246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4197 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_4197  flagellar hook capping protein  100 
 
 
228 aa  446  1.0000000000000001e-124  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5627  flagellar basal body rod modification protein  45.75 
 
 
226 aa  187  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3736  flagellar basal body rod modification protein  45.63 
 
 
222 aa  182  4.0000000000000006e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2968  flagellar basal body rod modification protein  46.29 
 
 
225 aa  174  8e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.127656  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1635  flagellar basal body rod modification protein  44.84 
 
 
221 aa  174  9e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.904883  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1555  flagellar basal body rod modification protein  48.77 
 
 
223 aa  171  7.999999999999999e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.96706  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2571  flagellar hook capping protein  46.31 
 
 
231 aa  169  2e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.67756  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2250  flagellar basal body rod modification protein  46.31 
 
 
231 aa  169  3e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01071  flagellar basal body rod modification protein D  45.81 
 
 
231 aa  168  6e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.600835  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01079  hypothetical protein  45.81 
 
 
231 aa  168  6e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.703206  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2525  flagellar basal body rod modification protein  45.81 
 
 
231 aa  168  6e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.414017  hitchhiker  0.00818545 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1198  flagellar basal body rod modification protein  45.81 
 
 
231 aa  168  6e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1454  flagellar basal body rod modification protein  45.81 
 
 
231 aa  168  6e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00192771 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1323  flagellar basal body rod modification protein  42.92 
 
 
222 aa  167  1e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2053  flagellar basal body rod modification protein  45.32 
 
 
231 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.251185 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1198  flagellar basal body rod modification protein  45.81 
 
 
231 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2012  flagellar basal body rod modification protein  41.36 
 
 
232 aa  166  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1288  flagellar basal body rod modification protein  41.36 
 
 
232 aa  166  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.126128  normal  0.0193993 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1273  flagellar basal body rod modification protein  41.36 
 
 
232 aa  166  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.41149  normal  0.0170794 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2196  flagellar basal body rod modification protein  41.36 
 
 
232 aa  166  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000763375 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1244  flagellar basal body rod modification protein  41.36 
 
 
232 aa  166  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.450688  normal  0.238344 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1956  flagellar hook capping protein  42.18 
 
 
228 aa  160  2e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2596  flagellar basal body rod modification protein  43.41 
 
 
224 aa  159  3e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.661244  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1870  flagellar basal body rod modification protein  40.61 
 
 
224 aa  159  4e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2322  flagellar basal body rod modification protein  42.61 
 
 
228 aa  158  8e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1589  flagellar basal body rod modification protein  43.69 
 
 
236 aa  158  8e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24020  flagellar basal body rod modification protein  40.43 
 
 
222 aa  157  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2000  flagellar basal body rod modification protein  43.28 
 
 
225 aa  157  2e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2423  flagellar basal body rod modification protein  42.17 
 
 
228 aa  155  4e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.563147  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1527  flagellar hook capping protein  40.1 
 
 
225 aa  150  1e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2922  flagellar hook capping protein  42.72 
 
 
224 aa  144  9e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1976  flagellar basal body rod modification protein  37.96 
 
 
235 aa  141  7e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3712  flagellar hook capping protein  41 
 
 
215 aa  137  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.395074 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4789  flagellar hook capping protein  41 
 
 
215 aa  137  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.739847  normal  0.428557 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0751  flagellar hook capping protein  42.65 
 
 
229 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.873785  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0344  basal-body rod modification protein FlgD  41.21 
 
 
221 aa  134  9e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.974182  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0631  flagellar hook capping protein  40.19 
 
 
220 aa  134  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0242  flagellar basal body rod modification protein  42.4 
 
 
278 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6369  flagellar basal body rod modification protein  43.07 
 
 
251 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.338716  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0464  flagellar basal body rod modification protein  41.01 
 
 
280 aa  132  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0268  flagellar basal body rod modification protein  41.01 
 
 
280 aa  132  6e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.501331  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0280  flagellar basal body rod modification protein  41.01 
 
 
280 aa  132  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2409  flagellar basal body rod modification protein  41.83 
 
 
248 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.858083  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3023  flagellar basal body rod modification protein  41.83 
 
 
248 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112366  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2732  flagellar hook capping protein  41.21 
 
 
224 aa  130  1.0000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000455072 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3327  flagellar basal body rod modification protein  40.28 
 
 
277 aa  128  6e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0142  flagellar basal body rod modification protein  42.08 
 
 
240 aa  128  6e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.937871 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2996  flagellar basal body rod modification protein  40.28 
 
 
277 aa  128  6e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0567  flagellar hook capping protein  38 
 
 
236 aa  128  6e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2097  flagellar basal body rod modification protein  40.28 
 
 
277 aa  128  6e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3352  flagellar basal body rod modification protein  40.28 
 
 
277 aa  128  6e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3792  flagellar basal body rod modification protein  41.58 
 
 
240 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3716  flagellar hook capping protein  39 
 
 
223 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0895  flagellar hook capping protein  40.2 
 
 
222 aa  126  4.0000000000000003e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0928  flagellar hook capping protein  43.15 
 
 
223 aa  124  1e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3042  flagellar basal body rod modification protein  41.83 
 
 
248 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4422  flagellar hook capping protein  34.21 
 
 
216 aa  122  4e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3018  flagellar basal body rod modification protein  40.1 
 
 
247 aa  122  6e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2950  flagellar basal body rod modification protein  37.62 
 
 
237 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.427206  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3068  flagellar basal body rod modification protein  40.1 
 
 
248 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2933  flagellar basal body rod modification protein  40.1 
 
 
248 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.766915 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4249  flagellar basal body rod modification protein  36.7 
 
 
242 aa  119  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3915  flagellar hook capping protein  42.53 
 
 
221 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0387265 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3102  flagellar hook capping protein  38.19 
 
 
216 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.576147  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3829  flagellar hook capping protein  38.19 
 
 
216 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0782  flagellar hook capping protein  39 
 
 
230 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2376  flagellar hook capping protein  34.63 
 
 
226 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1774  flagellar hook capping protein  35.21 
 
 
245 aa  113  2.0000000000000002e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3730  flagellar basal body rod modification protein  33.18 
 
 
235 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.468195  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4206  flagellar hook capping protein  38.42 
 
 
221 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2848  flagellar basal body rod modification protein  35.68 
 
 
221 aa  111  9e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.128669 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0576  flagellar hook capping protein  38.66 
 
 
227 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1790  flagellar basal body rod modification protein  34.34 
 
 
235 aa  110  1.0000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1219  flagellar hook capping protein  35.32 
 
 
226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.248011  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2336  flagellar basal body rod modification protein  35.18 
 
 
236 aa  110  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1466  flagellar basal body rod modification protein  33.04 
 
 
234 aa  109  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2211  flagellar basal-body rod modification protein FlgD  34.62 
 
 
238 aa  109  4.0000000000000004e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3831  flagellar hook capping protein  40.94 
 
 
221 aa  108  6e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1904  flagellar basal body rod modification protein  35.05 
 
 
227 aa  108  7.000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.141438 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3105  flagellar hook capping protein  36.76 
 
 
218 aa  107  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3950  flagellar basal body rod modification protein  34.45 
 
 
233 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0518  flagellar hook capping protein  33.7 
 
 
293 aa  106  3e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3071  flagellar hook capping protein  38.61 
 
 
217 aa  106  3e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.113202 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1712  basal-body rod modification protein FlgD  34.98 
 
 
263 aa  105  4e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4389  flagellar basal body rod modification protein  34.45 
 
 
233 aa  105  8e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.459754  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4298  flagellar basal body rod modification protein  29.44 
 
 
227 aa  104  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1388  flagellar hook capping protein  39 
 
 
225 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0334116  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50460  flagellar basal body rod modification protein  30.74 
 
 
237 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.021036 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2433  flagellar hook capping protein  33.33 
 
 
226 aa  103  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3479  flagellar basal body rod modification protein  30.29 
 
 
229 aa  102  5e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.205954  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2565  flagellar hook capping protein  35.84 
 
 
225 aa  102  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0763244  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2469  flagellar hook capping protein  35.84 
 
 
225 aa  102  7e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.144549  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0417  flagellar hook assembly protein FlgD  35.83 
 
 
218 aa  101  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004171  flagellar basal-body rod modification protein FlgD  34.67 
 
 
236 aa  100  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01011  flagellar basal body rod modification protein  35.71 
 
 
221 aa  100  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.695232  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06155  flagellar basal body rod modification protein  35.71 
 
 
221 aa  100  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000566097  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1104  flagellar hook capping protein  31.42 
 
 
225 aa  99.8  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1260  flagellar hook capping protein  35.53 
 
 
284 aa  99.4  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1226  flagellar basal body rod modification protein  34.24 
 
 
225 aa  98.2  9e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1226  flagellar basal body rod modification protein  34.24 
 
 
225 aa  98.2  9e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>