More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4097 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_4097  quinolinate synthetase  100 
 
 
374 aa  765    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0938  quinolinate synthetase  82.7 
 
 
377 aa  634  1e-180  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.432246  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0903  quinolinate synthetase  81.96 
 
 
377 aa  627  1e-179  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3497  quinolinate synthetase  82.93 
 
 
374 aa  626  1e-178  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0545578  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2820  quinolinate synthetase  82.38 
 
 
374 aa  622  1e-177  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3850  quinolinate synthetase  82.47 
 
 
375 aa  614  1e-175  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1319  quinolinate synthetase  81.72 
 
 
378 aa  607  1e-173  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0026  quinolinate synthetase  77.66 
 
 
370 aa  581  1.0000000000000001e-165  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.44147  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2874  quinolinate synthetase  67.36 
 
 
384 aa  531  1e-150  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2737  quinolinate synthetase  67.1 
 
 
384 aa  527  1e-148  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.919283  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2717  quinolinate synthetase  67.98 
 
 
382 aa  527  1e-148  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2327  quinolinate synthetase  67.98 
 
 
382 aa  527  1e-148  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0615138 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0789  quinolinate synthetase  67.9 
 
 
391 aa  522  1e-147  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.343381  normal  0.0932442 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5838  quinolinate synthetase  67.11 
 
 
378 aa  519  1e-146  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2531  quinolinate synthetase  67.37 
 
 
378 aa  518  1e-146  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.647299 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0813  quinolinate synthetase  68.8 
 
 
379 aa  518  1e-146  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.820419 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1895  quinolinate synthetase  67.37 
 
 
378 aa  520  1e-146  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3153  quinolinate synthetase  69.36 
 
 
379 aa  520  1e-146  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428379  normal  0.197173 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2553  quinolinate synthetase  67.37 
 
 
378 aa  519  1e-146  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2506  quinolinate synthetase  67.37 
 
 
378 aa  520  1e-146  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2449  quinolinate synthetase  67.19 
 
 
382 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2424  quinolinate synthetase  67.11 
 
 
378 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.274031  hitchhiker  0.000442231 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0580  quinolinate synthetase  69.08 
 
 
376 aa  514  1e-144  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.916208  normal  0.575901 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0776  quinolinate synthetase  67.74 
 
 
378 aa  509  1e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2236  quinolinate synthetase  66.58 
 
 
378 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.694626  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2105  quinolinate synthetase  66.58 
 
 
378 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.384303  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1026  quinolinate synthetase  66.58 
 
 
378 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0959109  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2651  quinolinate synthetase  66.58 
 
 
378 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0978  quinolinate synthetase  66.31 
 
 
378 aa  503  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0974  quinolinate synthetase  66.31 
 
 
378 aa  503  1e-141  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2015  quinolinate synthetase  66.3 
 
 
372 aa  487  1e-136  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.332411 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1131  quinolinate synthetase  67.71 
 
 
350 aa  483  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1554  quinolinate synthetase  67.23 
 
 
371 aa  473  1e-132  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1964  quinolinate synthetase  65.01 
 
 
395 aa  473  1e-132  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2150  quinolinate synthetase  65.81 
 
 
377 aa  458  9.999999999999999e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0256  quinolinate synthetase  65.36 
 
 
357 aa  454  1e-127  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0768  quinolinate synthetase  60.98 
 
 
375 aa  455  1e-127  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.68917 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1789  quinolinate synthetase  65.54 
 
 
355 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0746  quinolinate synthetase  66.97 
 
 
356 aa  452  1.0000000000000001e-126  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1740  quinolinate synthetase  59.5 
 
 
352 aa  449  1e-125  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1282  quinolinate synthetase  64.44 
 
 
352 aa  449  1e-125  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1103  quinolinate synthetase  61.79 
 
 
375 aa  449  1e-125  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02681  quinolinate synthetase  65.96 
 
 
345 aa  449  1e-125  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000074326  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1928  quinolinate synthetase  64.86 
 
 
355 aa  451  1e-125  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0143239 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2342  quinolinate synthetase  64.56 
 
 
357 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0632  quinolinate synthetase  60.34 
 
 
379 aa  447  1.0000000000000001e-124  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0820  quinolinate synthetase  62.46 
 
 
347 aa  445  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0928901  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0883  quinolinate synthetase  62.46 
 
 
347 aa  445  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00857048  normal  0.855008 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2025  quinolinate synthetase  64.16 
 
 
357 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00330504  hitchhiker  0.0000127586 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2128  quinolinate synthetase  63.86 
 
 
357 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.252809  hitchhiker  0.00117458 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1888  quinolinate synthetase  64.26 
 
 
360 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.683594  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1712  quinolinate synthetase  64.09 
 
 
355 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0567053 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3082  quinolinate synthetase  62.76 
 
 
353 aa  444  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0534607  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0915  quinolinate synthetase  61.88 
 
 
367 aa  441  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0741807  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4393  quinolinate synthetase  65.35 
 
 
352 aa  442  1e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.27497  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0221  quinolinate synthetase  63.94 
 
 
343 aa  441  1e-123  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.071665 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2152  quinolinate synthetase  63.66 
 
 
355 aa  441  1e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000718643  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0851  quinolinate synthetase  61.88 
 
 
367 aa  443  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000370628  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2243  quinolinate synthetase  63.25 
 
 
355 aa  441  1e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1241  quinolinate synthetase  61.86 
 
 
347 aa  443  1e-123  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000887562  normal  0.241472 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1254  quinolinate synthetase  62.17 
 
 
353 aa  442  1e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00563741  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2219  quinolinate synthetase  63.66 
 
 
355 aa  441  1e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000709559  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1950  quinolinate synthetase  63.86 
 
 
357 aa  444  1e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.692849  hitchhiker  0.00216399 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1938  quinolinate synthetase  63.25 
 
 
355 aa  441  1e-123  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.43657  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51330  quinolinate synthetase  64.39 
 
 
352 aa  442  1e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000717846 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4505  quinolinate synthetase  63.66 
 
 
355 aa  441  1e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0730  quinolinate synthetase  64.15 
 
 
353 aa  441  1e-123  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.274788  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1282  quinolinate synthetase  61.58 
 
 
353 aa  439  9.999999999999999e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000000716329  hitchhiker  0.00188816 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1231  quinolinate synthetase  62.61 
 
 
352 aa  438  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.687008 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3981  quinolinate synthetase  62.92 
 
 
352 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.857271  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4397  quinolinate synthetase  63.83 
 
 
352 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.352624 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1260  quinolinate synthetase  62.61 
 
 
352 aa  438  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.720292  normal  0.335843 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0792  quinolinate synthetase  61.88 
 
 
347 aa  441  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000157841  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2326  quinolinate synthetase  64.24 
 
 
355 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00278867 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35390  quinolinate synthetase  66.14 
 
 
352 aa  438  9.999999999999999e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2281  quinolinate synthetase  62.95 
 
 
355 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.880932  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0600  quinolinate synthetase  59.5 
 
 
379 aa  441  9.999999999999999e-123  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.287851  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2202  quinolinate synthetase  63.36 
 
 
360 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0931792  normal  0.199865 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1696  quinolinate synthetase  61.99 
 
 
353 aa  439  9.999999999999999e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000330857  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00703  quinolinate synthetase  62.05 
 
 
347 aa  434  1e-121  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000418206  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2892  quinolinate synthetase complex, A subunit  62.05 
 
 
347 aa  434  1e-121  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000810119  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0777  quinolinate synthetase  62.05 
 
 
347 aa  435  1e-121  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000642145  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2912  quinolinate synthetase  62.05 
 
 
347 aa  434  1e-121  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00694281  normal  0.200335 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0852  quinolinate synthetase  62.05 
 
 
344 aa  435  1e-121  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000151704  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0773  quinolinate synthetase  62.35 
 
 
347 aa  437  1e-121  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000227851  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4187  quinolinate synthetase  62.61 
 
 
352 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.152766  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3071  quinolinate synthetase  65.09 
 
 
359 aa  437  1e-121  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0793  quinolinate synthetase  65.71 
 
 
352 aa  435  1e-121  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0774972  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00692  hypothetical protein  62.05 
 
 
347 aa  434  1e-121  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000554591  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2232  quinolinate synthetase  63.36 
 
 
355 aa  437  1e-121  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.011888  hitchhiker  0.00937696 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0804  quinolinate synthetase  61.75 
 
 
347 aa  433  1e-120  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000282158  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1542  quinolinate synthetase  61.72 
 
 
352 aa  431  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.061023 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0671  quinolinate synthetase  61.75 
 
 
347 aa  433  1e-120  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000178464  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3959  quinolinate synthetase complex, subunit A  61.42 
 
 
352 aa  430  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.510358  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01614  quinolinate synthetase  59.88 
 
 
353 aa  429  1e-119  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1161  quinolinate synthetase complex, A subunit  61.26 
 
 
347 aa  429  1e-119  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.143012  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2898  quinolinate synthetase complex, A subunit  60.73 
 
 
349 aa  425  1e-118  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000238804  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2524  quinolinate synthetase  62.15 
 
 
356 aa  423  1e-117  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.792691  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0852  quinolinate synthetase  64.29 
 
 
342 aa  422  1e-117  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00075405  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2953  quinolinate synthetase  60.99 
 
 
353 aa  423  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000127352  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>