59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3306 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3306  hypothetical protein  100 
 
 		 227 aa  442  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.40361  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32420  hypothetical protein  57.79 
 
 		 221 aa  211  5.999999999999999e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1329  hypothetical protein  50 
 
 		 218 aa  180  1e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.385927  hitchhiker  0.00262088 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0105  hypothetical protein  42.45 
 
 		 221 aa  149  3e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0136053  normal  0.0348722 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4177  hypothetical protein  49.65 
 
 		 225 aa  142  3e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22720  hypothetical protein  38.29 
 
 		 243 aa  118  7.999999999999999e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00260  hypothetical protein  40 
 
 		 242 aa  103  3e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2783  hypothetical protein  35.98 
 
 		 211 aa  95.5  6e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0781526  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2804  integral membrane protein  35.98 
 
 		 207 aa  95.5  6e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.39512  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2530  integral membrane protein  35.98 
 
 		 207 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000539484 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2762  integral membrane protein  35.37 
 
 		 207 aa  92.8  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.342781  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2555  hypothetical protein  34.15 
 
 		 211 aa  89.4  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.011471  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0824  integral membrane protein  37.31 
 
 		 211 aa  88.2  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.701818  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0473  hypothetical protein  37.31 
 
 		 211 aa  88.2  9e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.690189  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0424  hypothetical protein  37.31 
 
 		 211 aa  88.2  9e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2372  hypothetical protein  37.31 
 
 		 211 aa  88.2  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0588117  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1802  hypothetical protein  37.31 
 
 		 211 aa  88.2  9e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2511  hypothetical protein  37.31 
 
 		 211 aa  88.2  9e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0635  hypothetical protein  36.27 
 
 		 211 aa  86.7  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0911562  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22140  hypothetical protein  36.48 
 
 		 259 aa  86.3  4e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0260  hypothetical protein  39.26 
 
 		 203 aa  83.6  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.121755 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2748  hypothetical protein  33.14 
 
 		 213 aa  81.3  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.52306 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3297  hypothetical protein  32.12 
 
 		 220 aa  79.7  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.487466 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0511  hypothetical protein  35.18 
 
 		 217 aa  77.4  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0555837  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4194  hypothetical protein  30.41 
 
 		 219 aa  75.1  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3191  hypothetical protein  34.04 
 
 		 218 aa  73.9  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3928  hypothetical protein  30.1 
 
 		 219 aa  72.4  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.811707  normal  0.0524532 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1085  hypothetical protein  30.67 
 
 		 226 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2553  hypothetical protein  36.52 
 
 		 207 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.284006  normal  0.21762 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2278  hypothetical protein  35.63 
 
 		 207 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.887481  normal  0.0474109 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4357  hypothetical protein  35.76 
 
 		 211 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460456 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1274  hypothetical protein  29.83 
 
 		 236 aa  64.3  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.28471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4574  hypothetical protein  28.57 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3911  hypothetical protein  30.88 
 
 		 236 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4455  hypothetical protein  30.88 
 
 		 236 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.554622  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3616  hypothetical protein  30.88 
 
 		 236 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.776236 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5984  hypothetical protein  30.82 
 
 		 227 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.834885  normal  0.450186 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3289  hypothetical protein  30.67 
 
 		 236 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.356174  normal  0.642024 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1212  hypothetical protein  31.75 
 
 		 255 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.194441  normal  0.436437 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2236  hypothetical protein  35.61 
 
 		 226 aa  61.6  0.000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.112154 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3805  hypothetical protein  30.67 
 
 		 212 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.404034  normal  0.773364 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4273  hypothetical protein  31.06 
 
 		 211 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2177  hypothetical protein  31.69 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.359775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4672  hypothetical protein  31.69 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.178311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0526  hypothetical protein  30.21 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1448  hypothetical protein  30.43 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.601654  normal  0.316889 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2219  hypothetical protein  32.28 
 
 		 173 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.233822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3812  hypothetical protein  28.05 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2191  hypothetical protein  27.46 
 
 		 236 aa  52.4  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2415  hypothetical protein  32.74 
 
 		 235 aa  52  0.000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00323539  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19750  hypothetical protein  28.98 
 
 		 238 aa  52  0.000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00552394  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0275  hypothetical protein  30.15 
 
 		 219 aa  50.4  0.00002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2760  hypothetical protein  31.87 
 
 		 215 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0499164  normal  0.364973 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0743  hypothetical protein  25.41 
 
 		 208 aa  49.7  0.00004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.247142  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3299  hypothetical protein  28.4 
 
 		 219 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0654352  normal  0.14095 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl508  unknown transmembrane protein  23.5 
 
 		 315 aa  48.5  0.00009  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.901421  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2774  hypothetical protein  30.63 
 
 		 215 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.152324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2730  hypothetical protein  30.63 
 
 		 215 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.826821  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02190  hypothetical protein  26.35 
 
 		 230 aa  46.6  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>