146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4036 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4036  globin  100 
 
 		 139 aa  290  6e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0847  globin  81.48 
 
 		 143 aa  233  5.0000000000000005e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0945  globin  73.97 
 
 		 166 aa  211  2.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.286317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2018  globin  77.17 
 
 		 133 aa  208  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3254  globin  70.59 
 
 		 134 aa  202  2e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.512401  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2781  globin  72.73 
 
 		 141 aa  200  7e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.778315  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3454  globin  72.73 
 
 		 141 aa  199  9.999999999999999e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.273084  normal  0.734777 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2697  putative globin  61.19 
 
 		 136 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2302  globin  63.16 
 
 		 136 aa  171  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2317  globin  62.41 
 
 		 136 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0697  globin  66.4 
 
 		 142 aa  171  3.9999999999999995e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.462727 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2195  globin  62.41 
 
 		 136 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0999  globin  62.41 
 
 		 136 aa  170  5.999999999999999e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0834187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1667  globin  62.41 
 
 		 136 aa  169  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.291446  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2279  globin  62.41 
 
 		 136 aa  169  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0935  hypothetical protein  62.7 
 
 		 139 aa  168  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5606  globin-like protein  61.65 
 
 		 136 aa  168  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.62023  normal  0.960923 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2090  putative oxygen-binding protein (globin)  62.1 
 
 		 134 aa  163  6.9999999999999995e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1030  hypothetical protein  60.15 
 
 		 164 aa  163  8e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3244  putative oxygen-binding protein, globin-like  62.5 
 
 		 137 aa  163  8e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2241  globin  62.9 
 
 		 134 aa  163  8e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.723886  normal  0.694262 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1316  globin  61.72 
 
 		 137 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.129637 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2049  globin  59.26 
 
 		 141 aa  161  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.366529  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1917  globin  61.29 
 
 		 134 aa  160  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.626219  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1867  hypothetical protein  59.4 
 
 		 148 aa  160  6e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1401  hypothetical protein  59.4 
 
 		 148 aa  160  6e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1095  hypothetical protein  59.4 
 
 		 136 aa  159  9e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0772  hypothetical protein  59.4 
 
 		 136 aa  159  9e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1253  hypothetical protein  59.4 
 
 		 136 aa  159  9e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1261  hypothetical protein  59.4 
 
 		 136 aa  159  9e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.100755  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0378  hypothetical protein  59.4 
 
 		 136 aa  159  9e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.746099  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0899  globin  57.78 
 
 		 147 aa  159  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1355  globin  55.91 
 
 		 129 aa  148  2e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.610023  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1997  hypothetical protein  51.16 
 
 		 129 aa  141  3e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.174841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3955  globin  54.33 
 
 		 128 aa  141  3e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.405628  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0774  putative oxygen-binding protein (globin)  50.39 
 
 		 126 aa  130  3.9999999999999996e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.207145 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1800  globin family protein  49.61 
 
 		 128 aa  128  2.0000000000000002e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3147  conserved hypothetical globin-like protein  49.22 
 
 		 129 aa  125  3e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0120923  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1256  globin  46.46 
 
 		 137 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.331075 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1548  heme-binding protein, putative  48.85 
 
 		 130 aa  122  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1263  globin  48.85 
 
 		 129 aa  122  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.932923 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1464  putative globin  46.51 
 
 		 139 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00251248 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2346  globin  45.8 
 
 		 142 aa  114  3.9999999999999997e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.636016  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1878  hypothetical protein  43.61 
 
 		 131 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2330  globin  42.42 
 
 		 130 aa  105  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.260372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3650  globin  41.01 
 
 		 141 aa  102  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.260647 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00030  putative hemoglobin-like oxygen-binding protein  41.27 
 
 		 143 aa  100  6e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0488861  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3444  hypothetical protein  40.94 
 
 		 130 aa  99  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.237349  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5890  putative hemoglobin protein (truncated hemoglobin)  42.75 
 
 		 152 aa  98.6  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429127  normal  0.556027 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2614  globin  50.49 
 
 		 133 aa  98.6  3e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.307504  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4060  globin family  40.94 
 
 		 145 aa  97.8  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.171574 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0410  globin  41.41 
 
 		 144 aa  97.8  5e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.236118 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3010  globin  39.84 
 
 		 136 aa  96.7  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1326  globin  42.31 
 
 		 139 aa  95.5  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0051  globin  37.4 
 
 		 143 aa  95.9  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.294967  normal  0.0701367 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3728  globin  40.91 
 
 		 142 aa  95.9  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.325061  hitchhiker  0.00731261 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18050  globin-like protein  37.01 
 
 		 131 aa  95.9  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0868344  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3261  globin  38.28 
 
 		 136 aa  94.4  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.4456 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1767  globin  43.31 
 
 		 137 aa  92  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0039  globin  38.35 
 
 		 145 aa  92.4  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.372259  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0038  globin  38.35 
 
 		 145 aa  92.8  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000122438 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0038  globin  38.35 
 
 		 145 aa  92.8  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0612769  unclonable  0.00000927103 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0046  globin  38.64 
 
 		 149 aa  92  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0363016  normal  0.25879 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0036  globin  35.88 
 
 		 145 aa  91.7  3e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0572064  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0034  globin  36.64 
 
 		 145 aa  91.7  3e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0103941 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0039  globin  38.64 
 
 		 144 aa  92  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.102658  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2370  globin  40.48 
 
 		 130 aa  91.3  4e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.16985  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0031  globin  37.4 
 
 		 145 aa  91.3  4e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0800503  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0034  globin  37.59 
 
 		 144 aa  91.3  4e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.674256  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0042  globin  35.88 
 
 		 145 aa  90.9  5e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0182573  hitchhiker  0.000000860997 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1116  hypothetical protein  41.27 
 
 		 132 aa  89.7  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1209  hypothetical protein  41.27 
 
 		 132 aa  89.7  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4091  globin family protein  41.27 
 
 		 132 aa  89  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1355  globin family protein  41.27 
 
 		 132 aa  89  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1105  globin  41.27 
 
 		 132 aa  88.6  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1279  globin family protein  41.27 
 
 		 132 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1317  hypothetical protein  41.27 
 
 		 132 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.997153  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1098  globin family protein  41.27 
 
 		 132 aa  88.6  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1092  globin family protein  41.27 
 
 		 132 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.720422  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0039  globin  35.11 
 
 		 145 aa  87.8  4e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0031  globin  36.29 
 
 		 144 aa  87.8  4e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0030771  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1250  globin family protein  40.48 
 
 		 132 aa  88.2  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0031  globin  39.37 
 
 		 156 aa  87  8e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000058274  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1225  globin  40.31 
 
 		 125 aa  85.5  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0341074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0911  globin  39.68 
 
 		 132 aa  85.5  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0132  globin  37.9 
 
 		 144 aa  84.3  5e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.823311 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1200  globin  41.53 
 
 		 137 aa  83.2  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.139357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3575  hemoglobin-like protein  40.16 
 
 		 125 aa  81.6  0.000000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1243  globin  40.32 
 
 		 133 aa  80.5  0.000000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2419  globin  38.71 
 
 		 123 aa  80.1  0.000000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5317  globin  38.35 
 
 		 139 aa  77.4  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0702045  normal  0.216575 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0783  globin  37.8 
 
 		 133 aa  77  0.00000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259249 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3074  globin  33.98 
 
 		 138 aa  75.9  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0236905 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0069  globin  36.45 
 
 		 131 aa  74.7  0.0000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1609  globin  38.35 
 
 		 132 aa  74.3  0.0000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.650446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5057  globin  35.94 
 
 		 131 aa  72.8  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.342069 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1626  globin  38.89 
 
 		 137 aa  73.2  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3913  globin  39.1 
 
 		 142 aa  71.6  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.237071 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1149  globin  33.57 
 
 		 140 aa  71.2  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.572775  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0771  globin  34.92 
 
 		 137 aa  70.5  0.000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>