260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3131 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3131  class II aldolase/adducin family protein  100 
 
 		 255 aa  535  1e-151  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.22582  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0069  class II aldolase/adducin-like  79.28 
 
 		 256 aa  420  1e-117  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.872153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0382  aldolase II superfamily protein  74.38 
 
 		 250 aa  389  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.583518  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1098  aldolase II superfamily protein  73.14 
 
 		 331 aa  383  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.674816  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2856  aldolase II superfamily protein  73.55 
 
 		 250 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.180826  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2703  aldolase II superfamily protein  73.55 
 
 		 322 aa  383  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1406  aldolase II superfamily protein  64.57 
 
 		 256 aa  353  2e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0901  aldolase II superfamily protein  65.06 
 
 		 260 aa  346  2e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.693732 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3366  class II aldolase/adducin-like  61.04 
 
 		 250 aa  337  9.999999999999999e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19700  aldolase II superfamily protein  62.06 
 
 		 259 aa  336  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4305  aldolase II superfamily protein  59.7 
 
 		 264 aa  330  1e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1696  aldolase II superfamily protein  61.26 
 
 		 259 aa  330  1e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0893  aldolase II superfamily protein  60.16 
 
 		 256 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1319  aldolase II superfamily protein  60.56 
 
 		 255 aa  326  3e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.764419 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0859  aldolase II superfamily protein  60.96 
 
 		 255 aa  325  3e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1340  aldolase II superfamily protein  60.96 
 
 		 255 aa  325  3e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4472  aldolase II superfamily protein  60.32 
 
 		 255 aa  322  2e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0173222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3281  aldolase II superfamily protein  62.55 
 
 		 261 aa  323  2e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2609  class II aldolase/adducin family protein  54.51 
 
 		 257 aa  322  3e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.79052  decreased coverage  0.00794454 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1964  aldolase II superfamily protein  58.8 
 
 		 252 aa  316  3e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.467535 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01199  class II aldolase/adducin-like protein  57.92 
 
 		 251 aa  306  3e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2707  class II aldolase/adducin family protein  57.09 
 
 		 258 aa  296  2e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2055  aldolase II superfamily protein  55.34 
 
 		 260 aa  296  2e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3521  aldolase II superfamily protein  54.55 
 
 		 259 aa  288  7e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.568287  normal  0.727743 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1938  aldolase II superfamily protein  54.22 
 
 		 259 aa  286  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0215875  normal  0.268304 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3038  aldolase II superfamily protein  52.24 
 
 		 259 aa  279  3e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.774237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3083  aldolase II superfamily protein  52.36 
 
 		 258 aa  275  6e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0977304  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1172  class II aldolase/adducin domain-containing protein  53.2 
 
 		 256 aa  275  7e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0834795  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01738  class II aldolase/adducin-like protein  51.24 
 
 		 255 aa  264  1e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4074  aldolase II superfamily protein  51.85 
 
 		 258 aa  264  1e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.639944 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2871  aldolase II superfamily protein  62.24 
 
 		 251 aa  263  2e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4013  aldolase II superfamily protein  51.44 
 
 		 258 aa  263  2e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.60091 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1685  class II aldolase/adducin-like  49.61 
 
 		 255 aa  263  2e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2818  aldolase II superfamily protein  62.24 
 
 		 251 aa  262  4e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4533  aldolase II superfamily protein  51.44 
 
 		 258 aa  262  4e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.159765 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3368  aldolase II superfamily protein  51.64 
 
 		 259 aa  258  8e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000643093  hitchhiker  0.0000000000000156191 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0857  aldolase II superfamily protein  49.59 
 
 		 257 aa  253  3e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1837  class II aldolase/adducin family protein  46.59 
 
 		 255 aa  252  4.0000000000000004e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.036347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4200  class II aldolase/adducin family protein  46.03 
 
 		 264 aa  245  4.9999999999999997e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.183465 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1506  class II aldolase/adducin family protein  50.41 
 
 		 252 aa  244  9e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.443125  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1139  aldolase II superfamily protein  51.24 
 
 		 258 aa  241  7e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.8489  normal  0.168164 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2536  aldolase II superfamily protein  52.19 
 
 		 264 aa  241  7e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0456669  hitchhiker  0.00862817 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3039  aldolase II superfamily protein  47.83 
 
 		 259 aa  241  1e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3687  aldolase II superfamily protein  52.07 
 
 		 257 aa  240  2e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4680  aldolase II superfamily protein  52.07 
 
 		 257 aa  240  2e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0426137 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0672  class II aldolase/adducin family protein  48.79 
 
 		 252 aa  238  1e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.999953 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3224  aldolase II superfamily protein  53.06 
 
 		 264 aa  236  3e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.217165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2698  aldolase II superfamily protein  48.56 
 
 		 246 aa  236  3e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31370  aldolase II superfamily protein  50.19 
 
 		 257 aa  236  4e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.331304  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5623  class II aldolase/adducin family protein  48.18 
 
 		 262 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.136767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0503  class II aldolase/adducin family protein  45.27 
 
 		 266 aa  233  2.0000000000000002e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2291  aldolase II superfamily protein  51.34 
 
 		 271 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.318887  decreased coverage  0.0000307771 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2487  class II aldolase/adducin domain protein  50.79 
 
 		 271 aa  230  1e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0255579  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0822  aldolase II superfamily protein  50.61 
 
 		 261 aa  229  4e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0953493  normal  0.275996 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0427  class II aldolase/adducin-like  52.58 
 
 		 263 aa  228  8e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.358684  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5236  class II aldolase/adducin family protein  52.58 
 
 		 282 aa  227  1e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0806  aldolase II superfamily protein  48.58 
 
 		 261 aa  227  2e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.666611  normal  0.411116 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1652  class II aldolase/adducin-like  48.55 
 
 		 257 aa  226  2e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.48855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4212  class II aldolase/adducin-like protein  47.37 
 
 		 262 aa  227  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3891  aldolase II superfamily protein  48 
 
 		 261 aa  226  3e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3900  aldolase II superfamily protein  53.66 
 
 		 251 aa  226  4e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4440  class II aldolase/adducin family protein  47.18 
 
 		 262 aa  225  6e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.140435 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0752  aldolase II superfamily protein  50.61 
 
 		 261 aa  224  7e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.322405 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0807  aldolase II superfamily protein  48.36 
 
 		 257 aa  223  3e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3183  class II aldolase/adducin family protein  45.97 
 
 		 256 aa  219  3e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0280906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5620  aldolase II superfamily protein  50.83 
 
 		 257 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1719  class II aldolase/adducin family protein  45.87 
 
 		 267 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.174281 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1977  putative class II aldolase/adducin  46.03 
 
 		 261 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621706  normal  0.451747 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5383  aldolase II superfamily protein  42.91 
 
 		 263 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103736  normal  0.161678 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1223  aldolase II superfamily protein  42.11 
 
 		 263 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.199351 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5445  aldolase II superfamily protein  43.82 
 
 		 260 aa  211  7e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0975629  normal  0.0271848 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0235  aldolase II superfamily protein  40.86 
 
 		 265 aa  204  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4873  aldolase II superfamily protein  49.79 
 
 		 258 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00795086  normal  0.948884 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0548  aldolase II superfamily protein  41.08 
 
 		 257 aa  198  6e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1038  aldolase II superfamily protein  38.89 
 
 		 254 aa  198  7.999999999999999e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.552674  normal  0.877247 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0340  aldolase II superfamily protein  44.25 
 
 		 237 aa  197  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.945791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2800  aldolase II superfamily protein  40.91 
 
 		 257 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1817  class II aldolase/adducin family protein  40.08 
 
 		 253 aa  195  5.000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.865133  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3233  aldolase II superfamily protein  38.78 
 
 		 274 aa  194  1e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2667  aldolase II superfamily protein  40.25 
 
 		 257 aa  194  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2138  aldolase II superfamily protein  40.25 
 
 		 257 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2751  aldolase II superfamily protein  40.25 
 
 		 257 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2776  aldolase II superfamily protein  39.83 
 
 		 257 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6078  aldolase II superfamily protein  40.91 
 
 		 257 aa  192  4e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.91923 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21590  aldolase II superfamily protein  49.19 
 
 		 265 aa  192  5e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3557  aldolase II superfamily protein  38.4 
 
 		 274 aa  192  6e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0518  aldolase II superfamily protein  40.33 
 
 		 258 aa  191  1e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1795  aldolase II superfamily protein  38.21 
 
 		 277 aa  188  5.999999999999999e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.185946 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0803  aldolase II superfamily protein  39.08 
 
 		 258 aa  187  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3282  aldolase II superfamily protein  39.51 
 
 		 254 aa  187  2e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.271869  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0638  aldolase II superfamily protein  39.08 
 
 		 258 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0623  aldolase II superfamily protein  39.08 
 
 		 258 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5956  aldolase II superfamily protein  42.68 
 
 		 271 aa  186  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.931337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3086  aldolase II superfamily protein  39.09 
 
 		 256 aa  185  5e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0236483 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0024  aldolase II superfamily protein  38.66 
 
 		 258 aa  185  7e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.178448  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2213  aldolase II superfamily protein  38.66 
 
 		 258 aa  185  7e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2494  aldolase II superfamily protein  38.66 
 
 		 258 aa  185  7e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2870  aldolase II superfamily protein  38.66 
 
 		 258 aa  185  7e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0947  class II aldolase/adducin family protein  36.21 
 
 		 250 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3889  class II aldolase/adducin-like  42.02 
 
 		 250 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.279463  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>