67 
 
 		 223 aa  159  5e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.89951e-53 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2736  hypothetical protein  47.67 
 
 		 223 aa  159  5e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00167476  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2665  integral membrane protein  47.67 
 
 		 223 aa  159  5e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.173454  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2946  hypothetical protein  47.67 
 
 		 223 aa  159  5e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000002611  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2986  hypothetical protein  47.67 
 
 		 223 aa  159  6e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000888326  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3839  hypothetical protein  47.94 
 
 		 287 aa  158  7e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.562242 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4044  integral membrane protein TerC  43.5 
 
 		 239 aa  158  7e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0916  integral membrane protein TerC  48.45 
 
 		 237 aa  156  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.968219  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0428  integral membrane protein TerC  41.42 
 
 		 225 aa  156  3e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000236492  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1816  integral membrane protein TerC  46.07 
 
 		 242 aa  154  9e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.34813  normal  0.112253 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3917  integral membrane protein TerC  47.72 
 
 		 238 aa  154  1e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0557397  hitchhiker  0.00349463 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4666  integral membrane protein TerC  43.87 
 
 		 245 aa  154  1e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.918315 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2567  integral membrane protein TerC  49.75 
 
 		 232 aa  154  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0398811  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0556  hypothetical protein  48.48 
 
 		 232 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3864  integral membrane protein TerC  43.87 
 
 		 245 aa  152  4e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.170759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1266  Integral membrane protein TerC  37.61 
 
 		 228 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0764  Integral membrane protein TerC  47.06 
 
 		 223 aa  151  8e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2327  hypothetical protein  48.96 
 
 		 233 aa  151  8e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.844452  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0949  hypothetical protein  42.56 
 
 		 230 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0295104 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1600  hypothetical protein  48 
 
 		 292 aa  145  5e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.3941  normal  0.277358 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3386  hypothetical protein  39.09 
 
 		 346 aa  143  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.501698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3512  integral membrane protein TerC  36.71 
 
 		 251 aa  139  3e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0508752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0926  putative transmembrane protein  40.51 
 
 		 233 aa  137  1e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00232112  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0805  integral membrane protein TerC  39.33 
 
 		 258 aa  137  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0662924  normal  0.60376 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2845  Integral membrane protein TerC  43.03 
 
 		 198 aa  136  4e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.100755 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1209  Integral membrane protein TerC  41.76 
 
 		 249 aa  135  5e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2121  hypothetical protein  48.72 
 
 		 273 aa  135  7.000000000000001e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3022  integral membrane protein TerC  36.68 
 
 		 233 aa  129  6e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5883  integral membrane protein TerC  59.43 
 
 		 111 aa  123  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.418613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0569  Integral membrane protein TerC  36.48 
 
 		 221 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>