More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3881 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3881  guanine deaminase  100 
 
 		 428 aa  868    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1496  guanine deaminase  71.66 
 
 		 449 aa  636    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1047  guanine deaminase  71.63 
 
 		 430 aa  630  1e-179  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.134811  normal  0.230797 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2147  guanine deaminase  71.5 
 
 		 454 aa  612  9.999999999999999e-175  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1049  guanine deaminase  70.99 
 
 		 427 aa  611  1e-173  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3295  guanine deaminase  68.55 
 
 		 445 aa  608  1e-173  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.403629  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1129  guanine deaminase  70.75 
 
 		 427 aa  609  1e-173  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.387393  normal  0.517294 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1336  guanine deaminase  68.09 
 
 		 432 aa  582  1.0000000000000001e-165  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.117257  hitchhiker  0.000886879 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2377  guanine deaminase  52.22 
 
 		 439 aa  433  1e-120  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.796063  normal  0.732304 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0946  guanine deaminase  52.69 
 
 		 451 aa  429  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.334638  normal  0.424226 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2429  guanine deaminase  53.71 
 
 		 440 aa  426  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.935428  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0977  guanine deaminase  51.75 
 
 		 439 aa  425  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0414452 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4129  guanine deaminase  51.28 
 
 		 438 aa  422  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3045  guanine deaminase  52.12 
 
 		 457 aa  424  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.206823  normal  0.141945 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0539  guanine deaminase  51.75 
 
 		 439 aa  423  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0893  guanine deaminase  51.75 
 
 		 438 aa  422  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0756096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1018  guanine deaminase  51.75 
 
 		 439 aa  423  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0881  guanine deaminase  51.75 
 
 		 438 aa  414  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.821524  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0709  guanine deaminase  50.94 
 
 		 441 aa  414  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0889  guanine deaminase  53.96 
 
 		 446 aa  411  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.159977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1610  guanine deaminase  53.38 
 
 		 437 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2099  guanine deaminase  51.85 
 
 		 445 aa  401  9.999999999999999e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.716358 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0463  guanine deaminase  51.99 
 
 		 436 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.451458  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0981  guanine deaminase  51.99 
 
 		 436 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3023  guanine deaminase  51.99 
 
 		 436 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.494486  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2918  guanine deaminase  51.99 
 
 		 436 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.495945  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2609  guanine deaminase  51.99 
 
 		 436 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.694405  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0166  guanine deaminase  51.99 
 
 		 436 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.301231  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2978  guanine deaminase  51.99 
 
 		 436 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.528772  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2250  guanine deaminase  51.36 
 
 		 444 aa  398  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1926  guanine deaminase  50.86 
 
 		 444 aa  394  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0907648  normal  0.0757179 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1794  guanine deaminase  47.55 
 
 		 434 aa  386  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.868706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1336  guanine deaminase  54.59 
 
 		 435 aa  384  1e-105  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.521939  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22260  guanine deaminase  49.3 
 
 		 432 aa  380  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.119985  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1677  guanine deaminase  45.56 
 
 		 433 aa  380  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3663  guanine aminohydrolase  46.51 
 
 		 437 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1812  guanine deaminase  46.39 
 
 		 444 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00974317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3607  guanine deaminase  46.5 
 
 		 434 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2754  guanine deaminase  46.14 
 
 		 433 aa  369  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.481519 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4281  guanine deaminase  46.28 
 
 		 434 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.523934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3717  guanine deaminase  46.15 
 
 		 429 aa  368  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3845  guanine deaminase  46.05 
 
 		 434 aa  363  2e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.397164 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1587  guanine deaminase  46.05 
 
 		 434 aa  363  4e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4872  guanine deaminase  43.39 
 
 		 449 aa  355  8.999999999999999e-97  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.673098  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3016  guanine deaminase  43.35 
 
 		 438 aa  354  2e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02716  guanine deaminase  43.1 
 
 		 439 aa  352  5e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.712282  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02678  hypothetical protein  43.1 
 
 		 439 aa  352  5e-96  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.600174  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44770  guanine deaminase  45.2 
 
 		 434 aa  352  7e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.828703  normal  0.188746 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0809  guanine deaminase  43.1 
 
 		 438 aa  352  8e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3812  guanine deaminase  45.2 
 
 		 434 aa  351  1e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.203808  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0825  guanine deaminase  43.1 
 
 		 438 aa  352  1e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3209  guanine deaminase  43.1 
 
 		 438 aa  352  1e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01787  hypothetical protein  42.17 
 
 		 466 aa  351  2e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4173  guanine deaminase  43.1 
 
 		 438 aa  351  2e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0210  guanine deaminase  45.6 
 
 		 432 aa  350  3e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.20137  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3043  guanine deaminase  42.86 
 
 		 438 aa  350  3e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2684  guanine deaminase  43.77 
 
 		 441 aa  345  1e-93  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.573349 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1807  guanine deaminase  44.63 
 
 		 446 aa  344  2e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000553099  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1896  guanine deaminase  44.25 
 
 		 433 aa  343  4e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0545  guanine deaminase  43.99 
 
 		 428 aa  342  5e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01660  guanine deaminase  47.65 
 
 		 456 aa  342  5.999999999999999e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000118805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2429  guanine deaminase  39.44 
 
 		 431 aa  342  7e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2724  guanine deaminase  44.27 
 
 		 425 aa  342  1e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2299  guanine deaminase  44.77 
 
 		 443 aa  340  2e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.255928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1905  guanine deaminase  44.22 
 
 		 429 aa  338  9e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02520  guanine deaminase  42.23 
 
 		 435 aa  336  3.9999999999999995e-91  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3458  guanine deaminase  47.44 
 
 		 434 aa  336  5e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.164027 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0293  guanine deaminase  43.81 
 
 		 426 aa  332  6e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0801  guanine deaminase  46.91 
 
 		 445 aa  329  7e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3192  guanine deaminase  46.51 
 
 		 449 aa  328  8e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.673626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1786  guanine deaminase  44.32 
 
 		 453 aa  328  1.0000000000000001e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4494  guanine deaminase  41.87 
 
 		 435 aa  327  3e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0638874  normal  0.0636141 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1143  guanine deaminase  41.87 
 
 		 428 aa  327  3e-88  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.14597  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3142  guanine deaminase  42.18 
 
 		 436 aa  325  1e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.14624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4260  guanine deaminase  42 
 
 		 425 aa  325  1e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.910106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3326  guanine deaminase  41.51 
 
 		 435 aa  320  1.9999999999999998e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2870  guanine deaminase  40.8 
 
 		 435 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.153116 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3479  guanine deaminase  41.89 
 
 		 461 aa  320  3e-86  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4625  guanine deaminase  41.35 
 
 		 447 aa  318  1e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.430513 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4655  guanine deaminase  46.09 
 
 		 457 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0274988  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2771  guanine deaminase  44.05 
 
 		 428 aa  313  2.9999999999999996e-84  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.888774  normal  0.860518 
 
 
-
 
NC_004310  BR0354  guanine deaminase  39.52 
 
 		 434 aa  312  6.999999999999999e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0370  guanine deaminase  39.52 
 
 		 434 aa  311  2e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.230205  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2838  guanine deaminase  40.79 
 
 		 434 aa  310  2.9999999999999997e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.444806  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0456  guanine deaminase  39.66 
 
 		 434 aa  306  5.0000000000000004e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1727  guanine deaminase  43.37 
 
 		 452 aa  306  7e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.434119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2046  guanine deaminase  43.37 
 
 		 452 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.177828  normal  0.651599 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1087  guanine deaminase  42.6 
 
 		 457 aa  301  2e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0146521 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1148  amidohydrolase  43.69 
 
 		 486 aa  299  5e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.318929  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0081  amidohydrolase  41.18 
 
 		 513 aa  293  3e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.601015 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2623  guanine deaminase  42.71 
 
 		 454 aa  273  5.000000000000001e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.19525 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5972  guanine deaminase  38.97 
 
 		 419 aa  248  2e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.747945 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0506  guanine deaminase  36.81 
 
 		 465 aa  244  3e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1795  guanine deaminase  33.73 
 
 		 432 aa  239  9e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.319049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1462  guanine deaminase  37.05 
 
 		 430 aa  238  1e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0429597  normal  0.689164 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2606  guanine deaminase  36.71 
 
 		 444 aa  234  3e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1468  guanine deaminase  30.52 
 
 		 405 aa  219  7e-56  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00567224  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0256  guanine deaminase  36.78 
 
 		 439 aa  217  2.9999999999999998e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0772  guanine deaminase, putative  35.22 
 
 		 409 aa  199  1.0000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.952693  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0915  Guanine deaminase  35.22 
 
 		 409 aa  199  1.0000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>