More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4901 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4901  Redoxin domain protein  100 
 
 		 165 aa  332  1e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.273187  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0270  putative transmembrane protein  85.11 
 
 		 174 aa  261  4e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0405  redoxin domain-containing protein  78.52 
 
 		 203 aa  259  2e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0287  Redoxin domain protein  81.69 
 
 		 167 aa  255  2e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.610229  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0292  redoxin domain-containing protein  81.69 
 
 		 167 aa  255  2e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000102715 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0217  redoxin domain-containing protein  82.27 
 
 		 171 aa  253  6e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.219465 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0350  redoxin domain-containing protein  71.34 
 
 		 168 aa  250  7e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112402 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1278  redoxin domain-containing protein  67.27 
 
 		 167 aa  241  5e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0318  hypothetical protein  66.9 
 
 		 166 aa  215  2e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0164115  normal  0.0202423 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0190  Redoxin domain protein  55.62 
 
 		 186 aa  193  9e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.968687  normal  0.596413 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0196  Redoxin domain protein  55.62 
 
 		 185 aa  192  1e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0104775 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0333  putative transmembrane protein  55.62 
 
 		 213 aa  191  3e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.847937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0233  thioredoxin-like protein  56.52 
 
 		 179 aa  191  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0228  redoxin domain-containing protein  57.14 
 
 		 174 aa  189  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.454071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4046  redoxin domain-containing protein  54 
 
 		 166 aa  189  2e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000205313 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0284  putative transmembrane protein  59.86 
 
 		 178 aa  187  5e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4194  putative thiol-disulfide isomerase and thioredoxins  57.82 
 
 		 176 aa  184  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.462178 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0521  Redoxin domain protein  57.82 
 
 		 176 aa  184  5e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.037804  normal  0.85402 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3225  hypothetical protein  57.93 
 
 		 178 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0643  resA domain-containing protein  57.93 
 
 		 178 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.826532  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1393  hypothetical protein  57.93 
 
 		 178 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0200  hypothetical protein  57.93 
 
 		 178 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2819  hypothetical protein  57.93 
 
 		 178 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0479  putative thiol-disulfide oxidoreductase  57.93 
 
 		 178 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0459  putative thiol-disulfide oxidoreductase  57.93 
 
 		 178 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0433  redoxin domain-containing protein  57.93 
 
 		 179 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0402  hypothetical protein  57.93 
 
 		 178 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2787  redoxin domain-containing protein  57.93 
 
 		 178 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.787444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2925  redoxin domain-containing protein  57.93 
 
 		 178 aa  181  5.0000000000000004e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6212  Thiol-disulfide isomerase/thioredoxin-like  57.53 
 
 		 194 aa  180  8.000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2256  redoxin  57.93 
 
 		 178 aa  179  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.087584  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2881  redoxin domain-containing protein  57.93 
 
 		 178 aa  179  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2870  redoxin domain-containing protein  57.93 
 
 		 178 aa  179  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0218082  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2431  putative thioredoxin  52.59 
 
 		 164 aa  166  2e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0247  Redoxin domain protein  48.63 
 
 		 165 aa  160  1e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.549118  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0475  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  41.07 
 
 		 173 aa  148  3e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0206  Redoxin domain protein  43.51 
 
 		 167 aa  139  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0399  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  38.61 
 
 		 171 aa  130  5e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.689513  normal  0.928423 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2412  Redoxin domain protein  32.93 
 
 		 167 aa  123  1e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1257  resA domain-containing protein  37.13 
 
 		 165 aa  121  5e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0432  redoxin domain-containing protein  36.09 
 
 		 169 aa  107  7.000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0116447 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2145  Redoxin domain protein  36.6 
 
 		 172 aa  102  3e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.765284  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1569  putative thioredoxin  41.07 
 
 		 167 aa  94  8e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000853418  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0861  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.35 
 
 		 189 aa  91.7  5e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.155376  hitchhiker  0.00638708 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0325  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.62 
 
 		 189 aa  90.5  9e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0365546 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3927  thioredoxin-like  32.61 
 
 		 174 aa  87  9e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298512  normal  0.186192 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1533  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.93 
 
 		 193 aa  86.7  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1598  thiol-disulfide oxidoreductase  32.72 
 
 		 173 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.966744  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1356  thiol-disulfide oxidoreductase  31.93 
 
 		 173 aa  85.9  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1396  thiol-disulfide oxidoreductase  32.93 
 
 		 173 aa  85.1  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1959  redoxin domain-containing protein  33.58 
 
 		 189 aa  84.3  8e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0329542  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3817  thiol-disulfide oxidoreductase  33.74 
 
 		 173 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000518727 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2903  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.59 
 
 		 184 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0181  alkyl hydroperoxide reductase  30.88 
 
 		 183 aa  82.8  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0243778  normal  0.461108 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1634  thiol-disulfide oxidoreductase  32.1 
 
 		 173 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1383  thiol-disulfide oxidoreductase  33.74 
 
 		 173 aa  82.4  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1528  thiol-disulfide oxidoreductase  33.74 
 
 		 173 aa  82  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1494  thiol-disulfide oxidoreductase  33.74 
 
 		 173 aa  82.4  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1566  thiol-disulfide oxidoreductase  33.13 
 
 		 173 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.62392e-19 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1355  thiol-disulfide oxidoreductase  32.72 
 
 		 173 aa  80.9  0.000000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1197  thiol-disulfide oxidoreductase  35.34 
 
 		 173 aa  80.5  0.000000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0399  thiol-disulfide oxidoreductase  32.94 
 
 		 174 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3317  AhpC/TSA family protein  32.47 
 
 		 191 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2261  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.77 
 
 		 191 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.124304  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2939  redoxin domain-containing protein  33.14 
 
 		 179 aa  79.7  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.670984  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3405  ahpC/TSA family protein  32.47 
 
 		 191 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3367  AhpC/TSA family protein  32.47 
 
 		 191 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0144546  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3674  ahpC/TSA family protein  32.47 
 
 		 191 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.309572  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1124  redoxin domain-containing protein  31.54 
 
 		 181 aa  79  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.65139  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3623  ahpC/TSA family protein  32.47 
 
 		 191 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000131744 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0272  thioredoxin family protein  36.5 
 
 		 182 aa  77.4  0.00000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.900103 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0240  Redoxin domain protein  32.35 
 
 		 188 aa  77.4  0.00000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2908  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like  35.77 
 
 		 199 aa  77.4  0.00000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.629655  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3632  ahpC/TSA family protein  31.82 
 
 		 191 aa  77.4  0.00000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0183092  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3638  ahpC/TSA family protein  31.82 
 
 		 191 aa  77.4  0.00000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00315479  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6172  Redoxin domain protein  33.14 
 
 		 187 aa  77  0.00000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5008  Redoxin domain protein  30.5 
 
 		 248 aa  76.6  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.437471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1445  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.88 
 
 		 182 aa  77  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2023  redoxin domain-containing protein  31.5 
 
 		 161 aa  76.6  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.388068 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2408  hypothetical protein  33.33 
 
 		 160 aa  76.3  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.908805  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3951  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like protein  29.49 
 
 		 188 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.337329 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5686  redoxin domain-containing protein  32.12 
 
 		 186 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.131775 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3551  thioredoxin family protein  34.95 
 
 		 184 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0547  peroxiredoxin-like protein  28.26 
 
 		 168 aa  75.9  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1904  thioredoxin family protein  40.88 
 
 		 184 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000368388  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3474  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.16 
 
 		 169 aa  75.5  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.163841 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1793  thioredoxin family protein  39.86 
 
 		 184 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1358  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.88 
 
 		 179 aa  75.1  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000315647  hitchhiker  0.00000356135 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1239  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like protein  30.07 
 
 		 422 aa  75.1  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.502856  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5033  redoxin domain-containing protein  33.33 
 
 		 581 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.807705  normal  0.724504 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1648  thioredoxin family protein  40.15 
 
 		 184 aa  74.7  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000012411  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1779  thioredoxin family protein  40.15 
 
 		 184 aa  74.7  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.710861  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3720  ahpC/TSA family protein  31.17 
 
 		 191 aa  74.3  0.0000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2222  thiol-disulfide oxidoreductase  36.97 
 
 		 174 aa  74.3  0.0000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000493791  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1829  thioredoxin family protein  40.15 
 
 		 184 aa  74.3  0.0000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1852  thioredoxin family protein  40.15 
 
 		 184 aa  73.9  0.0000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.056942  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1627  thioredoxin family protein  40.15 
 
 		 184 aa  74.3  0.0000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000123929  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1597  thioredoxin family protein  40.15 
 
 		 184 aa  74.3  0.0000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0109831  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4497  Redoxin domain protein  34.31 
 
 		 691 aa  74.3  0.0000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0047  hypothetical protein  25.86 
 
 		 165 aa  73.9  0.0000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.147207  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>