263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3125 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3125  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 360 aa  723    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0961162  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1906  FAD dependent oxidoreductase  63.27 
 
 		 351 aa  448  1e-125  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.118317  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4982  FAD dependent oxidoreductase  62.01 
 
 		 368 aa  440  9.999999999999999e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2903  FAD dependent oxidoreductase  62.57 
 
 		 358 aa  436  1e-121  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0779713  normal  0.848921 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2933  FAD dependent oxidoreductase  59.67 
 
 		 383 aa  430  1e-119  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.677522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1783  FAD dependent oxidoreductase  60.06 
 
 		 367 aa  418  1e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1983  FAD dependent oxidoreductase  60.06 
 
 		 367 aa  419  1e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.460512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3031  FAD dependent oxidoreductase  61.56 
 
 		 369 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.33562 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4048  FAD dependent oxidoreductase  52.97 
 
 		 407 aa  362  4e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0468618 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0533  putative transmembrane protein  39.24 
 
 		 343 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.515103  normal  0.24784 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0410  putative transmembrane protein  37.07 
 
 		 332 aa  166  6.9999999999999995e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0126834 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0425  putative transmembrane protein  36.49 
 
 		 355 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.133341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3950  FAD dependent oxidoreductase  37.21 
 
 		 330 aa  160  4e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1229  putative deoxyribodipyrimidine photolyase  35.65 
 
 		 324 aa  159  5e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0596771  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2285  FAD dependent oxidoreductase  33.83 
 
 		 314 aa  156  5.0000000000000005e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1481  FAD dependent oxidoreductase  35.17 
 
 		 341 aa  154  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0886  putative transmembrane protein  35.48 
 
 		 329 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5843  FAD dependent oxidoreductase  33.72 
 
 		 354 aa  140  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01726  lipoprotein, putative  33.82 
 
 		 344 aa  140  4.999999999999999e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0965  amine oxidase, flavin-containing  34.51 
 
 		 328 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0288  DNA photolyase FAD-binding protein  31.52 
 
 		 843 aa  129  8.000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1126  amine oxidase, flavin-containing protein  32.74 
 
 		 328 aa  125  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0049  FAD dependent oxidoreductase  30.58 
 
 		 313 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0871855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1075  FAD dependent oxidoreductase  31.86 
 
 		 328 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.817137 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4732  FAD dependent oxidoreductase  31.41 
 
 		 328 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.104678  normal  0.528339 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61600  hypothetical protein  31.99 
 
 		 327 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0728796 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5306  hypothetical protein  32.17 
 
 		 327 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4301  FAD dependent oxidoreductase  31.62 
 
 		 339 aa  114  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4447  hypothetical protein  31.53 
 
 		 328 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0783  FAD dependent oxidoreductase  31 
 
 		 328 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.918451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1655  FAD dependent oxidoreductase  27.3 
 
 		 333 aa  110  3e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0742  hypothetical protein  30.7 
 
 		 328 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.64643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0770  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like protein  30.7 
 
 		 328 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.780127  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41390  FAD dependent oxidoreductase  30.14 
 
 		 329 aa  104  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.196664  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4064  FAD dependent oxidoreductase  27.37 
 
 		 361 aa  89.7  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.521902 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0999  hypothetical protein  30.61 
 
 		 320 aa  89.4  9e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.277798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3599  FAD dependent oxidoreductase  26.07 
 
 		 346 aa  89  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4574  HI0933-like protein  26.55 
 
 		 359 aa  85.9  9e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0625  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like protein  24.93 
 
 		 413 aa  80.1  0.00000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484917 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1154  hypothetical protein  26.2 
 
 		 337 aa  77.4  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.177743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0204  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like  22.52 
 
 		 389 aa  77  0.0000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.508635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1151  FAD dependent oxidoreductase  27.09 
 
 		 338 aa  75.9  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.493674  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0160  hypothetical protein  28.32 
 
 		 319 aa  70.1  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.443199  normal  0.129694 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1925  hypothetical protein  28.79 
 
 		 347 aa  68.2  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.315657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1735  hypothetical protein  28.65 
 
 		 313 aa  64.7  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1750  hypothetical protein  42.74 
 
 		 313 aa  62.4  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4120  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like  29.26 
 
 		 348 aa  62  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0254972  normal  0.970052 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4691  FAD dependent oxidoreductase  24.92 
 
 		 323 aa  62  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0114981 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4204  FAD dependent oxidoreductase  30.47 
 
 		 346 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.429398 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48060  predicted protein  26.39 
 
 		 523 aa  58.9  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.387117  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2190  FAD dependent oxidoreductase  26.79 
 
 		 344 aa  58.9  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4414  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like  28.57 
 
 		 381 aa  58.2  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0288059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2785  FAD dependent oxidoreductase  28.31 
 
 		 335 aa  57.8  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.81235  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0507  FAD dependent oxidoreductase  38.96 
 
 		 342 aa  57  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.770202  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0540  FAD dependent oxidoreductase  38.96 
 
 		 342 aa  56.6  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0536  FAD dependent oxidoreductase  38.96 
 
 		 342 aa  56.6  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.84854  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1706  phytoene desaturase  52.73 
 
 		 519 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0132  hypothetical protein  26.67 
 
 		 349 aa  54.7  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.751971  normal  0.181819 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0435  FAD dependent oxidoreductase  28.79 
 
 		 347 aa  54.3  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.164811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1276  putative NAD/FAD-dependent oxidoreductase  25.07 
 
 		 340 aa  54.7  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.965881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3075  putative phytoene desaturase  44.78 
 
 		 506 aa  53.9  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.873802  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1387  amine oxidase  47.37 
 
 		 503 aa  54.3  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.600466  hitchhiker  0.00651843 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0825  hypothetical protein  42.5 
 
 		 316 aa  53.1  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5128  zeta-phytoene desaturase  44.07 
 
 		 506 aa  53.1  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.146602 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0027  FAD dependent oxidoreductase  31.02 
 
 		 344 aa  53.5  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3228  Zeta-phytoene desaturase  49.32 
 
 		 519 aa  52.8  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.285222  normal  0.0185992 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2493  protoporphyrinogen oxidase  41.57 
 
 		 476 aa  52  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000052803 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3573  phytoene desaturase  48.15 
 
 		 509 aa  51.2  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26410  UDP-galactopyranose mutase  44.07 
 
 		 507 aa  51.6  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.739873 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1847  phytoene dehydrogenase-related protein  43.75 
 
 		 503 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5454  phytoene dehydrogenase-related protein  46.43 
 
 		 512 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3760  FAD dependent oxidoreductase  49.09 
 
 		 524 aa  50.8  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00569391 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5075  amine oxidase  46.43 
 
 		 512 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1150  amine oxidase  44.9 
 
 		 491 aa  50.8  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5163  phytoene dehydrogenase-related protein  46.43 
 
 		 512 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.134146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1209  heterodisulfide reductase, A subunit  34.52 
 
 		 660 aa  50.8  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0946  UDP-galactopyranose mutase  37.97 
 
 		 495 aa  50.8  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4005  FAD dependent oxidoreductase  43.08 
 
 		 516 aa  50.8  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.665607  hitchhiker  0.00234507 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1289  FAD dependent oxidoreductase  47.27 
 
 		 516 aa  50.1  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.571457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1046  phytoene dehydrogenase  34.69 
 
 		 494 aa  49.7  0.00008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.586405  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1785  amine oxidase flavin-containing  41.07 
 
 		 478 aa  49.3  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.162076  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1924  amine oxidase, flavin-containing  41.07 
 
 		 478 aa  49.3  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00199174  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0879  2,4-dienoyl-CoA reductase  40.86 
 
 		 670 aa  49.3  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.667587  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1893  protoporphyrinogen oxidase  46.67 
 
 		 421 aa  49.3  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1176  amine oxidase  42.55 
 
 		 577 aa  48.5  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1453  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  37.31 
 
 		 1067 aa  48.5  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.551419 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3693  phytoene desaturase  47.27 
 
 		 499 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00357896 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0396  heterodisulfide reductase subunit  41.51 
 
 		 194 aa  48.1  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.97777  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0484  phytoene desaturase  41.79 
 
 		 493 aa  47.8  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1399  phytoene desaturase  47.46 
 
 		 502 aa  48.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1596  putative oxidoreductase  46.67 
 
 		 445 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3513  methoxyneurosporene dehydrogenase  39.71 
 
 		 532 aa  47.8  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.705776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4081  amine oxidase  48.08 
 
 		 571 aa  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.39239 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6235  putative oxidoreductase  46.67 
 
 		 445 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0391718  normal  0.166247 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1535  putative oxidoreductase  44.26 
 
 		 449 aa  47.8  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1072  hypothetical protein  42.86 
 
 		 421 aa  47.4  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00830956 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1426  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like protein  24.35 
 
 		 362 aa  48.1  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1383  hypothetical protein  38.36 
 
 		 436 aa  47.4  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.152417  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3809  phytoene desaturase  48.15 
 
 		 492 aa  47.4  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4019  putative oxidoreductase  55.81 
 
 		 448 aa  47.4  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>