161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2971 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2971  TOBE domain protein  100 
 
 		 71 aa  135  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.123269  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3040  TOBE domain-containing protein  94.37 
 
 		 71 aa  128  3e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.465009  normal  0.0659327 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4635  TOBE domain-containing protein  91.55 
 
 		 71 aa  124  3e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.560309  hitchhiker  0.0000128283 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1466  molybdenum-pterin binding  87.32 
 
 		 71 aa  121  4e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0340252  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1487  TOBE domain-containing protein  87.32 
 
 		 71 aa  121  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1667  TOBE domain-containing protein  87.32 
 
 		 71 aa  121  4e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000784196  normal  0.211047 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1085  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  87.32 
 
 		 71 aa  120  5e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.252098  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1565  molybdenum-pterin binding  87.32 
 
 		 71 aa  120  5e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.239605  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1541  TOBE domain-containing protein  87.32 
 
 		 71 aa  120  5e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00697531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1774  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  87.32 
 
 		 71 aa  120  8e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.448602  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1342  putative molybdopterin-binding protein  84.51 
 
 		 71 aa  119  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.128998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4707  molybdenum-pterin binding protein  87.32 
 
 		 71 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.322393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2490  molybdenum-pterin binding protein  87.32 
 
 		 71 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1646  TOBE domain-containing protein  84.51 
 
 		 71 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.285785  normal  0.27143 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2415  TOBE domain-containing protein  85.71 
 
 		 74 aa  119  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1839  molybdenum-pterin binding protein  84.51 
 
 		 102 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1236  molybdenum-pterin binding protein, putative  84.51 
 
 		 71 aa  118  3e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1993  molybdenum-pterin binding protein  84.51 
 
 		 71 aa  118  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.197061  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1722  putative molybdenum-pterin binding protein  84.51 
 
 		 71 aa  118  3e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.431486  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0379  putative molybdenum-pterin binding protein  84.51 
 
 		 71 aa  118  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0391614  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1824  molybdenum-pterin binding protein  84.51 
 
 		 71 aa  118  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0782  putative molybdenum-pterin binding protein  84.51 
 
 		 71 aa  118  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.196459  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2498  molybdenum-pterin binding protein, putative  83.1 
 
 		 71 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1218  TOBE domain protein  81.69 
 
 		 71 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.648939  normal  0.187717 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1281  TOBE domain protein  81.69 
 
 		 71 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.238328  normal  0.240101 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1747  TOBE domain protein  81.69 
 
 		 71 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5410  molybdenum-pterin binding protein  76.06 
 
 		 71 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.209434  hitchhiker  0.00653645 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5313  molybdenum-pterin binding domain protein  74.65 
 
 		 71 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4873  molybdenum-pterin binding protein  74.65 
 
 		 71 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19590  putative molybdopterin-binding protein  76.06 
 
 		 71 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1686  putative molybdopterin-binding protein  76.06 
 
 		 71 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4971  TOBE domain-containing protein  76.06 
 
 		 71 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0185371 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0265  TOBE domain-containing protein  76.06 
 
 		 71 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0241  TOBE domain protein  76.06 
 
 		 71 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.252493  normal  0.0167291 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0256  TOBE domain-containing protein  76.06 
 
 		 71 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0359931  normal  0.02055 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4319  TOBE domain-containing protein  76.06 
 
 		 90 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.128218 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1973  molybdenum-pterin binding protein  78.87 
 
 		 71 aa  106  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0618  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  70.42 
 
 		 71 aa  105  3e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000430997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0119  molybdenum-pterin binding protein II  77.78 
 
 		 72 aa  103  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.148673  hitchhiker  0.000165 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1261  TOBE domain protein  64.06 
 
 		 68 aa  79.7  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.880864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1545  molybdenum-pterin binding protein  64.06 
 
 		 68 aa  79.7  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.206583  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0977  TOBE domain-containing protein  51.52 
 
 		 68 aa  58.2  0.00000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0246  TOBE domain protein  43.08 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1501  TOBE domain-containing protein  53.03 
 
 		 68 aa  56.2  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2403  TOBE domain protein  51.56 
 
 		 69 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1651  TOBE domain-containing protein  48.48 
 
 		 66 aa  55.5  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.8226  normal  0.692606 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3442  TOBE domain protein  50.77 
 
 		 67 aa  55.5  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.650149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0263  TOBE domain-containing protein  50 
 
 		 66 aa  55.8  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1265  putative molybdenum transport protein ModA  40.91 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3265  TOBE domain protein  44.62 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.36964  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0242  TOBE domain protein  40 
 
 		 142 aa  53.1  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2845  TOBE domain protein  47.69 
 
 		 69 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.86249 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3905  TOBE domain-containing protein  45.45 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0935603 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2622  TOBE domain-containing protein  47.69 
 
 		 69 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.142109 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2003  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  49.23 
 
 		 69 aa  52.4  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.372116 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1576  TOBE domain protein  41.54 
 
 		 69 aa  52.4  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0940  transcriptional regulator, ModE family  51.61 
 
 		 263 aa  52.8  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000762676  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3872  molybdenum-pterin binding protein  40 
 
 		 67 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.262463  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4168  TOBE domain-containing protein  40 
 
 		 67 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.000227017  normal  0.0498154 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0168  TOBE domain protein  39.34 
 
 		 67 aa  52.4  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0057717 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0274  TOBE domain protein  46.15 
 
 		 69 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0234749 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2652  TOBE domain protein  44.62 
 
 		 69 aa  52  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.57185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0612  TOBE domain protein  43.94 
 
 		 74 aa  52  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0412  TOBE domain protein  43.08 
 
 		 69 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.288913  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1559  molybdenum-pterin binding protein  44.62 
 
 		 69 aa  50.8  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0856932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1529  ModE family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 269 aa  50.8  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3338  TOBE domain-containing protein  41.54 
 
 		 69 aa  50.8  0.000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.457795 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3365  TOBE domain-containing protein  44.62 
 
 		 69 aa  50.8  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1711  hypothetical protein  34.92 
 
 		 142 aa  50.4  0.000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.536702 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1546  TOBE domain-containing protein  41.54 
 
 		 69 aa  50.4  0.000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0121614  hitchhiker  0.000827182 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0416  TOBE domain-containing protein  40 
 
 		 69 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0354242 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0872  TOBE domain protein  39.06 
 
 		 68 aa  50.1  0.000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5200  TOBE domain protein  40 
 
 		 69 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2011  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  40 
 
 		 69 aa  50.1  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.673987  normal  0.933043 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4993  TOBE domain protein  41.18 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.988497 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3381  TOBE domain protein  38.46 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0288596  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0810  regulatory protein LysR  43.28 
 
 		 260 aa  49.7  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3712  TOBE domain protein  38.46 
 
 		 69 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1903  TOBE domain-containing protein  41.54 
 
 		 69 aa  48.9  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4442  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  42.42 
 
 		 68 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.973007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0277  TOBE domain protein  43.08 
 
 		 156 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0114044 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2052  TOBE domain protein  40 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2490  molybdenum-pterin binding  44.62 
 
 		 70 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.17041  normal  0.0308789 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2558  molybdenum-pterin binding protein  44.62 
 
 		 70 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0127714  normal  0.0579886 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2857  molybdenum-pterin binding protein  40 
 
 		 155 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.951599 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3108  TOBE domain-containing protein  40 
 
 		 69 aa  48.1  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0224442  hitchhiker  0.00000231206 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1641  TOBE domain-containing protein  46.15 
 
 		 69 aa  48.1  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000021781 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0855  molybdenum-pterin binding protein  38.46 
 
 		 69 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2745  TOBE domain protein  43.08 
 
 		 70 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0239742  normal  0.422578 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1609  TOBE domain-containing protein  43.08 
 
 		 70 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.532613  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5868  molybdenum-pterin binding protein (Mop)  42.42 
 
 		 68 aa  47.8  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.342359 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1598  TOBE domain-containing protein  43.08 
 
 		 70 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00386409  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1632  TOBE domain-containing protein  43.08 
 
 		 70 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3768  TOBE domain protein  41.54 
 
 		 69 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5517  TOBE domain protein  38.46 
 
 		 69 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.520442  normal  0.766178 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2239  ModE family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 278 aa  47.4  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.814022  normal  0.101345 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3942  molybdenum-pterin binding protein  40 
 
 		 69 aa  47  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0213707 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1928  ModE family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 274 aa  46.2  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.105567  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0436  TOBE domain-containing protein  40.32 
 
 		 141 aa  46.2  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1692  transcriptional regulator, ModE family  45.16 
 
 		 263 aa  46.6  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>