More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4216 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4216  GTPase ObgE  100 
 
 		 362 aa  736    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.862872  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0843  GTPase ObgE  88.17 
 
 		 379 aa  621  1e-177  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.946123  normal  0.830278 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0772  GTPase ObgE  87.32 
 
 		 357 aa  620  1e-176  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1270  GTPase ObgE  86.55 
 
 		 355 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0124615  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0837  GTPase ObgE  85 
 
 		 361 aa  605  9.999999999999999e-173  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.330133  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0749  GTPase ObgE  84.25 
 
 		 364 aa  606  9.999999999999999e-173  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709359 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3673  GTPase ObgE  87.78 
 
 		 357 aa  602  1.0000000000000001e-171  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.291643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5484  GTP-binding protein Obg/CgtA  84.83 
 
 		 371 aa  602  1.0000000000000001e-171  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.215863  normal  0.278538 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3915  GTPase ObgE  79.28 
 
 		 363 aa  553  1e-156  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0260013 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0513  hypothetical protein  79.33 
 
 		 370 aa  548  1e-155  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.609745  normal  0.0660512 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3275  GTP-binding protein Obg/CgtA  75.28 
 
 		 369 aa  523  1e-147  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000381573 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2820  GTPase ObgE  71.43 
 
 		 366 aa  470  1.0000000000000001e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0271751  normal  0.376646 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2956  GTPase ObgE  71.43 
 
 		 365 aa  468  1.0000000000000001e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3104  GTPase ObgE  72.04 
 
 		 365 aa  468  1.0000000000000001e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2655  GTPase ObgE  71 
 
 		 364 aa  468  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.031606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3065  GTPase ObgE  71.3 
 
 		 364 aa  470  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.72259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3668  GTPase ObgE  67.13 
 
 		 370 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0100142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3260  GTPase ObgE  66.2 
 
 		 372 aa  461  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0444  GTPase ObgE  66.2 
 
 		 372 aa  461  1e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2521  GTPase ObgE  66.2 
 
 		 372 aa  461  1e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.685664  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2650  GTPase ObgE  68.24 
 
 		 370 aa  462  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0689213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3522  GTPase ObgE  66.2 
 
 		 372 aa  461  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.091064  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3524  GTPase ObgE  66.2 
 
 		 372 aa  461  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1142  GTPase ObgE  66.3 
 
 		 372 aa  462  1e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3487  GTPase ObgE  66.2 
 
 		 372 aa  462  1e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1303  GTPase ObgE  66.2 
 
 		 372 aa  461  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0511  GTPase ObgE  66.57 
 
 		 370 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.166146  normal  0.91816 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3447  GTPase ObgE  67.94 
 
 		 373 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.179081  hitchhiker  0.00548922 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0509  GTPase ObgE  67.94 
 
 		 373 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.626266 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0486  GTPase ObgE  66.3 
 
 		 370 aa  457  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.165624  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0101  GTPase ObgE  67.13 
 
 		 370 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.113103  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0196  GTPase ObgE  64.17 
 
 		 362 aa  446  1.0000000000000001e-124  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00825185  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0553  GTPase ObgE  67.13 
 
 		 370 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000106913  normal  0.0178049 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0583  GTPase ObgE  67.13 
 
 		 370 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0349123  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0214  GTPase ObgE  63.46 
 
 		 370 aa  441  1e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.301302 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2800  GTPase ObgE  69.32 
 
 		 369 aa  444  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0270558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2217  GTPase ObgE  62.61 
 
 		 353 aa  422  1e-117  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000677684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1817  GTPase ObgE  59.22 
 
 		 354 aa  410  1e-113  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.389419  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1631  GTPase ObgE  63.05 
 
 		 397 aa  402  1e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3208  GTPase ObgE  60.36 
 
 		 347 aa  396  1e-109  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3472  GTPase ObgE  61.92 
 
 		 363 aa  389  1e-107  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.004996  normal  0.428622 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0866  GTPase ObgE  65.96 
 
 		 350 aa  390  1e-107  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2702  GTPase ObgE  57.77 
 
 		 341 aa  386  1e-106  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2574  GTPase ObgE  57.77 
 
 		 341 aa  385  1e-106  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0847  GTP1/OBG domain-containing protein  59.58 
 
 		 358 aa  385  1e-106  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0690  GTPase ObgE  60 
 
 		 408 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0722  GTPase ObgE  60 
 
 		 408 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320956 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3680  GTPase ObgE  58.76 
 
 		 406 aa  384  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.96249 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2248  GTPase ObgE  56.97 
 
 		 345 aa  378  1e-104  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.0000169157  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40770  GTPase ObgE  60.64 
 
 		 405 aa  380  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0703  GTPase ObgE  58.31 
 
 		 407 aa  379  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.718504 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4495  GTPase ObgE  58.38 
 
 		 408 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.589803  normal  0.496901 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0722  GTPase ObgE  56.78 
 
 		 408 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.91341 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4858  GTPase ObgE  58.38 
 
 		 407 aa  375  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5206  GTPase ObgE  58.76 
 
 		 406 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.683682  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0476  GTPase ObgE  56.76 
 
 		 395 aa  377  1e-103  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60445  GTPase ObgE  58.76 
 
 		 406 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233536 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0799  GTP-binding protein, GTP1/Obg family  57.73 
 
 		 407 aa  372  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0857  GTPase ObgE  57.94 
 
 		 397 aa  369  1e-101  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.121335  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3035  GTPase ObgE  55.09 
 
 		 345 aa  368  1e-100  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.736033  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2007  GTP-binding protein Obg/CgtA  57.51 
 
 		 356 aa  367  1e-100  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.339199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1006  GTPase ObgE  56.86 
 
 		 389 aa  363  2e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000134861  decreased coverage  0.00000589779 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0343  GTPase ObgE  57.27 
 
 		 346 aa  363  4e-99  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000591605  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0268  GTP-binding protein Obg/CgtA  58.41 
 
 		 375 aa  360  2e-98  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1525  GTPase ObgE  52.56 
 
 		 357 aa  357  1.9999999999999998e-97  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0871  GTPase ObgE  60.62 
 
 		 387 aa  356  3.9999999999999996e-97  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0184633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0956  GTPase ObgE  60 
 
 		 386 aa  355  6.999999999999999e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3476  GTPase ObgE  58.11 
 
 		 391 aa  352  5e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000303711  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3743  GTPase ObgE  54.99 
 
 		 390 aa  350  2e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4236  GTP-binding protein Obg/CgtA  56.75 
 
 		 396 aa  350  2e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000643018  hitchhiker  0.00000182471 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3609  GTPase ObgE  54.99 
 
 		 390 aa  350  2e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000696199  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3978  GTPase ObgE  54.99 
 
 		 390 aa  350  2e-95  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000165157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1582  GTPase ObgE  51.7 
 
 		 357 aa  350  3e-95  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03729  GTPase ObgE  56.84 
 
 		 392 aa  349  4e-95  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0913386  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0248  GTPase ObgE  54.49 
 
 		 392 aa  348  7e-95  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0561  GTPase ObgE  56.41 
 
 		 390 aa  348  9e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00587502  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3736  GTPase ObgE  58.59 
 
 		 397 aa  347  2e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0046392  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3087  GTPase ObgE  56.98 
 
 		 388 aa  347  2e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1681  GTPase ObgE  55.49 
 
 		 339 aa  347  2e-94  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00207916  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0498  GTPase ObgE  55.19 
 
 		 339 aa  345  8.999999999999999e-94  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000072734  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1010  GTPase ObgE  55.32 
 
 		 402 aa  344  1e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000125239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1121  GTPase ObgE  58.46 
 
 		 350 aa  345  1e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.261529  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3357  GTPase ObgE  57.14 
 
 		 392 aa  344  1e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0207536  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0796  GTPase ObgE  55.56 
 
 		 390 aa  342  5.999999999999999e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000620978  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0527  GTPase ObgE  55.17 
 
 		 386 aa  342  8e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0476  GTPase ObgE  54.7 
 
 		 390 aa  340  2.9999999999999998e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000104171  normal  0.949161 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2855  GTPase ObgE  55.29 
 
 		 395 aa  340  2.9999999999999998e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000349951  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1504  GTPase ObgE  53.41 
 
 		 405 aa  339  4e-92  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1683  GTPase ObgE  55.38 
 
 		 405 aa  339  4e-92  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0638359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0897  GTPase ObgE  59.7 
 
 		 388 aa  339  4e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00842399  normal  0.946957 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3123  GTPase ObgE  59.7 
 
 		 388 aa  339  4e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0347517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3217  GTPase ObgE  59.7 
 
 		 388 aa  339  4e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000011291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0460  GTP-binding protein Obg/CgtA  55 
 
 		 374 aa  339  5e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177259 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0283  GTP-binding protein Obg/CgtA  55 
 
 		 374 aa  339  5e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0981  GTPase ObgE  61.54 
 
 		 388 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00015516  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3649  GTPase ObgE  58.81 
 
 		 388 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1038  GTPase ObgE  57.18 
 
 		 389 aa  336  3.9999999999999995e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000432526  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1071  GTPase ObgE  57.18 
 
 		 389 aa  336  3.9999999999999995e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00003897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0969  GTPase ObgE  57.18 
 
 		 389 aa  336  3.9999999999999995e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00013573  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1601  GTPase ObgE  55.83 
 
 		 402 aa  336  3.9999999999999995e-91  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000135042  hitchhiker  0.000110073 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>