263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3287 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3287  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 140 aa  291  2e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0335707  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1898  thioesterase superfamily protein  75.54 
 
 		 140 aa  230  6e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.292723 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2677  thioesterase superfamily protein  75.54 
 
 		 140 aa  229  8.000000000000001e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3014  thioesterase superfamily protein  75.54 
 
 		 139 aa  228  1e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.80515  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3983  thioesterase superfamily protein  69.57 
 
 		 139 aa  217  3.9999999999999997e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.813194  normal  0.0353277 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4309  thioesterase superfamily protein  69.78 
 
 		 156 aa  214  4e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.515868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2065  thioesterase superfamily protein  58.82 
 
 		 147 aa  182  1.0000000000000001e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0110405 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0815  thioesterase superfamily protein  51.52 
 
 		 139 aa  157  4e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.545456  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1565  thioesterase superfamily protein  49.23 
 
 		 142 aa  141  4e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2611  thioesterase family protein  48.44 
 
 		 147 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1348  thioesterase superfamily protein  49.22 
 
 		 143 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1388  thioesterase superfamily protein  49.22 
 
 		 143 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4608  thioesterase superfamily protein  49.22 
 
 		 143 aa  137  6e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00844353  normal  0.865959 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0981  thioesterase superfamily protein  49.22 
 
 		 146 aa  136  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1463  thioesterase superfamily protein  49.22 
 
 		 146 aa  136  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1151  thioesterase superfamily protein  46.15 
 
 		 133 aa  135  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.758431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1364  putative thioesterase  47.2 
 
 		 134 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1267  thioesterase superfamily protein  46.15 
 
 		 133 aa  132  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.384152  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2763  thioesterase superfamily protein  45.53 
 
 		 132 aa  126  8.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1693  thioesterase family protein  45.14 
 
 		 159 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1937  thioesterase superfamily protein  43.18 
 
 		 136 aa  125  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00538677  normal  0.170289 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1441  thioesterase superfamily protein  47.15 
 
 		 132 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1114  thioesterase family protein  47.66 
 
 		 143 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0224064  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1871  thioesterase family protein  47.66 
 
 		 143 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0652374  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1717  thioesterase family protein  47.66 
 
 		 143 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0944  thioesterase family protein  47.66 
 
 		 143 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1556  thioesterase family protein  47.66 
 
 		 143 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000380649  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0217  thioesterase family protein  47.66 
 
 		 143 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0748592  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1786  thioesterase superfamily protein  52.43 
 
 		 213 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1657  thioesterase superfamily protein  39.85 
 
 		 139 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2356  hypothetical protein  32.06 
 
 		 134 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1590  thioesterase superfamily protein  35.16 
 
 		 135 aa  96.7  9e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.359349  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2925  hypothetical protein  34.33 
 
 		 130 aa  96.3  1e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27910  hypothetical protein  29.01 
 
 		 134 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2779  hypothetical protein  35.56 
 
 		 130 aa  94.4  5e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1926  thioesterase superfamily protein  28.24 
 
 		 136 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.187016 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5175  thioesterase superfamily protein  35.94 
 
 		 139 aa  86.7  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.641217 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3772  thioesterase superfamily protein  33.83 
 
 		 142 aa  84  7e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.478707  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01695  Predicted thioesterase  30.6 
 
 		 137 aa  80.5  0.000000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.431774  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1117  thioesterase superfamily protein  27.74 
 
 		 135 aa  74.7  0.0000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.235483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0036  thioesterase superfamily protein  33.86 
 
 		 139 aa  74.3  0.0000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4857  thioesterase superfamily protein  30.65 
 
 		 143 aa  72  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0084  thioesterase superfamily protein  31.75 
 
 		 154 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0081  thioesterase superfamily protein  31.75 
 
 		 154 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0074  thioesterase superfamily protein  28.91 
 
 		 141 aa  69.3  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0066  thioesterase superfamily protein  30.95 
 
 		 146 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0085  thioesterase superfamily protein  30.95 
 
 		 154 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0080  thioesterase superfamily protein  30.95 
 
 		 150 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04892  putative thioesterase  26.67 
 
 		 134 aa  69.7  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000899406  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0086  thioesterase superfamily protein  30.95 
 
 		 150 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0080  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.92 
 
 		 142 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0083  thioesterase superfamily protein  30.95 
 
 		 142 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0092  hypothetical protein  33.06 
 
 		 161 aa  67.8  0.00000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.190576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1678  thioesterase superfamily protein  28.26 
 
 		 145 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.71411 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3106  thioesterase superfamily protein  28.46 
 
 		 156 aa  67  0.00000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0244  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 163 aa  66.2  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.758642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0966  thioesterase superfamily protein  29.2 
 
 		 145 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3968  thioesterase superfamily protein  28.35 
 
 		 140 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1624  thioesterase superfamily protein  30 
 
 		 143 aa  65.9  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2050  hypothetical protein  25.9 
 
 		 150 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00110893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3691  thioesterase superfamily protein  25.9 
 
 		 150 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06649  thioesterase  29.41 
 
 		 150 aa  63.9  0.0000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1614  thioesterase superfamily protein  25.2 
 
 		 149 aa  63.5  0.0000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4456  thioesterase superfamily protein  27.41 
 
 		 144 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1939  thioesterase superfamily protein  28.23 
 
 		 147 aa  63.5  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.158219  hitchhiker  0.00402541 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001138  predicted thioesterase  29.85 
 
 		 150 aa  62  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1611  thioesterase superfamily protein  27.42 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0525726  normal  0.904244 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4269  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2836  thioesterase superfamily protein  29.85 
 
 		 146 aa  62.4  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10164  hypothetical protein  25.41 
 
 		 151 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3842  thioesterase superfamily protein  27.97 
 
 		 157 aa  61.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.601909  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1769  thioesterase superfamily protein  29.84 
 
 		 147 aa  61.2  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.201031  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0191  thioesterase superfamily protein  27.01 
 
 		 140 aa  60.8  0.000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0277  thioesterase superfamily protein  25 
 
 		 143 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0872113 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4183  thioesterase superfamily protein  27.2 
 
 		 142 aa  60.5  0.000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1882  thioesterase superfamily protein  27.27 
 
 		 144 aa  60.1  0.000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1644  thioesterase superfamily protein  27.94 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0073  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  31.75 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3586  thioesterase superfamily protein  26.09 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0101  thioesterase superfamily protein  30.09 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37230  predicted thioesterase  26.67 
 
 		 136 aa  58.9  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0929724 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04031  thioesterase family protein domain protein  26.52 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3395  thioesterase superfamily protein  26.81 
 
 		 153 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.435542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1644  thioesterase superfamily protein  25 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0978  thioesterase superfamily protein  27.34 
 
 		 131 aa  58.2  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3214  thioesterase superfamily protein  32.73 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3704  thioesterase superfamily protein  27.2 
 
 		 153 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0102  thioesterase superfamily protein  22.39 
 
 		 147 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.208156 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0112  thioesterase superfamily protein  22.39 
 
 		 147 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5015  thioesterase superfamily protein  24.39 
 
 		 137 aa  57.4  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.168597  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0121  thioesterase superfamily protein  22.39 
 
 		 147 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.750457  normal  0.0163891 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0382  thioesterase superfamily protein  28.23 
 
 		 143 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4076  hypothetical protein  30.47 
 
 		 144 aa  57  0.00000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2550  thioesterase superfamily protein  27.78 
 
 		 149 aa  57  0.00000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2820  hypothetical protein  25.37 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.132561 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1202  thioesterase superfamily protein  23.53 
 
 		 175 aa  56.2  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000375293  normal  0.571615 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0426  thioesterase superfamily protein  26.95 
 
 		 155 aa  56.2  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2619  thioesterase superfamily protein  28.74 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68490  hypothetical protein  23.66 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.222508 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1332  thioesterase superfamily protein  26.77 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0269982  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>