More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4132 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_0371  FAD linked oxidase domain-containing protein  69.72 
 
 		 1371 aa  1906    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.717387 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0793  FAD linked oxidase domain protein  79.37 
 
 		 1307 aa  2128    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.147444  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1604  FAD linked oxidase domain protein  71.13 
 
 		 1279 aa  1882    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1757  oxidoreductase, putative  66.77 
 
 		 1308 aa  1703    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0454  putative oxidoreductase protein  72.24 
 
 		 1345 aa  1937    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.306454 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0564  FAD linked oxidase domain-containing protein  71.56 
 
 		 1344 aa  1914    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2315  oxidoreductase, FAD-binding  71.72 
 
 		 1342 aa  1924    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.401308  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2763  oxidoreductase, FAD-binding  71.72 
 
 		 1342 aa  1924    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.197737  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0183  oxidoreductase, FAD-binding  71.72 
 
 		 1342 aa  1924    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1899  FAD linked oxidase domain-containing protein  71.21 
 
 		 1279 aa  1889    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.967348  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4121  hypothetical protein  64.8 
 
 		 1291 aa  1680    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0427  hypothetical protein  72.24 
 
 		 1324 aa  1955    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1511  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.07 
 
 		 1218 aa  766    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0219  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  65.63 
 
 		 1259 aa  1681    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.524228  normal  0.117138 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2778  FAD linked oxidase domain-containing protein  58.7 
 
 		 1289 aa  1494    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.826538  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0842  oxidoreductase, FAD-binding  71.72 
 
 		 1342 aa  1925    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0664  oxidoreductase, FAD-binding  71.72 
 
 		 1342 aa  1925    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3218  FAD linked oxidase domain protein  35.86 
 
 		 1212 aa  704    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4132  FAD linked oxidase domain protein  100 
 
 		 1292 aa  2671    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.48543  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6062  hypothetical protein  70.77 
 
 		 1341 aa  1912    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1235  oxidoreductase, FAD-binding  36.19 
 
 		 1217 aa  717    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.201991 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0799  oxidoreductase, FAD-binding  38.28 
 
 		 1214 aa  768    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.549534  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1769  oxidoreductase, FAD-binding, putative  56.89 
 
 		 1277 aa  1398    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0690  FAD linked oxidase domain protein  65.11 
 
 		 1292 aa  1686    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0778  FAD linked oxidase domain-containing protein  83.75 
 
 		 1265 aa  2192    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.756982 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2738  putative oxidoreductase protein  81.33 
 
 		 1308 aa  2132    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0789331 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5464  FAD linked oxidase domain-containing protein  81.78 
 
 		 1304 aa  2181    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.279541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0646  FAD linked oxidase domain protein  69.45 
 
 		 1364 aa  1916    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.801662  normal  0.70972 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3648  FAD linked oxidase domain-containing protein  83.08 
 
 		 1304 aa  2231    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0550  oxidoreductase, FAD-binding  71.36 
 
 		 1359 aa  1909    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2395  oxidoreductase, FAD-binding  71.72 
 
 		 1342 aa  1924    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3018  FAD linked oxidase-like  36.34 
 
 		 1213 aa  709    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0954  FAD linked oxidase domain protein  38.05 
 
 		 1221 aa  768    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.798871 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2653  FAD linked oxidase domain-containing protein  71.32 
 
 		 1340 aa  1905    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1288  FAD linked oxidase-like  82.66 
 
 		 1307 aa  2219    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0476  FAD linked oxidase-like protein  63.45 
 
 		 1271 aa  1647    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0858  FAD linked oxidase-like  84.55 
 
 		 1300 aa  2262    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.106319 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2999  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.34 
 
 		 1227 aa  735    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.479303 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1309  FAD linked oxidase domain-containing protein  79.49 
 
 		 1292 aa  2076    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0171955 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3117  FAD linked oxidase domain protein  35.93 
 
 		 1212 aa  704    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4053  putative oxidoreductase  70.12 
 
 		 1349 aa  1917    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0864  FAD linked oxidase domain-containing protein  79.6 
 
 		 1307 aa  2132    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.411484 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1263  FAD linked oxidase domain protein  38.24 
 
 		 1202 aa  768    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00018481 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0367  FAD linked oxidase-like protein  72.01 
 
 		 1324 aa  1957    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.985716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0329  FAD linked oxidase domain protein  71.77 
 
 		 1345 aa  1924    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.271253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0750  FAD linked oxidase domain-containing protein  80.08 
 
 		 1309 aa  2141    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.886785 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1445  FAD linked oxidase domain protein  56.89 
 
 		 1277 aa  1398    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0680  oxidoreductase, FAD-binding  71.57 
 
 		 1342 aa  1921    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.837218  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1652  FAD linked oxidase domain protein  36.73 
 
 		 1210 aa  730    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.154476  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2123  FAD linked oxidase-like  71.72 
 
 		 1341 aa  1910    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2762  FAD linked oxidase domain-containing protein  71.72 
 
 		 1341 aa  1910    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1605  FAD linked oxidase domain protein  37.42 
 
 		 1218 aa  730    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.447482  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1638  FAD linked oxidase domain-containing protein  58.24 
 
 		 1288 aa  1497    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0344  FAD linked oxidase domain protein  71.84 
 
 		 1345 aa  1925    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.599686  normal  0.30676 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2786  FAD linked oxidase domain-containing protein  71.47 
 
 		 1340 aa  1910    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.616835  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0053  FAD linked oxidase domain-containing protein  54.58 
 
 		 1286 aa  1415    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.170448  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2735  FAD linked oxidase domain-containing protein  71.72 
 
 		 1341 aa  1910    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.330233  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1918  FAD linked oxidase domain-containing protein  52.14 
 
 		 1282 aa  1368    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0545  FAD linked oxidase domain protein  57.34 
 
 		 1280 aa  1503    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.650585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1789  FAD linked oxidase domain protein  32.56 
 
 		 1183 aa  518  1.0000000000000001e-145  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0377487  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0312  oxidoreductase  32.63 
 
 		 1188 aa  511  1e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1131  FAD linked oxidase domain protein  31.88 
 
 		 1197 aa  504  1e-141  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0306  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.48 
 
 		 1187 aa  500  1e-140  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2353  FAD linked oxidase domain protein  32.37 
 
 		 1204 aa  496  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.251166 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0044  FAD linked oxidase domain protein  30.22 
 
 		 1183 aa  491  1e-137  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.559839  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1592  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24.69 
 
 		 459 aa  114  1.0000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0693  glycolate oxidase, subunit GlcD  26.01 
 
 		 459 aa  113  3e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0311097  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0525  FAD linked oxidase domain protein  26.94 
 
 		 456 aa  110  1e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00145948  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2776  FAD linked oxidase domain protein  27.41 
 
 		 472 aa  109  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1012  glycolate oxidase iron-sulfur subunit, putative  24.68 
 
 		 430 aa  108  6e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.443233  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1351  putative FAD-binding oxidoreductase  27.16 
 
 		 472 aa  107  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.652696  normal  0.185636 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0517  glycolate oxidase, subunit GlcD  23.65 
 
 		 460 aa  107  2e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0493306  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1347  glycolate oxidase, subunit GlcD  23.42 
 
 		 460 aa  105  4e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1226  glycolate oxidase, subunit GlcD  23.42 
 
 		 460 aa  105  4e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0612986  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0682  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.5 
 
 		 493 aa  102  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.325958 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4598  FAD linked oxidase-like  26.92 
 
 		 473 aa  103  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.347374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2621  oxidoreductase, FAD-binding  27.46 
 
 		 473 aa  102  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.6474  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0971  FAD linked oxidase-like  26.81 
 
 		 473 aa  102  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.18122  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1453  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.81 
 
 		 473 aa  102  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.473918  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1313  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.23 
 
 		 469 aa  102  7e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.130987  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0843  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  22.02 
 
 		 418 aa  101  9e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000303103  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1862  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.33 
 
 		 472 aa  101  9e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.258357  hitchhiker  0.0000244132 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1431  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.75 
 
 		 473 aa  100  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.488984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0372  FAD linked oxidase-like  23.73 
 
 		 461 aa  100  2e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.942962  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1704  oxidoreductase, FAD-binding  27.46 
 
 		 473 aa  99.8  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0409  oxidoreductase, FAD-binding  27.46 
 
 		 473 aa  99.8  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0939  oxidoreductase, FAD-binding  27.46 
 
 		 473 aa  99.8  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1472  oxidoreductase, FAD-binding  27.46 
 
 		 473 aa  99.8  3e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0753  oxidoreductase, FAD-binding  27.46 
 
 		 473 aa  99.8  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.78628  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2133  FAD linked oxidase domain protein  26.34 
 
 		 457 aa  99  5e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.247129 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1859  oxidoreductase, FAD-binding  27.2 
 
 		 524 aa  98.2  8e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1682  oxidoreductase, FAD-binding  27.2 
 
 		 473 aa  98.2  9e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1374  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.68 
 
 		 473 aa  98.2  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.901201 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1615  glycolate oxidase, subunit GlcD  22.81 
 
 		 460 aa  97.8  1e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1914  FAD linked oxidase domain protein  24.94 
 
 		 485 aa  97.4  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0185125  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1578  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.37 
 
 		 475 aa  97.1  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1334  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.68 
 
 		 473 aa  97.1  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2375  FAD linked oxidase-like protein  24.34 
 
 		 952 aa  95.5  6e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4517  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  23.06 
 
 		 434 aa  94.7  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2369  FAD linked oxidase domain protein  24.35 
 
 		 481 aa  94.4  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>