110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5095 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_5095  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  100 
 
 		 150 aa  296  5e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760748  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0798  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  37.59 
 
 		 148 aa  72.8  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.952791  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1424  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  31.58 
 
 		 152 aa  68.6  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3541  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  33.57 
 
 		 145 aa  67  0.00000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1558  putative heat shock protein  39.81 
 
 		 170 aa  66.6  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0443108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4623  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  34.35 
 
 		 257 aa  66.2  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0179388  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0115  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  35.04 
 
 		 478 aa  66.6  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0115  hypothetical protein  35.04 
 
 		 478 aa  66.6  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.3697  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2665  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  37.65 
 
 		 335 aa  64.3  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0135  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  37.29 
 
 		 397 aa  60.8  0.000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000192889  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0847  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  39.29 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.687312 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2320  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  37.61 
 
 		 165 aa  60.1  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0508  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  36.96 
 
 		 126 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0182  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  35.58 
 
 		 365 aa  58.2  0.00000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.630616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0769  hypothetical protein  31.19 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2252  putative lipoprotein  27.5 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.208393  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3920  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  34.55 
 
 		 351 aa  57  0.00000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0592511  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3930  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  36.73 
 
 		 274 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2470  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  34.26 
 
 		 282 aa  56.6  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0121591  normal  0.0239407 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3278  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  36.73 
 
 		 280 aa  56.2  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0137  hypothetical protein  32.59 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.0000000000209855  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1254  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  37.65 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.540401  normal  0.154785 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0923  hypothetical protein  31.82 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2782  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  37.17 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.3452  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3829  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  25.32 
 
 		 251 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.238028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3548  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  30.28 
 
 		 138 aa  55.5  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3670  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  30.28 
 
 		 138 aa  55.5  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.141959 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3479  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  30.28 
 
 		 138 aa  55.5  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3778  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  26.53 
 
 		 251 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1051  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  35.45 
 
 		 524 aa  54.3  0.0000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.488391  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52290  hypothetical protein  28.68 
 
 		 135 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.378524 
 
 
-
 
NC_004310  BR0695  hypothetical protein  34.23 
 
 		 267 aa  53.1  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4585  hypothetical protein  27.27 
 
 		 135 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1402  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  29.93 
 
 		 146 aa  53.5  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.418877  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1816  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  33.66 
 
 		 242 aa  52.4  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0798  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  32.69 
 
 		 273 aa  52.8  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.146449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2944  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  36.64 
 
 		 154 aa  52.4  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0644  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  39.47 
 
 		 226 aa  52  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.143261 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1647  hypothetical protein  26.43 
 
 		 143 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.114343  normal  0.330548 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2054  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  30.58 
 
 		 234 aa  52  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.957862  normal  0.117423 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3439  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  32.76 
 
 		 258 aa  52  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0867  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  32.04 
 
 		 137 aa  51.6  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0603  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  44.83 
 
 		 220 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.112924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3498  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  34.07 
 
 		 221 aa  52  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2767  hypothetical protein  33.08 
 
 		 140 aa  51.6  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0864  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  27.61 
 
 		 138 aa  51.2  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.847217  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2578  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  30.52 
 
 		 279 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0748  hypothetical protein  31.9 
 
 		 275 aa  50.4  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.455346  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1249  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  27.13 
 
 		 134 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000125713 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0765  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  30.91 
 
 		 138 aa  50.4  0.000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3258  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  30.91 
 
 		 138 aa  50.4  0.000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3361  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  30.91 
 
 		 138 aa  50.1  0.000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1384  hypothetical protein  35.71 
 
 		 281 aa  50.1  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0928654  normal  0.157353 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3641  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  27.88 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.901897  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0686  hypothetical protein  33.33 
 
 		 297 aa  50.1  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0260  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  33.04 
 
 		 206 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0516  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  31.93 
 
 		 176 aa  49.7  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4070  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  26.36 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.618195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0776  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  28.83 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2767  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  30.89 
 
 		 151 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.795518  normal  0.509159 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0803  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  31.63 
 
 		 221 aa  49.3  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1727  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  28.43 
 
 		 132 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000179415  normal  0.7023 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2088  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  31.9 
 
 		 197 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.162999  normal  0.076046 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1928  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  29.29 
 
 		 278 aa  48.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000453787  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0192  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  29.2 
 
 		 354 aa  48.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000042827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4560  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  31.25 
 
 		 284 aa  47.8  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.98407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2593  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  33.04 
 
 		 267 aa  47.8  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04470  hypothetical protein  34.78 
 
 		 137 aa  47.8  0.00005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.1707  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0977  hypothetical protein  32 
 
 		 187 aa  47.4  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0590  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  40.24 
 
 		 140 aa  47.4  0.00007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.927794 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0863  protein of unknown function DUF306, MetA and HslJ  30.53 
 
 		 137 aa  47.4  0.00008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0275  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  27.72 
 
 		 145 aa  47  0.00009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0694  hypothetical protein  41.38 
 
 		 246 aa  46.6  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00754314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2713  hypothetical protein  31.2 
 
 		 269 aa  47  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0787  heat shock protein  29.17 
 
 		 166 aa  46.6  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0351684 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02640  probable secreted protein containing HslJ-like protein  32.29 
 
 		 274 aa  46.2  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1923  hypothetical protein  34.07 
 
 		 182 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.87534  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1348  hypothetical protein  34.07 
 
 		 224 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.243872  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4226  hypothetical protein  25 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.294612  normal  0.737644 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0641  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  24.82 
 
 		 141 aa  45.8  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1033  hypothetical protein  34.07 
 
 		 182 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.365055  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1083  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  30 
 
 		 279 aa  45.8  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0834  hypothetical protein  34.07 
 
 		 182 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.653609  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1186  hypothetical protein  34.07 
 
 		 182 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.323907  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1194  hypothetical protein  34.07 
 
 		 182 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.121272  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0316  hypothetical protein  34.07 
 
 		 182 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00587093  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1209  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  25.76 
 
 		 134 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4523  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  38.46 
 
 		 139 aa  46.2  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.207196  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2900  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  31.19 
 
 		 133 aa  45.1  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.456772  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1050  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  27.96 
 
 		 283 aa  44.7  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2359  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  31.07 
 
 		 181 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.714187  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1980  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  29.86 
 
 		 149 aa  43.9  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5662  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  30.84 
 
 		 181 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.938365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1708  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  28.97 
 
 		 181 aa  42.7  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2320  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  28.97 
 
 		 181 aa  42.7  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341012  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2878  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  34.38 
 
 		 241 aa  43.5  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0957  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  30.48 
 
 		 181 aa  43.5  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2343  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  28.97 
 
 		 181 aa  42.7  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0123815 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2239  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  35.06 
 
 		 181 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.393899  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0543  conserved hypothetical META domain lipoprotein  44.19 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>