More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3022 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2793  fructose-bisphosphate aldolase  89.94 
 
 
345 aa  637  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.918989  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3022  fructose-bisphosphate aldolase, class II, Calvin cycle subtype  100 
 
 
338 aa  694  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625607  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0384  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  79.23 
 
 
354 aa  568  1e-161  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2386  fructose-bisphosphate aldolase, class II, Calvin cycle subtype  75.67 
 
 
354 aa  553  1e-156  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.109398 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1518  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  76.04 
 
 
345 aa  545  1e-154  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  9.80725e-05  decreased coverage  7.6105e-05 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3624  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  77.81 
 
 
345 aa  543  1e-153  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.113592  normal  0.210537 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2889  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  73.96 
 
 
354 aa  543  1e-153  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2804  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  73.67 
 
 
354 aa  538  1e-152  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4960  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  75.15 
 
 
354 aa  538  1e-152  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4833  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  75.15 
 
 
354 aa  538  1e-152  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0506  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  75.15 
 
 
354 aa  538  1e-152  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5009  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  74.56 
 
 
354 aa  534  1e-151  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.694536 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5262  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  74.85 
 
 
354 aa  536  1e-151  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4787  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  75.07 
 
 
354 aa  534  1e-151  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.111053 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0390  fructose-bisphosphate aldolase, class II  75.37 
 
 
354 aa  535  1e-151  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0370  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  75.74 
 
 
354 aa  534  1e-151  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3248  fructose-bisphosphate aldolase, class II  74.78 
 
 
356 aa  534  1e-151  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3037  fructose-bisphosphate aldolase, class II  75.15 
 
 
354 aa  535  1e-151  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2849  fructose-bisphosphate aldolase, class II, Calvin cycle subtype  74.78 
 
 
356 aa  534  1e-151  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0980884  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1489  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  73.59 
 
 
354 aa  533  1e-150  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.156888  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1988  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  78.08 
 
 
338 aa  533  1e-150  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0362683  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1912  fructose-bisphosphate aldolase, class II  74.48 
 
 
354 aa  529  1e-149  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.326014  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0462  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  72.78 
 
 
354 aa  527  1e-149  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07230  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  73.37 
 
 
354 aa  529  1e-149  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0658  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  73.67 
 
 
354 aa  530  1e-149  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.76632  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3876  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  72.4 
 
 
354 aa  526  1e-148  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05600  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  73.96 
 
 
354 aa  527  1e-148  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.933141  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2844  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  73.29 
 
 
354 aa  527  1e-148  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2447  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  77.45 
 
 
345 aa  527  1e-148  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.88579 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0791  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  72.49 
 
 
354 aa  522  1e-147  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.475428  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3751  fructose-bisphosphate aldolase, class II  76.26 
 
 
345 aa  522  1e-147  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0163  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  72.37 
 
 
355 aa  521  1e-147  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0408428 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3350  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  72.78 
 
 
355 aa  520  1e-146  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000198413  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2243  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  72.86 
 
 
349 aa  517  1e-146  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0152373 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0933  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  72.78 
 
 
355 aa  520  1e-146  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0875  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  72.78 
 
 
355 aa  520  1e-146  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0776  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  72.78 
 
 
355 aa  520  1e-146  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0266968  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0672  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  72.49 
 
 
354 aa  519  1e-146  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181894  normal  0.967694 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0557  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  72.7 
 
 
354 aa  518  1e-146  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.368512  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3247  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  72.78 
 
 
355 aa  520  1e-146  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0347517  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1530  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  72.78 
 
 
354 aa  517  1e-145  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0405  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  71.81 
 
 
354 aa  516  1e-145  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.841441  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0755  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  72.19 
 
 
354 aa  516  1e-145  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.119495  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2756  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  72.19 
 
 
355 aa  517  1e-145  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5957  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  72.11 
 
 
354 aa  515  1e-145  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.67865  normal  0.160231 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0650  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  71.6 
 
 
354 aa  514  1e-145  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0196207  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0503  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  73 
 
 
354 aa  516  1e-145  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.262664  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2546  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  71.81 
 
 
354 aa  512  1e-144  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1815  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  72.19 
 
 
354 aa  513  1e-144  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.267172  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2655  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  71.81 
 
 
354 aa  513  1e-144  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3041  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  71.89 
 
 
354 aa  511  1e-144  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0163377  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3047  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  71.89 
 
 
354 aa  511  1e-144  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.589963  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0877  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  71.01 
 
 
354 aa  512  1e-144  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  2.90228e-06  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2626  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  71.81 
 
 
354 aa  513  1e-144  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0937863  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2673  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  71.81 
 
 
354 aa  512  1e-144  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000776519  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1086  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  71.6 
 
 
355 aa  511  1e-144  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  8.14215e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2015  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  71.81 
 
 
354 aa  513  1e-144  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1039  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  70.71 
 
 
354 aa  508  1e-143  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3275  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  71.22 
 
 
354 aa  510  1e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.604828  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0841  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  71.3 
 
 
354 aa  511  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0830  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  71.89 
 
 
355 aa  510  1e-143  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.254898  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0836  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  71.3 
 
 
354 aa  511  1e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2428  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  71.3 
 
 
354 aa  511  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0594  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  71.3 
 
 
354 aa  511  1e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0691  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  71.51 
 
 
354 aa  509  1e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.858155  normal  0.247033 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4630  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  70.03 
 
 
354 aa  508  1e-143  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0997  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  71.3 
 
 
354 aa  511  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1974  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  70.12 
 
 
363 aa  509  1e-143  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0299  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  71.3 
 
 
354 aa  511  1e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0267498  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0879  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  71.01 
 
 
354 aa  510  1e-143  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0229  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  70.12 
 
 
363 aa  509  1e-143  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.58536  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3656  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  71.89 
 
 
355 aa  510  1e-143  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3537  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  71.89 
 
 
355 aa  510  1e-143  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0040  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  71.3 
 
 
354 aa  511  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3462  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  71.89 
 
 
355 aa  510  1e-143  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0665  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  71.3 
 
 
354 aa  511  1e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0461  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  70.92 
 
 
354 aa  506  1e-142  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.671902  normal  0.237356 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0708  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  70.41 
 
 
345 aa  507  1e-142  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0417855  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3596  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  72.11 
 
 
354 aa  506  1e-142  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  8.79946e-05 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0480  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  70.33 
 
 
354 aa  506  1e-142  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.669489  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0493  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  70.33 
 
 
354 aa  506  1e-142  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.85021  normal  0.786226 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4316  fructose-bisphosphate aldolase, class II  68.64 
 
 
355 aa  505  1e-142  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0683  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  70.41 
 
 
345 aa  507  1e-142  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.262233  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0573  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  70.62 
 
 
354 aa  503  1e-141  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2029  fructose-bisphosphate aldolase, class II, Calvin cycle subtype  69.73 
 
 
359 aa  501  1e-141  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.394674  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4099  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  69.14 
 
 
359 aa  498  1e-140  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.109682  normal  0.324334 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0166  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  69.14 
 
 
359 aa  496  1e-139  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0304491 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0935  fructose-bisphosphate aldolase, class II  68.05 
 
 
370 aa  497  1e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3218  fructose-bisphosphate aldolase  71.17 
 
 
354 aa  497  1e-139  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.338247  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0967  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  69.44 
 
 
359 aa  493  1e-138  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4576  fructose-bisphosphate aldolase  68.05 
 
 
354 aa  492  1e-138  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0797  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  70.87 
 
 
357 aa  493  1e-138  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.162751  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0994  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  69.44 
 
 
359 aa  493  1e-138  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.135805  normal  0.788402 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1443  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  68.84 
 
 
357 aa  491  1e-138  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.66755  normal  0.139145 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5097  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  67.46 
 
 
354 aa  489  1e-137  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2492  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  68.34 
 
 
359 aa  490  1e-137  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.180719 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08421  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  69.37 
 
 
357 aa  489  1e-137  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.201369  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08441  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  69.67 
 
 
357 aa  490  1e-137  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08011  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  69.67 
 
 
357 aa  489  1e-137  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0594842  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0789  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  69.37 
 
 
357 aa  489  1e-137  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>