More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4789 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4789  formyltetrahydrofolate deformylase  100 
 
 		 285 aa  591  1e-168  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.284642  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0419  formyltetrahydrofolate deformylase  83.63 
 
 		 282 aa  494  1e-139  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0700542  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0297  formyltetrahydrofolate deformylase  84.23 
 
 		 282 aa  496  1e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.338729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0428  formyltetrahydrofolate deformylase  83.63 
 
 		 282 aa  494  1e-139  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1081  formyltetrahydrofolate deformylase  85.05 
 
 		 307 aa  487  1e-137  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0648  formyltetrahydrofolate deformylase  82.21 
 
 		 282 aa  487  1e-137  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.101006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0438  formyltetrahydrofolate deformylase  82.8 
 
 		 282 aa  486  1e-136  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.275251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0609  formyltetrahydrofolate deformylase  79.36 
 
 		 282 aa  478  1e-134  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0706  formyltetrahydrofolate deformylase  81.14 
 
 		 282 aa  477  1e-134  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3290  formyltetrahydrofolate deformylase  76.16 
 
 		 282 aa  457  9.999999999999999e-129  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.38752 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4112  formyltetrahydrofolate deformylase  65.97 
 
 		 289 aa  378  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0336  formyltetrahydrofolate deformylase  66.08 
 
 		 287 aa  375  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0606  formyltetrahydrofolate deformylase  65.62 
 
 		 289 aa  376  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930988 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1873  formyltetrahydrofolate deformylase  65.14 
 
 		 288 aa  369  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00824927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2699  formyltetrahydrofolate deformylase  62.8 
 
 		 294 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.622702  normal  0.252245 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2841  formyltetrahydrofolate deformylase  62.8 
 
 		 294 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1752  formyltetrahydrofolate deformylase  64.44 
 
 		 288 aa  367  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2074  formyltetrahydrofolate deformylase  64.66 
 
 		 288 aa  367  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.437396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6111  formyltetrahydrofolate deformylase  63.7 
 
 		 294 aa  367  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.481987  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2792  formyltetrahydrofolate deformylase  63.01 
 
 		 294 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.329734 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0534  formyltetrahydrofolate deformylase  62.8 
 
 		 294 aa  366  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2167  formyltetrahydrofolate deformylase  63.01 
 
 		 294 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2781  formyltetrahydrofolate deformylase  63.01 
 
 		 294 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.184484  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0127  formyltetrahydrofolate deformylase  63.7 
 
 		 282 aa  365  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.236113  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0591  formyltetrahydrofolate deformylase  64.58 
 
 		 293 aa  363  1e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.232311  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0777  formyltetrahydrofolate deformylase  64.58 
 
 		 293 aa  363  1e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0607  formyltetrahydrofolate deformylase  64.58 
 
 		 293 aa  363  1e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2236  formyltetrahydrofolate deformylase  62.72 
 
 		 288 aa  363  1e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.209687  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0496  formyltetrahydrofolate deformylase  63.89 
 
 		 293 aa  363  2e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.275042  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3097  formyltetrahydrofolate deformylase  64.58 
 
 		 293 aa  362  3e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2211  formyltetrahydrofolate deformylase  62.37 
 
 		 288 aa  362  3e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308703  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2952  formyltetrahydrofolate deformylase  64.58 
 
 		 293 aa  362  3e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.855251  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0066  formyltetrahydrofolate deformylase  64.58 
 
 		 293 aa  362  3e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1524  formyltetrahydrofolate deformylase  64.58 
 
 		 293 aa  362  3e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0213  formyltetrahydrofolate deformylase  63.35 
 
 		 283 aa  357  9.999999999999999e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.543031 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1303  formyltetrahydrofolate deformylase  61.69 
 
 		 295 aa  356  2.9999999999999997e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.154885 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3983  formyltetrahydrofolate deformylase  61.4 
 
 		 285 aa  355  5e-97  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.523347 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28050  formyltetrahydrofolate deformylase  61.7 
 
 		 302 aa  351  5.9999999999999994e-96  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0961827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0154  formyltetrahydrofolate deformylase  60.71 
 
 		 283 aa  351  8e-96  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00603763  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2993  formyltetrahydrofolate deformylase  61.15 
 
 		 280 aa  350  2e-95  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7341  formyltetrahydrofolate deformylase  59.57 
 
 		 284 aa  347  1e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0997377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0690  formyltetrahydrofolate deformylase  59.09 
 
 		 286 aa  346  2e-94  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2544  formyltetrahydrofolate deformylase  60.65 
 
 		 282 aa  344  8.999999999999999e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.553017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3546  formyltetrahydrofolate deformylase  59.66 
 
 		 295 aa  343  2e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.299703  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2508  formyltetrahydrofolate deformylase  59.52 
 
 		 288 aa  337  9e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.257697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1114  formyltetrahydrofolate deformylase  59.29 
 
 		 286 aa  337  9.999999999999999e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.851375  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3853  formyltetrahydrofolate deformylase  60.21 
 
 		 287 aa  335  5e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.565594  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8736  formyltetrahydrofolate deformylase  60.07 
 
 		 294 aa  335  5.999999999999999e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.52802  normal  0.356392 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1188  formyltetrahydrofolate deformylase  58.99 
 
 		 286 aa  331  8e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000131662 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1100  formyltetrahydrofolate deformylase  58.06 
 
 		 283 aa  331  8e-90  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.862849  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1192  formyltetrahydrofolate deformylase  58.42 
 
 		 283 aa  330  1e-89  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2830  formyltetrahydrofolate deformylase  55.2 
 
 		 294 aa  330  1e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.694192  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00495  formyltetrahydrofolate deformylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11620)  57.64 
 
 		 289 aa  329  3e-89  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.39908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3717  formyltetrahydrofolate deformylase  56.14 
 
 		 309 aa  329  3e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6004  formyltetrahydrofolate deformylase  55.4 
 
 		 293 aa  328  4e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.91162  normal  0.0315018 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4704  formyltetrahydrofolate deformylase  56.25 
 
 		 289 aa  328  4e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.452468  normal  0.348836 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4206  formyltetrahydrofolate deformylase  54.84 
 
 		 294 aa  328  5.0000000000000004e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3310  formyltetrahydrofolate deformylase  55.04 
 
 		 294 aa  328  6e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6011  formyltetrahydrofolate deformylase  54.26 
 
 		 294 aa  327  1.0000000000000001e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1458  formyltetrahydrofolate deformylase  56.12 
 
 		 294 aa  327  1.0000000000000001e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5200  formyltetrahydrofolate deformylase  56.94 
 
 		 281 aa  327  1.0000000000000001e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.569737 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2613  formyltetrahydrofolate deformylase  56.47 
 
 		 294 aa  327  1.0000000000000001e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.705504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4904  formyltetrahydrofolate deformylase  56.47 
 
 		 294 aa  327  1.0000000000000001e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.500086 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0748  formyltetrahydrofolate deformylase  55.99 
 
 		 291 aa  326  2.0000000000000001e-88  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.811069  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6579  formyltetrahydrofolate deformylase  53.76 
 
 		 294 aa  325  6e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4957  normal  0.0500835 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4496  formyltetrahydrofolate deformylase  53.76 
 
 		 294 aa  325  8.000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5642  formyltetrahydrofolate deformylase  54.15 
 
 		 294 aa  324  9e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.60464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1628  formyltetrahydrofolate deformylase  52.98 
 
 		 298 aa  323  2e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0459247  normal  0.542854 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0411  formyltetrahydrofolate deformylase  56.75 
 
 		 295 aa  323  2e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.789305  normal  0.762078 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2356  formyltetrahydrofolate deformylase  61.21 
 
 		 285 aa  323  3e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3590  formyltetrahydrofolate deformylase  57.39 
 
 		 298 aa  322  5e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0643  formyltetrahydrofolate deformylase  57.75 
 
 		 284 aa  321  8e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03765  formyltetrahydrofolate deformylase  59.7 
 
 		 263 aa  317  1e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3699  formyltetrahydrofolate deformylase  56.69 
 
 		 303 aa  317  1e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0909  formyltetrahydrofolate deformylase  54.8 
 
 		 294 aa  316  2e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0852  formyltetrahydrofolate deformylase  54.8 
 
 		 294 aa  316  2e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.631909  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0556  formyltetrahydrofolate deformylase  57.8 
 
 		 297 aa  316  3e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2873  formyltetrahydrofolate deformylase  55.91 
 
 		 282 aa  315  4e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.571166  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1591  formyltetrahydrofolate deformylase  56.18 
 
 		 284 aa  315  5e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1145  formyltetrahydrofolate deformylase  55.71 
 
 		 287 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.857181  normal  0.75307 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2971  formyltetrahydrofolate deformylase  52.88 
 
 		 294 aa  311  6.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.266607 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0189  formyltetrahydrofolate deformylase  54.96 
 
 		 284 aa  311  7.999999999999999e-84  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00979575 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2891  formyltetrahydrofolate deformylase  54.23 
 
 		 283 aa  311  1e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.954133  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3470  formyltetrahydrofolate deformylase  53.82 
 
 		 288 aa  310  2e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04640  formyltetrahydrofolate deformylase  55.12 
 
 		 301 aa  308  5e-83  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.432525  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3621  formyltetrahydrofolate deformylase  53.68 
 
 		 284 aa  308  5e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.155921  normal  0.0233728 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2094  formyltetrahydrofolate deformylase  50.53 
 
 		 298 aa  308  5.9999999999999995e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0689957  normal  0.0344586 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1837  formyltetrahydrofolate deformylase  54.58 
 
 		 290 aa  306  2.0000000000000002e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.457824  normal  0.78955 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1110  formyltetrahydrofolate deformylase  53.77 
 
 		 303 aa  306  4.0000000000000004e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.344472  normal  0.241232 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3457  formyltetrahydrofolate deformylase  54.45 
 
 		 284 aa  305  6e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2603  formyltetrahydrofolate deformylase  51.07 
 
 		 294 aa  305  7e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.426643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0944  formyltetrahydrofolate deformylase  51.07 
 
 		 294 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2376  formyltetrahydrofolate deformylase  53.76 
 
 		 293 aa  303  3.0000000000000004e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0552536 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5709  formyltetrahydrofolate deformylase  55 
 
 		 287 aa  302  4.0000000000000003e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.506805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1153  formyltetrahydrofolate deformylase  52.48 
 
 		 284 aa  302  4.0000000000000003e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.677496  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2106  formyltetrahydrofolate deformylase  54.42 
 
 		 288 aa  302  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.815168  normal  0.379054 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3462  formyltetrahydrofolate deformylase  53 
 
 		 306 aa  302  5.000000000000001e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2226  formyltetrahydrofolate deformylase  53.74 
 
 		 288 aa  301  7.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0326176  normal  0.659595 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1883  formyltetrahydrofolate deformylase  54.45 
 
 		 291 aa  300  1e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0189555 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2382  formyltetrahydrofolate deformylase  55.36 
 
 		 285 aa  298  6e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>