More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3984 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3984  NLP/P60 protein  100 
 
 		 173 aa  342  2e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.499071  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0019  NLP/P60 protein  61.94 
 
 		 160 aa  185  2e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0865382  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0001  NLP/P60 protein  62.58 
 
 		 160 aa  186  2e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.309085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0020  NLP/P60 protein  66.19 
 
 		 184 aa  178  2.9999999999999997e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2733  NLP/P60 protein  64.84 
 
 		 190 aa  171  5.999999999999999e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0192428  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0741  NLP/P60  62.99 
 
 		 167 aa  164  5e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.128662  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1706  lipoprotein, putative  50 
 
 		 181 aa  149  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33170  NLP/P60 family lipoprotein  53.29 
 
 		 173 aa  149  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0857869  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3683  NLP/P60  55.73 
 
 		 181 aa  144  5e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00454661 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1228  NLP/P60 protein  54 
 
 		 177 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.771322  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1670  NLP/P60 protein  56.43 
 
 		 177 aa  142  3e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4048  NLP/P60 protein  51.63 
 
 		 177 aa  142  3e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1747  NLP/P60 protein  54.86 
 
 		 174 aa  141  4e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1268  NLP/P60 protein  53.42 
 
 		 177 aa  141  6e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.200264 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4179  putative lipoprotein  56.91 
 
 		 197 aa  138  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000450162  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48790  putative lipoprotein  56.91 
 
 		 177 aa  138  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.006644  hitchhiker  0.0000000144437 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1659  hypothetical protein  47.34 
 
 		 209 aa  137  8.999999999999999e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.255203  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1606  NLP/P60 protein  47.34 
 
 		 209 aa  136  1e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1638  NLP/P60  53.66 
 
 		 178 aa  134  8e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.52996  normal  0.0475001 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0427  NLP/P60 protein  52.8 
 
 		 177 aa  128  4.0000000000000003e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00285469  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2887  NLP/P60 protein  51.43 
 
 		 179 aa  128  5.0000000000000004e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.171139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01907  lipoprotein  53.72 
 
 		 133 aa  125  2.0000000000000002e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.324405  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1314  lipoprotein transmembrane  50.85 
 
 		 258 aa  123  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1982  NLP/P60 family protein  45.16 
 
 		 234 aa  122  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000770897  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1602  NLP/P60 family protein  45.16 
 
 		 234 aa  122  3e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000000624175  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2630  NLP/P60 family protein  45.16 
 
 		 234 aa  122  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000022944  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2543  NlpC/P60 domain-containing protein  45.16 
 
 		 218 aa  122  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.241327  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2393  putative transmembrane lipoprotein  41.53 
 
 		 404 aa  122  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.951834  normal  0.103299 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1378  NLP/P60 family protein  45.16 
 
 		 218 aa  122  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0650104  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2105  NLP/P60 family protein  45.16 
 
 		 218 aa  122  3e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000576333  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3208  NLP/P60 family protein  45.16 
 
 		 218 aa  122  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00320254  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1794  NLP/P60 protein  43.45 
 
 		 418 aa  122  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.435053  hitchhiker  0.00883906 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2489  NlpC/P60 domain-containing protein  45.16 
 
 		 234 aa  122  3e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00285101  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1218  NLP/P60 protein  44.35 
 
 		 224 aa  121  4e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00850028  normal  0.283839 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1250  NLP/P60 protein  49.17 
 
 		 248 aa  121  4e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.000552171  normal  0.790948 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2497  NLP/P60 protein  44.35 
 
 		 221 aa  121  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000164638  normal  0.0130851 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1018  NLP/P60 protein  45.9 
 
 		 215 aa  121  6e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.121174  normal  0.0409551 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1640  NLP/P60 family protein  44.35 
 
 		 221 aa  121  6e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000364437  normal  0.336888 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1112  NLP/P60 protein  45.9 
 
 		 215 aa  120  7e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.893499 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2142  NLP/P60  45.16 
 
 		 226 aa  120  9e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0634754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1960  NLP/P60 protein  44.35 
 
 		 223 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0530532  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3968  NLP/P60 protein  43.2 
 
 		 211 aa  120  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.12193  normal  0.0821241 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1999  NLP/P60  50.83 
 
 		 226 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.762084  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2125  NLP/P60  45.16 
 
 		 228 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.839892  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5367  NLP/P60 family protein  44.35 
 
 		 224 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2090  NLP/P60 protein  44.35 
 
 		 223 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226051  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2077  NLP/P60 protein  44.35 
 
 		 223 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010952  normal  0.957052 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1189  NLP/P60 protein  49.17 
 
 		 249 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.103363  normal  0.0364754 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1379  NLP/P60 protein  43.55 
 
 		 223 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0123318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1972  NLP/P60  49.17 
 
 		 212 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.107958  normal  0.172208 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6019  NLP/P60  44.35 
 
 		 223 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377627  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2058  NLP/P60 protein  44.35 
 
 		 223 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000524971  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3747  NLP/P60  40.56 
 
 		 166 aa  117  6e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.60725  normal  0.715068 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2166  NLP/P60 protein  43.2 
 
 		 194 aa  117  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.343346  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1890  NLP/P60 protein  41.95 
 
 		 363 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00780805  hitchhiker  0.0000000811276 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6213  NLP/P60  41.95 
 
 		 363 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.935456  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1866  NLP/P60 protein  41.95 
 
 		 363 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0919  NLP/P60 protein  47.5 
 
 		 382 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0475791  normal  0.21921 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1160  NLP/P60 family lipoprotein  39.66 
 
 		 407 aa  115  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.812731  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1397  NLP/P60 family lipoprotein  39.66 
 
 		 407 aa  115  3e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.929375  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1510  NLP/P60 protein  43.33 
 
 		 184 aa  115  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2408  NLP/P60 family lipoprotein  39.66 
 
 		 407 aa  115  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.166866  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1887  NLP/P60 family lipoprotein  39.66 
 
 		 407 aa  115  3e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.850579  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0009  NLP/P60 family lipoprotein  39.66 
 
 		 407 aa  115  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30529  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2244  NlpC/P60 family lipoprotein  39.66 
 
 		 404 aa  115  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2283  NlpC/P60 family lipoprotein  39.66 
 
 		 404 aa  115  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2888  NLP/P60 protein  48.76 
 
 		 234 aa  114  6e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2186  NLP/P60 family lipoprotein  45.65 
 
 		 407 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2585  NLP/P60 protein  46.09 
 
 		 183 aa  114  8.999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.364054  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5167  NLP/P60 family lipoprotein  40.8 
 
 		 364 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1407  NLP/P60 protein  40.46 
 
 		 369 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.374528 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1177  putative transmembrane protein  44.26 
 
 		 222 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0196017  normal  0.188955 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1201  NLP/P60  38.57 
 
 		 169 aa  113  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0388  NLP/P60  44.54 
 
 		 170 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.815605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1804  NLP/P60 protein  41.04 
 
 		 354 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33180  NLP/P60 family lipoprotein  36.36 
 
 		 205 aa  112  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.38174  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1776  NLP/P60 protein  40.46 
 
 		 353 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48800  hypothetical protein  37.84 
 
 		 205 aa  110  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.040428  hitchhiker  0.0000000044472 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1605  NLP/P60 protein  44.36 
 
 		 279 aa  110  8.000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1658  hypothetical protein  44.36 
 
 		 287 aa  110  9e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.110646  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1665  NLP/P60 protein  42.28 
 
 		 194 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4180  hypothetical protein  45.97 
 
 		 193 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000520752  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1787  NLP/P60 protein  39.2 
 
 		 202 aa  108  5e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0258261 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1746  NLP/P60 protein  38.33 
 
 		 203 aa  107  6e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1100  NLP/P60 protein  40.16 
 
 		 215 aa  107  7.000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19170  hypothetical protein  37.58 
 
 		 198 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.545233 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01625  predicted lipoprotein  40.94 
 
 		 271 aa  106  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.712982  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1868  NlpC/P60 family protein  40.94 
 
 		 271 aa  106  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000206609  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1974  NLP/P60 protein  40.94 
 
 		 271 aa  106  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117191 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1985  NLP/P60 protein  40.94 
 
 		 271 aa  106  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.778309  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2367  NlpC/P60 family protein  40.94 
 
 		 271 aa  107  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00414236  normal  0.27776 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0396  NLP/P60 protein  43.65 
 
 		 150 aa  106  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01615  hypothetical protein  40.94 
 
 		 271 aa  106  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.749344  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1543  NlpC/P60 family protein  40.94 
 
 		 275 aa  107  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.179042 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1852  NlpC/P60 family protein  40.94 
 
 		 271 aa  106  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000302623  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1402  NLP/P60 protein  47.41 
 
 		 175 aa  106  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1664  NLP/P60 protein  40 
 
 		 192 aa  106  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1734  NlpC/P60 family protein  40.94 
 
 		 271 aa  106  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.252215  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1654  hypothetical protein  37.58 
 
 		 177 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2667  peptidace C40 NLP/P60  39.84 
 
 		 187 aa  106  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.411217  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>