More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3920 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0856  aldehyde dehydrogenase  66.88 
 
 		 479 aa  648    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4215  aldehyde dehydrogenase  81.13 
 
 		 481 aa  787    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4298  aldehyde dehydrogenase  81.55 
 
 		 481 aa  817    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0641  Succinate-semialdehyde dehydrogenase  75.26 
 
 		 478 aa  711    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2203  Aldehyde Dehydrogenase  85.18 
 
 		 481 aa  822    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5948  aldehyde dehydrogenase  81.97 
 
 		 481 aa  794    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0375443  normal  0.16852 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5440  aldehyde dehydrogenase  83.09 
 
 		 482 aa  833    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0711889 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1600  2,5-dioxopentanoate dehydrogenase (NAD+)  80.92 
 
 		 481 aa  785    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.397581  normal  0.596345 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0944  Aldehyde Dehydrogenase  75.26 
 
 		 478 aa  706    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.566077  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0086  2,5-dioxopentanoate dehydrogenase (NAD+)  79.04 
 
 		 505 aa  776    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.688678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2060  2,5-dioxopentanoate dehydrogenase (NAD+)  84.7 
 
 		 481 aa  816    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.166188 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1365  2,5-dioxopentanoate dehydrogenase (NAD+)  75.31 
 
 		 479 aa  736    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0205154 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5717  aldehyde dehydrogenase  75.62 
 
 		 480 aa  721    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.124179 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3958  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  81.34 
 
 		 481 aa  808    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1026  2,5-dioxopentanoate dehydrogenase (NAD+)  75.26 
 
 		 478 aa  694    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.418547  normal  0.273416 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3830  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  81.76 
 
 		 481 aa  796    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.576477  normal  0.202881 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3920  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  100 
 
 		 480 aa  966    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.179943  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4409  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  81.34 
 
 		 481 aa  808    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.745854  normal  0.407196 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2714  aldehyde dehydrogenase  62.79 
 
 		 482 aa  615  1e-175  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.767285  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2680  succinate-semialdehyde dehydrogenase  61.89 
 
 		 476 aa  615  1e-175  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2413  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  63.56 
 
 		 476 aa  601  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.338088  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1076  aldehyde dehydrogenase family protein  59.5 
 
 		 480 aa  585  1e-166  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0746  Aldehyde Dehydrogenase  60.59 
 
 		 477 aa  574  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1844  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  62.47 
 
 		 478 aa  572  1.0000000000000001e-162  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4206  aldehyde dehydrogenase  59.79 
 
 		 477 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.124463 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4576  Aldehyde Dehydrogenase  60 
 
 		 477 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0345994 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4723  Aldehyde Dehydrogenase  59.79 
 
 		 477 aa  568  1e-161  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0425775 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1176  aldehyde dehydrogenase  59.96 
 
 		 477 aa  570  1e-161  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0771902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1451  aldehyde dehydrogenase  60.89 
 
 		 478 aa  564  1.0000000000000001e-159  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1965  aldehyde dehydrogenase  58.95 
 
 		 476 aa  562  1.0000000000000001e-159  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0727  Aldehyde Dehydrogenase  57.68 
 
 		 481 aa  558  1e-157  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.505527 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2541  aldehyde dehydrogenase  58.35 
 
 		 477 aa  557  1e-157  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.870804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5533  aldehyde dehydrogenase  59.32 
 
 		 477 aa  541  9.999999999999999e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.35176  normal  0.0235365 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4416  aldehyde dehydrogenase  59.83 
 
 		 477 aa  526  1e-148  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3961  succinate-semialdehyde dehydrogenase  52.75 
 
 		 475 aa  526  1e-148  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0708949  normal  0.0170918 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3197  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  53.38 
 
 		 476 aa  508  9.999999999999999e-143  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.13725  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4703  Aldehyde Dehydrogenase  53.18 
 
 		 475 aa  504  1e-141  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.100697 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3638  succinate semialdehyde dehydrogenase  52.54 
 
 		 475 aa  500  1e-140  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.344095  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1053  succinate semialdehyde dehydrogenase  52.74 
 
 		 478 aa  493  9.999999999999999e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3971  Aldehyde Dehydrogenase  50.21 
 
 		 477 aa  488  1e-136  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3067  succinate semialdehyde dehydrogenase  54.12 
 
 		 485 aa  481  1e-134  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.417891 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4520  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  50.63 
 
 		 477 aa  477  1e-133  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0406915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2805  succinate semialdehyde dehydrogenase  50.21 
 
 		 478 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1597  succinate semialdehyde dehydrogenase  51.38 
 
 		 496 aa  470  1.0000000000000001e-131  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.263811  normal  0.212402 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6485  aldehyde dehydrogenase  48.85 
 
 		 485 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6720  aldehyde dehydrogenase  48.85 
 
 		 495 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25373  normal  0.78876 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6819  aldehyde dehydrogenase  49.89 
 
 		 493 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.190703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3846  aldehyde dehydrogenase  50.42 
 
 		 477 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3956  Aldehyde Dehydrogenase  50.21 
 
 		 477 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2116  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  50.42 
 
 		 477 aa  457  1e-127  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0796029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3739  aldehyde dehydrogenase  50.32 
 
 		 487 aa  452  1.0000000000000001e-126  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0797  succinate semialdehyde dehydrogenase  49.26 
 
 		 476 aa  442  1e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0399  aldehyde dehydrogenase family protein  47.64 
 
 		 476 aa  440  9.999999999999999e-123  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4390  aldehyde dehydrogenase  48.41 
 
 		 478 aa  440  9.999999999999999e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0223  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  46.11 
 
 		 476 aa  419  1e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6851  aldehyde dehydrogenase  46.51 
 
 		 485 aa  404  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.635745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2142  Aldehyde Dehydrogenase  44.4 
 
 		 486 aa  396  1e-109  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3441  succinate semialdehyde dehydrogenase  46.1 
 
 		 479 aa  397  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.301737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3903  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  43.04 
 
 		 482 aa  392  1e-108  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.85959 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2941  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  43.04 
 
 		 482 aa  392  1e-108  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4662  succinic semialdehyde dehydrogenase  44.44 
 
 		 493 aa  393  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1045  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  42.83 
 
 		 482 aa  392  1e-108  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2781  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  42.83 
 
 		 482 aa  392  1e-108  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.610238 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02517  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  42.83 
 
 		 482 aa  391  1e-107  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1022  succinic semialdehyde dehydrogenase  42.83 
 
 		 482 aa  391  1e-107  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2796  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  42.83 
 
 		 482 aa  391  1e-107  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0048  succinic semialdehyde dehydrogenase  44.28 
 
 		 488 aa  389  1e-107  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2828  Aldehyde Dehydrogenase  45.24 
 
 		 483 aa  390  1e-107  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0187  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  43.49 
 
 		 480 aa  389  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3395  succinate semialdehyde dehydrogenase  44.56 
 
 		 509 aa  389  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.610857  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02481  hypothetical protein  42.83 
 
 		 482 aa  391  1e-107  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1756  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  44.47 
 
 		 491 aa  387  1e-106  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0228  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  43.13 
 
 		 480 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3676  succinate semialdehyde dehydrogenase  44.8 
 
 		 484 aa  387  1e-106  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.851329 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3273  succinic semialdehyde dehydrogenase  45.84 
 
 		 492 aa  385  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3766  aldehyde dehydrogenase  44.19 
 
 		 483 aa  385  1e-106  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0213  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  43.13 
 
 		 480 aa  385  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2774  succinic semialdehyde dehydrogenase  43.78 
 
 		 486 aa  384  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4999  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  42.83 
 
 		 480 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2991  succinic semialdehyde dehydrogenase  42.64 
 
 		 485 aa  384  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6539300000000001e-18 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2474  succinic semialdehyde dehydrogenase  41.67 
 
 		 487 aa  382  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.353671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0231  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  43.56 
 
 		 483 aa  384  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1691  succinic semialdehyde dehydrogenase  43.56 
 
 		 484 aa  384  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.943711  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0237  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  43.13 
 
 		 480 aa  385  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0814  Aldehyde Dehydrogenase  42.71 
 
 		 480 aa  384  1e-105  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350858  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2905  succinate semialdehyde dehydrogenase  45.94 
 
 		 494 aa  384  1e-105  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0343  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  43.13 
 
 		 483 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2971  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  42.53 
 
 		 482 aa  381  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0217153 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1292  succinic semialdehyde dehydrogenase  42.64 
 
 		 485 aa  381  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00190928  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3092  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  42.53 
 
 		 482 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3399  succinic semialdehyde dehydrogenase  43.34 
 
 		 500 aa  380  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5115  succinate semialdehyde dehydrogenase  43.01 
 
 		 489 aa  379  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3722  succinic semialdehyde dehydrogenase  43.76 
 
 		 500 aa  379  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1976  succinate semialdehyde dehydrogenase  42.49 
 
 		 496 aa  379  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.275824  normal  0.526034 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8306  succinic semialdehyde dehydrogenase  43.19 
 
 		 493 aa  381  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.985186  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2988  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  42.53 
 
 		 482 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.853074  normal  0.0957266 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0786  succinic semialdehyde dehydrogenase  42.7 
 
 		 493 aa  382  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1323  succinate semialdehyde dehydrogenase  42.83 
 
 		 485 aa  381  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.73252  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03430  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  42.92 
 
 		 483 aa  379  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59013  hitchhiker  1.44142e-17 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49080  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  42.98 
 
 		 483 aa  379  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.133526  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>