More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3824 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3824  acetate kinase  100 
 
 		 385 aa  765    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.56864  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2189  acetate kinase  49.87 
 
 		 397 aa  363  2e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2655  acetate kinase  54.88 
 
 		 405 aa  358  6e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2377  acetate kinase  50.81 
 
 		 393 aa  357  1.9999999999999998e-97  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000961127 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2633  acetate kinase  51.8 
 
 		 392 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2706  acetate kinase  52.15 
 
 		 398 aa  355  8.999999999999999e-97  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2060  acetate kinase  54.27 
 
 		 390 aa  354  1e-96  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3806  acetate kinase  53.46 
 
 		 394 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.449542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6909  acetate kinase  52.28 
 
 		 401 aa  352  5.9999999999999994e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2978  acetate kinase  51.41 
 
 		 404 aa  351  1e-95  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.158659 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5046  acetate kinase  50.26 
 
 		 398 aa  350  2e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1954  acetate kinase  48.7 
 
 		 400 aa  350  3e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.151784  normal  0.354384 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44030  acetate kinase  51.49 
 
 		 394 aa  349  4e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1203  acetate kinase  52.57 
 
 		 396 aa  349  5e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2138  putative phosphoketolase  51.52 
 
 		 1305 aa  348  8e-95  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0981949  normal  0.111283 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5745  acetate kinase  52.71 
 
 		 392 aa  347  3e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.466778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7294  acetate kinase  51.4 
 
 		 396 aa  345  6e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.975242  normal  0.796012 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3569  acetate kinase  51.09 
 
 		 411 aa  345  6e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1295  acetate kinase  51.71 
 
 		 402 aa  344  2e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0053  acetate kinase  51.71 
 
 		 402 aa  343  4e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0974  acetate kinase  49.08 
 
 		 393 aa  341  1e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.724455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5415  acetate kinase  53.45 
 
 		 402 aa  340  2e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4675  acetate kinase  51.24 
 
 		 391 aa  340  2e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0275467 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1589  acetate kinase  53.01 
 
 		 394 aa  339  5e-92  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1128  acetate kinase  53.06 
 
 		 401 aa  338  7e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.323074 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1568  acetate kinase  51.47 
 
 		 400 aa  333  2e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.489684  normal  0.769699 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3686  acetate kinase  50.43 
 
 		 393 aa  333  3e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.320417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0563  acetate kinase  49.73 
 
 		 400 aa  332  8e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0534  acetate kinase  50.14 
 
 		 405 aa  332  8e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3252  acetate kinase  48.1 
 
 		 403 aa  327  3e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.770051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1467  acetate kinase  46.61 
 
 		 402 aa  326  3e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2798  acetate kinase  52.32 
 
 		 416 aa  327  3e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00189465 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1823  acetate kinase  51.99 
 
 		 399 aa  326  4.0000000000000003e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4653  acetate kinase  50.49 
 
 		 408 aa  325  1e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.350055  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2099  acetate kinase  46.13 
 
 		 403 aa  324  2e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1027  acetate kinase  48.83 
 
 		 400 aa  322  6e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.529199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0632  acetate kinase  49.86 
 
 		 382 aa  321  9.999999999999999e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.214656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3495  acetate kinase  53.45 
 
 		 402 aa  318  7e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4871  acetate kinase  53.45 
 
 		 402 aa  318  7e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0199  acetate kinase  47.45 
 
 		 408 aa  317  2e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.111809  normal  0.353737 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3608  acetate kinase  48.16 
 
 		 398 aa  316  4e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.880493  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1895  acetate kinase  46.13 
 
 		 391 aa  315  7e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0865  acetate kinase  46.54 
 
 		 404 aa  314  1.9999999999999998e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2692  acetate kinase  53.2 
 
 		 396 aa  312  4.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0498  acetate kinase  48.91 
 
 		 400 aa  310  2e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1254  acetate kinase  48.01 
 
 		 396 aa  310  2e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3225  acetate kinase  49.08 
 
 		 1230 aa  310  2.9999999999999997e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2914  acetate kinase  48.01 
 
 		 396 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4216  acetate kinase  50 
 
 		 389 aa  309  5e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00713648  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1669  propionate kinase  52.45 
 
 		 407 aa  308  9e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.575965  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2235  acetate kinase  46.65 
 
 		 390 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0560  acetate kinase  48.26 
 
 		 413 aa  302  6.000000000000001e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.844026 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0625  acetate kinase  45.97 
 
 		 407 aa  299  6e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0741  acetate kinase  45.38 
 
 		 395 aa  298  1e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.660011 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3310  putative phosphoketolase  48.29 
 
 		 1230 aa  297  3e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3116  acetate kinase  50.92 
 
 		 1228 aa  291  1e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.550572  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2975  acetate kinase  50.79 
 
 		 391 aa  291  1e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.409912  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0562  acetate kinase  44.59 
 
 		 405 aa  290  2e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0334  acetate kinase  43.09 
 
 		 401 aa  290  3e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4317  acetate kinase  43.33 
 
 		 393 aa  288  9e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.113396 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4427  acetate kinase  43.33 
 
 		 393 aa  288  9e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.209023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0356  acetate kinase  45.59 
 
 		 397 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0416  acetate kinase  48.26 
 
 		 392 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3055  acetate kinase  48.26 
 
 		 392 aa  283  3.0000000000000004e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1060  acetate kinase  49.18 
 
 		 392 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2656  acetate kinase  49.18 
 
 		 392 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.508707  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2799  acetate kinase  48.85 
 
 		 392 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6098  acetate kinase  49.38 
 
 		 389 aa  283  5.000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00705419 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0120  acetate kinase  48.85 
 
 		 392 aa  281  2e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.188552  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1285  acetate kinase  48.85 
 
 		 392 aa  281  2e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0144  acetate kinase  48.85 
 
 		 392 aa  281  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0408  acetate kinase  50.83 
 
 		 389 aa  280  2e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0750002  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0754  acetate kinase  49.21 
 
 		 410 aa  279  7e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.433474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5898  acetate kinase  46.36 
 
 		 404 aa  278  1e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.239661 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0051  acetate kinase  47.95 
 
 		 397 aa  278  2e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.942272  normal  0.0351432 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2188  acetate kinase  43.24 
 
 		 372 aa  275  1.0000000000000001e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2610  acetate kinase  50.65 
 
 		 371 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.328672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10210  acetate kinase  39.48 
 
 		 398 aa  272  6e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000154307  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0386  acetate kinase  43.37 
 
 		 401 aa  272  9e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1915  acetate kinase  44.04 
 
 		 399 aa  271  1e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.305645  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_5006  hypothetical protein  47.21 
 
 		 385 aa  270  4e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.9079 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2216  acetate kinase  42.81 
 
 		 372 aa  269  5.9999999999999995e-71  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0422  acetate kinase  50.34 
 
 		 371 aa  268  2e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0372136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4284  acetate kinase  44.39 
 
 		 399 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.155669 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1271  acetate kinase  39.28 
 
 		 406 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2136  acetate kinase  39.71 
 
 		 397 aa  266  5e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000219259  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3453  acetate kinase  41.88 
 
 		 412 aa  266  5e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.698429 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1936  acetate kinase  37.5 
 
 		 404 aa  264  2e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0760  acetate kinase  38.17 
 
 		 406 aa  263  4e-69  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6386  acetate kinase  44.66 
 
 		 394 aa  263  4e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1295  acetate kinase  41.45 
 
 		 402 aa  263  4.999999999999999e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.317937  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4372  acetate kinase  41.69 
 
 		 412 aa  262  6e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.920791  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3176  acetate kinase  41.96 
 
 		 412 aa  261  1e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3470  acetate kinase  47.7 
 
 		 392 aa  260  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.787409 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3816  acetate kinase  44.59 
 
 		 399 aa  260  3e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  normal  0.604346 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1523  acetate kinase  44.82 
 
 		 396 aa  260  4e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2303  acetate kinase  39.19 
 
 		 398 aa  259  7e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1028  acetate kinase  39.19 
 
 		 399 aa  259  7e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000413101  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3310  acetate kinase  42.31 
 
 		 397 aa  257  2e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.865638  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1731  acetate kinase  37.6 
 
 		 401 aa  257  2e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000422881  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>