More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3549 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3549  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 1022 aa  1993    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642921  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5181  adenylate/guanylate cyclase  29.04 
 
 		 1227 aa  263  1e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.454407  normal  0.397726 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6475  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  29.18 
 
 		 1175 aa  231  5e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.928071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2863  transcriptional activator domain-containing protein  31.3 
 
 		 1132 aa  193  1e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1600  ATPase-like protein  30.5 
 
 		 1071 aa  189  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4935  tetratricopeptide TPR_4  31.69 
 
 		 1029 aa  181  4.999999999999999e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6796  transcriptional regulator  32.89 
 
 		 1118 aa  176  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0744  ATPase-like protein  33.33 
 
 		 1054 aa  175  5e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4285  ATPase-like protein  28.57 
 
 		 1114 aa  173  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2931  ATPase-like protein  27.96 
 
 		 1051 aa  172  3e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.111498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0498  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  29.87 
 
 		 1150 aa  170  1e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.813194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  31.94 
 
 		 1029 aa  169  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2227  XRE family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 1015 aa  163  2e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0324  transcriptional regulator, LuxR family  28.67 
 
 		 938 aa  162  4e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5333  transcriptional regulator, LuxR family  32.27 
 
 		 992 aa  155  2.9999999999999998e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7885  ATPase-like protein  30.04 
 
 		 1121 aa  154  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.811946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2785  transcriptional regulator, LuxR family  32.88 
 
 		 1013 aa  151  6e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0848  transcriptional regulator, LuxR family  33.5 
 
 		 954 aa  150  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6794  transcriptional regulator  31.67 
 
 		 723 aa  147  7.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0773  transcriptional regulator, LuxR family  30.76 
 
 		 967 aa  147  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1757  transcriptional regulator, LuxR family  29.78 
 
 		 993 aa  146  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.790916  normal  0.333807 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4424  transcriptional activator domain-containing protein  34.64 
 
 		 1055 aa  144  7e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.518741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4524  adenylate/guanylate cyclase  31.26 
 
 		 1105 aa  144  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1020  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  32.04 
 
 		 1441 aa  142  3e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0795  transcriptional regulator, LuxR family  32.43 
 
 		 983 aa  142  3e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0361  LuxR family transcriptional regulator  33.25 
 
 		 973 aa  142  3.9999999999999997e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1470  SARP family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 1141 aa  142  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2662  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.4 
 
 		 1422 aa  141  6e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0735  ATPase-like protein  29.1 
 
 		 1118 aa  141  7.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1416  SARP family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 1141 aa  141  7.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1434  SARP family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 1141 aa  141  7.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5023  transcriptional regulator, LuxR family  31.33 
 
 		 982 aa  139  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2669  winged helix family transcriptional regulator ATPase  30.96 
 
 		 1123 aa  139  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.940937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1406  transcriptional activator domain-containing protein  31.04 
 
 		 1067 aa  138  5e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4653  transcriptional regulator  30.96 
 
 		 1148 aa  138  5e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.346184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2730  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  29.23 
 
 		 1429 aa  138  6.0000000000000005e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.225426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2962  transcriptional activator domain protein  32.92 
 
 		 1013 aa  136  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000192637 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5445  transcriptional regulator  33.67 
 
 		 1161 aa  136  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.202606 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4382  regulatory protein, LuxR  30.69 
 
 		 1006 aa  135  5e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172901  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1815  transcriptional regulator  29.35 
 
 		 1141 aa  133  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0114746 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1559  ATPase-like protein  32.39 
 
 		 916 aa  133  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0403  transcriptional regulator, LuxR family  34.93 
 
 		 981 aa  132  3e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.106797 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7631  ATPase-like protein  31.03 
 
 		 1123 aa  130  9.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.289533  normal  0.197233 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1458  adenylate/guanylate cyclase  25.57 
 
 		 1271 aa  127  8.000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4593  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.93 
 
 		 1141 aa  127  9e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3295  multi-sensor signal transduction multi-kinase  25.38 
 
 		 1774 aa  125  4e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0348  LuxR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 975 aa  124  8e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0210125 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6723  adenylate/guanylate cyclase  27.42 
 
 		 1148 aa  124  9e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5676  transcriptional regulator, LuxR family  35.85 
 
 		 953 aa  124  9e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.228112  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7187  transcriptional regulator  28.12 
 
 		 1198 aa  124  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1960  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  30.23 
 
 		 1080 aa  123  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0817  diguanylate cyclase  23.26 
 
 		 1826 aa  124  9.999999999999999e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1786  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  29.59 
 
 		 1081 aa  122  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0749  transcriptional activator domain protein  26.8 
 
 		 1090 aa  122  4.9999999999999996e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0791  ATP-binding region ATPase domain protein  25.68 
 
 		 2051 aa  122  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.417988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1636  TPR repeat transcriptional activator domain-containing protein  30.67 
 
 		 1126 aa  121  6e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6166  adenylate/guanylate cyclase  28.87 
 
 		 1139 aa  121  7.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3347  transcriptional activator domain-containing protein  32.73 
 
 		 1109 aa  120  9e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2803  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  25.35 
 
 		 1805 aa  120  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.70885 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4724  transcriptional activator domain-containing protein  31.28 
 
 		 713 aa  119  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1272  transcriptional regulator, LuxR family  33.17 
 
 		 967 aa  119  3e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.47802  normal  0.275164 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3641  adenylate/guanylate cyclase  29.81 
 
 		 1138 aa  118  6e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595732  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0044  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  28.49 
 
 		 1360 aa  118  6.9999999999999995e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0143745  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4504  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  25.45 
 
 		 1795 aa  117  8.999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.575028 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1068  transcriptional regulator, LuxR family  30.42 
 
 		 966 aa  117  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4503  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  25.35 
 
 		 1797 aa  115  5e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.194827  normal  0.137244 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5410  LuxR family transcriptional regulator  27.79 
 
 		 952 aa  115  6e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3799  LuxR family transcriptional regulator  27.79 
 
 		 952 aa  115  6e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00558742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5349  transcriptional regulator, LuxR family  30.8 
 
 		 900 aa  114  7.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0835513  normal  0.0775284 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0854  ATP-binding region ATPase domain protein  27.21 
 
 		 1871 aa  114  8.000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2845  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF and PAS/PAC sensor  26.89 
 
 		 1934 aa  114  9e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.218586  normal  0.818872 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4622  multi-sensor signal transduction multi-kinase  30.19 
 
 		 1780 aa  114  9e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701325  normal  0.952257 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2107  serine/threonine protein kinase  25.5 
 
 		 670 aa  114  9e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.568575 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3535  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  25.29 
 
 		 1804 aa  114  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.655347 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1181  ATPase, putative adenylate/guanylate cyclase activity  26.68 
 
 		 1134 aa  114  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3612  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.98 
 
 		 1089 aa  114  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.758157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2256  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  26.89 
 
 		 1295 aa  113  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2513  regulatory protein, LuxR  31 
 
 		 964 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0733559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3318  serine/threonine protein kinase  31.34 
 
 		 1403 aa  113  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0363788 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0405  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  28.51 
 
 		 1291 aa  112  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3945  serine/threonine protein kinase  29.85 
 
 		 1402 aa  112  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0258209  decreased coverage  0.00379805 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2277  multi-sensor signal transduction multi-kinase  28.45 
 
 		 1797 aa  112  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.947046 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2978  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.82 
 
 		 1942 aa  112  4.0000000000000004e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5817  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  24.63 
 
 		 1117 aa  111  6e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.987754  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5436  transcriptional regulator, LuxR family  29.27 
 
 		 959 aa  111  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800009 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1771  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  29.08 
 
 		 1403 aa  110  9.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00900617  normal  0.173635 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8304  transcriptional regulator, LuxR family  28.63 
 
 		 1084 aa  110  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3968  serine/threonine protein kinase  25.28 
 
 		 1908 aa  110  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.221286 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5691  sterile alpha motif-containing protein  31.17 
 
 		 1055 aa  109  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4928  transcriptional activator domain-containing protein  30.55 
 
 		 1075 aa  109  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.66885  normal  0.971064 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1683  PAS sensor protein  27.23 
 
 		 1833 aa  109  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.725143 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0256  TPR repeat-containing protein  30.35 
 
 		 1298 aa  109  3e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.636433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3995  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  27.63 
 
 		 1794 aa  108  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6020  multi-sensor signal transduction multi-kinase  27.41 
 
 		 1666 aa  108  4e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4834  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.32 
 
 		 1149 aa  108  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.519309  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3289  SARP family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 1116 aa  108  6e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16943  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0338  transcriptional regulator  28.87 
 
 		 1193 aa  108  7e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.497277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4197  transcriptional regulator, LuxR family  27.98 
 
 		 998 aa  107  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3683  transcriptional activator domain-containing protein  29.02 
 
 		 1034 aa  107  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00198659  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1264  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.53 
 
 		 1053 aa  107  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.313737  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>