More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4779 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  100 
 
 		 324 aa  656    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1128  hypothetical protein  77.78 
 
 		 324 aa  529  1e-149  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.794936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0744  hypothetical protein  73.85 
 
 		 325 aa  504  9.999999999999999e-143  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.61051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4631  hypothetical protein  71.38 
 
 		 325 aa  468  1.0000000000000001e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0441  hypothetical protein  67.9 
 
 		 322 aa  425  1e-118  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0368157  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0450  hypothetical protein  67.69 
 
 		 322 aa  424  1e-117  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.697568  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5108  hypothetical protein  63.11 
 
 		 324 aa  417  9.999999999999999e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.031393  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  55.03 
 
 		 338 aa  349  3e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2999  hypothetical protein  50.33 
 
 		 324 aa  323  2e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.272534 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4537  hypothetical protein  52.16 
 
 		 319 aa  321  9.000000000000001e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000308592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3347  hypothetical protein  43.75 
 
 		 330 aa  297  2e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.261888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0062  hypothetical protein  50.85 
 
 		 341 aa  295  6e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3597  hypothetical protein  46.89 
 
 		 323 aa  295  1e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4931  extra-cytoplasmic solute receptor  47.33 
 
 		 330 aa  294  2e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.875929 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5277  hypothetical protein  47.02 
 
 		 327 aa  292  5e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450812  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  45.06 
 
 		 328 aa  292  6e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  45.06 
 
 		 328 aa  292  6e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0983  hypothetical protein  48.76 
 
 		 339 aa  291  8e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0688  hypothetical protein  47.06 
 
 		 326 aa  286  4e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.502545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1547  hypothetical protein  45.54 
 
 		 324 aa  283  4.0000000000000003e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  45.4 
 
 		 325 aa  281  1e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  46.05 
 
 		 325 aa  278  9e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1021  hypothetical protein  44.85 
 
 		 323 aa  275  8e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.345353  normal  0.559311 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  42.11 
 
 		 328 aa  274  1.0000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  43.23 
 
 		 330 aa  273  4.0000000000000004e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1019  hypothetical protein  45.96 
 
 		 334 aa  272  7e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.100584  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  43.12 
 
 		 358 aa  271  1e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  43.75 
 
 		 326 aa  271  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  43.79 
 
 		 330 aa  271  1e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0795  hypothetical protein  44.31 
 
 		 346 aa  270  2e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  44.71 
 
 		 336 aa  270  2e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  42.64 
 
 		 332 aa  270  2.9999999999999997e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  44.63 
 
 		 339 aa  269  4e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  44.19 
 
 		 333 aa  269  5.9999999999999995e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  43.29 
 
 		 339 aa  268  8e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0578  hypothetical protein  44.79 
 
 		 327 aa  268  1e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  45.97 
 
 		 353 aa  267  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  42.41 
 
 		 356 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  42.02 
 
 		 331 aa  266  5e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  44.74 
 
 		 332 aa  265  8e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  43.93 
 
 		 339 aa  265  1e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  44.48 
 
 		 324 aa  263  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  43.52 
 
 		 328 aa  263  3e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  43.23 
 
 		 333 aa  263  3e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  41.3 
 
 		 322 aa  261  8.999999999999999e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  42.06 
 
 		 323 aa  261  1e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5733  hypothetical protein  45 
 
 		 341 aa  261  2e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558781 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0779  hypothetical protein  44.33 
 
 		 335 aa  259  4e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  44.97 
 
 		 355 aa  258  8e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  44.52 
 
 		 330 aa  258  8e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  41.64 
 
 		 324 aa  258  1e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  40.94 
 
 		 327 aa  258  1e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4645  extra-cytoplasmic solute receptor  42.77 
 
 		 348 aa  258  1e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  43.12 
 
 		 334 aa  257  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  40.94 
 
 		 328 aa  257  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3194  hypothetical protein  42.59 
 
 		 318 aa  257  2e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  44.37 
 
 		 310 aa  257  2e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3792  extra-cytoplasmic solute receptor  43.52 
 
 		 326 aa  257  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  40 
 
 		 329 aa  256  3e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  43.96 
 
 		 335 aa  255  7e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3017  hypothetical protein  41.9 
 
 		 326 aa  255  8e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0135549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3250  hypothetical protein  43.14 
 
 		 330 aa  255  9e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.268792 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  41.59 
 
 		 331 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  42.17 
 
 		 345 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7860  hypothetical protein  40.92 
 
 		 324 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.266797 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0843  hypothetical protein  40.43 
 
 		 324 aa  254  1.0000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  42.17 
 
 		 345 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  45.05 
 
 		 349 aa  253  2.0000000000000002e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  41.27 
 
 		 351 aa  253  3e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3216  hypothetical protein  43.65 
 
 		 332 aa  253  3e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  42.06 
 
 		 336 aa  253  3e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  44.82 
 
 		 325 aa  252  5.000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  40.5 
 
 		 336 aa  252  6e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  42.81 
 
 		 328 aa  252  7e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  42.09 
 
 		 325 aa  252  7e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  43.62 
 
 		 324 aa  251  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3798  hypothetical protein  41.3 
 
 		 326 aa  251  1e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.226331  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2898  hypothetical protein  42.62 
 
 		 334 aa  251  2e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000220815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  41.54 
 
 		 344 aa  251  2e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  41.54 
 
 		 323 aa  250  2e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0619  hypothetical protein  42.94 
 
 		 325 aa  250  3e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0038  hypothetical protein  41.77 
 
 		 332 aa  249  3e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.914226 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  40.2 
 
 		 325 aa  249  3e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5284  hypothetical protein  41.93 
 
 		 330 aa  250  3e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.145464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  42.86 
 
 		 326 aa  249  4e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3869  hypothetical protein  42.28 
 
 		 332 aa  249  4e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0415956  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  41.47 
 
 		 330 aa  249  5e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  40.99 
 
 		 332 aa  249  6e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  41.45 
 
 		 328 aa  249  6e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  39.61 
 
 		 332 aa  249  6e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  41.95 
 
 		 337 aa  249  6e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  42.64 
 
 		 335 aa  248  7e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2023  hypothetical protein  40.56 
 
 		 327 aa  248  8e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0638  twin-arginine translocation pathway signal  40.43 
 
 		 330 aa  248  9e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  44 
 
 		 330 aa  248  9e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  44 
 
 		 330 aa  248  9e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2068  hypothetical protein  41.8 
 
 		 342 aa  248  1e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.233928  normal  0.741427 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3331  hypothetical protein  42.62 
 
 		 336 aa  248  1e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  41.95 
 
 		 331 aa  248  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5968  hypothetical protein  41.07 
 
 		 344 aa  248  1e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>