More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5091 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_5091  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  100 
 
 		 333 aa  665    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4625  translation factor SUA5  67.36 
 
 		 331 aa  412  1e-114  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3861  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  66.97 
 
 		 327 aa  412  1e-114  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.647921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3936  translation factor SUA5  63.96 
 
 		 332 aa  402  1e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.182526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3284  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  63.66 
 
 		 332 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4564  translation factor SUA5  67.16 
 
 		 336 aa  390  1e-107  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1544  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  62.86 
 
 		 348 aa  382  1e-105  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.676955  normal  0.0127604 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0988  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  62.16 
 
 		 332 aa  368  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.330084 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0195  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  54.09 
 
 		 389 aa  363  2e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0297  translation factor SUA5  63.1 
 
 		 335 aa  359  4e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0755964 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0367  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  60 
 
 		 346 aa  304  2.0000000000000002e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000143554 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0465  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  51.08 
 
 		 347 aa  281  1e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.17381 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0553  translation factor SUA5  53.25 
 
 		 328 aa  280  2e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0840  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  51.83 
 
 		 342 aa  280  3e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0303  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  51.83 
 
 		 341 aa  280  3e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1003  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein, putative  51.83 
 
 		 342 aa  280  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0845  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  51.83 
 
 		 341 aa  280  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0598  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  51.83 
 
 		 341 aa  280  3e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0044  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  51.83 
 
 		 341 aa  280  3e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.939032  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2432  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  51.83 
 
 		 341 aa  280  3e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0695  translation factor SUA5  51.38 
 
 		 346 aa  279  4e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.274507  normal  0.401857 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0676  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  52.73 
 
 		 342 aa  278  7e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.727288 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0669  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  51.84 
 
 		 341 aa  278  1e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0497  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  54.1 
 
 		 337 aa  277  2e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.271479  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0484  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  53.8 
 
 		 337 aa  276  5e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.862271 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3271  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  51.06 
 
 		 346 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.917971 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0507  translation factor SUA5  50.46 
 
 		 330 aa  272  5.000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2669  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  52.22 
 
 		 342 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5953  translation factor SUA5  51.9 
 
 		 342 aa  271  1e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.270235 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2542  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  51.9 
 
 		 342 aa  270  2e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.636354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2011  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  50.3 
 
 		 342 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2622  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  50.3 
 
 		 342 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.378273  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0452  translation factor SUA5  51.08 
 
 		 331 aa  269  4e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2651  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  50.3 
 
 		 342 aa  268  8e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.654843  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0577  hypothetical protein  53.99 
 
 		 336 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1811  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  45.3 
 
 		 362 aa  257  2e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.101238  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1674  Sua5/YciO/YrdC family protein  46.67 
 
 		 328 aa  249  5e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1371  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  46.67 
 
 		 328 aa  249  5e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3187  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  45.93 
 
 		 370 aa  246  3e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.436725  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0607  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  46.67 
 
 		 364 aa  240  2.9999999999999997e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.97472  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5123  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  43.29 
 
 		 346 aa  236  4e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.401349  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5452  sua5/yciO/yrdC/ywlC family protein  41.46 
 
 		 346 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0228845  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5503  sua5/yciO/yrdC/ywlC family protein  41.77 
 
 		 346 aa  236  6e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000113963  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5174  sua5/yciO/yrdC/ywlC family protein  41.77 
 
 		 346 aa  236  6e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5009  sua5/yciO/yrdC/ywlC family protein  41.77 
 
 		 346 aa  236  6e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000874149  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5025  sua5/yciO/yrdC/ywlC family protein  41.77 
 
 		 346 aa  236  6e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00487742  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5568  sua5/yciO/yrdC/ywlC family protein  41.77 
 
 		 346 aa  236  6e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00343157  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5417  sua5/yciO/yrdC/ywlC family protein  41.77 
 
 		 346 aa  236  6e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.7505e-62 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5504  sua5/yciO/yrdC/ywlC family protein  42.07 
 
 		 346 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000376853  unclonable  1.14998e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5448  sua5/yciO/yrdC/ywlC family protein  41.77 
 
 		 346 aa  232  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.011245  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2023  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  45.87 
 
 		 326 aa  227  2e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0150257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3846  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  40.85 
 
 		 347 aa  223  3e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00967711  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0598  hypothetical protein  40.66 
 
 		 329 aa  220  3e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1961  translation factor SUA5  48.48 
 
 		 335 aa  219  6e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4092  translation factor SUA5  44.04 
 
 		 321 aa  216  5e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.323692 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2595  translation factor SUA5  37.24 
 
 		 351 aa  211  1e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0328746  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4186  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  42.82 
 
 		 355 aa  210  4e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.302621  hitchhiker  0.00000330857 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17950  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  36.49 
 
 		 364 aa  208  1e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0108517  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0444  translation factor SUA5  43.15 
 
 		 322 aa  207  2e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.193197  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4321  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  42.15 
 
 		 356 aa  207  3e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.550799 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0096  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  36.71 
 
 		 354 aa  206  5e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0831  translation factor SUA5  43.98 
 
 		 327 aa  206  6e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.167827  hitchhiker  0.00199309 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3747  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  37.36 
 
 		 352 aa  205  8e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.585251  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0400  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  51.23 
 
 		 345 aa  203  3e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4305  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  42.24 
 
 		 327 aa  203  4e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0757875 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3432  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  42.25 
 
 		 349 aa  203  4e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3319  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  38.46 
 
 		 348 aa  202  5e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.831205  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0452  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  38.96 
 
 		 316 aa  200  1.9999999999999998e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.865666 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4009  hypothetical protein  45.57 
 
 		 328 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3166  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  40.12 
 
 		 354 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0126434  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1247  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  45 
 
 		 330 aa  200  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3265  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  43.07 
 
 		 345 aa  199  3.9999999999999996e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.327071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1267  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  45.54 
 
 		 326 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2842  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  45.76 
 
 		 335 aa  199  7.999999999999999e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2902  hypothetical protein  36.12 
 
 		 322 aa  196  4.0000000000000005e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0454  translation factor SUA5  37.54 
 
 		 342 aa  196  4.0000000000000005e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0445  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  45.57 
 
 		 328 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1565  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  36.42 
 
 		 324 aa  196  5.000000000000001e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2395  translation factor SUA5  41 
 
 		 352 aa  196  5.000000000000001e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3044  hypothetical protein  36.12 
 
 		 322 aa  195  7e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4587  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  44.98 
 
 		 329 aa  195  9e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2696  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  45.59 
 
 		 328 aa  193  3e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.680873 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2387  translation factor SUA5  42.86 
 
 		 333 aa  193  4e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.833113 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1246  putative translation factor (SUA5)  38.86 
 
 		 334 aa  193  4e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.377442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33949  predicted protein  36.47 
 
 		 387 aa  192  7e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0774  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  42.9 
 
 		 320 aa  192  8e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.902931  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1075  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  35.48 
 
 		 348 aa  192  1e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3830  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  43.81 
 
 		 332 aa  191  2e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.905115 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2023  translation factor SUA5  39.13 
 
 		 339 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.161833  normal  0.111129 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1394  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  39.2 
 
 		 324 aa  189  5e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.406188 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4105  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  44.83 
 
 		 329 aa  189  8e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.854949  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1857  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  39.44 
 
 		 322 aa  188  9e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0257  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  38.32 
 
 		 359 aa  188  1e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00354892  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1782  translation factor SUA5  36.72 
 
 		 337 aa  187  2e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0807  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  36.87 
 
 		 338 aa  187  2e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.172547  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1132  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  43.61 
 
 		 329 aa  187  3e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.763244 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1686  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  36.11 
 
 		 315 aa  186  4e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2287  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  39.23 
 
 		 346 aa  186  6e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.036585  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1588  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  39.94 
 
 		 317 aa  186  6e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.704065  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2418  translation factor SUA5  36.45 
 
 		 321 aa  185  9e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.85919  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>