More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4447 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RSp1085  secretion ATPase protein  74.19 
 
 		 450 aa  665    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4250  type II secretion system protein E  74.01 
 
 		 451 aa  664    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558641  normal  0.482793 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5411  type II secretion system protein E  76.06 
 
 		 440 aa  674    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0593921  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1944  type II/IV secretion system protein  75.29 
 
 		 447 aa  676    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000254156  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4663  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  74.13 
 
 		 447 aa  671    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0858858  decreased coverage  0.000709192 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2540  type II/IV secretion system protein  74.83 
 
 		 446 aa  676    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511754  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2070  type II secretion system protein E  73.58 
 
 		 440 aa  650    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.577602  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1791  type II/IV secretion system protein  75.29 
 
 		 447 aa  676    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.24079  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2796  putative type II/IV secretion ATPase protein, TadA  76.64 
 
 		 469 aa  687    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178047  normal  0.242978 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1655  type II secretion system protein E  74.77 
 
 		 469 aa  684    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4447  type II secretion system protein E  100 
 
 		 438 aa  885    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3656  type II/IV secretion system protein, ATPase domain-containing protein  76.17 
 
 		 438 aa  674    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1043  type II secretion system protein E  74.01 
 
 		 450 aa  672    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.994378  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1445  type II secretion system protein E  75.99 
 
 		 455 aa  683    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.314248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1405  type II secretion system protein E  75.93 
 
 		 454 aa  682    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1523  type II secretion system protein E  74.01 
 
 		 450 aa  672    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.68059  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4360  type II secretion system protein E  74.01 
 
 		 451 aa  664    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1499  type II secretion system protein E  74.01 
 
 		 450 aa  672    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000031609 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1730  type II secretion system protein E  75.06 
 
 		 447 aa  675    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000224608 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1770  type II/IV secretion system protein  75.29 
 
 		 447 aa  676    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2323  type II secretion system protein E  62.8 
 
 		 449 aa  558  1e-158  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.935094 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1776  tight adherence protein TadA  77.29 
 
 		 335 aa  508  1e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.515803  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0119  secretion system protein, putaive  77.29 
 
 		 335 aa  508  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0220928  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2324  type II secretion system protein E  56.52 
 
 		 444 aa  490  1e-137  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2702  tight adherence protein TadA  56.52 
 
 		 444 aa  490  1e-137  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.585164  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1640  type II secretion system protein E  49.01 
 
 		 417 aa  413  1e-114  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.75229  normal  0.33759 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2738  type II secretion system protein E  47.67 
 
 		 624 aa  382  1e-105  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5324  type II secretion system protein E  47.79 
 
 		 462 aa  384  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350722  decreased coverage  0.000466022 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2569  type II secretion system protein E  53.25 
 
 		 463 aa  379  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4617  type II secretion system protein E  47.29 
 
 		 460 aa  381  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.511137 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2647  type II secretion system protein E  47.63 
 
 		 459 aa  374  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  48.26 
 
 		 444 aa  374  1e-102  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3512  type II secretion system protein E  50.38 
 
 		 449 aa  372  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.657436  normal  0.0925086 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7195  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  46.73 
 
 		 455 aa  370  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.141277  normal  0.285879 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4396  type II secretion system protein E  50.27 
 
 		 481 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2160  type II secretion system protein E  48.53 
 
 		 438 aa  371  1e-101  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0397447  normal  0.0352451 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1752  Flp pilus assembly ATPase CpaF  45.61 
 
 		 451 aa  366  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0795  type II secretion system protein  45.93 
 
 		 472 aa  368  1e-100  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0588  type II secretion system protein E  45.14 
 
 		 454 aa  366  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106283  normal  0.228191 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2555  type II secretion system protein E  45.41 
 
 		 464 aa  368  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174933  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2913  type II secretion system protein E  46.99 
 
 		 452 aa  368  1e-100  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6366  type II secretion system protein E  47.26 
 
 		 454 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.595615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0641  type II secretion system protein E  46.02 
 
 		 456 aa  367  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.677023  normal  0.303221 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5492  type II secretion system protein E  47.26 
 
 		 454 aa  368  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0157969  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0804  type II secretion system protein E  50.14 
 
 		 473 aa  368  1e-100  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6778  type II secretion system protein E  47.26 
 
 		 454 aa  368  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.367997  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0072  type II secretion system protein E  49.09 
 
 		 408 aa  365  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.928138  normal  0.608061 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2966  type II/IV secretion system protein  48.83 
 
 		 455 aa  364  1e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.265625  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3009  type II secretion system protein E  47.06 
 
 		 445 aa  365  1e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1316  type II secretion system protein  48.56 
 
 		 455 aa  364  2e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3091  type II/IV secretion system protein  48.83 
 
 		 455 aa  364  2e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2363  type II/IV secretion system protein  51.84 
 
 		 560 aa  363  3e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.158902  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1498  type II secretion system protein E  49.29 
 
 		 468 aa  363  4e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0545  type II secretion system protein E  45.59 
 
 		 454 aa  363  4e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.732692 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1522  type II secretion system protein E  47.18 
 
 		 467 aa  362  5.0000000000000005e-99  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3210  type II secretion system protein E  47.75 
 
 		 463 aa  362  6e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.532215 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2274  type II secretion system protein  48.83 
 
 		 455 aa  362  6e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0655  type II secretion system protein  46.12 
 
 		 479 aa  362  9e-99  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.181528 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6002  type II secretion system protein E  45.98 
 
 		 455 aa  362  9e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.661496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6298  type II secretion system protein E  45.98 
 
 		 455 aa  362  1e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  48.63 
 
 		 453 aa  360  2e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1274  type II secretion system protein E  47.51 
 
 		 463 aa  361  2e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1109  type II secretion system protein E  49.87 
 
 		 608 aa  360  4e-98  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.280352  normal  0.0921606 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1682  type II secretion system protein E  47.51 
 
 		 465 aa  358  9e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000847512 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2825  type II secretion system protein E  48.02 
 
 		 450 aa  358  9e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3966  type II secretion system protein E  48.54 
 
 		 449 aa  356  5e-97  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.406102 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2019  type II secretion system protein E  46.61 
 
 		 442 aa  355  1e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.547771  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1876  type II secretion system protein E  46.44 
 
 		 477 aa  353  2.9999999999999997e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4853  type II/IV secretion system protein, putative  49.73 
 
 		 418 aa  353  4e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4393  type II secretion system protein E  49.47 
 
 		 418 aa  352  5e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0309  type II secretion system protein E  46.33 
 
 		 455 aa  352  7e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55890  putative type II secretion system protein  48.95 
 
 		 421 aa  352  8e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4869  putative type II secretion system protein  48.68 
 
 		 421 aa  351  2e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.192053  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3241  type II secretion system protein E  46.44 
 
 		 478 aa  350  3e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1918  type II secretion system protein E  45.81 
 
 		 442 aa  349  4e-95  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.250738  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1528  type II secretion system protein E  44.78 
 
 		 457 aa  349  5e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1161  type II secretion system protein E  48.21 
 
 		 469 aa  349  7e-95  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2982  type II secretion system protein E  47.62 
 
 		 487 aa  348  8e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330952  hitchhiker  0.00479532 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0799  type II secretion system protein E  45.21 
 
 		 452 aa  348  8e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0726  type II secretion system protein E  44.09 
 
 		 492 aa  348  1e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.50497  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2045  type II secretion system protein E  47.64 
 
 		 458 aa  348  1e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0948744  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0846  type II secretion system protein E  49.2 
 
 		 418 aa  347  2e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2366  putative pilus assembly protein  45.5 
 
 		 441 aa  347  2e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.108206  normal  0.102588 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1815  type II secretion system protein E  48.04 
 
 		 449 aa  347  3e-94  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.15146  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1019  type II secretion system protein E  46.28 
 
 		 472 aa  347  3e-94  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2349  type II secretion system protein E  50.55 
 
 		 485 aa  346  5e-94  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.413673 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2830  type II secretion system protein E  45.79 
 
 		 482 aa  346  5e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1126  type II secretion system protein E  46.68 
 
 		 484 aa  345  7e-94  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.188659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4000  type II secretion system protein E  44.88 
 
 		 500 aa  345  8e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.737782  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1905  putative Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  51.25 
 
 		 485 aa  345  1e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.094928  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1725  type II secretion system protein E  52.58 
 
 		 465 aa  345  1e-93  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0554  type II secretion system protein E  51.25 
 
 		 485 aa  345  1e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1876  type IV pilus assembly protein  46.77 
 
 		 523 aa  345  1e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.483104  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0828  CpaF  46.77 
 
 		 520 aa  344  2e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.13968  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3355  type II secretion system protein E  43.49 
 
 		 488 aa  344  2e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1888  type IV pilus assembly protein  46.77 
 
 		 523 aa  344  2e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.414931  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2044  component of type IV pilus  46.77 
 
 		 521 aa  344  2e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101478  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2354  type II secretion system protein E  45.73 
 
 		 452 aa  344  2e-93  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1677  CpaF  46.77 
 
 		 520 aa  344  2e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.521474  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0333  CpaF  46.77 
 
 		 520 aa  344  2e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0947071  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>