40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3037 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3037  hypothetical protein  100 
 
 		 393 aa  773    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.245994  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1795  hypothetical protein  70.44 
 
 		 391 aa  483  1e-135  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175604 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4978  hypothetical protein  47.94 
 
 		 406 aa  291  1e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.638405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0722  hypothetical protein  46.04 
 
 		 402 aa  282  7.000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.126756 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2846  hypothetical protein  42.74 
 
 		 394 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.194777  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2612  hypothetical protein  40.78 
 
 		 416 aa  252  8.000000000000001e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0743279  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3093  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  38.05 
 
 		 397 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239597  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1278  hypothetical protein  41.56 
 
 		 367 aa  210  3e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1948  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  37.36 
 
 		 391 aa  207  2e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.105929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1846  hypothetical protein  38.49 
 
 		 429 aa  204  3e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2181  hypothetical protein  38.24 
 
 		 422 aa  203  4e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.376116 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0028  hypothetical protein  36.9 
 
 		 420 aa  203  5e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1797  putative exported protein of unknown function  38.31 
 
 		 427 aa  202  9e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.227031  normal  0.544981 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1891  hypothetical protein  38.55 
 
 		 408 aa  201  9.999999999999999e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.999876  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2258  hypothetical protein  38 
 
 		 400 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5945  hypothetical protein  39.03 
 
 		 400 aa  199  7e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1858  hypothetical protein  39.69 
 
 		 405 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5013  hypothetical protein  41.34 
 
 		 423 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.333808  normal  0.0166676 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3133  hypothetical protein  36.01 
 
 		 392 aa  196  7e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.637765 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3621  hypothetical protein  44.66 
 
 		 402 aa  194  3e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0789115 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5317  hypothetical protein  38.36 
 
 		 424 aa  194  3e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0865725  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1336  hypothetical protein  38.94 
 
 		 408 aa  191  1e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.616275 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4870  hypothetical protein  38.66 
 
 		 408 aa  191  2e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.128964 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2664  hypothetical protein  40.21 
 
 		 386 aa  189  7e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.164078  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1537  hypothetical protein  38.66 
 
 		 408 aa  188  1e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.505562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3938  hypothetical protein  32.74 
 
 		 429 aa  188  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.350729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3146  hypothetical protein  37.5 
 
 		 412 aa  186  5e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2412  hypothetical protein  40.91 
 
 		 411 aa  186  6e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0007  hypothetical protein  33.82 
 
 		 410 aa  182  6e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2721  hypothetical protein  38.49 
 
 		 423 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.157004 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1941  hypothetical protein  36.75 
 
 		 393 aa  169  8e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.86402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0483  hypothetical protein  36.05 
 
 		 395 aa  162  9e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.715666 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1240  hypothetical protein  37.09 
 
 		 394 aa  161  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.314539  normal  0.831655 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2582  hypothetical protein  35.2 
 
 		 369 aa  160  4e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0026  hypothetical protein  34.16 
 
 		 395 aa  158  2e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2901  extracellular ligand-binding receptor  24.44 
 
 		 419 aa  53.1  0.000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0430  extracellular ligand-binding receptor  24.62 
 
 		 445 aa  50.4  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.249043 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4645  extracellular ligand-binding receptor  24.78 
 
 		 415 aa  45.1  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.142564 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4699  extracellular ligand-binding receptor  23.49 
 
 		 432 aa  43.5  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.525381 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3698  Extracellular ligand-binding receptor  24.48 
 
 		 415 aa  43.1  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>