59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2892 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2892  protein of unknown function DUF330  100 
 
 		 210 aa  413  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.529816  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2680  putative lipoprotein  39.9 
 
 		 207 aa  114  8.999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.208689  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0710  hypothetical protein  38.65 
 
 		 238 aa  106  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0677  hypothetical protein  38.65 
 
 		 239 aa  106  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0204159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0226  hypothetical protein  38.65 
 
 		 238 aa  105  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0625  hypothetical protein  37.91 
 
 		 240 aa  104  8e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435543  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1444  hypothetical protein  37.68 
 
 		 208 aa  103  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.753012  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3798  hypothetical protein  38.04 
 
 		 240 aa  102  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.860154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0601  hypothetical protein  37.65 
 
 		 242 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.391552  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0578  hypothetical protein  40 
 
 		 195 aa  100  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.410916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2675  hypothetical protein  39.51 
 
 		 243 aa  99  5e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.681553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3534  hypothetical protein  37.1 
 
 		 253 aa  97.4  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0808039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4001  hypothetical protein  35.29 
 
 		 250 aa  92.4  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1267  hypothetical protein  33.92 
 
 		 264 aa  90.1  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2536  hypothetical protein  34.2 
 
 		 233 aa  89  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3383  hypothetical protein  34.71 
 
 		 256 aa  86.7  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2560  putative lipoprotein  34.71 
 
 		 252 aa  86.7  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1153  putative lipoprotein  34.71 
 
 		 256 aa  86.7  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0291  putative lipoprotein  34.71 
 
 		 252 aa  86.7  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2377  putative lipoprotein  34.71 
 
 		 256 aa  86.7  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0803735  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3341  hypothetical protein  34.71 
 
 		 239 aa  86.3  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.376866  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3375  putative lipoprotein  34.71 
 
 		 252 aa  86.7  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.203626  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6815  hypothetical protein  37.89 
 
 		 215 aa  85.5  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.655082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0710  protein of unknown function DUF330  32.93 
 
 		 248 aa  85.1  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2126  putative lipoprotein  36.27 
 
 		 233 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0863972  normal  0.08915 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0529  hypothetical protein  36.15 
 
 		 222 aa  82.4  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0600  hypothetical protein  38 
 
 		 211 aa  80.5  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0442544  normal  0.826922 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0516  protein of unknown function DUF330  34.74 
 
 		 222 aa  78.6  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3046  hypothetical protein  30.2 
 
 		 207 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.796041  normal  0.0181531 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3180  lipoprotein, putative  27.8 
 
 		 207 aa  75.5  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.131862  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5803  hypothetical protein  37.5 
 
 		 236 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000107973  hitchhiker  0.000892453 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2220  protein of unknown function DUF330  33.12 
 
 		 197 aa  72.8  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000082506 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5279  hypothetical protein  29.76 
 
 		 233 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3241  protein of unknown function DUF330  29.1 
 
 		 199 aa  66.2  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4087  hypothetical protein  28.04 
 
 		 188 aa  66.2  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00226644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2001  protein of unknown function DUF330  33.12 
 
 		 196 aa  65.1  0.0000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.142199  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1569  hypothetical protein  31.65 
 
 		 209 aa  64.3  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.849012  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5507  hypothetical protein  29.95 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2579  hypothetical protein  29.5 
 
 		 191 aa  61.6  0.000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.621383 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2417  hypothetical protein  33.77 
 
 		 204 aa  61.2  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0242841  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0364  putative lipoprotein  31.37 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.14709  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44160  hypothetical protein  28.57 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.266274  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2578  hypothetical protein  27.36 
 
 		 176 aa  58.5  0.00000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.130696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0652  hypothetical protein  26.6 
 
 		 196 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.049729  normal  0.69496 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0404  hypothetical protein  29.73 
 
 		 203 aa  57.8  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3138  hypothetical protein  27.91 
 
 		 176 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2634  hypothetical protein  27.62 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2832  hypothetical protein  28.08 
 
 		 183 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.766034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1231  protein of unknown function DUF330  30.97 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.228197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2448  hypothetical protein  31.33 
 
 		 201 aa  52  0.000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.136482  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6349  hypothetical protein  26.5 
 
 		 225 aa  50.8  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.238642  normal  0.295075 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0041  putative lipoprotein  34.56 
 
 		 206 aa  50.1  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.240026  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3139  hypothetical protein  33.65 
 
 		 200 aa  45.1  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.260987  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0327  protein of unknown function DUF330  31.96 
 
 		 204 aa  45.1  0.0009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5821  hypothetical protein  30 
 
 		 212 aa  44.7  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0514246  normal  0.606405 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0667  hypothetical protein  29.25 
 
 		 211 aa  43.9  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0256  hypothetical protein  29.06 
 
 		 205 aa  42.7  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0041  protein of unknown function DUF330  32.59 
 
 		 197 aa  42.4  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1055  protein of unknown function DUF330  38.89 
 
 		 198 aa  42.4  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>