40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3212 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3212  protein of unknown function DUF126  100 
 
 		 150 aa  306  5.9999999999999995e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6625  hypothetical protein  77.94 
 
 		 154 aa  229  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.925457 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6392  hypothetical protein  77.94 
 
 		 154 aa  229  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6223  hypothetical protein  77.21 
 
 		 154 aa  226  9e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0718  hypothetical protein  40.15 
 
 		 147 aa  110  7.000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1471  hypothetical protein  33.33 
 
 		 137 aa  95.5  2e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0208  hypothetical protein  43.31 
 
 		 137 aa  93.6  9e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.920123  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1457  hypothetical protein  40.77 
 
 		 146 aa  87.4  6e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.219192 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0800  aconitase subunit 2  41.18 
 
 		 131 aa  85.9  2e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000377463 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1309  hypothetical protein  38.4 
 
 		 132 aa  82.8  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0648242  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1041  hypothetical protein  35.88 
 
 		 138 aa  80.5  0.000000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.587371 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0615  predicted aconitase subunit 2  37.8 
 
 		 142 aa  78.6  0.00000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.478753  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1693  hypothetical protein  34.01 
 
 		 599 aa  75.9  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4854  hypothetical protein  36.08 
 
 		 563 aa  72.4  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.684084  normal  0.761618 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4133  hypothetical protein  40.62 
 
 		 580 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47930  hypothetical protein  40.62 
 
 		 580 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.444415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0797  hypothetical protein  34.45 
 
 		 136 aa  70.5  0.000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0009  hypothetical protein  40.66 
 
 		 155 aa  68.9  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.604454  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0506  protein of unknown function DUF126  32 
 
 		 130 aa  68.2  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3862  hypothetical protein  36.17 
 
 		 563 aa  67.8  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0019  hypothetical protein  31.34 
 
 		 131 aa  67  0.00000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2143  protein of unknown function DUF521  37.11 
 
 		 580 aa  65.5  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.180277  normal  0.183216 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0452  hypothetical protein  29.86 
 
 		 138 aa  64.3  0.0000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.265076  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1754  hypothetical protein  32.09 
 
 		 130 aa  61.2  0.000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0709  hypothetical protein  32.09 
 
 		 130 aa  61.2  0.000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0149  hypothetical protein  32.09 
 
 		 130 aa  60.5  0.000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.104212  normal  0.0128163 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08629  DUF521 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G00490)  31.63 
 
 		 576 aa  59.3  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.255951  normal  0.881341 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47407  predicted protein  31.78 
 
 		 652 aa  56.2  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4968  hypothetical protein  29.69 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.861184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2555  hypothetical protein  34.74 
 
 		 150 aa  52.8  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000224136  normal  0.128546 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0054  hypothetical protein  28.12 
 
 		 128 aa  52.4  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0848  protein of unknown function DUF126  25.41 
 
 		 120 aa  52  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1423  aconitase subunit 2  33.73 
 
 		 166 aa  50.8  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00470678  normal  0.0794476 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3763  hypothetical protein  31.16 
 
 		 159 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.177508 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2339  aconitase subunit 2  31.82 
 
 		 154 aa  48.5  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3637  hypothetical protein  30.3 
 
 		 149 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.983078  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4970  hypothetical protein  31.96 
 
 		 152 aa  47.8  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3760  hypothetical protein  31.68 
 
 		 159 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0710107  normal  0.198691 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5491  hypothetical protein  30.53 
 
 		 149 aa  46.2  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.982679 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4603  hypothetical protein  31.68 
 
 		 159 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>