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for query gene Vapar_3680 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



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Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_3680  Carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 
152 aa  305  1.0000000000000001e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2188  carboxymuconolactone decarboxylase  83.05 
 
 
129 aa  199  9.999999999999999e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0944  carboxymuconolactone decarboxylase  73.02 
 
 
132 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.292875  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2209  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  70 
 
 
132 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.231556  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2370  putative carboxymuconolactone decarboxylase  62.14 
 
 
148 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.006176  normal  0.29565 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1479  carboxymuconolactone decarboxylase  70 
 
 
133 aa  171  2.9999999999999996e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3139  putative 4-carboxymuconolactone decarboxylase  65 
 
 
132 aa  170  6.999999999999999e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.287088  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1863  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  67.5 
 
 
132 aa  167  3e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1373  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  67.5 
 
 
132 aa  167  3e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.378973  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1817  Carboxymuconolactone decarboxylase  66.13 
 
 
152 aa  168  3e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.291528 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0034  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  67.5 
 
 
132 aa  167  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0633482  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1134  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  67.5 
 
 
132 aa  167  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2653  Carboxymuconolactone decarboxylase  69.17 
 
 
138 aa  167  6e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0083  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  63.33 
 
 
128 aa  166  1e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2385  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  66.67 
 
 
132 aa  166  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2257  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  66.67 
 
 
132 aa  166  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.769981  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2219  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  66.67 
 
 
132 aa  166  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1568  carboxymuconolactone decarboxylase  79.8 
 
 
109 aa  165  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.630321 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0086  Carboxymuconolactone decarboxylase  63.33 
 
 
128 aa  164  4e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7471  Carboxymuconolactone decarboxylase  71.79 
 
 
299 aa  164  4e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4266  carboxymuconolactone decarboxylase  63.33 
 
 
128 aa  164  4e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0089  carboxymuconolactone decarboxylase  63.33 
 
 
128 aa  164  4e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0089  carboxymuconolactone decarboxylase  62.5 
 
 
128 aa  164  4e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1781  carboxymuconolactone decarboxylase  71.9 
 
 
144 aa  164  4e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0083  carboxymuconolactone decarboxylase  62.5 
 
 
128 aa  163  8e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1753  carboxymuconolactone decarboxylase  68.22 
 
 
144 aa  163  9e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.165068 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4049  carboxymuconolactone decarboxylase  62.71 
 
 
134 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001374  4-carboxymuconolactone decarboxylase  63.25 
 
 
125 aa  161  3e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000000210016  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1430  carboxymuconolactone decarboxylase  70.25 
 
 
145 aa  160  6e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.346703  hitchhiker  0.00433375 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1867  carboxymuconolactone decarboxylase  69.42 
 
 
144 aa  159  9e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.159406  hitchhiker  0.000781215 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6236  carboxymuconolactone decarboxylase  69.42 
 
 
144 aa  159  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.291446  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1843  carboxymuconolactone decarboxylase  69.42 
 
 
144 aa  159  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.19287  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5144  carboxymuconolactone decarboxylase  69.42 
 
 
144 aa  158  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0349025  normal  0.605964 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5696  carboxymuconolactone decarboxylase  64.96 
 
 
130 aa  157  6e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3873  carboxymuconolactone decarboxylase  60.17 
 
 
125 aa  157  6e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0837  putative carboxymuconolactone decarboxylase  77.32 
 
 
110 aa  157  7e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2083  Carboxymuconolactone decarboxylase  71.15 
 
 
123 aa  155  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.995495 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2477  Carboxymuconolactone decarboxylase  72.16 
 
 
118 aa  149  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.333736 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02340  Carboxymuconolactone decarboxylase  62.71 
 
 
138 aa  149  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0293457  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1703  Carboxymuconolactone decarboxylase  59.32 
 
 
131 aa  144  6e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.232307  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2098  carboxymuconolactone decarboxylase  51.09 
 
 
295 aa  137  3.9999999999999997e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.327283  normal  0.0268513 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0016  carboxymuconolactone decarboxylase  62.86 
 
 
261 aa  131  3e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2473  Carboxymuconolactone decarboxylase  53.6 
 
 
260 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.15664  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4934  carboxymuconolactone decarboxylase  51.67 
 
 
150 aa  128  3e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.249654  decreased coverage  0.00938968 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1856  carboxymuconolactone decarboxylase  48.48 
 
 
275 aa  127  4.0000000000000003e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.519725  normal  0.376905 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0521  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  46.55 
 
 
127 aa  117  4.9999999999999996e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.66457 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4060  Carboxymuconolactone decarboxylase  48.33 
 
 
136 aa  113  7.999999999999999e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.735994  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2239  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase  44.92 
 
 
122 aa  107  6e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1188  carboxymuconolactone decarboxylase  52.75 
 
 
128 aa  93.6  9e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.373506  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6219  carboxymuconolactone decarboxylase  41.28 
 
 
363 aa  88.6  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2296  4-carboxymuconolactone decarboxylase  39.5 
 
 
123 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0265397  normal  0.659303 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2568  carboxymuconolactone decarboxylase  34.17 
 
 
132 aa  84.3  5e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.136392 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0768  4-carboxymuconolactone decarboxylase  37.39 
 
 
250 aa  84  6e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000904176 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2661  carboxymuconolactone decarboxylase  41.32 
 
 
125 aa  84  6e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2504  4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.88 
 
 
129 aa  83.2  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4016  3-oxoadipate enol-lactonase  36.51 
 
 
392 aa  82.4  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00993372  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2255  carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 
129 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.344767  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3042  Alpha/beta hydrolase  34.62 
 
 
380 aa  82  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440112  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5022  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  35.43 
 
 
396 aa  81.3  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.391243  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2144  carboxymuconolactone decarboxylase  45.65 
 
 
268 aa  81.3  0.000000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000390984 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0952  Carboxymuconolactone decarboxylase  38.21 
 
 
127 aa  81.3  0.000000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2061  4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.88 
 
 
132 aa  80.9  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2974  4-carboxymuconolactone decarboxylase  37.82 
 
 
125 aa  80.9  0.000000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0318  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase  36.23 
 
 
133 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.623335  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3648  carboxymuconolactone decarboxylase  33.87 
 
 
129 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00963465  normal  0.158809 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2260  carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 
129 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2082  carboxymuconolactone decarboxylase  34.38 
 
 
129 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.984068 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7932  4-carboxymuconolactone decarboxylase  41.84 
 
 
132 aa  80.5  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.238463  normal  0.729855 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1011  4-carboxymuconolactone decarboxylase  35.77 
 
 
402 aa  79.3  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.101506  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2454  4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.11 
 
 
132 aa  79.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.835529  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2361  hypothetical protein  47.06 
 
 
127 aa  79.3  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.850012 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4207  4-carboxymuconolactone decarboxylase  33.59 
 
 
135 aa  79  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5046  carboxymuconolactone decarboxylase  39.13 
 
 
154 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.336576 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1954  hypothetical protein  43.3 
 
 
298 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.513058  normal  0.328983 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38170  4-carboxymuconolactone decarboxylase  35.34 
 
 
130 aa  78.6  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.230767  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02850  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase  36.59 
 
 
133 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181902 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2469  Carboxymuconolactone decarboxylase  37.8 
 
 
138 aa  77.8  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.799907  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3222  Carboxymuconolactone decarboxylase  33.07 
 
 
248 aa  77.8  0.00000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.02067  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4433  4-carboxymuconolactone decarboxylase  35.54 
 
 
130 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.145648  hitchhiker  0.00893399 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4342  4-carboxymuconolactone decarboxylase  35.54 
 
 
130 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0210047  normal  0.0491818 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2342  4-carboxymuconolactone decarboxylase  37.61 
 
 
132 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2931  carboxymuconolactone decarboxylase  35.04 
 
 
129 aa  77.4  0.00000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000640912  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1021  4-carboxymuconolactone decarboxylase  35.54 
 
 
132 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0594936 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1381  4-carboxymuconolactone decarboxylase  35.54 
 
 
130 aa  77.4  0.00000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.760953  normal  0.559328 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5081  Carboxymuconolactone decarboxylase  38.46 
 
 
122 aa  77.4  0.00000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5284  4-carboxymuconolactone decarboxylase  31.2 
 
 
128 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.327444  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2482  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  40.86 
 
 
140 aa  76.6  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000156087  normal  0.0594202 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4473  4-carboxymuconolactone decarboxylase  31.2 
 
 
128 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3162  4-carboxymuconolactone decarboxylase  31.2 
 
 
128 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3125  carboxymuconolactone decarboxylase  31.2 
 
 
129 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3215  carboxymuconolactone decarboxylase  43.75 
 
 
124 aa  76.6  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0050  4-carboxymuconolactone decarboxylase  32.26 
 
 
128 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2086  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  40.86 
 
 
140 aa  76.6  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000641307  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2441  carboxymuconolactone decarboxylase  36.94 
 
 
276 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1901  carboxymuconolactone decarboxylase  37.19 
 
 
129 aa  76.6  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.508941 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5109  4-carboxymuconolactone decarboxylase  31.2 
 
 
129 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008391  Bamb_5021  4-carboxymuconolactone decarboxylase  31.2 
 
 
128 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_010552  BamMC406_3566  carboxymuconolactone decarboxylase  37.39 
 
 
132 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.199431  hitchhiker  0.00916142 
 
 
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NC_010465  YPK_2194  carboxymuconolactone decarboxylase  40.86 
 
 
140 aa  76.6  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008543  Bcen2424_5750  4-carboxymuconolactone decarboxylase  31.2 
 
 
129 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0988817 
 
 
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