More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2967 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2967  2-dehydropantoate 2-reductase  100 
 
 		 311 aa  624  1e-178  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.53344  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2600  2-dehydropantoate 2-reductase  58.06 
 
 		 311 aa  355  6.999999999999999e-97  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.11896 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4726  2-dehydropantoate 2-reductase  58.47 
 
 		 315 aa  348  9e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.14221 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2669  2-dehydropantoate 2-reductase  56.49 
 
 		 310 aa  347  2e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0588922  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0016  2-dehydropantoate 2-reductase  54.07 
 
 		 307 aa  342  4e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5770  2-dehydropantoate 2-reductase  55.34 
 
 		 307 aa  341  8e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4203  2-dehydropantoate 2-reductase  58.47 
 
 		 315 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.379422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5461  2-dehydropantoate 2-reductase  56.65 
 
 		 315 aa  331  1e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.853784  normal  0.141843 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3545  2-dehydropantoate 2-reductase  56.65 
 
 		 315 aa  330  2e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16372  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4822  2-dehydropantoate 2-reductase  56.65 
 
 		 315 aa  330  2e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0882  2-dehydropantoate 2-reductase  56.33 
 
 		 315 aa  330  3e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.277426 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0186  2-dehydropantoate 2-reductase  55.7 
 
 		 306 aa  329  4e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0313  2-dehydropantoate 2-reductase  55.99 
 
 		 307 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.82281 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0729  2-dehydropantoate 2-reductase  54.28 
 
 		 306 aa  326  4.0000000000000003e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.691763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4498  2-dehydropantoate 2-reductase  53.85 
 
 		 312 aa  325  6e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.646734  normal  0.399113 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0163  2-dehydropantoate 2-reductase  55.7 
 
 		 306 aa  323  2e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3781  2-dehydropantoate 2-reductase  56.77 
 
 		 312 aa  323  2e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0449567 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0018  2-dehydropantoate 2-reductase  54.72 
 
 		 306 aa  323  2e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6687  2-dehydropantoate 2-reductase  56.31 
 
 		 312 aa  322  4e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3118  2-dehydropantoate 2-reductase  52.55 
 
 		 312 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.782034 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4423  2-dehydropantoate 2-reductase  51.92 
 
 		 311 aa  311  1e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.852681 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0021  2-dehydropantoate 2-reductase  52.77 
 
 		 306 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0191  2-dehydropantoate 2-reductase  55.05 
 
 		 305 aa  308  5e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0743  ketopantoate reductase ApbA/PanE  51.28 
 
 		 311 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.786977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0085  2-dehydropantoate 2-reductase  53.5 
 
 		 314 aa  305  8.000000000000001e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2936  2-dehydropantoate 2-reductase  51.27 
 
 		 312 aa  301  1e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.178942 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3162  2-dehydropantoate 2-reductase  51.27 
 
 		 312 aa  297  2e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.396021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6167  2-dehydropantoate 2-reductase  53.8 
 
 		 314 aa  296  4e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3518  2-dehydropantoate 2-reductase  54.95 
 
 		 305 aa  295  7e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2980  Ketopantoate reductase ApbA/PanE domain protein  44.69 
 
 		 323 aa  266  5e-70  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0174  2-dehydropantoate 2-reductase  49.52 
 
 		 313 aa  255  5e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.170216 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0059  2-dehydropantoate 2-reductase  48.59 
 
 		 321 aa  255  6e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1713  2-dehydropantoate 2-reductase  43.46 
 
 		 306 aa  253  2.0000000000000002e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0067  2-dehydropantoate 2-reductase  48.28 
 
 		 321 aa  251  2e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1405  2-dehydropantoate 2-reductase  45.13 
 
 		 307 aa  242  5e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0600  2-dehydropantoate 2-reductase  41.1 
 
 		 314 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000137771  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3883  2-dehydropantoate 2-reductase  46.82 
 
 		 312 aa  224  1e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.535579 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1918  2-dehydropantoate 2-reductase  40.07 
 
 		 314 aa  220  3e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000931177 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1991  2-dehydropantoate 2-reductase  40.07 
 
 		 314 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000310773  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1877  2-dehydropantoate 2-reductase  39.72 
 
 		 314 aa  219  5e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0355332  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1964  2-dehydropantoate 2-reductase  39.32 
 
 		 314 aa  219  6e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00305796  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3467  2-dehydropantoate 2-reductase  39.37 
 
 		 314 aa  218  1e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000905297  hitchhiker  8.32908e-18 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1696  2-dehydropantoate 2-reductase  38.64 
 
 		 314 aa  217  2e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.231571  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1746  2-dehydropantoate 2-reductase  40.42 
 
 		 314 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2408  2-dehydropantoate 2-reductase  41.1 
 
 		 306 aa  216  2.9999999999999998e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0790989 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1884  2-dehydropantoate 2-reductase  40.42 
 
 		 314 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1738  2-dehydropantoate 2-reductase  40.07 
 
 		 314 aa  216  5e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0314725  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4552  2-dehydropantoate 2-reductase  42.58 
 
 		 307 aa  214  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4116  2-dehydropantoate 2-reductase  41.56 
 
 		 308 aa  213  3.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.605632 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1913  ketopantoate reductase ApbA/PanE  39.52 
 
 		 304 aa  209  4e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02788  2-dehydropantoate 2-reductase  44.94 
 
 		 312 aa  206  4e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4737  ketopantoate reductase ApbA/PanE  42.95 
 
 		 310 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1107  2-dehydropantoate 2-reductase  42.63 
 
 		 319 aa  188  8e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06250  2-dehydropantoate 2-reductase  38.96 
 
 		 305 aa  172  6.999999999999999e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0294  2-dehydropantoate 2-reductase  34.43 
 
 		 307 aa  157  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.220777  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0535  2-dehydropantoate 2-reductase  31.34 
 
 		 307 aa  139  8.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000195412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5181  2-dehydropantoate 2-reductase  30.99 
 
 		 307 aa  138  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000000387537  normal  0.288245 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0328  2-dehydropantoate 2-reductase  32.55 
 
 		 315 aa  113  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0244641  normal  0.0158618 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0603  2-dehydropantoate 2-reductase  31.18 
 
 		 299 aa  112  9e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5042  2-dehydropantoate 2-reductase  30.5 
 
 		 301 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1736  2-dehydropantoate 2-reductase  27.93 
 
 		 309 aa  110  4.0000000000000004e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0419891 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0858  2-dehydropantoate 2-reductase  31.89 
 
 		 311 aa  108  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00149615  normal  0.0154258 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0713  2-dehydropantoate 2-reductase  26.5 
 
 		 306 aa  104  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2643  2-dehydropantoate 2-reductase  34.78 
 
 		 302 aa  103  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0600227  normal  0.533415 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0218  2-dehydropantoate 2-reductase  30.55 
 
 		 300 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2230  2-dehydropantoate 2-reductase  35 
 
 		 305 aa  100  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157651  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2981  2-dehydropantoate 2-reductase  28.43 
 
 		 319 aa  99.4  6e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.3758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4615  2-dehydropantoate 2-reductase  35.71 
 
 		 312 aa  98.6  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2683  2-dehydropantoate 2-reductase  31.85 
 
 		 302 aa  97.4  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2998  2-dehydropantoate 2-reductase, putative  34.29 
 
 		 315 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0207469 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1859  2-dehydropantoate 2-reductase  30.28 
 
 		 311 aa  98.2  2e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.540128  normal  0.594276 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0270  2-dehydropantoate 2-reductase  29.41 
 
 		 318 aa  97.4  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.267073 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5528  2-dehydropantoate 2-reductase  34.13 
 
 		 316 aa  96.3  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5892  2-dehydropantoate 2-reductase  34.13 
 
 		 316 aa  96.3  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700658  normal  0.998449 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1293  2-dehydropantoate 2-reductase  27.56 
 
 		 312 aa  95.9  7e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.519384  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2695  2-dehydropantoate 2-reductase  33.81 
 
 		 315 aa  95.9  7e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.120286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6243  2-dehydropantoate 2-reductase  29.76 
 
 		 316 aa  94.7  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6131  2-dehydropantoate 2-reductase  33.81 
 
 		 341 aa  94  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1477  ketopantoate reductase  27.14 
 
 		 337 aa  91.7  1e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1400  2-dehydropantoate 2-reductase  28.34 
 
 		 345 aa  91.7  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6528  2-dehydropantoate 2-reductase  28.83 
 
 		 316 aa  90.9  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2951  2-dehydropantoate 2-reductase  24.92 
 
 		 305 aa  90.1  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2776  2-dehydropantoate 2-reductase  24.92 
 
 		 305 aa  89.4  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2816  2-dehydropantoate 2-reductase  24.92 
 
 		 305 aa  89.4  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2839  2-dehydropantoate 2-reductase  24.92 
 
 		 305 aa  88.6  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.748115 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2735  2-dehydropantoate 2-reductase  24.92 
 
 		 305 aa  88.6  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4507  2-dehydropantoate 2-reductase  27.34 
 
 		 335 aa  88.2  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28047  normal  0.622175 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6020  2-dehydropantoate 2-reductase  31.43 
 
 		 316 aa  87.8  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.217101  normal  0.377898 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5508  2-dehydropantoate 2-reductase  31.73 
 
 		 323 aa  88.2  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723336  normal  0.36356 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2523  2-dehydropantoate 2-reductase  27.33 
 
 		 312 aa  87.4  3e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0258  ketopantoate reductase  25.32 
 
 		 331 aa  86.3  6e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.466283  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0557  ketopantoate reductase ApbA/PanE  28.27 
 
 		 334 aa  85.9  9e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.302954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0533  ketopantoate reductase ApbA/PanE  28.27 
 
 		 334 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1673  ketopantoate reductase ApbA/PanE  28.27 
 
 		 334 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.662338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1695  ketopantoate reductase ApbA/PanE-like protein  28.27 
 
 		 334 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2226  2-dehydropantoate 2-reductase  27.39 
 
 		 336 aa  84.7  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1723  ketopantoate reductase ApbA/PanE  28.27 
 
 		 334 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.711694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1739  ketopantoate reductase ApbA/PanE  28.27 
 
 		 334 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.753948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2486  2-dehydropantoate 2-reductase  26.77 
 
 		 319 aa  84.7  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.570621  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2416  2-dehydropantoate 2-reductase  26.2 
 
 		 335 aa  83.6  0.000000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.483923  normal  0.193956 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>