225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3709 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3709  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 		 183 aa  357  4e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1878  OmpA/MotB domain protein  55.8 
 
 		 179 aa  145  4.0000000000000006e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2055  OmpA/MotB domain-containing protein  55.8 
 
 		 179 aa  145  4.0000000000000006e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0263919  normal  0.321427 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3940  OmpA/MotB domain-containing protein  49.19 
 
 		 174 aa  136  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0125128  normal  0.230028 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2987  OmpA/MotB domain-containing protein  47.78 
 
 		 179 aa  129  3e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.221024  normal  0.129145 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2800  OmpA/MotB domain-containing protein  46.41 
 
 		 177 aa  122  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.705658  normal  0.415796 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3552  OmpA/MotB  40.84 
 
 		 196 aa  108  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.237192  normal  0.244916 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2357  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  51.92 
 
 		 842 aa  104  5e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.131798  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2121  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  58.33 
 
 		 823 aa  100  8e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.475646 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1793  OmpA/MotB  29.67 
 
 		 156 aa  72  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.557894 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0102  outer membrane related peptidoglycan-associated lipoprotein  46.94 
 
 		 214 aa  67  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.207037  normal  0.26967 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4148  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.6 
 
 		 560 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3197  cytochrome c oxidase, subunit II  40.43 
 
 		 525 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0672  cytochrome c oxidase, subunit II  40.43 
 
 		 525 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.275557  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0170  cytochrome c oxidase, subunit II  40.43 
 
 		 517 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.32275  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1422  cytochrome c oxidase, subunit II  40.43 
 
 		 517 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0507  cytochrome c oxidase, subunit II  40.43 
 
 		 525 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2849  cytochrome c oxidase, subunit II  40.43 
 
 		 517 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1412  OmpA/MotB domain-containing protein  42.11 
 
 		 321 aa  58.5  0.00000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.166227  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0489  cytochrome c oxidase, subunit II  40.43 
 
 		 525 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0426  cytochrome c oxidase, subunit II  40.43 
 
 		 525 aa  57  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4171  putative cytochrome c oxidase  37.5 
 
 		 538 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.82291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0456  cytochrome c oxidase, subunit II  43.75 
 
 		 532 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3984  ompA family protein  30.23 
 
 		 278 aa  53.9  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.25861  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2858  cytochrome c oxidase, subunit II  43.75 
 
 		 532 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.760436 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3238  OmpA/MotB domain protein  33.55 
 
 		 228 aa  53.9  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2233  cytochrome c oxidase, subunit II  43.75 
 
 		 532 aa  53.9  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.247804  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2902  cytochrome c oxidase, subunit II  43.75 
 
 		 535 aa  53.9  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2847  cytochrome c oxidase, subunit II  43.75 
 
 		 532 aa  53.9  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2764  cytochrome c oxidase, subunit II  43.75 
 
 		 535 aa  53.9  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.802533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0553  OmpA/MotB domain-containing protein  33.61 
 
 		 224 aa  53.5  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0276  cytochrome c oxidase, subunit II  43.75 
 
 		 557 aa  53.5  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51710  peptidoglycan associated lipoprotein OprL precursor  36.36 
 
 		 168 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000147686  hitchhiker  0.00068918 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0544  cytochrome c oxidase, subunit II  40.62 
 
 		 544 aa  53.5  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.214831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3992  peptidoglycan-associated lipoprotein  36.45 
 
 		 165 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.603171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1022  OmpA/MotB domain protein  31.37 
 
 		 228 aa  52.8  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6176  cytochrome c oxidase, subunit II  42.19 
 
 		 531 aa  52.4  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.678657 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4535  peptidoglycan associated lipoprotein OprL precursor  35.54 
 
 		 169 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4195  peptidoglycan-associated lipoprotein  36.45 
 
 		 166 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.678066  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15220  outer membrane protein, OmpA/MotB family  34.95 
 
 		 270 aa  51.2  0.000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1223  peptidoglycan-associated lipoprotein OprL  35.51 
 
 		 166 aa  51.2  0.000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1252  peptidoglycan-associated lipoprotein  35.51 
 
 		 166 aa  51.2  0.000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0470873  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3971  peptidoglycan-associated lipoprotein  34.58 
 
 		 166 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0120  hypothetical protein  34.13 
 
 		 558 aa  50.4  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 239 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1406  OmpA/MotB domain protein  35.64 
 
 		 194 aa  50.8  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.975063 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1416  OmpA/MotB  34.58 
 
 		 167 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0389621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0244  outer membrane protein  30.77 
 
 		 331 aa  50.1  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4401  OmpA/MotB  35.51 
 
 		 165 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0950269  normal  0.949799 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2322  OmpA/MotB domain-containing protein  38.24 
 
 		 222 aa  49.7  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0351877 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3241  OmpA/MotB domain-containing protein  27.1 
 
 		 383 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.809781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2702  OmpA/MotB domain-containing protein  32.08 
 
 		 270 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.248823  normal  0.0593962 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3868  OmpA/MotB domain protein  32.08 
 
 		 412 aa  49.3  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0195  OmpA/MotB domain-containing protein  35.19 
 
 		 228 aa  49.3  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  33.98 
 
 		 270 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.578444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  31.4 
 
 		 525 aa  48.5  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1506  ompA family protein  32.73 
 
 		 260 aa  48.1  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1234  OmpA/MotB domain-containing protein  37.14 
 
 		 196 aa  48.1  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455837  normal  0.175097 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  30.1 
 
 		 261 aa  48.1  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  30.1 
 
 		 261 aa  47.8  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5561  OmpA/MotB domain protein  38.75 
 
 		 276 aa  47.8  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4198  OmpA/MotB domain protein  33.01 
 
 		 270 aa  47.8  0.00009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1655  OmpA/MotB domain-containing protein  33.01 
 
 		 270 aa  47.8  0.00009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1316  OmpA/MotB  32.73 
 
 		 260 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4964  OmpA/MotB  38.37 
 
 		 830 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  36 
 
 		 266 aa  47.4  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  31.45 
 
 		 498 aa  47.4  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1888  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  29.13 
 
 		 919 aa  47.4  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.640223  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1278  OmpA domain-containing protein  35.78 
 
 		 166 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0630955  normal  0.378402 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2341  OmpA/MotB domain protein  30.07 
 
 		 222 aa  46.6  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0995  OmpA/MotB domain protein  27.68 
 
 		 179 aa  46.6  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1999  OmpA/MotB  32.04 
 
 		 271 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.411511  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2645  OmpA/MotB  40 
 
 		 225 aa  46.6  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4178  OmpA/MotB domain-containing protein  32.35 
 
 		 229 aa  46.6  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1066  OmpA/MotB  31.68 
 
 		 264 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2441  OmpA/MotB domain-containing protein  30.88 
 
 		 215 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000422184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1033  OmpA family protein  33.33 
 
 		 228 aa  46.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.383964  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5767  OmpA/MotB family protein  30.88 
 
 		 214 aa  46.6  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00312455  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0812  OmpA/MotB domain-containing protein  36.19 
 
 		 240 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36630  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  34.75 
 
 		 179 aa  47  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.668034  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2067  OmpA/MotB domain protein  31.62 
 
 		 216 aa  47  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.697357  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0798  OmpA/MotB domain-containing protein  36.19 
 
 		 247 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.870311  normal  0.182881 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2260  OmpA/MotB  32.14 
 
 		 830 aa  46.6  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0062  putative outer membrane lipoprotein  32.79 
 
 		 220 aa  46.6  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1825  OmpA/MotB  30.88 
 
 		 215 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000764276  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1599  outer membrane fibronectin-binding protein  30.64 
 
 		 333 aa  47  0.0002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.00000000197596  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2436  OmpA/MotB domain-containing protein  30.88 
 
 		 215 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0140056  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1762  OmpA/MotB domain protein  35 
 
 		 478 aa  46.6  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000778911  normal  0.308446 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08396  OmpA/MotB  31.17 
 
 		 424 aa  46.6  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2694  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 228 aa  46.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.110946 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0773  OmpA/MotB domain protein  36.19 
 
 		 236 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.892444  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0711  ompA family protein  32.35 
 
 		 215 aa  46.2  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0433789  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4416  OmpA/MotB domain-containing protein  33.65 
 
 		 240 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.632487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1262  OmpA/MotB  33.65 
 
 		 217 aa  46.2  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.140432  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0992  OmpA/MotB domain-containing protein  36.11 
 
 		 190 aa  45.8  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.629928 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2633  OmpA/MotB domain-containing protein  38.89 
 
 		 831 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1054  ompA family protein  32.35 
 
 		 215 aa  46.2  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1059  ompA family protein  32.35 
 
 		 215 aa  46.2  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1615  ompA family protein  32.35 
 
 		 215 aa  46.2  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.180495  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0172  putative outer membrane lipoprotein  33.65 
 
 		 220 aa  46.2  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>