More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4336 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_4336  NAD(+)/NADH kinase family protein  100 
 
 
303 aa  615  1e-175  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0937154  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1651  NAD(+)/NADH kinase family protein  71.76 
 
 
298 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.105713  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1302  NAD(+)/NADH kinase family protein  68.77 
 
 
291 aa  419  1e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1051  NAD(+)/NADH kinase family protein  69.1 
 
 
298 aa  419  1e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3601  NAD(+)/NADH kinase family protein  68.65 
 
 
298 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00672502 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0908  NAD(+)/NADH kinase family protein  68.11 
 
 
291 aa  413  1e-114  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.42987  normal  0.404915 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5420  NAD(+)/NADH kinase family protein  65.35 
 
 
298 aa  410  1e-113  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0833  NAD(+)/NADH kinase family protein  66.01 
 
 
298 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.110049  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0904  NAD(+)/NADH kinase family protein  66.01 
 
 
298 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3334  NAD(+)/NADH kinase family protein  60.13 
 
 
301 aa  368  1e-101  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3488  NAD(+)/NADH kinase family protein  57.81 
 
 
306 aa  352  4e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000826356 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1035  NAD(+)/NADH kinase family protein  54.39 
 
 
318 aa  326  2.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2481  NAD(+)/NADH kinase family protein  54.18 
 
 
312 aa  322  5e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2650  NAD(+)/NADH kinase family protein  53.67 
 
 
302 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.219637  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2887  NAD(+)/NADH kinase family protein  53.18 
 
 
312 aa  317  2e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0714  NAD(+)/NADH kinase family protein  54.97 
 
 
300 aa  316  3e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0260  NAD(+)/NADH kinase family protein  54.97 
 
 
300 aa  316  3e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0744  NAD(+)/NADH kinase family protein  54.97 
 
 
300 aa  316  3e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.359036  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1301  NAD(+)/NADH kinase family protein  54.33 
 
 
299 aa  315  4e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00867601  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2504  NAD(+)/NADH kinase family protein  52.51 
 
 
300 aa  315  6e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.586186  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3285  NAD(+)/NADH kinase family protein  54 
 
 
300 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.178669  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3328  NAD(+)/NADH kinase family protein  54 
 
 
345 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3318  NAD(+)/NADH kinase family protein  54 
 
 
345 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2640  NAD(+)/NADH kinase family protein  53.85 
 
 
300 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.42258  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3967  NAD(+)/NADH kinase family protein  53.82 
 
 
300 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0322803 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0638  NAD(+)/NADH kinase family protein  53.49 
 
 
300 aa  311  6.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0662  NAD(+)/NADH kinase family protein  53.49 
 
 
300 aa  311  6.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2332  NAD(+)/NADH kinase family protein  53.87 
 
 
300 aa  311  1e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3832  NAD(+)/NADH kinase family protein  52.49 
 
 
300 aa  310  1e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0493  NAD(+)/NADH kinase family protein  53.87 
 
 
300 aa  311  1e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2213  NAD(+)/NADH kinase family protein  53.87 
 
 
344 aa  310  2e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1106  NAD(+)/NADH kinase family protein  53.87 
 
 
320 aa  310  2e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.479863  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0731  NAD(+)/NADH kinase family protein  53.16 
 
 
300 aa  310  2e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.988053 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1773  NAD(+) kinase  52.36 
 
 
301 aa  308  1.0000000000000001e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1488  ATP-NAD/AcoX kinase  51.01 
 
 
301 aa  301  1e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0999  NAD(+)/NADH kinase family protein  53.04 
 
 
313 aa  293  4e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.893596  normal  0.333478 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1725  NAD(+) kinase  45.51 
 
 
293 aa  254  8e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.17125  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2422  NAD(+)/NADH kinase family protein  44.7 
 
 
294 aa  253  3e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.781627  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0774  NAD(+) kinase  43.29 
 
 
290 aa  253  3e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000137115 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0931  ATP-NAD/AcoX kinase  42.71 
 
 
309 aa  242  5e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2031  NAD kinase  40.67 
 
 
290 aa  236  3e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.347734  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2573  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  39.4 
 
 
309 aa  229  4e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000341976  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1355  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  40.92 
 
 
309 aa  226  3e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000052487  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3006  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  40.92 
 
 
292 aa  226  4e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000540691  hitchhiker  0.000000451072 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2792  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  39 
 
 
309 aa  224  9e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000237572  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1523  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  40 
 
 
292 aa  224  1e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2733  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  40 
 
 
309 aa  224  1e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000296073  normal  0.942574 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2806  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  40 
 
 
309 aa  224  1e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0126891  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2438  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  40.4 
 
 
292 aa  224  1e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000505876  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2773  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  40.07 
 
 
292 aa  223  2e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000370492  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1378  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  40.59 
 
 
309 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000100687  normal  0.288093 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1341  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  40.59 
 
 
309 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000175505  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2903  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  40 
 
 
309 aa  224  2e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000229952  normal  0.0349698 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2993  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  40.53 
 
 
292 aa  223  3e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000131242  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1273  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  39.33 
 
 
309 aa  221  8e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000702127  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3331  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  39.93 
 
 
307 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000815034  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3480  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  38.87 
 
 
292 aa  218  7.999999999999999e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0011597  normal  0.0787505 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0451  ATP-NAD kinase  42.57 
 
 
295 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0612  ATP-NAD/AcoX kinase  42.57 
 
 
300 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3685  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  39.2 
 
 
292 aa  213  3.9999999999999995e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000258302  normal  0.101663 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02503  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  39.53 
 
 
292 aa  212  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000896223  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1060  ATP-NAD/AcoX kinase  39.53 
 
 
292 aa  212  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000577429  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3004  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  39.53 
 
 
292 aa  212  4.9999999999999996e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000243328  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2773  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  39.53 
 
 
292 aa  212  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000144313  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2899  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  39.53 
 
 
292 aa  212  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000060122  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1069  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  39.53 
 
 
292 aa  212  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0224782  normal  0.0704222 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02467  hypothetical protein  39.53 
 
 
292 aa  212  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000137745  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3855  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  39.53 
 
 
292 aa  212  7e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000447787  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2767  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  39.53 
 
 
292 aa  212  7e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000128996  normal  0.109172 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3095  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  39.2 
 
 
292 aa  212  7.999999999999999e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000116865  normal  0.241472 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1859  hypothetical protein  38.41 
 
 
290 aa  211  9e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.202337  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1377  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  38.93 
 
 
293 aa  211  1e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000779832  normal  0.0588551 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2888  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  38.93 
 
 
293 aa  211  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  3.4384500000000004e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3009  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  39.53 
 
 
292 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2827  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  39.53 
 
 
292 aa  210  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000328242  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2898  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  39.53 
 
 
292 aa  210  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2896  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  39.53 
 
 
292 aa  210  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.72588  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0969  sugar kinase  41.09 
 
 
294 aa  209  3e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.43035  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2878  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  39.53 
 
 
292 aa  208  9e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.126338 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3297  ATP-NAD/AcoX kinase  40.22 
 
 
292 aa  207  2e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0523073  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02268  NAD kinase  38.05 
 
 
291 aa  206  3e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1307  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  38.72 
 
 
293 aa  206  6e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2975  ATP-NAD/AcoX kinase  41.63 
 
 
255 aa  205  6e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000435253  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2876  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  36.33 
 
 
295 aa  205  7e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3824  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  36.42 
 
 
293 aa  204  1e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.816615  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2738  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  36.33 
 
 
295 aa  204  1e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1190  NAD(+) kinase  38.41 
 
 
293 aa  204  1e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1715  NAD(+) kinase  37.16 
 
 
291 aa  203  3e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1572  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  37.33 
 
 
296 aa  202  5e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.237811 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0729  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  40.07 
 
 
298 aa  202  6e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0279623  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1733  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  37.58 
 
 
294 aa  202  7e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0964  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  39.48 
 
 
298 aa  202  7e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000412128  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0915  NAD(+) kinase  35.69 
 
 
299 aa  201  9.999999999999999e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.895385  normal  0.356896 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1764  NAD(+) kinase  39.26 
 
 
303 aa  200  1.9999999999999998e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0416828 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2072  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  37 
 
 
294 aa  200  1.9999999999999998e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1544  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  37 
 
 
296 aa  199  3e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.305452 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2012  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  37.12 
 
 
315 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0863357  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3730  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  37 
 
 
296 aa  199  3e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3217  NAD(+) kinase  38.01 
 
 
292 aa  199  3e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.159038  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1617  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  34.34 
 
 
340 aa  199  5e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.771585  hitchhiker  0.0000000108776 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>