More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3815 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_0059  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  68.85 
 
 
953 aa  1347    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3815  molybdopterin oxidoreductase  100 
 
 
981 aa  2041    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336583  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2047  molybdopterin oxidoreductase family protein  67.88 
 
 
978 aa  1348    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0570  DMSO reductase chain A  55.02 
 
 
958 aa  1054    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.345051  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1445  molybdopterin oxidoreductase family protein  67.88 
 
 
978 aa  1348    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2001  molybdopterin oxidoreductase  69.34 
 
 
978 aa  1368    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.754637  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1443  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 protein  48.15 
 
 
932 aa  887    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1743  molybdopterin oxidoreductase  70.37 
 
 
974 aa  1394    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.216268  normal  0.286341 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4524  molybdopterin oxidoreductase  69.97 
 
 
978 aa  1383    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.556057 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1675  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  54.77 
 
 
974 aa  1027    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2646  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  51.68 
 
 
935 aa  938    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0950035  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0144  Nitrate reductase  55.65 
 
 
968 aa  1077    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.20864 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1801  molybdopterin oxidoreductase  63.41 
 
 
961 aa  1261    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.356497  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6214  molybdopterin oxidoreductase  69.46 
 
 
978 aa  1384    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.492261  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1238  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  48.3 
 
 
928 aa  850    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.389489  normal  0.0809066 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1071  molybdopterin oxidoreductase family protein  67.78 
 
 
973 aa  1346    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3996  molybdopterin oxidoreductase  87.87 
 
 
979 aa  1828    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.290267  normal  0.0213209 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0340  putative molybdopterin oxidoreductase family protein  66.46 
 
 
969 aa  1333    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1936  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  52.96 
 
 
973 aa  991    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0860  molybdopterin oxidoreductase family protein  87.24 
 
 
981 aa  1773    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1356  molybdopterin oxidoreductase family protein  67.88 
 
 
973 aa  1348    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3221  molybdopterin oxidoreductase  67.88 
 
 
973 aa  1348    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.461579  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3106  molybdopterin oxidoreductase  67.88 
 
 
973 aa  1348    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2338  molybdopterin oxidoreductase  67.88 
 
 
973 aa  1348    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.941239  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0767  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  49.13 
 
 
923 aa  834    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4940  molybdopterin oxidoreductase  70.79 
 
 
974 aa  1402    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.335021 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0612  conserved hypothetical protein  26.44 
 
 
1426 aa  270  1e-70  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0814  anaerobic dehydrogenase  27.02 
 
 
1434 aa  266  1e-69  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0197792  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3094  molybdopterin oxidoreductase  25.13 
 
 
858 aa  200  1.0000000000000001e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.799457  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1335  molybdopterin oxidoreductase  25.05 
 
 
928 aa  192  2e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.374333  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1560  molybdopterin oxidoreductase  26.07 
 
 
917 aa  186  2.0000000000000003e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.444202 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1863  molybdopterin oxidoreductase  25.72 
 
 
932 aa  182  2.9999999999999997e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0514904 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0607  molydopterin dinucleotide-binding region  25.37 
 
 
910 aa  181  5.999999999999999e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.408169 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2042  twin-arginine translocation pathway signal  24.45 
 
 
930 aa  181  8e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.607166  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0954  twin-arginine translocation pathway signal  25.03 
 
 
927 aa  179  3e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.323124  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02584  hypothetical protein  23.33 
 
 
992 aa  178  5e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2453  molybdopterin oxidoreductase  25.35 
 
 
909 aa  174  7.999999999999999e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.154365  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0353  formate dehydrogenase  26.73 
 
 
833 aa  174  7.999999999999999e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000992334  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0938  molybdopterin oxidoreductase  27.82 
 
 
817 aa  173  1e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0255421  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2385  molybdopterin oxidoreductase  23.58 
 
 
839 aa  171  5e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0793925 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6878  molybdopterin oxidoreductase  23.92 
 
 
1148 aa  171  6e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0354139  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1121  molybdopterin oxidoreductase  26.16 
 
 
812 aa  171  7e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.721348  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0619  molybdopterin oxidoreductase  24.84 
 
 
911 aa  167  1.0000000000000001e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4198  molybdopterin oxidoreductase  23.96 
 
 
1155 aa  167  1.0000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.320615  normal  0.676689 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11280  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  26.37 
 
 
864 aa  165  4.0000000000000004e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1646  molybdopterin oxidoreductase  25.22 
 
 
807 aa  164  8.000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.165657  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2304  molybdopterin oxidoreductase  26.65 
 
 
803 aa  159  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0471  molydopterin dinucleotide-binding region  23.35 
 
 
1017 aa  157  8e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20860  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  22.22 
 
 
942 aa  154  8e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1197  molybdopterin oxidoreductase  22.86 
 
 
934 aa  154  8e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1500  molybdopterin oxidoreductase  27.27 
 
 
856 aa  154  8e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000790574 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0163  molybdopterin oxidoreductase  23.38 
 
 
851 aa  152  4e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1567  molybdopterin oxidoreductase  24.34 
 
 
803 aa  150  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1029  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  24.15 
 
 
814 aa  149  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0307  molybdopterin oxidoreductase  24.21 
 
 
938 aa  149  2.0000000000000003e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000512628  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0969  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  24.04 
 
 
814 aa  148  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1063  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  24.04 
 
 
814 aa  148  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0105709  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1078  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  24.04 
 
 
814 aa  146  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.965114 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1835  molybdopterin oxidoreductase  25.91 
 
 
916 aa  147  1e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.357483  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0998  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  24.04 
 
 
814 aa  147  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.181006  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3287  molybdopterin oxidoreductase  25.59 
 
 
781 aa  146  2e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.239512  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1056  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit  23.8 
 
 
814 aa  146  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2177  sulfur reductase, molybdopterin subunit  25.91 
 
 
909 aa  146  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00898  dimethyl sulfoxide reductase, anaerobic, subunit A  23.8 
 
 
814 aa  145  3e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0778088  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2749  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  23.8 
 
 
814 aa  145  3e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2702  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit A  23.8 
 
 
814 aa  145  3e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.98868 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0999  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit  23.8 
 
 
814 aa  145  3e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00905  hypothetical protein  23.8 
 
 
814 aa  145  3e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0839348  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0969  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit  23.8 
 
 
814 aa  145  5e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3636  molybdopterin oxidoreductase  24.96 
 
 
765 aa  144  7e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000159575 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2478  molybdopterin oxidoreductase  23.85 
 
 
820 aa  143  9.999999999999999e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.495104  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2226  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit  23.82 
 
 
814 aa  144  9.999999999999999e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.982689 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0353  molybdopterin oxidoreductase  26.6 
 
 
805 aa  143  9.999999999999999e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.127927 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0897  tetrathionate reductase, subunit A  24.34 
 
 
1029 aa  143  1.9999999999999998e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0797102  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0470  molybdopterin oxidoreductase  22.39 
 
 
855 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0162  molybdopterin oxidoreductase  26.61 
 
 
805 aa  142  3e-32  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4361  molybdopterin dinucleotide-binding region  25.95 
 
 
1138 aa  141  6e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1597  molybdopterin oxidoreductase  25.15 
 
 
800 aa  141  6e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1668  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  23.54 
 
 
811 aa  141  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22240  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  22.34 
 
 
836 aa  140  1e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.17201 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1841  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  23.54 
 
 
811 aa  139  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17920  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  26.03 
 
 
826 aa  140  2e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.194946  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1674  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  23.65 
 
 
811 aa  138  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.666152  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4785  molydopterin dinucleotide-binding region  24.18 
 
 
1031 aa  138  5e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1612  molydopterin dinucleotide-binding region  23.76 
 
 
967 aa  138  5e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1609  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  23.65 
 
 
811 aa  138  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.356497  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1600  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  23.54 
 
 
811 aa  137  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.573894  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2959  molybdopterin oxidoreductase  24.15 
 
 
913 aa  137  9.999999999999999e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.791344  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0450  formate dehydrogenase  32.28 
 
 
722 aa  136  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2768  molydopterin dinucleotide-binding region  24.92 
 
 
898 aa  136  1.9999999999999998e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.81742  normal  0.229258 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1869  molybdopterin oxidoreductase  30.6 
 
 
800 aa  135  5e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0325829 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2259  formate dehydrogenase-O, major subunit, selenocysteine-containing  27.63 
 
 
1023 aa  135  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181302  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1149  molybdopterin oxidoreductase  23.73 
 
 
856 aa  134  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000213682  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1908  molybdopterin oxidoreductase  23.52 
 
 
876 aa  133  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1789  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.43 
 
 
1020 aa  133  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1868  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.43 
 
 
1020 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1687  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit A  24.23 
 
 
817 aa  131  5.0000000000000004e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.914371  normal  0.111557 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1613  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit YnfE  23.23 
 
 
808 aa  131  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0707  formate dehydrogenase, alpha subunit, selenocysteine-containing  26.33 
 
 
1023 aa  130  9.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0422  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  24.69 
 
 
806 aa  130  1.0000000000000001e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0580651  decreased coverage  0.000000000595111 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>