288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3539 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3539  HI0933 family protein  100 
 
 		 402 aa  818    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.110532  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2335  HI0933 family protein  74.63 
 
 		 413 aa  627  1e-178  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00707215  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2846  hypothetical protein  74.63 
 
 		 413 aa  624  1e-178  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2884  HI0933-like protein  73.58 
 
 		 414 aa  613  9.999999999999999e-175  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2097  hypothetical protein  71.64 
 
 		 419 aa  602  1.0000000000000001e-171  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.234168  normal  0.897923 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2364  hypothetical protein  70.65 
 
 		 406 aa  592  1e-168  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.709721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1400  hypothetical protein  69.93 
 
 		 415 aa  579  1e-164  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.615162  normal  0.401096 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3283  HI0933-like protein  69.44 
 
 		 416 aa  568  1e-161  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1238  hypothetical protein  65.58 
 
 		 414 aa  514  1e-144  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1787  hypothetical protein  61.93 
 
 		 406 aa  487  1e-136  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000418833 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0885  hypothetical protein  57.14 
 
 		 416 aa  425  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3945  hypothetical protein  53.54 
 
 		 405 aa  424  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2547  hypothetical protein  54.21 
 
 		 394 aa  420  1e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.374165  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0335  hypothetical protein  54.59 
 
 		 407 aa  413  1e-114  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0837  hypothetical protein  54.59 
 
 		 407 aa  413  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1709  hypothetical protein  54.59 
 
 		 407 aa  413  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0368  FAD-dependent oxidoreductase  54.59 
 
 		 407 aa  413  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1516  hypothetical protein  54.59 
 
 		 407 aa  413  1e-114  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.631373  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2388  FAD-dependent oxidoreductase  54.59 
 
 		 407 aa  413  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.396449  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2824  HI0933-like protein  54.71 
 
 		 405 aa  414  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2530  FAD-dependent oxidoreductase  54.59 
 
 		 407 aa  413  1e-114  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2218  putative transmembrane protein  54.22 
 
 		 412 aa  408  1e-113  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4817  hypothetical protein  55.24 
 
 		 406 aa  409  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.571028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6778  HI0933 family protein  53.77 
 
 		 390 aa  411  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763254 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0617  hypothetical protein  54.33 
 
 		 407 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2610  hypothetical protein  56.06 
 
 		 378 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.624584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2423  HI0933 family protein  54.12 
 
 		 407 aa  404  1e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2030  HI0933 family protein  53.63 
 
 		 407 aa  402  1e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4483  HI0933-like protein  54.45 
 
 		 406 aa  403  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3779  hypothetical protein  53.4 
 
 		 405 aa  401  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.28946  normal  0.0295291 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3645  hypothetical protein  54.45 
 
 		 406 aa  403  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3882  hypothetical protein  54.45 
 
 		 406 aa  403  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.151985 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2208  hypothetical protein  52.85 
 
 		 406 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3253  hypothetical protein  53.14 
 
 		 405 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0198176 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1707  HI0933-like protein  53.12 
 
 		 399 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.105129 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2183  hypothetical protein  51.77 
 
 		 396 aa  383  1e-105  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.286863 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3931  HI0933 family protein  50.74 
 
 		 397 aa  384  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3274  hypothetical protein  51.88 
 
 		 396 aa  382  1e-105  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142928  normal  0.877884 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1635  hypothetical protein  48.05 
 
 		 405 aa  376  1e-103  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1831  HI0933-like protein  52.39 
 
 		 402 aa  377  1e-103  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.000611752  normal  0.363311 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4118  HI0933 family protein  49.01 
 
 		 394 aa  378  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2949  putative FAD dependent oxidoreductase  47.62 
 
 		 401 aa  374  1e-102  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3858  hypothetical protein  48.4 
 
 		 398 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00469108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0375  HI0933-like protein  48.48 
 
 		 393 aa  370  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0303  hypothetical protein  48.99 
 
 		 394 aa  368  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.918662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0047  hypothetical protein  47.86 
 
 		 394 aa  368  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322221 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0044  hypothetical protein  47.36 
 
 		 394 aa  365  1e-100  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1798  hypothetical protein  49.24 
 
 		 392 aa  368  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0054  hypothetical protein  47.86 
 
 		 396 aa  367  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3791  hypothetical protein  48.51 
 
 		 398 aa  366  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3962  hypothetical protein  48.51 
 
 		 398 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.327369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1621  HI0933 family protein  49.13 
 
 		 394 aa  367  1e-100  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0160754  normal  0.370908 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4328  hypothetical protein  47.61 
 
 		 394 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3901  hypothetical protein  48.51 
 
 		 398 aa  366  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.150346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4094  hypothetical protein  48.88 
 
 		 460 aa  367  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4032  hypothetical protein  48.63 
 
 		 398 aa  367  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2434  hypothetical protein  47.37 
 
 		 398 aa  368  1e-100  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0123  hypothetical protein  48.63 
 
 		 460 aa  367  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.291133  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3781  hypothetical protein  48.76 
 
 		 398 aa  366  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1357  hypothetical protein  49.26 
 
 		 409 aa  365  1e-100  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.999189  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0049  hypothetical protein  47.61 
 
 		 394 aa  366  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000378391 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0051  HI0933 family protein  47.61 
 
 		 394 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.71818 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0055  hypothetical protein  47.36 
 
 		 394 aa  365  1e-100  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000153695 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00166  predicted flavoprotein  47.37 
 
 		 393 aa  364  2e-99  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0047  hypothetical protein  47.22 
 
 		 394 aa  364  2e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0051  hypothetical protein  46.97 
 
 		 394 aa  363  3e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000135975 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0592  HI0933 family protein  48.65 
 
 		 405 aa  362  4e-99  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00536  oxidoreductase  46.48 
 
 		 397 aa  363  4e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0623  hypothetical protein  47.26 
 
 		 428 aa  363  4e-99  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.228803 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0691  HI0933 family protein  48.99 
 
 		 414 aa  363  4e-99  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1349  hypothetical protein  49.62 
 
 		 393 aa  362  6e-99  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001943  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  46.98 
 
 		 397 aa  361  1e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0413  HI0933-like protein  48.5 
 
 		 392 aa  361  1e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0650019  normal  0.0294705 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4688  hypothetical protein  48.24 
 
 		 413 aa  360  2e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00402  hypothetical protein  48.28 
 
 		 393 aa  360  2e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.96178  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0223  HI0933 family protein  49.62 
 
 		 400 aa  360  3e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0224  hypothetical protein  49.36 
 
 		 400 aa  359  5e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3974  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  49.36 
 
 		 400 aa  359  5e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3691  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  49.36 
 
 		 400 aa  359  5e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4838  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  49.36 
 
 		 400 aa  358  7e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03341  predicted oxidoreductase with FAD/NAD(P)-binding domain  49.36 
 
 		 400 aa  358  8e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.542782  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03294  hypothetical protein  49.36 
 
 		 400 aa  358  8e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.555868  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3830  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  49.36 
 
 		 400 aa  358  9.999999999999999e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3781  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  49.11 
 
 		 400 aa  357  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3802  hypothetical protein  45.96 
 
 		 394 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1392  hypothetical protein  49.12 
 
 		 393 aa  356  2.9999999999999997e-97  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574952  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0599  HI0933 family protein  47.16 
 
 		 392 aa  357  2.9999999999999997e-97  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.623073 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0145  hypothetical protein  45.41 
 
 		 394 aa  353  2e-96  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3694  HI0933-like protein  46.1 
 
 		 398 aa  354  2e-96  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0064  hypothetical protein  46.38 
 
 		 397 aa  353  4e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4873  hypothetical protein  45.45 
 
 		 394 aa  353  4e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0156  hypothetical protein  48.37 
 
 		 392 aa  352  7e-96  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4204  HI0933 family protein  46.93 
 
 		 399 aa  352  7e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4487  HI0933 family protein  47.79 
 
 		 399 aa  350  2e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28030  HI0933-like protein  46.68 
 
 		 411 aa  349  4e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1341  hypothetical protein  47.76 
 
 		 393 aa  347  2e-94  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0801  hypothetical protein  47.92 
 
 		 395 aa  347  2e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0398  HI0933 family protein  49.09 
 
 		 406 aa  347  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00801709 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5249  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  45.34 
 
 		 392 aa  346  3e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1441  HI0933-like protein  47.5 
 
 		 394 aa  346  4e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>