More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3577 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3577  sulfatase  100 
 
 		 438 aa  908    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.176651  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5404  sulfatase  73.47 
 
 		 457 aa  674    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.268396  normal  0.742595 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4466  sulfatase  72.46 
 
 		 453 aa  662    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0640965 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2294  sulfatase  74.77 
 
 		 442 aa  693    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.434198  normal  0.499589 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0296  sulfatase  61.7 
 
 		 442 aa  551  1e-156  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8255  sulfatase  49.3 
 
 		 482 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.229678  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0474  sulfatase  49.42 
 
 		 491 aa  410  1e-113  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0555  sulfatase  48.11 
 
 		 486 aa  402  1e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1353  n-acetylgalactosamine-6-sulfate sulfatase  45.8 
 
 		 471 aa  367  1e-100  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0725989  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4240  twin-arginine translocation pathway signal  43.94 
 
 		 457 aa  367  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.615359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3436  sulfatase  46.3 
 
 		 462 aa  367  1e-100  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0895  sulfatase  34.25 
 
 		 471 aa  238  2e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.281969  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1449  sulfatase  34.93 
 
 		 495 aa  234  3e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.499056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6052  sulfatase  35.42 
 
 		 453 aa  230  4e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1213  sulfatase  34.47 
 
 		 487 aa  228  2e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.255178  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0785  sulfatase  34.12 
 
 		 472 aa  227  3e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.288009  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0936  sulfatase  34.62 
 
 		 479 aa  225  9e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0889  sulfatase  30.43 
 
 		 500 aa  219  6e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00184444  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4692  sulfatase  35.86 
 
 		 491 aa  219  7e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.66699 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1520  sulfatase  35.19 
 
 		 631 aa  214  2.9999999999999995e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0242635  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2602  sulfatase  31.65 
 
 		 452 aa  211  1e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0740  sulfatase  34.67 
 
 		 440 aa  211  3e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1182  sulfatase  33.5 
 
 		 465 aa  211  3e-53  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3949  sulfatase  32.46 
 
 		 470 aa  210  5e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.184377  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4650  sulfatase  31.2 
 
 		 539 aa  206  9e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3999  sulfatase  32.18 
 
 		 467 aa  204  2e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0302  sulfatase  34.14 
 
 		 543 aa  201  3e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.139649 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0881  sulfatase  31.24 
 
 		 510 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.789189  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0571  sulfatase  32.61 
 
 		 517 aa  195  1e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2850  sulfatase  29.57 
 
 		 563 aa  194  2e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00796001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3852  sulfatase  31.51 
 
 		 468 aa  194  4e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0360  Steryl-sulfatase  31.41 
 
 		 553 aa  192  8e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5003  sulfatase  30.02 
 
 		 533 aa  192  1e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2738  sulfatase  34.54 
 
 		 466 aa  191  2e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.846304  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2166  sulfatase  30.54 
 
 		 497 aa  190  5e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.696706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2065  sulfatase  29.16 
 
 		 542 aa  186  5e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0577602 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3375  sulfatase  29.69 
 
 		 571 aa  186  6e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.590124 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1131  sulfatase  31.72 
 
 		 551 aa  186  6e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00971  iduronate-sulfatase and sulfatase 1 precursor  30.28 
 
 		 558 aa  186  8e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3654  sulfatase  31.51 
 
 		 489 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0466355 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2382  sulfatase  32.52 
 
 		 488 aa  181  2e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.285521  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3985  sulfatase  32.83 
 
 		 478 aa  181  2.9999999999999997e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.135566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0345  sulfatase  31.38 
 
 		 474 aa  180  4.999999999999999e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00158762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2680  arylsulfatase  29.83 
 
 		 584 aa  179  8e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.246177  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1881  sulfatase  32.13 
 
 		 490 aa  179  1e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2408  sulfatase  30.79 
 
 		 548 aa  178  2e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.387467  hitchhiker  0.00012242 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1638  sulfatase  30.27 
 
 		 457 aa  177  3e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.132093 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6288  sulfatase  30.99 
 
 		 523 aa  176  9e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.44956 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2674  sulfatase  30.82 
 
 		 559 aa  174  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.687796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4652  sulfatase  27.68 
 
 		 551 aa  174  3.9999999999999995e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3990  sulfatase  28.76 
 
 		 582 aa  171  2e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3980  Cerebroside-sulfatase  34.77 
 
 		 458 aa  170  6e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3373  sulfatase  32.58 
 
 		 481 aa  169  9e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4036  sulfatase  30.58 
 
 		 459 aa  167  2.9999999999999998e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0188862  normal  0.130927 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2379  sulfatase  29.93 
 
 		 470 aa  167  4e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1327  sulfatase  28.95 
 
 		 480 aa  166  5.9999999999999996e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.499609  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4501  sulfatase  30.68 
 
 		 481 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.930305  normal  0.505642 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2364  sulfatase family protein  29.13 
 
 		 492 aa  164  4.0000000000000004e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.027189  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1516  sulfatase  27.45 
 
 		 553 aa  164  4.0000000000000004e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.943825  normal  0.893122 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1986  sulfatase  26.83 
 
 		 555 aa  162  7e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.737695 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0208  sulfatase  27.15 
 
 		 536 aa  161  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0383  sulfatase  27.96 
 
 		 563 aa  162  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1497  sulfatase  29.18 
 
 		 536 aa  162  2e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.139846  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3296  sulfatase  29.59 
 
 		 460 aa  160  4e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0308085  hitchhiker  0.000582836 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0390  sulfatase  31.28 
 
 		 464 aa  158  2e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.334066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4996  sulfatase  29.42 
 
 		 506 aa  157  3e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.317023 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3903  arylsulfatase  28.52 
 
 		 563 aa  157  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313687  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3650  sulfatase  29.18 
 
 		 482 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00127194  decreased coverage  0.00847064 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1700  sulfatase  29.89 
 
 		 479 aa  156  7e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0968821  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2052  sulfatase  25.91 
 
 		 543 aa  156  8e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.430392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3661  sulfatase  29.98 
 
 		 500 aa  156  8e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0317755  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3501  sulfatase  29.19 
 
 		 506 aa  156  8e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.486843  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3801  sulfatase  27.65 
 
 		 453 aa  156  9e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00499822  normal  0.102523 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2831  sulfatase  29.71 
 
 		 440 aa  155  2e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0404074 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4498  sulfatase  29.5 
 
 		 462 aa  154  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.697848  normal  0.704843 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3659  sulfatase  29.2 
 
 		 484 aa  154  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000330438  normal  0.826759 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3374  sulfatase  28.25 
 
 		 507 aa  154  2e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3651  sulfatase  28.39 
 
 		 483 aa  154  4e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000643806  normal  0.0204343 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0040  sulfatase  30.6 
 
 		 497 aa  154  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.843312  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0040  sulfatase  30.6 
 
 		 497 aa  154  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.872346  normal  0.13967 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0039  sulfatase  30.6 
 
 		 497 aa  154  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.225946 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3047  sulfatase  28.6 
 
 		 503 aa  154  4e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0209579 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0354  sulfatase  27.66 
 
 		 493 aa  154  4e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0038  sulfatase  30.6 
 
 		 497 aa  153  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.292867  hitchhiker  0.00560398 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6289  sulfatase  30.33 
 
 		 486 aa  153  5.9999999999999996e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.235101 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2941  sulfatase  30.23 
 
 		 480 aa  152  8.999999999999999e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.515365 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0038  sulfatase  29.05 
 
 		 497 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1655  sulfatase  28.89 
 
 		 554 aa  150  3e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.789399  normal  0.0842498 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0491  sulfatase  30.04 
 
 		 500 aa  150  3e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.244971 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0426  sulfatase  27.46 
 
 		 772 aa  150  5e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.452033  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2053  sulfatase  28.71 
 
 		 556 aa  150  6e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.627693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0931  sulfatase  26.82 
 
 		 535 aa  149  8e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3366  sulfatase  26.82 
 
 		 535 aa  149  8e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.897843 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0820  sulfatase  28.51 
 
 		 627 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0984  sulfatase  26.82 
 
 		 535 aa  149  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3662  sulfatase  30 
 
 		 637 aa  148  2.0000000000000003e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.33998  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1506  sulfatase  28.26 
 
 		 501 aa  148  2.0000000000000003e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.265184 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2624  arylsulfatase  26.67 
 
 		 541 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.344429  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01456  hypothetical protein  30.59 
 
 		 560 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01469  hypothetical protein  30.59 
 
 		 560 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>