More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4475 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4475  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 441 aa  887    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.220885  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4653  major facilitator transporter  69.69 
 
 		 439 aa  573  1.0000000000000001e-162  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.220092  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1372  major facilitator superfamily MFS_1  69.38 
 
 		 436 aa  556  1e-157  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.686349  normal  0.752679 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1212  major facilitator transporter  69.38 
 
 		 432 aa  555  1e-157  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.260069  normal  0.306936 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2097  major facilitator superfamily MFS_1  65.37 
 
 		 436 aa  551  1e-156  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.481915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2414  major facilitator superfamily MFS_1  65.37 
 
 		 436 aa  551  1e-156  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.136193 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1151  major facilitator superfamily MFS_1  67.83 
 
 		 441 aa  554  1e-156  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1248  major facilitator transporter  68.23 
 
 		 436 aa  552  1e-156  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.211018 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2792  major facilitator transporter  69.7 
 
 		 425 aa  551  1e-156  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.40286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2137  major facilitator transporter  65.37 
 
 		 436 aa  551  1e-156  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.115705  normal  0.336562 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1841  major facilitator transporter  68.4 
 
 		 424 aa  549  1e-155  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.271882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1236  major facilitator superfamily MFS_1  69.23 
 
 		 424 aa  545  1e-154  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4369  major facilitator superfamily transporter  68.26 
 
 		 441 aa  545  1e-154  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.70357  normal  0.783819 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3099  putative oxalate/formate antiporter  61.24 
 
 		 429 aa  536  1e-151  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6143  major facilitator transporter  61.5 
 
 		 437 aa  537  1e-151  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.645469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0121  major facilitator transporter  64.52 
 
 		 437 aa  537  1e-151  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4793  major facilitator superfamily MFS_1  64.29 
 
 		 437 aa  532  1e-150  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.716859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4311  major facilitator transporter  62.65 
 
 		 437 aa  530  1e-149  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.516977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1989  major facilitator superfamily MFS_1  62.86 
 
 		 437 aa  528  1e-148  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.180864  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2154  major facilitator superfamily MFS_1  63.04 
 
 		 430 aa  527  1e-148  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3800  major facilitator transporter  69.05 
 
 		 446 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0108  major facilitator superfamily MFS_1  65.93 
 
 		 419 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3098  putative oxalate/formate antiporter  61.37 
 
 		 438 aa  496  1e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4366  major facilitator superfamily transporter  58.71 
 
 		 447 aa  491  1e-137  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.370471  normal  0.238721 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5586  major facilitator transporter  59.95 
 
 		 428 aa  478  1e-134  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.88616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1247  major facilitator transporter  56.3 
 
 		 431 aa  481  1e-134  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.131802 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1150  major facilitator superfamily MFS_1  60.14 
 
 		 441 aa  479  1e-134  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4656  major facilitator transporter  58.35 
 
 		 443 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1371  major facilitator superfamily MFS_1  62.38 
 
 		 441 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.53264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1211  major facilitator transporter  62.38 
 
 		 441 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.729661  normal  0.434352 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4665  major facilitator transporter  56.42 
 
 		 444 aa  464  1e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3621  major facilitator transporter  57.96 
 
 		 439 aa  456  1e-127  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.387531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6027  major facilitator superfamily MFS_1  57.77 
 
 		 447 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.246055 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2262  major facilitator superfamily (MFS)oxalate/formate antiporter  58.52 
 
 		 447 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0179923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2758  major facilitator superfamily (MFS) oxalate/formate antiporter  60.14 
 
 		 443 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4698  major facilitator transporter  59.51 
 
 		 446 aa  451  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.068813  normal  0.0224266 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3283  major facilitator transporter  54.61 
 
 		 429 aa  442  1e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.21568  normal  0.253377 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5265  major facilitator transporter  54.61 
 
 		 429 aa  442  1e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.940755  normal  0.474002 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6739  major facilitator superfamily MFS_1  59.32 
 
 		 443 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.886987 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5950  major facilitator transporter  53.62 
 
 		 433 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00746077 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2227  major facilitator superfamily MFS_1  53.12 
 
 		 432 aa  437  1e-121  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.374569  normal  0.368601 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1951  major facilitator transporter  53.12 
 
 		 432 aa  437  1e-121  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0879  major facilitator transporter  61.39 
 
 		 428 aa  436  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.394095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1366  major facilitator superfamily MFS_1  60.24 
 
 		 428 aa  433  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.745533  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1906  major facilitator superfamily MFS_1  53.37 
 
 		 432 aa  432  1e-120  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.748854 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4329  major facilitator transporter  49.32 
 
 		 438 aa  424  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0362364  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0674  major facilitator transporter  53.94 
 
 		 417 aa  416  9.999999999999999e-116  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.201376  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5557  major facilitator superfamily MFS_1  53.87 
 
 		 450 aa  414  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0444  major facilitator transporter  44.58 
 
 		 422 aa  347  2e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.17352  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0965  major facilitator superfamily MFS_1  46.6 
 
 		 429 aa  346  5e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1033  major facilitator transporter  45.63 
 
 		 430 aa  342  8e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.512076  normal  0.078006 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1160  major facilitator superfamily MFS_1  45.63 
 
 		 430 aa  342  9e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.13883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4542  major facilitator transporter  44.61 
 
 		 421 aa  295  9e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.554547 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4451  MFS superfamily oxalate/formate antiporter  39.49 
 
 		 438 aa  268  1e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000266277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1590  major facilitator transporter  35.57 
 
 		 431 aa  258  2e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0171149  normal  0.72938 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2856  Oxalate/Formate Antiporter  30.41 
 
 		 430 aa  166  5.9999999999999996e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0094861  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3728  major facilitator transporter  32.02 
 
 		 411 aa  162  1e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3364  major facilitator transporter  29.22 
 
 		 412 aa  159  1e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2459  major facilitator transporter  28.28 
 
 		 402 aa  157  3e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0169362  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2718  oxalate:formate antiporter, putative  28.09 
 
 		 402 aa  156  6e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00584048  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2428  oxalate:formate antiporter (permease)  27.76 
 
 		 402 aa  154  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.739048  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1744  major facilitator superfamily MFS_1  30.56 
 
 		 425 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.799326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2746  putative oxalate:formate antiporter  27.51 
 
 		 402 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000311684  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2456  oxalate/formate antiporter (permease)  27.51 
 
 		 402 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001991  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2703  putative oxalate:formate antiporter  27.76 
 
 		 402 aa  152  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2607  putative oxalate:formate antiporter  27.51 
 
 		 402 aa  152  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000121238 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1179  major facilitator superfamily MFS_1  27.86 
 
 		 408 aa  150  3e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2952  major facilitator family transporter  27.63 
 
 		 398 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2736  major facilitator family transporter  27.63 
 
 		 398 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.601142  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1895  major facilitator superfamily MFS_1  32.15 
 
 		 416 aa  150  3e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2777  major facilitator family transporter  27.63 
 
 		 398 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2840  major facilitator family transporter  27.87 
 
 		 398 aa  150  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.638107  normal  0.599456 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2495  oxalate:formate antiporter  27.25 
 
 		 402 aa  150  4e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116022  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2680  oxalate:formate antiporter  27.25 
 
 		 402 aa  150  4e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2817  major facilitator family transporter  27.87 
 
 		 398 aa  150  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0448046  normal  0.764982 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3406  major facilitator transporter  27.67 
 
 		 408 aa  149  7e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.913918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3923  major facilitator transporter  30.59 
 
 		 418 aa  149  7e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.768461  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2695  putative oxalate:formate antiporter  27.25 
 
 		 402 aa  149  9e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000183174 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0515  major facilitator transporter  27.4 
 
 		 418 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1858  major facilitator transporter  28.97 
 
 		 402 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.633531  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0356  major facilitator superfamily MFS_1  28.77 
 
 		 411 aa  146  6e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0936  major facilitator superfamily MFS_1  29.29 
 
 		 407 aa  144  4e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2174  major facilitator transporter  25.45 
 
 		 400 aa  142  9e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0165144  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0598  MFS transporter  27.45 
 
 		 412 aa  142  9.999999999999999e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2356  major facilitator superfamily MFS_1  25.96 
 
 		 405 aa  141  3e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2332  putative oxalate:formate antiporter  25.93 
 
 		 400 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0134794  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2203  oxalate:formate antiporter  26.17 
 
 		 400 aa  139  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.111639  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2142  oxalate/formate antiporter  26.17 
 
 		 400 aa  139  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0401795  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2126  oxalate/formate antiporter  26.17 
 
 		 400 aa  139  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0875766  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2367  oxalate:formate antiporter  26.17 
 
 		 400 aa  139  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.880003  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2385  putative oxalate:formate antiporter  26.17 
 
 		 400 aa  139  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2993  putative oxalate:formate antiporter  25.93 
 
 		 400 aa  139  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0223405  normal  0.0497096 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2442  major facilitator superfamily MFS_1  25.62 
 
 		 405 aa  139  1e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.234485  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1880  major facilitator superfamily MFS_1  25.5 
 
 		 407 aa  138  2e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0103294  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2396  oxalate:formate antiporter, putative  26.42 
 
 		 400 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.429266  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2503  major facilitator superfamily MFS_1  27.95 
 
 		 436 aa  137  5e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0434  major facilitator transporter  29.23 
 
 		 391 aa  136  8e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000443521  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3733  major facilitator transporter  29.71 
 
 		 397 aa  136  8e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0466  major facilitator superfamily MFS_1  31.02 
 
 		 415 aa  136  9e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0852  major facilitator transporter  28.53 
 
 		 380 aa  135  9.999999999999999e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.498161  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>