288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4021 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4021  PHP domain protein  100 
 
 		 285 aa  588  1e-167  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3274  phosphotransferase domain-containing protein  79.86 
 
 		 287 aa  462  1e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.156936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3707  phosphotransferase domain-containing protein  77.89 
 
 		 287 aa  452  1.0000000000000001e-126  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.604473 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1005  PHP-like  81.34 
 
 		 286 aa  449  1e-125  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117289 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3431  phosphotransferase domain-containing protein  77.03 
 
 		 292 aa  437  1e-121  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2763  PHP domain protein  77.03 
 
 		 292 aa  437  1e-121  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.417679  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3236  PHP-like  75.7 
 
 		 319 aa  429  1e-119  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1626  phosphotransferase domain-containing protein  76.43 
 
 		 303 aa  426  1e-118  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2756  hypothetical protein  73.85 
 
 		 287 aa  422  1e-117  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.308411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2582  phosphotransferase domain-containing protein  73.4 
 
 		 298 aa  422  1e-117  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00424426 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5411  phosphotransferase domain-containing protein  75.53 
 
 		 287 aa  410  1e-113  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.861836 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1140  hypothetical protein  65.82 
 
 		 286 aa  370  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0844  phosphotransferase domain-containing protein  66.06 
 
 		 282 aa  363  2e-99  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0982  PHP domain protein  65.09 
 
 		 286 aa  360  2e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.727883  normal  0.091006 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1078  PHP domain protein  64.73 
 
 		 286 aa  356  1.9999999999999998e-97  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0351695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0994  PHP domain protein  65.07 
 
 		 283 aa  353  1e-96  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000016176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1100  PHP, C-terminal  62.13 
 
 		 281 aa  343  1e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1174  phosphotransferase domain-containing protein  62.87 
 
 		 279 aa  340  2e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.806701  decreased coverage  0.000000145397 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1580  hypothetical protein  61.54 
 
 		 276 aa  338  5e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.126849  normal  0.792239 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2553  PHP domain protein  61.17 
 
 		 276 aa  338  5.9999999999999996e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000196897  normal  0.153793 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1064  PHP-like protein  59.56 
 
 		 322 aa  336  1.9999999999999998e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0429351  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1683  phosphoesterase, putative  61.9 
 
 		 276 aa  329  4e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.478385  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3132  putative phosphoesterase  61.9 
 
 		 276 aa  329  4e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.322538  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1458  putative phosphoesterase  61.9 
 
 		 276 aa  329  4e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.525021  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2570  putative phosphoesterase  61.9 
 
 		 276 aa  329  4e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2185  putative phosphoesterase  61.9 
 
 		 276 aa  329  4e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2703  metal-dependent phosphoesterase  61.9 
 
 		 276 aa  328  5.0000000000000004e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2624  putative phosphoesterase  61.9 
 
 		 276 aa  328  5.0000000000000004e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2118  phosphotransferase domain-containing protein  64.1 
 
 		 279 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00317755 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5977  PHP-like  64.1 
 
 		 279 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2100  phosphotransferase domain-containing protein  64.1 
 
 		 279 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5406  PHP-like metal-dependent phosphoesterase  64.1 
 
 		 279 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.272926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1432  phosphotransferase domain-containing protein  60.22 
 
 		 277 aa  326  3e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.955485 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1901  phosphoesterase, putative  62.64 
 
 		 276 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2137  phosphotransferase domain-containing protein  62.64 
 
 		 276 aa  311  5.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2010  phosphotransferase domain-containing protein  62.27 
 
 		 276 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.258482  hitchhiker  0.000228692 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2314  PHP-like  55.31 
 
 		 279 aa  308  5e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2462  PHP, C-terminal  54.38 
 
 		 295 aa  291  7e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.735424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1528  phosphoesterase PHP  54.38 
 
 		 287 aa  281  7.000000000000001e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0724488 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1683  PHP domain protein  54.18 
 
 		 301 aa  275  8e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2384  PHP family metal-dependent phosphoesterase  46.4 
 
 		 278 aa  249  4e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1877  PHP-like protein  46.3 
 
 		 284 aa  248  7e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0359  phosphotransferase domain-containing protein  47.58 
 
 		 277 aa  227  1e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.663247  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1101  PHP domain protein  42.96 
 
 		 286 aa  217  2e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0987  hypothetical protein  42.96 
 
 		 286 aa  217  2e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.561558  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2402  phosphotransferase domain-containing protein  44.4 
 
 		 286 aa  215  5.9999999999999996e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2700  phosphotransferase domain-containing protein  44.4 
 
 		 302 aa  215  8e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2800  phosphotransferase domain-containing protein  44.4 
 
 		 302 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.660004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2721  phosphotransferase domain-containing protein  44.4 
 
 		 302 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1231  PHP-like  39.78 
 
 		 281 aa  211  1e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000070762  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1665  PHP domain protein  44.04 
 
 		 286 aa  211  1e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0193583  hitchhiker  0.000506182 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2911  phosphotransferase domain-containing protein  42.81 
 
 		 287 aa  208  8e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.367074 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0883  TrpH protein  40.22 
 
 		 269 aa  205  8e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.33957  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1430  phosphotransferase domain-containing protein  42.65 
 
 		 286 aa  202  4e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1718  hypothetical protein  40.29 
 
 		 278 aa  202  5e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1878  phosphotransferase domain-containing protein  40.52 
 
 		 288 aa  201  8e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1644  phosphotransferase domain-containing protein  40.93 
 
 		 292 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1529  phosphotransferase domain-containing protein  43.68 
 
 		 286 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.70197  normal  0.0178812 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1521  phosphotransferase domain-containing protein  44.04 
 
 		 286 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0120017 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3017  TrpH family protein  43.68 
 
 		 286 aa  199  3e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1463  phosphotransferase domain-containing protein  43.32 
 
 		 286 aa  198  7e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2666  phosphotransferase domain-containing protein  42.44 
 
 		 295 aa  197  1.0000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000470189 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1687  phosphotransferase domain-containing protein  41.61 
 
 		 285 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1834  phosphotransferase domain-containing protein  41.26 
 
 		 303 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.297742  normal  0.423951 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2449  PHP-like protein  40.14 
 
 		 286 aa  195  7e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3586  phosphoesterase PHP, N-terminal:PHP, C-terminal  40.99 
 
 		 287 aa  194  1e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.604486  normal  0.45236 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02756  hypothetical protein  38.55 
 
 		 292 aa  194  1e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1599  hypothetical protein  40.59 
 
 		 279 aa  193  3e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1487  PHP-like  38.87 
 
 		 287 aa  191  9e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0371486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2203  phosphotransferase domain-containing protein  40.36 
 
 		 298 aa  191  1e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000209881 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1397  hypothetical protein  39.85 
 
 		 279 aa  190  2e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2250  phosphotransferase domain-containing protein  41.03 
 
 		 286 aa  190  2e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00409955 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1931  PHP domain protein  39.85 
 
 		 297 aa  190  2e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2041  phosphotransferase domain-containing protein  42.8 
 
 		 311 aa  189  2.9999999999999997e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.67494  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1930  phosphotransferase domain-containing protein  42.8 
 
 		 299 aa  190  2.9999999999999997e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0687  phosphotransferase domain-containing protein  42.24 
 
 		 284 aa  189  4e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.134262  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1810  PHP domain protein  39.93 
 
 		 287 aa  189  5e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0150  phosphotransferase domain-containing protein  40.94 
 
 		 282 aa  188  9e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2828  PHP-like  39.05 
 
 		 288 aa  187  1e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2311  phosphotransferase domain-containing protein  42.44 
 
 		 310 aa  187  1e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0798  hypothetical protein  37.82 
 
 		 290 aa  186  3e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1155  hypothetical protein  38.18 
 
 		 281 aa  186  5e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.405335  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2171  PHP domain protein  39.71 
 
 		 290 aa  182  5.0000000000000004e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.772956  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2309  PHP domain protein  38.85 
 
 		 290 aa  182  6e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.244375  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1412  phosphotransferase domain-containing protein  38.52 
 
 		 286 aa  181  9.000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0394495  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4500  trpH family protein  38.16 
 
 		 286 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.655584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1061  phosphotransferase domain-containing protein  39.11 
 
 		 291 aa  179  5.999999999999999e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.145875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4006  phosphotransferase domain-containing protein  38.16 
 
 		 286 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000044787 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3789  phosphotransferase domain-containing protein  37.46 
 
 		 286 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000806386 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003090  PHP family hydrolase  38.89 
 
 		 264 aa  178  1e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.389296  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1898  putative phosphoesterase  39.19 
 
 		 293 aa  176  3e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000460558 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2008  PHP domain protein  39.11 
 
 		 296 aa  176  4e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.208855  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1867  putative phosphoesterase  39.19 
 
 		 293 aa  175  8e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000652478 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01240  hypothetical protein  39.19 
 
 		 293 aa  175  9e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01250  hypothetical protein  39.19 
 
 		 293 aa  175  9e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2383  PHP domain protein  39.19 
 
 		 293 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00108738  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1465  putative phosphoesterase  39.19 
 
 		 286 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.200678  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2362  phosphotransferase domain-containing protein  39.19 
 
 		 293 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000319693 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15640  Phosphoesterase (PHP family)  39.92 
 
 		 287 aa  174  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.3789  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1375  putative phosphoesterase  39.19 
 
 		 286 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>