More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3455 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3455  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 		 377 aa  752    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5088  acetyl-CoA acetyltransferase  65.89 
 
 		 385 aa  493  9.999999999999999e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.225671  normal  0.910861 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3795  acetyl-CoA acetyltransferase  66.31 
 
 		 378 aa  489  1e-137  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.143554 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26010  acyl-CoA thiolase  63.76 
 
 		 379 aa  480  1e-134  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.653949  normal  0.286691 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4443  acetyl-CoA acetyltransferase  62.43 
 
 		 382 aa  465  9.999999999999999e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0110645 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1756  acetyl-CoA acetyltransferase  61.33 
 
 		 378 aa  464  1e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.404662  normal  0.415846 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1310  Acetyl-CoA C-acyltransferase  61.64 
 
 		 380 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0005  acetyl-CoA acetyltransferase  65.6 
 
 		 378 aa  448  1e-125  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1743  acetyl-CoA acetyltransferase  60.53 
 
 		 378 aa  442  1e-123  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0625  acetyl-CoA acetyltransferase  59.09 
 
 		 378 aa  423  1e-117  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3226  acetyl-CoA acetyltransferases  56.42 
 
 		 373 aa  386  1e-106  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6698  acetyl-CoA acetyltransferase  52.6 
 
 		 388 aa  358  9.999999999999999e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0359  3-ketoacyl-CoA thiolase  51.3 
 
 		 390 aa  357  1.9999999999999998e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0389  acetyl-CoA acetyltransferase  51.04 
 
 		 390 aa  357  1.9999999999999998e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.578535  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0387  acetyl-CoA acetyltransferase  50.78 
 
 		 390 aa  355  5.999999999999999e-97  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0618  Acetyl-CoA C-acyltransferase  49.61 
 
 		 400 aa  353  2.9999999999999997e-96  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.206368  normal  0.954759 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1886  acetyl-CoA acetyltransferase  51.06 
 
 		 391 aa  342  4e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00936644 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1592  acetyl-CoA acetyltransferase  48.79 
 
 		 390 aa  342  5e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.160886  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2936  acetyl-CoA acetyltransferase  47.42 
 
 		 390 aa  342  5e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0348  acetyl-CoA acetyltransferase  51.16 
 
 		 392 aa  342  7e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.867472  hitchhiker  0.0000022311 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3087  acetyl-CoA acetyltransferase  47.67 
 
 		 390 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2470  3-ketoacyl-CoA thiolase  48.59 
 
 		 391 aa  335  7e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.559901  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2969  acetyl-CoA acetyltransferase  50.13 
 
 		 391 aa  335  7e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1472  acetyl-CoA acetyltransferase  45.54 
 
 		 406 aa  334  2e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0328581  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2820  acetyl-CoA acetyltransferase  46 
 
 		 398 aa  334  2e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0020  3-ketoacyl-CoA thiolase  50.78 
 
 		 387 aa  333  3e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000295013 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1595  acetyl-CoA acetyltransferase  47.94 
 
 		 394 aa  333  3e-90  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0022  3-ketoacyl-CoA thiolase  50.26 
 
 		 387 aa  333  3e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000376188 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0017  3-ketoacyl-CoA thiolase  49.74 
 
 		 387 aa  333  3e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2266  acetyl-CoA acetyltransferase  49.22 
 
 		 390 aa  333  4e-90  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024775 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0014  3-ketoacyl-CoA thiolase  49.74 
 
 		 387 aa  333  4e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0013127  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1434  acetyl-CoA acetyltransferase  46.25 
 
 		 398 aa  333  4e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.732779  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0221  acetyl-CoA acetyltransferase  46.04 
 
 		 394 aa  332  8e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0215  acetyl-CoA acetyltransferase  46.04 
 
 		 394 aa  332  8e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0015  3-ketoacyl-CoA thiolase  49.35 
 
 		 387 aa  330  2e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0019  3-ketoacyl-CoA thiolase  49.35 
 
 		 387 aa  330  2e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0120161 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0012  3-ketoacyl-CoA thiolase  49.35 
 
 		 387 aa  330  2e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0898923  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0019  3-ketoacyl-CoA thiolase  49.35 
 
 		 387 aa  330  2e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000205749 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0348  acetyl-CoA acetyltransferase  44.7 
 
 		 392 aa  330  2e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000894654  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0015  3-ketoacyl-CoA thiolase  49.87 
 
 		 387 aa  330  3e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0665218 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2876  acetyl-CoA acetyltransferase  50.52 
 
 		 390 aa  329  4e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.44366 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0020  3-ketoacyl-CoA thiolase  48.96 
 
 		 387 aa  329  4e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.237064  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0017  3-ketoacyl-CoA thiolase  49.61 
 
 		 387 aa  329  4e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000928533 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0023  3-ketoacyl-CoA thiolase  49.61 
 
 		 387 aa  329  4e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.188213  hitchhiker  0.0000000293236 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0020  3-ketoacyl-CoA thiolase  49.1 
 
 		 387 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1606  3-ketoacyl-CoA thiolase  49.09 
 
 		 391 aa  327  2.0000000000000001e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00425712  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5109  acetyl-CoA acetyltransferase  46.17 
 
 		 392 aa  326  4.0000000000000003e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0012  3-ketoacyl-CoA thiolase  48.7 
 
 		 387 aa  325  6e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0031  3-ketoacyl-CoA thiolase  49.1 
 
 		 387 aa  324  1e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.871061  normal  0.0355813 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2127  acetyl-CoA acetyltransferase  47.81 
 
 		 390 aa  323  2e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0448  acetyl-CoA acetyltransferase  47.19 
 
 		 398 aa  323  3e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4531  acetyl-CoA acetyltransferase  45.79 
 
 		 384 aa  323  3e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4085  acetyl-CoA acetyltransferase  48.21 
 
 		 399 aa  323  3e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.802435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4393  acetyl-CoA acetyltransferase  47.34 
 
 		 392 aa  322  5e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3064  acetyl-CoA acetyltransferase  47.34 
 
 		 392 aa  322  6e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1205  acetyl-CoA acetyltransferase  47.92 
 
 		 400 aa  321  9.999999999999999e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000642816 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2090  acetyl-CoA acetyltransferase  47.72 
 
 		 390 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000145195 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3596  acetyl-CoA acetyltransferase  45.22 
 
 		 390 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0574  acetyl-CoA acetyltransferase  48.74 
 
 		 398 aa  320  1.9999999999999998e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0595  acetyl-CoA acetyltransferase  48.49 
 
 		 398 aa  320  1.9999999999999998e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.837144 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1706  acetyl-CoA acetyltransferase  45.62 
 
 		 395 aa  319  5e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1340  acetyl-CoA acetyltransferase  48.49 
 
 		 398 aa  319  5e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2125  acetyl-CoA acetyltransferase  48.21 
 
 		 396 aa  319  6e-86  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.533302 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2412  acetyl-CoA acetyltransferase  47.7 
 
 		 399 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.804576  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0682  acetyl-CoA acetyltransferase  47.7 
 
 		 399 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0199  acetyl-CoA acetyltransferase  47.7 
 
 		 399 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0859  acetyl-CoA acetyltransferase  47.7 
 
 		 399 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0816  acetyl-CoA acetyltransferase  46.21 
 
 		 398 aa  318  7.999999999999999e-86  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0697  acetyl-CoA acetyltransferase  47.7 
 
 		 399 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.767205  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2332  acetyl-CoA acetyltransferase  47.7 
 
 		 399 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2746  acetyl-CoA acetyltransferase  47.7 
 
 		 399 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2058  thiolase  45.64 
 
 		 399 aa  318  9e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.35513  normal  0.039203 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0018  3-ketoacyl-CoA thiolase  47.67 
 
 		 387 aa  318  1e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.56685  normal  0.969653 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3121  acetyl-CoA acetyltransferase  44.31 
 
 		 406 aa  317  2e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000096812 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5143  acetyl-CoA acetyltransferase  45.22 
 
 		 390 aa  317  3e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3748  3-ketoacyl-CoA thiolase  49.22 
 
 		 387 aa  317  3e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0929  acetyl-CoA acetyltransferase  43.56 
 
 		 406 aa  317  3e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.561764  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0301  Beta-ketoadipyl CoA thiolase  48.7 
 
 		 401 aa  317  3e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0179307  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0566  acetyl-CoA acetyltransferase  47.7 
 
 		 399 aa  316  4e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5155  acetyl-CoA acetyltransferase  45.22 
 
 		 390 aa  316  4e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2825  beta-ketoadipyl CoA thiolase  48.13 
 
 		 401 aa  316  4e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3553  acetyl-CoA acetyltransferase  44.64 
 
 		 392 aa  316  5e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0573177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0095  acetyl-CoA acetyltransferase  45.48 
 
 		 390 aa  315  7e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1803  acetyl-CoA acetyltransferase  47.15 
 
 		 390 aa  315  7e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1145  3-ketoacyl-CoA thiolase  45.89 
 
 		 391 aa  315  7e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.112887  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0699  acetyl-CoA acetyltransferase  44.44 
 
 		 406 aa  315  7e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4834  acetyl-CoA acetyltransferase  45.22 
 
 		 390 aa  314  9.999999999999999e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0957  acetyl-CoA acetyltransferase  43.58 
 
 		 414 aa  315  9.999999999999999e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.711113  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2248  beta-ketoadipyl CoA thiolase  48.04 
 
 		 401 aa  314  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0780819  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0580  acetyl-CoA acetyltransferase  48.47 
 
 		 399 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1828  acetyl-CoA acetyltransferase  43.81 
 
 		 406 aa  314  1.9999999999999998e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.901012  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0416  acetyl-CoA acetyltransferase  47.45 
 
 		 399 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4876  acetyl-CoA acetyltransferase  45.22 
 
 		 390 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4718  acetyl-CoA acetyltransferase  45.22 
 
 		 390 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4226  3-ketoacyl-CoA thiolase  48.84 
 
 		 387 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.032199  hitchhiker  0.00446338 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5117  acetyl-CoA acetyltransferase  45.22 
 
 		 390 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5248  acetyl-CoA acetyltransferase  45.22 
 
 		 390 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5149  acetyl-CoA acetyltransferase  45.22 
 
 		 390 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4733  acetyl-CoA acetyltransferase  45.22 
 
 		 390 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1484  beta-ketoadipyl CoA thiolase  48.04 
 
 		 401 aa  313  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>