118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2898 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_1993  peptidase M48, Ste24p  56.03 
 
 		 615 aa  667    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142251 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2898  peptidase M48 Ste24p  100 
 
 		 621 aa  1271    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0804382  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2955  hypothetical protein  31.65 
 
 		 514 aa  86.3  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.121309  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4950  peptidase M48, Ste24p  28.53 
 
 		 723 aa  84  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35020  hypothetical protein  31.9 
 
 		 514 aa  82.8  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0826733  normal  0.973873 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2740  peptidase M48, Ste24p  28.53 
 
 		 510 aa  77.8  0.0000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35050  hypothetical protein  27.24 
 
 		 485 aa  77  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00854172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2958  hypothetical protein  26.83 
 
 		 485 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.188769  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0437  peptidase M48 Ste24p  28.62 
 
 		 503 aa  75.1  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1550  peptidase M48 Ste24p  29.02 
 
 		 705 aa  71.2  0.00000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.713683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1349  peptidase M48 Ste24p  29.02 
 
 		 705 aa  70.1  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.362461  normal  0.588641 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1278  peptidase M48 Ste24p  27.37 
 
 		 617 aa  65.9  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.589053  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0852  heat shock protein HtpX  29.96 
 
 		 287 aa  64.3  0.000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.356452  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3197  Zn-dependent protease with chaperone function-like  26.21 
 
 		 634 aa  63.9  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000540143 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3140  peptidase M48 Ste24p  30.58 
 
 		 623 aa  63.5  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0822769  hitchhiker  0.000295634 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1643  peptidase M48, Ste24p  28.15 
 
 		 337 aa  62.8  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.691275 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0490  Zn-dependent protease with chaperone function  24.32 
 
 		 615 aa  59.7  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3388  peptidase M48, Ste24p  26.67 
 
 		 645 aa  59.3  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.247321 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3384  peptidase M48 Ste24p  30.69 
 
 		 283 aa  58.5  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.414288 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7083  Zn-dependent protease with chaperone function-like protein  23.65 
 
 		 713 aa  58.2  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1032  peptidase M48, Ste24p  26.05 
 
 		 522 aa  58.2  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0108936 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0206  peptidase M48 Ste24p  24.77 
 
 		 293 aa  56.6  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0421  peptidase M48, Ste24p  24.5 
 
 		 279 aa  57  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000540856  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03400  Heat shock protein  27.46 
 
 		 287 aa  56.6  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.23608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0993  heat shock protein HtpX  25.83 
 
 		 296 aa  55.5  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.653344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2726  peptidase M48 Ste24p  26.22 
 
 		 623 aa  54.7  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0179908  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3806  peptidase M48, Ste24p  27.62 
 
 		 620 aa  54.3  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2252  heat shock protein HtpX  27.02 
 
 		 297 aa  54.3  0.000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00404  heat shock protein HtpX  26.69 
 
 		 292 aa  54.3  0.000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2574  heat shock protein HtpX  32.75 
 
 		 290 aa  54.7  0.000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5252  heat shock protein HtpX  25.83 
 
 		 292 aa  54.3  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1103  peptidase M48 Ste24p  24.92 
 
 		 292 aa  53.1  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.497475  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3563  peptidase M48 Ste24p  24.1 
 
 		 285 aa  53.1  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0930  heat shock protein HtpX  26.79 
 
 		 287 aa  52.8  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.173766  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4537  peptidase M48 Ste24p  29.89 
 
 		 274 aa  52.4  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.137704  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0511  heat shock protein HtpX  25 
 
 		 285 aa  52  0.00003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1239  heat shock protein HtpX  24.6 
 
 		 285 aa  51.6  0.00004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0907  heat shock protein HtpX  26.67 
 
 		 304 aa  51.6  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1928  peptidase M48, Ste24p  30.77 
 
 		 296 aa  51.6  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.987117  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2779  heat shock protein HtpX  31.43 
 
 		 289 aa  51.6  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0145109 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0373  peptidase M48 Ste24p  27.31 
 
 		 275 aa  51.6  0.00005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0941774  normal  0.226401 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1397  heat shock protein HtpX  26.34 
 
 		 285 aa  50.8  0.00007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.809815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2100  heat shock protein HtpX  27 
 
 		 289 aa  50.8  0.00007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4377  peptidase M48 Ste24p  26.25 
 
 		 284 aa  50.4  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0088  heat shock protein HtpX  30.43 
 
 		 289 aa  50.4  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.565985  normal  0.068582 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1269  peptidase M48, Ste24p  25.1 
 
 		 282 aa  50.1  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.293917 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1445  peptidase M48  30.43 
 
 		 289 aa  50.1  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4120  peptidase M48 Ste24p  30.43 
 
 		 296 aa  50.1  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365351 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0185  M48 family peptidase  28.74 
 
 		 279 aa  49.7  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166167 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2658  peptidase M48, Ste24p  27.56 
 
 		 301 aa  49.7  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.56784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2532  heat shock protein HtpX  29.65 
 
 		 309 aa  49.7  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0694  peptidase M48, Ste24p  26.73 
 
 		 292 aa  48.9  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.264807  normal  0.558522 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5090  peptidase M48 Ste24p  26.92 
 
 		 287 aa  48.5  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.847465  normal  0.617728 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1586  peptidase M48 Ste24p  30.66 
 
 		 268 aa  48.5  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.808778  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0952  heat shock protein HtpX  25.98 
 
 		 320 aa  48.1  0.0005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0584228  normal  0.434245 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3151  heat shock protein HtpX  30.72 
 
 		 309 aa  48.1  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.184609  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0833  peptidase M48 Ste24p  27.83 
 
 		 283 aa  48.1  0.0005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2189  heat shock protein HtpX  26.58 
 
 		 289 aa  47.8  0.0005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.436394  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0199  peptidase M48, Ste24p  27.76 
 
 		 287 aa  47.8  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.535846  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1255  heat shock protein HtpX  30.27 
 
 		 294 aa  47.4  0.0007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1130  Zn-dependent protease with chaperone function  22.8 
 
 		 305 aa  47.8  0.0007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000361886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1517  heat shock protein HtpX  24.52 
 
 		 348 aa  47.4  0.0008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.700222  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0660  heat shock protein HtpX  24.52 
 
 		 348 aa  47.4  0.0008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0293  heat shock protein HtpX  22.63 
 
 		 292 aa  47  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.985067 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6475  M48 family peptidase  24.24 
 
 		 285 aa  46.6  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1347  heat shock protein HtpX  24.26 
 
 		 300 aa  46.6  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3121  M48 family peptidase  24.24 
 
 		 285 aa  47  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.19734 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2748  heat shock protein HtpX  29.1 
 
 		 288 aa  46.6  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.459812  normal  0.591323 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3393  heat shock protein HtpX  24.71 
 
 		 291 aa  47  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.892823  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2626  peptidase M48 Ste24p  30.68 
 
 		 311 aa  45.8  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0270416  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0145  M48 family peptidase  27 
 
 		 285 aa  45.8  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0349  M48 family peptidase  27 
 
 		 285 aa  45.8  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3984  heat shock protein HtpX  25.93 
 
 		 295 aa  46.2  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.896568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0714  heat shock protein HtpX  29.47 
 
 		 299 aa  46.2  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000323195  normal  0.0549384 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1082  HtpX-2 peptidase  29.74 
 
 		 285 aa  45.8  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2510  M48 family peptidase  24.24 
 
 		 285 aa  46.2  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3179  M48 family peptidase  24.24 
 
 		 285 aa  46.2  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3124  M48 family peptidase  24.24 
 
 		 285 aa  46.2  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.840919  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2802  M48 family peptidase  27 
 
 		 285 aa  45.8  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1282  peptidase M48 Ste24p  28.89 
 
 		 296 aa  46.6  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.601738 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2278  M48 family peptidase  27 
 
 		 285 aa  45.8  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.564612  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0154  M48 family peptidase  27 
 
 		 285 aa  45.8  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.438309  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0163  M48 family peptidase  27 
 
 		 285 aa  45.8  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5388  peptidase M48 Ste24p  27.23 
 
 		 310 aa  46.2  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.612832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2356  M48 family peptidase  27 
 
 		 285 aa  45.8  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10573  heat shock protein HtpX  29.27 
 
 		 286 aa  45.8  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.346873 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1386  heat shock protein HtpX  25.23 
 
 		 285 aa  46.2  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.759716  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3140  M48 family peptidase  24.24 
 
 		 285 aa  46.2  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.911826  normal  0.757645 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3062  M48 family peptidase  24.24 
 
 		 285 aa  46.2  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07590  Heat shock protein  25.71 
 
 		 303 aa  46.2  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0578635 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1349  heat shock protein htpX  25.21 
 
 		 312 aa  46.2  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1110  peptidase M48 Ste24p  39.56 
 
 		 358 aa  46.2  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1189  M48 family peptidase  24.76 
 
 		 316 aa  45.8  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0329085  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3142  heat shock protein HtpX  24.29 
 
 		 300 aa  45.4  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.8089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4413  M48 family peptidase  26.47 
 
 		 296 aa  45.4  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.631317 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0242  heat shock protein HtpX  28.35 
 
 		 319 aa  45.8  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.61908 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1012  peptidase M48, Ste24p  30.68 
 
 		 310 aa  45.4  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00402297 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1196  heat shock protein HtpX  27.78 
 
 		 292 aa  45.4  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.383747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1626  heat shock protein HtpX  26.7 
 
 		 298 aa  45.1  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000267884  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0640  heat shock protein HtpX  23.08 
 
 		 297 aa  45.1  0.004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>