More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4723 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3892  AMP-binding domain protein  61.2 
 
 		 576 aa  716    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.239396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0318  AMP-binding domain protein  60.04 
 
 		 571 aa  687    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.922079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3764  AMP-binding domain protein  77.84 
 
 		 578 aa  910    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3458  acyl-CoA synthetase  56.83 
 
 		 562 aa  660    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.220235 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0442  AMP-binding domain protein  59.93 
 
 		 571 aa  681    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.89643  normal  0.841381 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3025  AMP-binding domain protein  60.53 
 
 		 576 aa  708    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0470  AMP-binding domain protein  78.38 
 
 		 579 aa  914    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.500012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2311  acyl-CoA synthetase  56.29 
 
 		 557 aa  653    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.462118  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2083  AMP-dependent synthetase and ligase  59.34 
 
 		 544 aa  665    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0108  AMP-binding domain protein  61.95 
 
 		 575 aa  730    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2959  AMP-binding domain protein  60.07 
 
 		 576 aa  711    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0308  AMP-binding domain protein  66.43 
 
 		 584 aa  788    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0462  AMP-binding domain protein  60.46 
 
 		 564 aa  701    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1467  AMP-binding domain protein  61.77 
 
 		 578 aa  705    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2479  acyl-CoA synthetase  56.65 
 
 		 557 aa  660    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.282098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0124  AMP-binding domain protein  61.24 
 
 		 575 aa  714    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0176  AMP-binding domain protein  60.07 
 
 		 576 aa  711    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.970705  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3655  AMP-binding domain protein  57.55 
 
 		 565 aa  652    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0315072 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34080  AMP-binding domain protein  58.39 
 
 		 552 aa  664    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.448325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2068  AMP-binding domain protein  68.19 
 
 		 596 aa  790    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3290  AMP-binding domain protein  61.77 
 
 		 575 aa  728    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0807  AMP-dependent synthetase and ligase  57.66 
 
 		 551 aa  656    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.472076  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3108  AMP-binding domain protein  59.78 
 
 		 546 aa  684    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.580008  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1448  AMP-dependent synthetase and ligase  58.88 
 
 		 596 aa  657    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2361  AMP-dependent synthetase and ligase  56.96 
 
 		 550 aa  642    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.727031  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3306  AMP-binding domain protein  60.6 
 
 		 576 aa  710    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63972  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3009  AMP-binding domain protein  58.32 
 
 		 546 aa  670    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0580  AMP-binding domain protein  59.4 
 
 		 576 aa  694    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.566618  normal  0.942666 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3209  AMP-binding domain protein  59.6 
 
 		 546 aa  682    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.609491  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1086  AMP-dependent synthetase and ligase  55.61 
 
 		 566 aa  644    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1693  AMP-binding domain protein  58.93 
 
 		 543 aa  641    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.301435  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3833  AMP-binding domain protein  75.49 
 
 		 601 aa  887    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4818  AMP-binding domain protein  55.47 
 
 		 540 aa  638    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4161  AMP-binding domain protein  80.21 
 
 		 577 aa  917    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0042  AMP-binding domain protein  62.48 
 
 		 576 aa  729    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0288  AMP-binding domain protein  59.75 
 
 		 564 aa  707    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0229323  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2941  acyl-CoA synthetase  55.48 
 
 		 557 aa  646    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.581775  normal  0.0544542 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4723  AMP-binding domain protein  100 
 
 		 560 aa  1170    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.712671  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0252  AMP-binding domain protein  59.75 
 
 		 564 aa  688    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3018  AMP-binding domain protein  60.07 
 
 		 576 aa  711    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0344  AMP-binding domain protein  62.43 
 
 		 562 aa  719    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.100012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0582  AMP-binding domain protein  59.07 
 
 		 587 aa  720    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.44238  normal  0.647319 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0339  AMP-binding domain protein  66.79 
 
 		 602 aa  790    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0610  AMP-binding domain protein  60.64 
 
 		 570 aa  695    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.920315  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5975  AMP-binding domain protein  78.56 
 
 		 572 aa  895    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4040  AMP-binding domain protein  60.07 
 
 		 576 aa  712    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2984  AMP-binding domain protein  57.59 
 
 		 546 aa  655    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.136347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2947  AMP-binding domain protein  61.06 
 
 		 575 aa  714    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.768033  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4437  AMP-binding domain protein  55.29 
 
 		 540 aa  637    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0770  AMP-dependent synthetase and ligase  54.3 
 
 		 566 aa  637    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.404945  normal  0.888891 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0108  AMP-binding domain protein  60.88 
 
 		 575 aa  713    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.480818  normal  0.901201 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2593  AMP-binding domain protein  55.1 
 
 		 574 aa  647    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1584  AMP-binding domain protein  60.07 
 
 		 570 aa  711    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0154  AMP-dependent synthetase and ligase  56.83 
 
 		 566 aa  656    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3966  AMP-binding domain protein  60.07 
 
 		 576 aa  711    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0099  AMP-binding domain protein  61.42 
 
 		 575 aa  723    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3353  AMP-binding domain protein  60.07 
 
 		 576 aa  711    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31470  AMP-binding domain protein  56.37 
 
 		 564 aa  646    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0028776  hitchhiker  0.0000000416298 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0108  AMP-binding domain protein  61.06 
 
 		 575 aa  714    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.969616  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2693  AMP-dependent synthetase and ligase  60.53 
 
 		 562 aa  707    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0752  AMP-binding domain protein  65.09 
 
 		 576 aa  776    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3045  AMP-binding domain protein  77.49 
 
 		 578 aa  907    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3937  AMP-binding domain protein  56.49 
 
 		 539 aa  647    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.104158  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2319  AMP-binding domain protein  60.42 
 
 		 565 aa  704    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.770298  normal  0.0254377 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0333  AMP-binding domain protein  60.39 
 
 		 571 aa  690    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4524  AMP-binding domain protein  55.29 
 
 		 540 aa  637    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3403  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  55.75 
 
 		 579 aa  642    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1563  AMP-binding domain protein  56.51 
 
 		 538 aa  650    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.716975 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4867  AMP-binding domain protein  57.95 
 
 		 538 aa  656    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.223701  normal  0.186874 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2679  AMP-binding domain protein  56.27 
 
 		 561 aa  635    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180976  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4355  AMP-binding domain protein  79.22 
 
 		 577 aa  903    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4063  AMP-binding domain protein  55.74 
 
 		 560 aa  632  1e-180  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365849  normal  0.0336017 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4872  AMP-binding domain protein  57.4 
 
 		 549 aa  634  1e-180  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4878  AMP-dependent synthetase and ligase  56.1 
 
 		 530 aa  634  1e-180  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0148671 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4008  AMP-dependent synthetase and ligase  55.13 
 
 		 1043 aa  633  1e-180  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4372  AMP-dependent synthetase and ligase  54.69 
 
 		 539 aa  629  1e-179  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1778  AMP-binding domain protein  55.09 
 
 		 560 aa  628  1e-178  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0198659 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0241  AMP-dependent synthetase and ligase  57.51 
 
 		 545 aa  627  1e-178  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.276778  normal  0.182333 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1627  AMP-dependent synthetase and ligase  53.55 
 
 		 571 aa  627  1e-178  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3661  AMP-binding domain protein  54.91 
 
 		 560 aa  625  1e-178  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000288335 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2285  AMP-binding domain protein  53.82 
 
 		 570 aa  625  1e-178  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0389499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2475  AMP-binding domain protein  53.98 
 
 		 574 aa  627  1e-178  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0776889  normal  0.707205 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1103  AMP-binding domain protein  53.47 
 
 		 552 aa  621  1e-177  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3316  AMP-dependent synthetase and ligase  55.94 
 
 		 541 aa  620  1e-176  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1813  AMP-binding domain protein  54.32 
 
 		 560 aa  619  1e-176  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.659175  normal  0.258259 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2357  AMP-binding domain protein  53.27 
 
 		 570 aa  619  1e-176  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0641132  normal  0.0814981 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2503  AMP-binding domain protein  53.85 
 
 		 568 aa  620  1e-176  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2563  AMP-binding domain protein  52.82 
 
 		 549 aa  617  1e-175  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45341e-16 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1904  AMP-binding domain protein  53.49 
 
 		 573 aa  615  1e-175  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1971  AMP-binding domain protein  53.2 
 
 		 578 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2721  AMP-binding domain protein  52.66 
 
 		 570 aa  614  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.443793  normal  0.43387 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1739  AMP-binding domain protein  52.66 
 
 		 570 aa  614  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.184325  hitchhiker  0.00142918 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2607  AMP-binding domain protein  52.66 
 
 		 570 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1032  AMP-dependent synthetase and ligase  50.71 
 
 		 566 aa  612  9.999999999999999e-175  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2646  AMP-binding domain protein  52.66 
 
 		 570 aa  614  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1650  AMP-binding domain protein  52.64 
 
 		 549 aa  612  9.999999999999999e-175  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1679  AMP-binding domain protein  52.95 
 
 		 570 aa  609  1e-173  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5134  AMP-binding domain protein  55.81 
 
 		 518 aa  610  1e-173  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0657606  normal  0.735688 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2014  AMP-dependent synthetase and ligase  53.01 
 
 		 542 aa  611  1e-173  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.534696  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0354  AMP-dependent synthetase and ligase  53.58 
 
 		 576 aa  608  9.999999999999999e-173  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.725771 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>