More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3244 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3244  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 158 aa  319  9.999999999999999e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0645  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 		 153 aa  121  3e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0664584 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2836  NUDIX hydrolase  41.06 
 
 		 158 aa  114  3.9999999999999997e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927915  normal  0.666703 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3518  NUDIX hydrolase  37.34 
 
 		 170 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0614  NUDIX hydrolase  39.87 
 
 		 169 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.287275  normal  0.48295 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3611  MutT/nudix family protein  37.01 
 
 		 169 aa  105  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.454124  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2108  NUDIX hydrolase  40.38 
 
 		 157 aa  105  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000452555  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3612  MutT/nudix family protein  37.97 
 
 		 169 aa  103  9e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.463705  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3223  NUDIX hydrolase  36.71 
 
 		 170 aa  102  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2037  NUDIX hydrolase  31.65 
 
 		 155 aa  96.3  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2831  NUDIX hydrolase  34.97 
 
 		 155 aa  90.1  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00779282  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3074  mutT/nudix family protein  34.97 
 
 		 155 aa  87.8  5e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2802  MutT/Nudix family protein  34.27 
 
 		 157 aa  87.8  6e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.187325  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2202  phosphohydrolase  32.88 
 
 		 155 aa  87.8  6e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.784536  hitchhiker  0.000000000000369619 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2765  MutT/Nudix family protein  32.24 
 
 		 157 aa  87  8e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3048  MutT/Nudix family protein  33.57 
 
 		 155 aa  85.1  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3081  mutT/nudix family protein  33.57 
 
 		 155 aa  84.3  6e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.401788  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3056  mutT/nudix family protein  32.87 
 
 		 157 aa  84  8e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2830  mutT/nudix family protein  31.47 
 
 		 155 aa  79  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.582109  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3044  mutT/nudix family protein  31.47 
 
 		 155 aa  79  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1043  NUDIX family hydrolase  35.1 
 
 		 159 aa  77.4  0.00000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1195  MutT/nudix family protein  30.43 
 
 		 153 aa  76.3  0.0000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0073  MutT/nudix family protein  30.23 
 
 		 162 aa  72.4  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0598  NUDIX hydrolase  32.47 
 
 		 163 aa  71.2  0.000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4321  NUDIX hydrolase  46.07 
 
 		 181 aa  69.7  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00183396  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0227  hypothetical protein  33.1 
 
 		 167 aa  67  0.00000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00160  ADP-ribose pyrophosphatase  33.83 
 
 		 143 aa  67  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.119195 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0317  ADP-ribose pyrophosphatase  33.71 
 
 		 156 aa  60.8  0.000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1790  NUDIX hydrolase  32.58 
 
 		 168 aa  58.9  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000145412  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0717  NUDIX hydrolase  30.07 
 
 		 168 aa  58.2  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1648  NUDIX hydrolase  30.57 
 
 		 172 aa  57.4  0.00000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000051086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2057  NUDIX hydrolase  29.66 
 
 		 168 aa  57.4  0.00000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000169928  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3311  NUDIX hydrolase  41.79 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3733  mutT/nudix family protein  40.91 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.412613  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2535  NUDIX hydrolase  32.31 
 
 		 140 aa  55.1  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.240977  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0490  NUDIX/MutT family protein  30.56 
 
 		 168 aa  55.5  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.0000000000225283  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3416  mutT/nudix family protein  40.91 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3685  mutT/nudix family protein  40.91 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.293788  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3636  mutT/nudix family protein  40.91 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1584  mutT/nudix family protein  40.91 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0325451 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7095  NUDIX hydrolase  30.43 
 
 		 155 aa  54.3  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.337747  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4380  MutT/Nudix family protein  30.4 
 
 		 144 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2758  putative mut-like protein  34.75 
 
 		 163 aa  53.9  0.0000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2554  NUDIX hydrolase  33.78 
 
 		 160 aa  53.9  0.0000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1999  mutT/nudix family protein  26.72 
 
 		 153 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00120864  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3644  mutT/nudix family protein  39.39 
 
 		 147 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2463  NUDIX hydrolase  30.71 
 
 		 148 aa  53.1  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.101073  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49101  predicted protein  30.93 
 
 		 174 aa  53.9  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00569442  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3653  mutT/nudix family protein  39.39 
 
 		 147 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4267  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  52.83 
 
 		 346 aa  53.5  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.178343  normal  0.0602888 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2074  mutT/nudix family protein  31.03 
 
 		 229 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000276659  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4321  NUDIX hydrolase  46.27 
 
 		 291 aa  52.4  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1854  mutT/nudix family protein  26.72 
 
 		 153 aa  52.4  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1825  MutT/Nudix family protein  26.72 
 
 		 153 aa  52.8  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000200422  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3377  MutT/Nudix family protein  39.39 
 
 		 147 aa  52.8  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4793  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  50.94 
 
 		 346 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0447007  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3327  MutT/Nudix family protein  37.88 
 
 		 147 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1997  mutT/nudix family protein  26.72 
 
 		 153 aa  52.4  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000428877  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2030  mutT/nudix family protein  26.72 
 
 		 153 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.83484e-43 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2839  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 		 140 aa  52.4  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00261887  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03438  MutT-nudix family protein  39.56 
 
 		 149 aa  52.4  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3873  NUDIX hydrolase  31.51 
 
 		 147 aa  52  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.666215  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1790  NUDIX hydrolase  31.01 
 
 		 200 aa  52.4  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0789359  normal  0.107189 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1809  MutT/Nudix family protein  26.72 
 
 		 153 aa  52.4  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00380434  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4887  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  50.94 
 
 		 346 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.150222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3330  mutT/nudix family protein  26.72 
 
 		 153 aa  52.4  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000371651  unclonable  1.49498e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1860  NUDIX hydrolase  28.45 
 
 		 153 aa  52.4  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00730748  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5399  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  50.94 
 
 		 346 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1319  ADP-ribose pyrophosphatase  28.46 
 
 		 148 aa  52  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0720149  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2094  mutT/nudix family protein  26.72 
 
 		 153 aa  52.4  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000267721  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29780  ADP-ribose pyrophosphatase  38.55 
 
 		 163 aa  52  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3479  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  50.94 
 
 		 346 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0251812  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0754  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 		 282 aa  51.6  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00528415  hitchhiker  0.00425905 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4467  NUDIX hydrolase  32.48 
 
 		 144 aa  51.6  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0825  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  50.94 
 
 		 346 aa  51.6  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0516478 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4534  mutT/nudix family protein  30.77 
 
 		 144 aa  51.2  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4887  mutT/nudix family protein  30.77 
 
 		 144 aa  51.2  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1924  NUDIX hydrolase  34.82 
 
 		 340 aa  51.2  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4370  MutT/Nudix family protein  28.21 
 
 		 144 aa  51.2  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0833  NUDIX hydrolase  37.63 
 
 		 155 aa  51.2  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0297624  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2453  MutT/Nudix family protein  34.71 
 
 		 148 aa  50.8  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0206727  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8400  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  40.28 
 
 		 139 aa  50.8  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.24066 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4745  mutT/nudix family protein  36.36 
 
 		 144 aa  50.8  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.710264  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5237  NUDIX hydrolase  32.08 
 
 		 150 aa  50.8  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.598281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1680  hypothetical protein  42.62 
 
 		 269 aa  50.8  0.000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2742  mutT/nudix family protein  34.71 
 
 		 148 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000947125  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3458  mutator MutT protein  32.35 
 
 		 141 aa  50.8  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.432135  hitchhiker  0.00028908 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0096  NUDIX hydrolase  37.88 
 
 		 141 aa  50.4  0.000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0757202  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0614  NUDIX hydrolase  30.61 
 
 		 135 aa  50.4  0.000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0852421  normal  0.976562 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2714  mutT/nudix family protein  31.82 
 
 		 148 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0283427  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1505  MutT/nudix family protein  37.97 
 
 		 158 aa  49.7  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000663569  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4313  NUDIX hydrolase  44.93 
 
 		 153 aa  50.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0234  NUDIX hydrolase  35.9 
 
 		 163 aa  50.1  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.425088  normal  0.397447 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1805  NUDIX hydrolase  36.04 
 
 		 174 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0770622 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2611  mutT/nudix family protein  33.33 
 
 		 148 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000504287 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2431  NUDIX hydrolase  28.91 
 
 		 148 aa  50.4  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.960036  normal  0.286625 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5104  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  41.49 
 
 		 345 aa  49.7  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180722  normal  0.842074 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67120  hypothetical protein  32.14 
 
 		 158 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1525  NUDIX hydrolase  35.14 
 
 		 441 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.103483 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1412  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.67 
 
 		 138 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.559865  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>