188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4755 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_4755  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  100 
 
 
195 aa  406  1e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.192202  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1267  putative NAD(P)H dehydrogenase (quinone) protein  58.76 
 
 
194 aa  231  6e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.497148 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1100  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  56.48 
 
 
195 aa  209  2e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.242851  normal  0.752323 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2033  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  55.44 
 
 
195 aa  205  3e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131158  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1714  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  54.92 
 
 
195 aa  204  7e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.6817  normal  0.668833 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1673  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  51.55 
 
 
193 aa  200  1e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  8.46124e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3555  NAD(P)H dehydrogenase protein  50.52 
 
 
193 aa  194  6e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.438204  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4668  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  48.97 
 
 
193 aa  188  5e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.588797 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1476  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  47.15 
 
 
193 aa  182  3e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1379  quinone dependent NADH dehydrogenase  48.7 
 
 
195 aa  179  2e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.144954  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7957  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  41.75 
 
 
195 aa  169  3e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.507514  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3280  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  43.81 
 
 
194 aa  161  5e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0657  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  45.18 
 
 
196 aa  161  7e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.578822 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3056  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  43.3 
 
 
194 aa  160  1e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3256  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  45.36 
 
 
194 aa  159  3e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.144602  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1378  quinone dependent NAD(P)H dehydrogenase  39.8 
 
 
211 aa  150  1e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.367665  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5137  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  43.15 
 
 
196 aa  147  1e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1477  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.78 
 
 
209 aa  145  5e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3142  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  41.75 
 
 
196 aa  144  8e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.2125 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4550  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  41.05 
 
 
197 aa  141  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.617173  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3499  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.95 
 
 
196 aa  136  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3697  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.07 
 
 
197 aa  128  5e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0869271  normal  0.563531 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0705  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.69 
 
 
195 aa  120  1e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4047  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.21 
 
 
256 aa  94.7  7e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.984998  hitchhiker  0.00915897 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2353  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  39.42 
 
 
244 aa  90.1  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.216649  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1125  ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  39.45 
 
 
200 aa  90.1  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5095  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  42.2 
 
 
193 aa  88.6  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.160737  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0714  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.24 
 
 
191 aa  88.2  7e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0139  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  33.12 
 
 
193 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.277932  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4666  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.5 
 
 
193 aa  86.3  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5100  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  41.28 
 
 
193 aa  87  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.203676  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4683  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  41.28 
 
 
193 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000925813  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5101  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  41.28 
 
 
193 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5061  hypothetical protein  32.5 
 
 
193 aa  85.9  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4826  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  41.28 
 
 
193 aa  85.5  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109009  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3358  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  33.33 
 
 
191 aa  85.5  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3112  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  33.33 
 
 
191 aa  85.5  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.460138  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3331  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  33.33 
 
 
191 aa  85.5  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5191  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  41.28 
 
 
193 aa  85.5  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.174213  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1688  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.52 
 
 
205 aa  85.1  6e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.468133 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4778  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  40.37 
 
 
193 aa  85.1  7e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3035  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.89 
 
 
191 aa  84.3  1e-15  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.700131  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3317  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  38.89 
 
 
191 aa  83.6  2e-15  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2320  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.52 
 
 
198 aa  82.4  3e-15  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.304506  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0238  putative NADPH-quinone reductase (modulator of drug activity B)  27.88 
 
 
193 aa  82.8  3e-15  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000322122  hitchhiker  7.73634e-09 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2187  ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  37.9 
 
 
233 aa  82.4  4e-15  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.415147  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1921  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  37.96 
 
 
191 aa  82.4  4e-15  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3310  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  37.96 
 
 
191 aa  82.4  4e-15  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0066019  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0727  putative NADPH-quinone reductase (modulator of drug activity B)  29.79 
 
 
198 aa  82  5e-15  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3002  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  38.89 
 
 
191 aa  82  5e-15  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0168994  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3099  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.79 
 
 
191 aa  82  6e-15  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.426933  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3330  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  32.79 
 
 
191 aa  82  6e-15  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0147  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.84 
 
 
249 aa  80.9  1e-14  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.280917  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1767  putative NADPH-quinone reductase (modulator of drug activity B)  25.89 
 
 
189 aa  79.7  2e-14  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3662  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.29 
 
 
204 aa  80.5  2e-14  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0914759  normal  0.143525 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3453  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.64 
 
 
192 aa  79.7  2e-14  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  4.56035e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04777  NAD(P)H quinone oxidoreductase  34.17 
 
 
222 aa  79.3  3e-14  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1308  putative NAD(P)H oxidoreductase(quinone)  31.37 
 
 
213 aa  79.7  3e-14  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.274882 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2966  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.82 
 
 
192 aa  79.3  3e-14  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2044  ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  36.29 
 
 
235 aa  79  4e-14  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.747837  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3720  ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  36.29 
 
 
235 aa  79  4e-14  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.405823  normal  0.727928 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0006  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.44 
 
 
197 aa  78.6  5e-14  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0938548  normal  0.382985 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3275  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.23 
 
 
204 aa  78.6  5e-14  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2789  oxidoreductase, putative  33.82 
 
 
201 aa  78.6  6e-14  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.287976  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1013  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.43 
 
 
193 aa  77.8  9e-14  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00015307  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3318  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.1 
 
 
237 aa  77.8  1e-13  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1730  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  30.41 
 
 
204 aa  77  2e-13  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6041  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.52 
 
 
216 aa  77  2e-13  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0823  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.06 
 
 
266 aa  76.3  2e-13  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0321  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.85 
 
 
206 aa  76.3  3e-13  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2640  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.69 
 
 
192 aa  75.9  3e-13  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.236166  normal  0.823408 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1711  Ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  33.07 
 
 
263 aa  75.9  4e-13  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3797  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30 
 
 
266 aa  75.5  5e-13  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000333556 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5228  Ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  31.11 
 
 
272 aa  75.1  5e-13  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.214443  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6111  NAD(P)H dehydrogenase quinone family protein  31.06 
 
 
262 aa  75.1  6e-13  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.509038 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0573  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  32.86 
 
 
206 aa  75.1  6e-13  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2110  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.85 
 
 
292 aa  74.7  7e-13  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3066  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.81 
 
 
198 aa  74.3  9e-13  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4131  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.3 
 
 
259 aa  74.3  9e-13  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1407  ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  31.82 
 
 
265 aa  74.3  1e-12  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.458712 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4021  Ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  30.15 
 
 
261 aa  73.9  1e-12  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0199607  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3342  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.53 
 
 
230 aa  73.6  2e-12  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.241608  normal  0.325854 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19550  putative NADPH-quinone reductase (modulator of drug activity B)  33.54 
 
 
265 aa  72.4  4e-12  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.154769  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6287  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.2 
 
 
198 aa  72.4  4e-12  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4963  ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  29.23 
 
 
259 aa  72.4  4e-12  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1713  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.54 
 
 
268 aa  72  5e-12  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0109  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  40.65 
 
 
223 aa  71.2  8e-12  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.12066  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2283  Ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  33.85 
 
 
263 aa  71.2  9e-12  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0096  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.72 
 
 
199 aa  70.9  1e-11  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  1.10916e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2460  ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  31.06 
 
 
258 aa  70.5  1e-11  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2044  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.23 
 
 
265 aa  70.9  1e-11  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2561  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.35 
 
 
259 aa  70.9  1e-11  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1404  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.35 
 
 
259 aa  70.9  1e-11  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.411972 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1362  ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  34.13 
 
 
259 aa  69.7  2e-11  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0148022  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2332  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.01 
 
 
262 aa  70.1  2e-11  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0396  quinone family oxidoreductase/NAD(P)H dehydrogenase  26.6 
 
 
192 aa  70.5  2e-11  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.030635  normal  0.183286 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5496  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.32 
 
 
261 aa  70.1  2e-11  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.993327 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2525  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.8 
 
 
191 aa  69.7  2e-11  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.280985  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2368  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.52 
 
 
232 aa  69.7  2e-11  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20800  NAD(P)H quinone oxidoreductase  27.48 
 
 
265 aa  69.7  3e-11  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0689455  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>