More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4796 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001301  ANIA_06835  cytochrome P450, putative (Eurofung)  38.11 
 
 
1083 aa  659    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4796  cytochrome P450  100 
 
 
1074 aa  2212    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5109  cytochrome P450  47.7 
 
 
1071 aa  916    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3231  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  47.09 
 
 
1006 aa  917    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3239  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  46.62 
 
 
1065 aa  944    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.113177  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2993  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  46.45 
 
 
1065 aa  941    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2981  NADPH-cytochrome P450 reductase  46.22 
 
 
1065 aa  941    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.313998  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2921  NADPH-cytochrome P450 reductase  46.45 
 
 
1065 aa  940    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3250  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  46.44 
 
 
1065 aa  943    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.95935  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2522  cytochrome P450  44.67 
 
 
1053 aa  868    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6803  cytochrome P450  41.64 
 
 
1063 aa  775    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.670423 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0268  cytochrome P450  40.44 
 
 
1059 aa  758    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3221  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  46.45 
 
 
1065 aa  941    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3229  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  46.54 
 
 
1065 aa  941    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3645  FAD-binding oxidoreductase  55.68 
 
 
1072 aa  1167    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.368759  normal  0.294023 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1820  cytochrome P450  55.55 
 
 
1075 aa  1180    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3467  cytochrome P450  41.18 
 
 
1064 aa  731    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4368  cytochrome P450  42.13 
 
 
1079 aa  743    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0838268  normal  0.451941 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2612  cytochrome P450  47.22 
 
 
1075 aa  914    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00689158  normal  0.012939 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6421  cytochrome P450  44.59 
 
 
1055 aa  857    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.018533 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2016  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  46.72 
 
 
1065 aa  944    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2936  cytochrome P450  46.63 
 
 
1065 aa  940    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.807105  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4258  cytochrome P450  42.13 
 
 
1079 aa  743    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.192468  normal  0.353505 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2602  cytochrome P450  36.99 
 
 
1096 aa  622  1e-176  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000391794  hitchhiker  0.00294815 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2584  FAD-binding domain protein  45.94 
 
 
521 aa  380  1e-104  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.318786  normal  0.0303893 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3962  cytochrome P450  37.63 
 
 
486 aa  325  2e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00595  NADPH--cytochrome P450 reductase (Eurofung)  30.19 
 
 
695 aa  270  1e-70  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1259  molybdopterin oxidoreductase  33 
 
 
1257 aa  261  4e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.804791  normal  0.0187222 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4801  cytochrome P450  40.76 
 
 
458 aa  260  8e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.788631  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_46903  predicted protein  31.91 
 
 
561 aa  243  1e-62  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.160153 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77786  predicted protein  29.17 
 
 
675 aa  243  2e-62  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.154992  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9283  predicted protein  31.08 
 
 
623 aa  241  6.999999999999999e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.101127  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3807  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  31.86 
 
 
591 aa  239  3e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0251884 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6268  Nitric oxide synthase NOS  32.64 
 
 
1524 aa  237  9e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0776  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  32.17 
 
 
594 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1302  molybdopterin oxidoreductase  35.06 
 
 
1338 aa  236  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.791008 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1703  molybdopterin oxidoreductase  33.1 
 
 
1357 aa  236  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.2815 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4880  cytochrome P450  32.05 
 
 
464 aa  228  5.0000000000000005e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1770  molybdopterin oxidoreductase  35.17 
 
 
1394 aa  226  2e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0309544  normal  0.0148137 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2200  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  31.05 
 
 
607 aa  226  2e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2191  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  29.95 
 
 
614 aa  225  3e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3738  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  32.3 
 
 
607 aa  224  6e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4016  molybdopterin oxidoreductase  33.51 
 
 
1341 aa  224  8e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.115945  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0665  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  31.35 
 
 
594 aa  223  1.9999999999999999e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000314937 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3064  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  31.78 
 
 
599 aa  222  3e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.286269  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4039  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  31.57 
 
 
610 aa  221  5e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_44507  predicted protein  31.18 
 
 
563 aa  220  1e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3193  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  30.13 
 
 
596 aa  219  2.9999999999999998e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0653  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  31.92 
 
 
598 aa  217  9.999999999999999e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.988648  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3080  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  32.21 
 
 
604 aa  216  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.274835  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND01320  electron transporter, putative  28.14 
 
 
741 aa  215  3.9999999999999995e-54  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4122  molybdopterin oxidoreductase  34.21 
 
 
1405 aa  214  5.999999999999999e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0706903  normal  0.0956254 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0682  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  31.88 
 
 
613 aa  213  1e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0919  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  30.7 
 
 
599 aa  213  2e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1331  molybdopterin oxidoreductase  34.46 
 
 
1342 aa  213  2e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0643917 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0892  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  31.88 
 
 
604 aa  213  2e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0953  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  30.92 
 
 
599 aa  213  2e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2696  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  32.61 
 
 
600 aa  212  4e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_50814  predicted protein  35.29 
 
 
401 aa  211  4e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0259055 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0546  molybdopterin oxidoreductase  32.1 
 
 
1409 aa  211  6e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0944  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  30.87 
 
 
599 aa  211  7e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2733  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  33.77 
 
 
584 aa  211  7e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.461724  hitchhiker  0.00000324313 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0932  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  31.81 
 
 
599 aa  210  9e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.520918  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3416  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  30.87 
 
 
599 aa  211  9e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0773  molybdopterin oxidoreductase  31.78 
 
 
1407 aa  210  1e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0855  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  31.77 
 
 
604 aa  210  1e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.111088  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4398  molybdopterin oxidoreductase  34.79 
 
 
1397 aa  210  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0909646  normal  0.0233897 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03589  sulfite reductase, alpha subunit (flavoprotein)  31.38 
 
 
608 aa  209  2e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.715854  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0431  flavodoxin domain-containing protein  32.31 
 
 
883 aa  209  3e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1906  FAD-binding domain protein  31.82 
 
 
628 aa  208  4e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2839  sulfite reductase subunit alpha  32.05 
 
 
602 aa  207  6e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3934  molybdopterin oxidoreductase  34.45 
 
 
1397 aa  207  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4759  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  29.48 
 
 
612 aa  206  2e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3434  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  28.89 
 
 
600 aa  205  3e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00417124 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5020  molybdopterin oxidoreductase  33.16 
 
 
1396 aa  204  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0317  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  30.24 
 
 
1383 aa  202  3e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4149  molybdopterin oxidoreductase  33.54 
 
 
1405 aa  201  5e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.639229  normal  0.059871 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5661  molybdopterin oxidoreductase  31.25 
 
 
1400 aa  201  5e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0590  sulphite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  31.67 
 
 
613 aa  201  7.999999999999999e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.257613  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2212  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  31.99 
 
 
1401 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.022132  normal  0.0161111 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1395  molybdopterin oxidoreductase  30.69 
 
 
1384 aa  199  2.0000000000000003e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.427794  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1172  nitrate reductase  32.42 
 
 
1427 aa  199  3e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0614569  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1985  molybdopterin oxidoreductase  32.37 
 
 
1403 aa  199  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.279834 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2427  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  31.33 
 
 
608 aa  197  7e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.032742 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1084  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  32.42 
 
 
1418 aa  196  1e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0241  FdhF  31.9 
 
 
1398 aa  196  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.322572  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3491  molybdopterin oxidoreductase  33.16 
 
 
1312 aa  197  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.421 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1247  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  32.42 
 
 
1418 aa  196  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.845678  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02133  sulfite reductase  33.05 
 
 
615 aa  196  2e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.887727  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0080  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  32.42 
 
 
1418 aa  196  2e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.567377  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0340  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  32.42 
 
 
1418 aa  196  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.270767  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1752  nitrate reductase, putative  32.42 
 
 
1418 aa  196  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0512469  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40283  predicted protein  27.1 
 
 
633 aa  195  3e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3016  molybdopterin oxidoreductase  33.33 
 
 
1317 aa  195  3e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.253668  normal  0.632425 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1663  nitrate reductase, putative  32.42 
 
 
1418 aa  195  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3365  sulfite reductase subunit alpha  29.4 
 
 
609 aa  193  1e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.834699  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4232  sulfite reductase  35.52 
 
 
539 aa  194  1e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0827  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  29.37 
 
 
607 aa  193  1e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1346  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  33.05 
 
 
1395 aa  192  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.635163 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1381  molybdopterin oxidoreductase  31.97 
 
 
1232 aa  192  4e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>