More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4899 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4899  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 415 aa  805    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0296  major facilitator transporter  61.39 
 
 		 431 aa  475  1e-133  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0236  major facilitator superfamily transporter  60.1 
 
 		 423 aa  448  1e-125  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.394936 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0294  major facilitator superfamily transporter  58.82 
 
 		 412 aa  418  1e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000111052 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0289  major facilitator superfamily MFS_1  58.33 
 
 		 412 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1279  major facilitator superfamily transporter  52.6 
 
 		 493 aa  405  1.0000000000000001e-112  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0035  major facilitator transporter  34.76 
 
 		 405 aa  207  3e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.55843 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1892  major facilitator superfamily MFS_1  38.32 
 
 		 431 aa  195  1e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1756  major facilitator transporter  39.28 
 
 		 407 aa  190  4e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3355  hypothetical protein  35.4 
 
 		 420 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.40936  normal  0.967492 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1836  major facilitator transporter  32.75 
 
 		 412 aa  159  1e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1496  hypothetical protein  38.28 
 
 		 461 aa  159  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.000950555  normal  0.877787 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2630  major facilitator transporter  32.14 
 
 		 425 aa  157  4e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2103  hypothetical protein  30.85 
 
 		 420 aa  151  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.36255  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1898  major facilitator transporter  31.2 
 
 		 420 aa  150  4e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0191579  normal  0.0647727 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0661  major facilitator transporter  32.59 
 
 		 418 aa  150  5e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.655156 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2317  major facilitator superfamily MFS_1  34.17 
 
 		 392 aa  147  4.0000000000000006e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.85922 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41790  carbohydrate transport membrane protein  30.85 
 
 		 415 aa  147  5e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2869  major facilitator superfamily MFS_1  29.95 
 
 		 413 aa  144  4e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000467547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2751  major facilitator transporter  29.63 
 
 		 407 aa  143  7e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1255  major facilitator transporter  29.66 
 
 		 413 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0230086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1470  major facilitator family transporter  31.01 
 
 		 412 aa  136  8e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1604  major facilitator family tranporter  31.01 
 
 		 412 aa  136  8e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1500  major facilitator family transporter  31.01 
 
 		 430 aa  136  9e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.154972  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2786  major facilitator family tranporter  31.01 
 
 		 412 aa  135  9e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000499606  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0560  major facilitator family transporter  31.01 
 
 		 412 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0767  major facilitator family tranporter  31.01 
 
 		 430 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2425  major facilitator transporter  32.22 
 
 		 427 aa  135  9.999999999999999e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.410851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1277  major facilitator family transporter  31.01 
 
 		 412 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.552414  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0591  major facilitator family tranporter  31.01 
 
 		 412 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1989  major facilitator transporter  30.69 
 
 		 418 aa  133  5e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1139  major facilitator superfamily MFS_1  31.67 
 
 		 395 aa  133  5e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.388877  normal  0.0189112 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0872  major facilitator transporter  30.19 
 
 		 414 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104086  normal  0.268886 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1166  major facilitator transporter  32.32 
 
 		 410 aa  130  3e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.117427  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1446  major facilitator transporter  31.25 
 
 		 416 aa  129  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1178  major facilitator transporter  32.04 
 
 		 410 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0817029  normal  0.188851 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2031  major facilitator transporter  31.79 
 
 		 410 aa  126  7e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000192505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4431  major facilitator transporter  31.03 
 
 		 405 aa  125  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000464132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1289  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 405 aa  124  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000170185  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0808  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 405 aa  124  4e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000152405  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1260  major facilitator transporter  31.03 
 
 		 405 aa  123  5e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00393517  normal  0.0788656 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0056  major facilitator superfamily MFS_1  31.17 
 
 		 411 aa  116  6e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3315  major facilitator family transporter  29.05 
 
 		 414 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0271  major facilitator transporter  27.47 
 
 		 418 aa  110  6e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0080  major facilitator transporter  27 
 
 		 434 aa  102  1e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.163505  hitchhiker  0.00273826 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0835  major facilitator transporter  27 
 
 		 434 aa  100  7e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.65824  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1068  major facilitator superfamily MFS_1  27.32 
 
 		 420 aa  99.8  9e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.27901  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1147  major facilitator superfamily transporter  27.32 
 
 		 420 aa  99.4  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.428295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0097  major facilitator superfamily MFS_1  26.56 
 
 		 415 aa  98.6  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0178467  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0257  major facilitator transporter  27.25 
 
 		 417 aa  98.2  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.72366 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0079  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 		 425 aa  94.7  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28688e-24 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3001  major facilitator transporter  28.84 
 
 		 432 aa  94.7  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0480  major facilitator superfamily MFS_1  25.13 
 
 		 395 aa  93.6  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0450  major facilitator superfamily MFS_1  25.06 
 
 		 436 aa  93.2  7e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.912084  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0117  major facilitator transporter  28.01 
 
 		 389 aa  92.4  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3925  major facilitator transporter  29.89 
 
 		 445 aa  87.4  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.362735 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2160  major facilitator transporter  26.98 
 
 		 433 aa  85.9  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.190844  normal  0.652722 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6743  major facilitator superfamily MFS_1  26.37 
 
 		 413 aa  84  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.15445  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6493  major facilitator transporter  31.71 
 
 		 417 aa  82.8  0.000000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217095  normal  0.0270431 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1373  major facilitator transporter  29.55 
 
 		 390 aa  80.9  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.421856  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1599  major facilitator transporter  27.86 
 
 		 428 aa  80.5  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0862698 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5613  major facilitator protein family permease  25.56 
 
 		 432 aa  79  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1897  major facilitator transporter  25.33 
 
 		 416 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0473254  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4524  major facilitator superfamily transporter  25.14 
 
 		 450 aa  76.6  0.0000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0130  major facilitator superfamily MFS_1  28.13 
 
 		 407 aa  75.5  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.879042  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0113  major facilitator superfamily transporter  27.65 
 
 		 407 aa  74.7  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.378923 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0706  hypothetical protein  24.68 
 
 		 430 aa  74.3  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0688  hypothetical protein  24.42 
 
 		 430 aa  73.9  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2772  major facilitator transporter  28.49 
 
 		 397 aa  73.9  0.000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0041  major facilitator transporter  29.55 
 
 		 390 aa  73.6  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5821  major facilitator superfamily permease  27.72 
 
 		 432 aa  72.4  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.836569  normal  0.302155 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0031  major facilitator transporter  29.37 
 
 		 390 aa  72.4  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1835  major facilitator superfamily MFS_1  29.28 
 
 		 423 aa  72  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.105556  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1289  hypothetical protein  21.47 
 
 		 432 aa  70.9  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1288  hypothetical protein  21.47 
 
 		 432 aa  70.9  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0431  major facilitator transporter  25.16 
 
 		 440 aa  68.2  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000529382  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2768  major facilitator superfamily MFS_1  22.9 
 
 		 421 aa  68.9  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.17695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5472  major facilitator transporter  28.44 
 
 		 437 aa  68.2  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1524  major facilitator transporter  27.86 
 
 		 434 aa  67.8  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.472365  normal  0.129065 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2516  major facilitator superfamily MFS_1  25.9 
 
 		 446 aa  67.8  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000164401  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2122  major facilitator transporter  28.63 
 
 		 461 aa  66.6  0.0000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2603  major facilitator superfamily MFS_1  26.72 
 
 		 437 aa  66.6  0.0000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2438  hypothetical protein  23 
 
 		 410 aa  65.9  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0477  inner membrane transport protein YajR  31.21 
 
 		 454 aa  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0475  inner membrane transport protein YajR  31.21 
 
 		 454 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0496  inner membrane transport protein YajR  31.21 
 
 		 454 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0538  inner membrane transport protein YajR  31.21 
 
 		 454 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.342738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0483  inner membrane transport protein YajR  31.21 
 
 		 454 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.121319 
 
 
-
 
NC_002978  WD1034  hypothetical protein  25.31 
 
 		 406 aa  64.3  0.000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2665  major facilitator superfamily MFS_1  30.06 
 
 		 421 aa  64.3  0.000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.6609  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2160  transporter, MFS superfamily  26.53 
 
 		 446 aa  63.5  0.000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2584  hypothetical protein  22 
 
 		 410 aa  63.5  0.000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0018  major facilitator family transporter  26.53 
 
 		 446 aa  63.5  0.000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0158  major facilitator superfamily MFS_1  25.71 
 
 		 411 aa  62.8  0.00000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3077  major facilitator transporter  26.55 
 
 		 456 aa  62.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.374174  normal  0.0107759 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3345  major facilitator transporter  32.24 
 
 		 417 aa  62.4  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.231985 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1860  hypothetical protein  23.38 
 
 		 426 aa  61.2  0.00000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0463  major facilitator transporter  30.06 
 
 		 454 aa  60.1  0.00000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3206  major facilitator transporter  30.06 
 
 		 454 aa  60.1  0.00000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000090157 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0894  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 453 aa  60.1  0.00000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.298012  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>