179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3140 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4073  formamidase  80.68 
 
 		 410 aa  694    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.398995  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5506  formamidase  79.71 
 
 		 409 aa  672    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0981  formamidase  78.78 
 
 		 410 aa  686    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.068454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1257  formamidase  82.35 
 
 		 409 aa  673    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.66975  normal  0.173821 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0569  formamidase  91.69 
 
 		 410 aa  778    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1706  formamidase (FmdA)  86.8 
 
 		 410 aa  748    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0170244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3859  formamidase  82.35 
 
 		 409 aa  674    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3737  formamidase  83.17 
 
 		 412 aa  719    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4631  formamidase  83.17 
 
 		 412 aa  719    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.250924  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3140  Formamidase  100 
 
 		 410 aa  844    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3860  formamidase  76.47 
 
 		 410 aa  654    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.534213  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3592  formamidase  91.2 
 
 		 409 aa  753    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5673  formamidase  83.41 
 
 		 412 aa  721    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0598  formamidase  82.11 
 
 		 409 aa  703    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.412035  normal  0.0121636 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1598  Formamidase  71.25 
 
 		 411 aa  637    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.52036  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0659  formamidase (formamide amidohydrolase)  81.62 
 
 		 409 aa  679    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190134  normal  0.386066 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3684  Formamidase  79.46 
 
 		 409 aa  683    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0179  formamidase  91.2 
 
 		 410 aa  776    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0225  formamidase  83.33 
 
 		 409 aa  716    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3566  Formamidase  79.46 
 
 		 409 aa  671    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3375  formamidase  79.46 
 
 		 409 aa  683    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1448  Formamidase  82.35 
 
 		 409 aa  713    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.360137  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2970  formamidase  76.77 
 
 		 410 aa  630  1e-179  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.231861 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1777  formamidase  69.35 
 
 		 406 aa  592  1e-168  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00161545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3110  Formamidase  68.73 
 
 		 408 aa  578  1e-164  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.441852  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3569  formamidase  69.17 
 
 		 408 aa  552  1e-156  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.704003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2309  Formamidase  61.22 
 
 		 397 aa  507  9.999999999999999e-143  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19680  predicted acetamidase/formamidase  56.4 
 
 		 414 aa  488  1e-137  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0111175 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0422  Formamidase  57.28 
 
 		 415 aa  482  1e-135  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0857845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2658  formamidase  56.25 
 
 		 416 aa  477  1e-133  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04577  FormamidasePutative uncharacterized protein (EC 3.5.1.49); [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9C453]  56.67 
 
 		 411 aa  465  9.999999999999999e-131  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.469129 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2262  formamidase  56.25 
 
 		 417 aa  457  1e-127  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2309  formamidase  56.25 
 
 		 417 aa  457  1e-127  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.215194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2301  formamidase  56.25 
 
 		 417 aa  457  1e-127  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.506693 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2158  Formamidase  55.77 
 
 		 417 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.062604  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0076  Formamidase  55.91 
 
 		 418 aa  449  1e-125  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5199  Formamidase  54.93 
 
 		 417 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12120  predicted acetamidase/formamidase  54.11 
 
 		 418 aa  447  1.0000000000000001e-124  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.181447  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28914  formamidase  51.81 
 
 		 426 aa  439  9.999999999999999e-123  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0986635 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2285  Acetamidase/Formamidase  55.09 
 
 		 423 aa  440  9.999999999999999e-123  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.117842 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1721  Formamidase  55.23 
 
 		 418 aa  437  1e-121  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.787514  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_54476  formidase  52.17 
 
 		 451 aa  437  1e-121  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.185862  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2157  Formamidase  50.25 
 
 		 420 aa  403  1e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174868  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21390  predicted acetamidase/formamidase  46.3 
 
 		 401 aa  321  1.9999999999999998e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.737575  normal  0.761775 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2612  formamidase  58.24 
 
 		 206 aa  225  9e-58  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0583639  normal  0.408367 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2662  formamidase  37.5 
 
 		 393 aa  200  3e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0965  formamidase  36.05 
 
 		 388 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0855422  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0022  Formamidase  32.2 
 
 		 459 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.846742  normal  0.0101399 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0627  Formamidase  33.15 
 
 		 318 aa  153  7e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0465  formamidase  33.33 
 
 		 322 aa  149  8e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000577809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3711  Formamidase  28.11 
 
 		 328 aa  120  3.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3253  acetamidase / formamidase  30.54 
 
 		 319 aa  113  5e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.426618  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3987  acetamidase/formamidase  30.54 
 
 		 319 aa  113  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0213  acetamidase/formamidase  28.57 
 
 		 315 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0179184  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6677  Acetamidase/Formamidase  28.85 
 
 		 314 aa  109  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.47216 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3274  ABC-type oligopeptide transport system periplasmic component-like protein  30.25 
 
 		 319 aa  107  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3551  acetamidase/formamidase  27.6 
 
 		 312 aa  107  4e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5629  formamidase  29.04 
 
 		 314 aa  104  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1337  acetamidase/formamidase  26.78 
 
 		 312 aa  103  7e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2810  Acetamidase/Formamidase  27.85 
 
 		 313 aa  99  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.451627 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4455  Acetamidase/Formamidase  31.23 
 
 		 418 aa  94  5e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.182113  normal  0.335394 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1803  acetamidase/formamidase  30.82 
 
 		 358 aa  92.8  9e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0385546 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0290  acetamidase/formamidase  30.38 
 
 		 373 aa  90.1  6e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3454  formamidase  28.73 
 
 		 224 aa  90.1  7e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0172386  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1750  acetamidase/formamidase  28.88 
 
 		 314 aa  89  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.122228 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2779  Acetamidase/Formamidase  28.76 
 
 		 363 aa  88.2  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.190953  hitchhiker  0.0000139746 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0412  Acetamidase/Formamidase  26.06 
 
 		 301 aa  86.7  8e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2188  acetamidase/formamidase  25.75 
 
 		 379 aa  82.8  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.318866  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1690  Acetamidase/Formamidase  25.75 
 
 		 438 aa  80.9  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.177288  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1761  Acetamidase/Formamidase  25.75 
 
 		 438 aa  80.9  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0982  acetamidase/formamidase  30.67 
 
 		 359 aa  80.9  0.00000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.555434 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2755  acetamidase/formamidase family protein  29.13 
 
 		 304 aa  79.7  0.00000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000518769 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1104  acetamidase/formamidase  25 
 
 		 299 aa  79.3  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.411366  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3711  acetamidase/formamidase  29.51 
 
 		 315 aa  79.3  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2616  acetamidase/formamidase family protein  27.84 
 
 		 304 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00237605  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17320  predicted acetamidase/formamidase  29.19 
 
 		 412 aa  77  0.0000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00772804  normal  0.101325 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2569  acetamidase/formamidase family protein  28.46 
 
 		 304 aa  76.3  0.0000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0602  transcriptional regulator  28.05 
 
 		 791 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.459823 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3600  hypothetical protein  29.82 
 
 		 485 aa  76.3  0.0000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.229476  normal  0.563302 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0486  Acetamidase/Formamidase  26.76 
 
 		 347 aa  75.9  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.123442 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5149  acetamidase/formamidase  28.97 
 
 		 343 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.606988  normal  0.788992 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2654  acetamidase/formamidase family protein  27.11 
 
 		 304 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00018513  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0497  acetamidase/formamidase  31.92 
 
 		 481 aa  76.3  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.22285  normal  0.380834 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4612  acetamidase/formamidase  26.58 
 
 		 324 aa  75.1  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.153809  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6506  hypothetical protein  27.33 
 
 		 413 aa  74.3  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4153  Acetamidase/Formamidase  27.72 
 
 		 305 aa  74.7  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1548  amidase  23.9 
 
 		 439 aa  73.9  0.000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0188778 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2418  acetamidase/formamidase family protein  27.07 
 
 		 304 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.397586  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2342  acetamidase  27.07 
 
 		 304 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.640951  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2596  acetamidase/formamidase family protein  27.07 
 
 		 304 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.669172  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1574  acetamidase/formamidase  25.86 
 
 		 498 aa  73.6  0.000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.569924  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0636  Acetamidase/Formamidase  23.97 
 
 		 305 aa  72.4  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4293  acetamidase/formamidase  27.94 
 
 		 332 aa  72.8  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0097508 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1964  Acetamidase/Formamidase  30.25 
 
 		 337 aa  72.4  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0147995  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4613  putative acetamidase/formamidase family protein  32.24 
 
 		 313 aa  72.4  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270897  normal  0.158803 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2780  acetamidase/formamidase  30.32 
 
 		 484 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1631  acetamidase/formamidase  28.17 
 
 		 320 aa  72.4  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0518528  normal  0.012309 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2541  acetamidase/formamidase  27.09 
 
 		 304 aa  72  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.158223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2377  acetamidase  26.2 
 
 		 303 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.91327  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2104  twin-arginine translocation pathway signal  31.19 
 
 		 483 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>