More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4376 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_6120  histidine kinase  60.98 
 
 		 606 aa  655    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.198202  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4376  histidine kinase  100 
 
 		 593 aa  1181    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.904194  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4096  histidine kinase  43.04 
 
 		 604 aa  253  6e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000005496 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0992  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.28 
 
 		 662 aa  249  1e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2571  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  42.01 
 
 		 634 aa  239  1e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0964097 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0510  histidine kinase  40.29 
 
 		 629 aa  238  3e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.302748  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5840  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.1 
 
 		 621 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.481716  hitchhiker  0.00124548 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1150  signal transduction histidine kinase-like protein  32.08 
 
 		 609 aa  229  1e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2935  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.48 
 
 		 817 aa  229  1e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1814  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  32.01 
 
 		 662 aa  224  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.23625 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4849  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.57 
 
 		 655 aa  224  4.9999999999999996e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0479308  normal  0.0448623 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0340  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  40.26 
 
 		 816 aa  223  8e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2038  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  43.01 
 
 		 653 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0554  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.98 
 
 		 675 aa  220  6e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.71067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2688  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.93 
 
 		 589 aa  218  2.9999999999999998e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5115  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.38 
 
 		 609 aa  217  4e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0345398 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0508  histidine kinase  38.93 
 
 		 663 aa  217  4e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.217821  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0106  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.76 
 
 		 657 aa  213  5.999999999999999e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.816197  normal  0.0449615 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0224  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.98 
 
 		 1167 aa  212  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4855  putative two-component hybrid histidine kinase, periplasmic sensor  29.44 
 
 		 591 aa  211  4e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.268249  normal  0.362022 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2335  histidine kinase  32.5 
 
 		 610 aa  211  4e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.249479  normal  0.165398 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2724  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.5 
 
 		 631 aa  210  5e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3169  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  36.84 
 
 		 1445 aa  210  5e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0898  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.8 
 
 		 1172 aa  207  3e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.149338  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0265  sensor histidine kinase  46.22 
 
 		 697 aa  206  8e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0252  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.4 
 
 		 1174 aa  206  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.854881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3978  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.99 
 
 		 1152 aa  205  1e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.508831  normal  0.169335 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2627  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.69 
 
 		 1116 aa  204  3e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.594612  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2352  histidine kinase  37.82 
 
 		 441 aa  204  5e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6380  putative two-component sensor histidine kinase  35.2 
 
 		 596 aa  203  9e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2456  composite two-component regulatory (sensor kinase and response regulator hybrid) transcription regulator protein  32.17 
 
 		 638 aa  202  1.9999999999999998e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0869  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.32 
 
 		 1316 aa  201  3e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0225926  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1985  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.64 
 
 		 1138 aa  200  6e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2881  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.89 
 
 		 632 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.365727 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3756  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.16 
 
 		 672 aa  197  3e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.866154  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02752  two-component system sensor protein  36.2 
 
 		 1150 aa  197  4.0000000000000005e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0523  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.68 
 
 		 1145 aa  196  1e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1292  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.71 
 
 		 1159 aa  195  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0372313  normal  0.867611 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1817  histidine kinase  34.97 
 
 		 454 aa  192  1e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7668  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.31 
 
 		 571 aa  192  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3605  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.02 
 
 		 610 aa  192  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.796778  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1695  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.88 
 
 		 1159 aa  191  4e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.948496  normal  0.574545 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0165  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.82 
 
 		 1168 aa  189  9e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.53132  normal  0.851256 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1871  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.49 
 
 		 856 aa  189  1e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2202  histidine kinase  33.89 
 
 		 447 aa  188  2e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4025  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.95 
 
 		 1159 aa  188  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0792472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1926  ATPase domain-containing protein  33.89 
 
 		 454 aa  188  3e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.82384 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2246  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.53 
 
 		 854 aa  187  5e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00766594  normal  0.0928411 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1250  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.95 
 
 		 1158 aa  187  5e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0252543 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2743  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  32.02 
 
 		 611 aa  186  7e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3356  histidine kinase  46.58 
 
 		 633 aa  186  8e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1570  Signal transduction histidine kinase-like  31.41 
 
 		 666 aa  186  1.0000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.733845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1765  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.39 
 
 		 586 aa  184  3e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.316397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38970  putative two-component sensor  35.31 
 
 		 881 aa  185  3e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.687207  normal  0.985828 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3319  putative two-component sensor  35.23 
 
 		 868 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2060  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.22 
 
 		 1111 aa  184  5.0000000000000004e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.749505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46370  putative two-component sensor  35.26 
 
 		 540 aa  184  6e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.304755  hitchhiker  0.00684988 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1850  putative two-component sensor  34.41 
 
 		 1159 aa  183  7e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.460329  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21700  putative two-component sensor  34.41 
 
 		 1159 aa  183  8.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2172  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.66 
 
 		 645 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0921  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.61 
 
 		 1169 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.306622  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3900  sensory box histidine kinase/response regulator  34.18 
 
 		 1157 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2676  histidine kinase  35.01 
 
 		 676 aa  181  2.9999999999999997e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00458174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4823  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35 
 
 		 1169 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1575  histidine kinase  37.44 
 
 		 777 aa  181  2.9999999999999997e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.179984 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3951  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.46 
 
 		 540 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.252359  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0090  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.16 
 
 		 1163 aa  181  4.999999999999999e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0316  sensor histidine kinase/response regulator  34.22 
 
 		 1174 aa  180  8e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0620  two component sensor kinase/response regulator hybrid  36.05 
 
 		 1169 aa  180  8e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1300  histidine kinase  33.19 
 
 		 468 aa  179  1e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0380592 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4194  histidine kinase  33.91 
 
 		 452 aa  179  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.100725  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0409  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.53 
 
 		 1171 aa  179  1e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.41 
 
 		 635 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1660  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.25 
 
 		 1156 aa  179  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0486727  normal  0.0112915 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2939  histidine kinase  34.29 
 
 		 447 aa  179  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.012617 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3255  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.54 
 
 		 1177 aa  177  5e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0680649  normal  0.187811 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4027  histidine kinase  43.07 
 
 		 471 aa  177  6e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0361881  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2531  histidine kinase  30.96 
 
 		 1146 aa  176  8e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.014523  hitchhiker  0.00504999 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1753  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.96 
 
 		 1146 aa  176  8e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2537  fused sensor protein/response regulator  34.2 
 
 		 842 aa  176  8e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5189  Signal transduction histidine kinase  35.4 
 
 		 539 aa  176  8e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.590136  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2683  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.51 
 
 		 567 aa  176  9e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.259535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1749  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.96 
 
 		 1146 aa  176  9e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0353406  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2664  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.16 
 
 		 655 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.215528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1585  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  34.34 
 
 		 1158 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.484303 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1792  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.96 
 
 		 1146 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.103598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2695  sensor histidine kinase  32.56 
 
 		 1147 aa  176  9.999999999999999e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2742  sensor histidine kinase/response regulator  31.3 
 
 		 1145 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1140  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.2 
 
 		 733 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35230  integral membrane sensor hybrid histidine protein kinase  33.16 
 
 		 1161 aa  175  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234785  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0068  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  32.3 
 
 		 1156 aa  175  2.9999999999999996e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2724  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.55 
 
 		 1140 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.178694  hitchhiker  0.00103188 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1500  Signal transduction histidine kinase (STHK) with CheB and CheR activity  34.15 
 
 		 1483 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0274  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.03 
 
 		 1169 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.41273  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3079  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.26 
 
 		 556 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4564  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.87 
 
 		 1169 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.519353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0837  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.93 
 
 		 1168 aa  174  5e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.303418 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3120  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.99 
 
 		 554 aa  174  5e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0189072  normal  0.493238 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0699  signal transduction histidine kinase  33.77 
 
 		 744 aa  173  5.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.324444  normal  0.102548 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2522  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.05 
 
 		 1146 aa  174  5.999999999999999e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00042371 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>