More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4869 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_0974  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.3 
 
 		 475 aa  668    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03616  F0F1 ATP synthase subunit beta  80.09 
 
 		 460 aa  752    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.587237  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4235  ATP synthase F1, beta subunit  80.09 
 
 		 460 aa  752    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3845  F0F1 ATP synthase subunit beta  79.53 
 
 		 458 aa  752    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000208529 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0113  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.52 
 
 		 470 aa  634    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.800377  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5413  F0F1 ATP synthase subunit beta  79.35 
 
 		 458 aa  740    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00278532 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0606  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.73 
 
 		 471 aa  638    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391377  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0012  F0F1 ATP synthase subunit beta  78.76 
 
 		 460 aa  745    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3355  F0F1 ATP synthase subunit beta  84.95 
 
 		 464 aa  814    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3317  F0F1 ATP synthase subunit beta  84.57 
 
 		 467 aa  808    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.156126  normal  0.0243325 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3968  F0F1 ATP synthase subunit beta  84.95 
 
 		 464 aa  814    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0062  F0F1 ATP synthase subunit beta  79.06 
 
 		 461 aa  730    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1587  F0F1 ATP synthase subunit beta  85.16 
 
 		 459 aa  815    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.986893  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2195  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.38 
 
 		 470 aa  638    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1799  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.91 
 
 		 521 aa  636    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.469261  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4747  F0F1 ATP synthase subunit beta  80.56 
 
 		 463 aa  758    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5599  ATP synthase F1, beta subunit  79.18 
 
 		 459 aa  741    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2201  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.3 
 
 		 475 aa  662    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0026  F0F1 ATP synthase subunit beta  82.03 
 
 		 466 aa  791    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.122802  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3730  F0F1 ATP synthase subunit beta  75.91 
 
 		 465 aa  723    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4607  F0F1 ATP synthase subunit beta  80.65 
 
 		 458 aa  755    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2957  F0F1 ATP synthase subunit beta  84.95 
 
 		 464 aa  814    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3053  F0F1 ATP synthase subunit beta  78.28 
 
 		 458 aa  734    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2910  F0F1 ATP synthase subunit beta  78.28 
 
 		 458 aa  734    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5295  F0F1 ATP synthase subunit beta  79.35 
 
 		 458 aa  740    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.122474 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5121  F0F1 ATP synthase subunit beta  79.18 
 
 		 459 aa  741    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2024  F0F1 ATP synthase subunit beta  79.24 
 
 		 477 aa  758    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.531003 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4114  F0F1 ATP synthase subunit beta  82.66 
 
 		 466 aa  785    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.181857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0255  F0F1 ATP synthase subunit beta  93.95 
 
 		 474 aa  881    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0651281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3346  F0F1 ATP synthase subunit beta  84.14 
 
 		 467 aa  811    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.185597  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4132  F0F1 ATP synthase subunit beta  80.73 
 
 		 460 aa  757    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.364679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2797  F0F1 ATP synthase subunit beta  79.14 
 
 		 459 aa  744    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0433  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.96 
 
 		 476 aa  639    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2298  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.87 
 
 		 482 aa  649    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0179  F0F1 ATP synthase subunit beta  84.95 
 
 		 464 aa  814    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.54754  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3074  F0F1 ATP synthase subunit beta  82.58 
 
 		 458 aa  775    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5730  F0F1 ATP synthase subunit beta  79.57 
 
 		 458 aa  745    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.201404  normal  0.43061 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2299  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.3 
 
 		 475 aa  668    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0962572  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0949  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.88 
 
 		 468 aa  636    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.740096  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3131  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.88 
 
 		 468 aa  636    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3288  F0F1 ATP synthase subunit beta  84.98 
 
 		 464 aa  816    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0021  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.59 
 
 		 482 aa  636    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.141679 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3644  F0F1 ATP synthase subunit beta  79.91 
 
 		 462 aa  753    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0562091  hitchhiker  0.000849017 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2014  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.59 
 
 		 462 aa  636    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3818  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.87 
 
 		 474 aa  649    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6356  F0F1 ATP synthase subunit beta  79.57 
 
 		 458 aa  745    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4462  F0F1 ATP synthase subunit beta  79.78 
 
 		 458 aa  758    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.718336  hitchhiker  0.0000000225829 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2165  F0F1 ATP synthase subunit beta  76.14 
 
 		 459 aa  714    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2922  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.46 
 
 		 509 aa  661    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2430  F0F1 ATP synthase subunit beta  79.14 
 
 		 458 aa  750    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0681755  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0372  F0F1 ATP synthase subunit beta  96.34 
 
 		 476 aa  905    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.678758 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0197  F0F1 ATP synthase subunit beta  92.24 
 
 		 471 aa  869    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0310  F0F1 ATP synthase subunit beta  84.95 
 
 		 459 aa  791    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.239632  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119590  ATP synthase beta chain, mitochondrial precursor  67.45 
 
 		 530 aa  637    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.114737  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1226  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.15 
 
 		 474 aa  635    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.877196  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2378  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.44 
 
 		 462 aa  654    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260932 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3308  F0F1 ATP synthase subunit beta  84.95 
 
 		 464 aa  814    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0659546  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0193  F0F1 ATP synthase subunit beta  79.83 
 
 		 475 aa  763    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.196024  normal  0.0120657 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0265  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.53 
 
 		 476 aa  634    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.615567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2402  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.85 
 
 		 481 aa  647    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4495  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.52 
 
 		 481 aa  640    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.632426  normal  0.0177309 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0308  F0F1 ATP synthase subunit beta  94.61 
 
 		 468 aa  890    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0848804 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1049  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.44 
 
 		 474 aa  645    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0106  F0F1 ATP synthase subunit beta  92.44 
 
 		 474 aa  875    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.167239  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3966  F0F1 ATP synthase subunit beta  79.96 
 
 		 470 aa  754    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000531769  normal  0.214208 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4365  F0F1 ATP synthase subunit beta  80.98 
 
 		 463 aa  755    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.853201  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2744  F0F1 ATP synthase subunit beta  84.71 
 
 		 465 aa  806    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.885602  normal  0.206147 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0327  F0F1 ATP synthase subunit beta  93.97 
 
 		 467 aa  881    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.713422  normal  0.632855 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0040  F0F1 ATP synthase subunit beta  85.59 
 
 		 464 aa  817    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0581071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3752  F0F1 ATP synthase subunit beta  80.98 
 
 		 463 aa  761    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00277276  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0559  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.53 
 
 		 476 aa  635    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.29252 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3284  F0F1 ATP synthase subunit beta  79 
 
 		 458 aa  741    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1105  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.7 
 
 		 517 aa  635    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2327  F0F1 ATP synthase subunit beta  79.24 
 
 		 477 aa  755    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.568138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3494  F0F1 ATP synthase subunit beta  85.2 
 
 		 467 aa  810    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000137861  normal  0.623408 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0141  F0F1 ATP synthase subunit beta  73.43 
 
 		 457 aa  695    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.773497  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4130  F0F1 ATP synthase subunit beta  80.77 
 
 		 463 aa  760    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.145707 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2086  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.8 
 
 		 474 aa  642    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.531544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2288  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.82 
 
 		 513 aa  639    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.966957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2949  F0F1 ATP synthase subunit beta  85.38 
 
 		 464 aa  817    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4295  F0F1 ATP synthase subunit beta  80.13 
 
 		 461 aa  751    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.797845  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1939  ATP synthase F1 subunit beta  67.66 
 
 		 482 aa  645    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4366  F0F1 ATP synthase subunit beta  80.98 
 
 		 463 aa  755    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.521445  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3956  F0F1 ATP synthase subunit beta  80.34 
 
 		 463 aa  752    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0165608  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1696  F0F1 ATP synthase subunit beta  80.86 
 
 		 457 aa  761    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1732  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.91 
 
 		 521 aa  636    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.352683  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3925  F0F1 ATP synthase subunit beta  80.34 
 
 		 463 aa  758    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0179078 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4017  F0F1 ATP synthase subunit beta  80.34 
 
 		 463 aa  758    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.436457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2869  F0F1 ATP synthase subunit beta  79.78 
 
 		 458 aa  751    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.761227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4045  F0F1 ATP synthase subunit beta  80.77 
 
 		 463 aa  754    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.632906  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1507  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.52 
 
 		 471 aa  637    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0408  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.02 
 
 		 480 aa  640    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.364668 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0097  F0F1 ATP synthase subunit beta  84.76 
 
 		 464 aa  815    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.26731  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73240  F0F1 ATP synthase subunit beta  79.57 
 
 		 458 aa  745    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3875  F0F1 ATP synthase subunit beta  80.35 
 
 		 464 aa  763    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0480  F0F1 ATP synthase subunit beta  96.98 
 
 		 471 aa  915    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2528  F0F1 ATP synthase subunit beta  77.52 
 
 		 467 aa  739    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0049  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.23 
 
 		 462 aa  640    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.534709  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0106  F0F1 ATP synthase subunit beta  85.38 
 
 		 464 aa  817    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3015  F0F1 ATP synthase subunit beta  84.95 
 
 		 464 aa  814    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.676639  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>