More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4831 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4831  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 		 424 aa  830    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.630346  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2035  secretion protein HlyD  71.5 
 
 		 430 aa  527  1e-148  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.789986  hitchhiker  0.00327746 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2887  RND family efflux transporter MFP subunit  76.05 
 
 		 430 aa  510  1e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.303028  normal  0.0961096 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0501  RND family efflux transporter MFP subunit  71.22 
 
 		 430 aa  494  1e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2066  secretion protein HlyD  68.49 
 
 		 428 aa  476  1e-133  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.567226  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0389  RND family efflux transporter MFP subunit  69.63 
 
 		 434 aa  451  1.0000000000000001e-126  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2256  RND family efflux transporter MFP subunit  66.93 
 
 		 404 aa  445  1.0000000000000001e-124  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0323  RND family efflux transporter MFP subunit  61.73 
 
 		 433 aa  440  9.999999999999999e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0318  efflux transporter, RND family, MFP subunit  65.48 
 
 		 436 aa  436  1e-121  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.199682  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3714  RND family efflux transporter MFP subunit  61.58 
 
 		 408 aa  401  9.999999999999999e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.132208 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3440  secretion protein HlyD  55.5 
 
 		 415 aa  384  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0011  acriflavin resistance lipoprotein A precursor  59.31 
 
 		 398 aa  372  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.511373  normal  0.0259122 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3745  efflux transporter, RND family, MFP subunit  58.2 
 
 		 423 aa  371  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3422  efflux transporter, RND family, MFP subunit  58.2 
 
 		 469 aa  370  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3588  secretion protein HlyD  58.03 
 
 		 415 aa  363  3e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5940  HlyD family secretion protein  51.71 
 
 		 425 aa  344  2e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.591185  normal  0.295801 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0809  secretion protein HlyD  49 
 
 		 392 aa  344  2e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.165865 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3492  RND family efflux transporter MFP subunit  50.75 
 
 		 405 aa  340  4e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.474299  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1849  efflux transporter, RND family, MFP subunit  49.23 
 
 		 422 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00425578 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0569  RND family efflux transporter MFP subunit  52.99 
 
 		 381 aa  335  5.999999999999999e-91  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3399  RND family efflux transporter MFP subunit  48.74 
 
 		 406 aa  331  1e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.852955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5837  secretion protein HlyD  52.62 
 
 		 412 aa  331  2e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.91911  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6204  RND family efflux transporter MFP subunit  52.62 
 
 		 412 aa  331  2e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.103192  hitchhiker  0.00610274 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2638  RND family efflux transporter MFP subunit  51.83 
 
 		 424 aa  330  4e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0551  efflux transporter, RND family, MFP subunit  52.86 
 
 		 411 aa  328  8e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.856573  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2369  efflux transporter, RND family, MFP subunit  49.1 
 
 		 433 aa  328  8e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.137399  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0518  secretion protein HlyD  52.86 
 
 		 412 aa  327  2.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1999  secretion protein HlyD  51.71 
 
 		 424 aa  327  3e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.931394  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2609  RND family efflux transporter MFP subunit  51.71 
 
 		 424 aa  327  3e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0547  efflux transporter, RND family, MFP subunit  51.77 
 
 		 410 aa  326  5e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6607  HlyD family secretion protein  54.22 
 
 		 418 aa  325  1e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.032922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0688  RND family efflux transporter MFP subunit  52.09 
 
 		 431 aa  322  6e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.921638  normal  0.624256 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6680  RND family efflux transporter MFP subunit  54.36 
 
 		 412 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231623  normal  0.121297 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0680  RND family efflux transporter MFP subunit  51.72 
 
 		 420 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.557778  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1127  RND family efflux transporter MFP subunit  45.88 
 
 		 395 aa  320  3.9999999999999996e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.295973  unclonable  0.0000000230672 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2529  RND family efflux transporter MFP subunit  54.07 
 
 		 432 aa  317  3e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.210606 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1018  RND family efflux transporter MFP subunit  50.4 
 
 		 420 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2758  secretion protein HlyD  48.21 
 
 		 385 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.215327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0610  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  50.4 
 
 		 420 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.80065  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0315  RND family efflux transporter MFP subunit  50.4 
 
 		 420 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0859  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  50.4 
 
 		 420 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1011  efflux transporter, RND family, MFP subunit  44.1 
 
 		 395 aa  313  2.9999999999999996e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.279031  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2445  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  50.4 
 
 		 420 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0854  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  50.4 
 
 		 420 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.719076  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0058  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  50.4 
 
 		 420 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0523497  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2656  RND family efflux transporter MFP subunit  53.78 
 
 		 432 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.444245  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2283  secretion protein HlyD  50.89 
 
 		 386 aa  312  6.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00947214 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0506  acriflavine resistance protein A  47.31 
 
 		 409 aa  311  1e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.951175  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2697  multidrug resistance protein  47.81 
 
 		 400 aa  311  1e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0287  acridine efflux pump  47.51 
 
 		 394 aa  311  1e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2937  RND family efflux transporter MFP subunit  51.94 
 
 		 391 aa  311  2e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0383787 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0910  efflux transporter, RND family, MFP subunit  49.87 
 
 		 393 aa  310  2e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0841  efflux transporter, RND family, MFP subunit  49.87 
 
 		 393 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.85215 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0553  acriflavine resistance protein A  47.06 
 
 		 409 aa  310  4e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3067  acriflavine resistance protein A  43.95 
 
 		 395 aa  310  4e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.018659  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3207  RND family efflux transporter MFP subunit  43.95 
 
 		 395 aa  310  4e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.474787  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3258  efflux transporter, RND family, MFP subunit  52.72 
 
 		 410 aa  309  8e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.110627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5599  secretion protein HlyD  45.34 
 
 		 418 aa  309  8e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5963  RND family efflux transporter MFP subunit  45.34 
 
 		 418 aa  309  8e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0363452 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0395  acriflavine resistance protein A  46.8 
 
 		 409 aa  308  9e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2880  multidrug efflux protein  44.58 
 
 		 388 aa  308  1.0000000000000001e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.876487 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3241  efflux transporter, RND family, MFP subunit  44.96 
 
 		 398 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0708  membrane fusion protein, RND efflux pump  52.13 
 
 		 410 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4303  efflux transporter, RND family, MFP subunit  44.71 
 
 		 386 aa  306  6e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2967  multidrug resistance protein  53.12 
 
 		 415 aa  306  6e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5151  efflux transporter, RND family, MFP subunit  49.43 
 
 		 385 aa  305  9.000000000000001e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.206378  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4007  secretion protein HlyD  44.71 
 
 		 386 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.430649  normal  0.0665893 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05530  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexA precursor  45.93 
 
 		 383 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3435  efflux transporter, RND family, MFP subunit  46.99 
 
 		 399 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.169321  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00414  multidrug efflux system  46.79 
 
 		 397 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3147  efflux transporter, RND family, MFP subunit  46.79 
 
 		 397 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.035839  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0497  acriflavine resistance protein A  46.79 
 
 		 397 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3153  RND family efflux transporter MFP subunit  46.79 
 
 		 397 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2893  secretion protein HlyD  49.38 
 
 		 385 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.127871  normal  0.371656 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00419  hypothetical protein  46.79 
 
 		 397 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0525  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexA precursor  45.68 
 
 		 442 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106985  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0539  acriflavine resistance protein A  46.79 
 
 		 397 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3651  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.03 
 
 		 441 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4503  RND family efflux transporter MFP subunit  48.55 
 
 		 384 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.148496 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6463  RND family efflux transporter MFP subunit  45.65 
 
 		 418 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.984064  normal  0.35165 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3680  secretion protein HlyD family protein  46.11 
 
 		 405 aa  303  4.0000000000000003e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3327  RND family efflux transporter MFP subunit  42.03 
 
 		 441 aa  303  5.000000000000001e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0943  RND family efflux transporter MFP subunit  48.6 
 
 		 397 aa  302  9e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2593  multidrug resistance protein, AcrA/AcrE family  49.71 
 
 		 386 aa  301  1e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.800698  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2482  RND family efflux transporter MFP subunit  48.41 
 
 		 391 aa  301  1e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3527  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.27 
 
 		 446 aa  300  4e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3455  efflux transporter, RND family, MFP subunit  50.78 
 
 		 391 aa  299  6e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.297905 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1193  HlyD family secretion protein  45.19 
 
 		 386 aa  299  7e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000622308  normal  0.342064 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2427  RND family efflux transporter MFP subunit  48.2 
 
 		 380 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.412114  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0478  RND family efflux transporter MFP subunit  52.03 
 
 		 416 aa  298  1e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350722  normal  0.0228976 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2314  RND family efflux transporter MFP subunit  50.78 
 
 		 391 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3499  RND family efflux transporter MFP subunit  51.8 
 
 		 395 aa  298  2e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0344164  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3715  RND family efflux transporter MFP subunit  46.7 
 
 		 382 aa  298  2e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.970475  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1070  efflux transporter, RND family, MFP subunit  49.42 
 
 		 397 aa  297  2e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00558937  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4472  RND family efflux transporter MFP subunit  43.31 
 
 		 447 aa  296  3e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0821721 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3560  acriflavine resistance protein E  44.76 
 
 		 385 aa  295  7e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0550362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3648  acriflavine resistance protein E  45.03 
 
 		 385 aa  295  1e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.444601  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1418  secretion protein HlyD  49.74 
 
 		 400 aa  294  2e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3699  RND family efflux transporter MFP subunit  46.35 
 
 		 390 aa  294  2e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3458  acriflavine resistance protein E  44.76 
 
 		 385 aa  293  4e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000310651  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>