More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2867 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2867  pentapeptide repeat protein  100 
 
 		 881 aa  1794    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.113451  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0203  pentapeptide repeat protein  45.2 
 
 		 886 aa  728    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.713128  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4191  pentapeptide repeat-containing protein  39.02 
 
 		 844 aa  586  1e-166  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3780  pentapeptide repeat protein  39.37 
 
 		 866 aa  569  1e-160  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2443  Protein of unknown function DUF2169  37.22 
 
 		 846 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26580  Pentapeptide repeat protein  37.53 
 
 		 872 aa  451  1e-125  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0343  pentapeptide repeat-containing protein  36.22 
 
 		 825 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.1938  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1900  pentapeptide repeat-containing protein  36.33 
 
 		 825 aa  449  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0911  pentapeptide repeat-containing protein  36.33 
 
 		 825 aa  449  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2173  pentapeptide repeat-containing protein  36.33 
 
 		 825 aa  449  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1198  pentapeptide repeat-containing protein  36.33 
 
 		 825 aa  449  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0252  pentapeptide repeat-containing protein  36.22 
 
 		 825 aa  446  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1704  pentapeptide repeat-containing protein  36.22 
 
 		 862 aa  446  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0532  pentapeptide repeat protein  33.85 
 
 		 870 aa  356  1e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0024  pentapeptide repeat-containing protein  24.68 
 
 		 949 aa  227  9e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0029  pentapeptide repeat-containing protein  28.27 
 
 		 976 aa  150  9e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.271954 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  33.91 
 
 		 381 aa  134  1.0000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  31.51 
 
 		 576 aa  117  7.999999999999999e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2958  pentapeptide repeat-containing protein  21.46 
 
 		 739 aa  117  1.0000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0161296 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3428  pentapeptide repeat-containing protein  21.46 
 
 		 739 aa  117  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3557  pentapeptide repeat-containing protein  21.46 
 
 		 739 aa  117  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  32.31 
 
 		 449 aa  114  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0862  pentapeptide repeat-containing protein  29.68 
 
 		 872 aa  112  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0163712  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  30.74 
 
 		 333 aa  107  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1681  pentapeptide repeat-containing protein  30.03 
 
 		 880 aa  106  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0723  pentapeptide repeat-containing protein  30.03 
 
 		 880 aa  106  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0612  pentapeptide repeat-containing protein  30.03 
 
 		 880 aa  106  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.65281  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2131  pentapeptide repeat-containing protein  30.03 
 
 		 880 aa  105  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0542  hypothetical protein  29.74 
 
 		 880 aa  105  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  32.47 
 
 		 332 aa  104  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2033  pentapeptide repeat-containing protein  29.45 
 
 		 877 aa  101  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2442  pentapeptide repeat protein  27.96 
 
 		 356 aa  98.2  7e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  33.55 
 
 		 311 aa  97.8  8e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  31.48 
 
 		 521 aa  96.3  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  28.3 
 
 		 340 aa  95.9  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  30.16 
 
 		 309 aa  95.9  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0861  pentapeptide repeat-containing protein  29.94 
 
 		 354 aa  93.6  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0186818  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1750  pentapeptide repeat protein  27.27 
 
 		 440 aa  94  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2034  pentapeptide repeat-containing protein  30.94 
 
 		 354 aa  92.4  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.895251  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  26.41 
 
 		 448 aa  92  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  30.71 
 
 		 336 aa  91.3  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  30.71 
 
 		 336 aa  91.3  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  29.67 
 
 		 517 aa  90.9  9e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  26.19 
 
 		 401 aa  90.5  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2132  pentapeptide repeat-containing protein  31.15 
 
 		 354 aa  90.5  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.855918  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  26.19 
 
 		 401 aa  90.5  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  30.8 
 
 		 264 aa  89.7  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0204  pentapeptide repeat protein  26.89 
 
 		 358 aa  89.4  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.550889  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  29.19 
 
 		 320 aa  89.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  29 
 
 		 862 aa  89.4  3e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  29.8 
 
 		 567 aa  88.6  5e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  30.56 
 
 		 343 aa  87.8  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  30.56 
 
 		 343 aa  87.8  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2767  pentapeptide repeat protein  27.52 
 
 		 408 aa  87.4  9e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1201  pentapeptide repeat-containing protein  30.9 
 
 		 515 aa  87.8  9e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0514272  normal  0.288763 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0533  pentapeptide repeat protein  29.17 
 
 		 355 aa  87.4  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1212  pentapeptide repeat-containing protein  32.06 
 
 		 420 aa  87.4  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.643735 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  28.06 
 
 		 294 aa  86.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3781  pentapeptide repeat protein  27.46 
 
 		 349 aa  86.7  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0025  pentapeptide repeat-containing protein  24.92 
 
 		 348 aa  86.7  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  29.62 
 
 		 493 aa  86.3  0.000000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1703  pentapeptide repeat protein  31.19 
 
 		 295 aa  85.5  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.279305  normal  0.0241547 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  30.07 
 
 		 291 aa  85.5  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1241  pentapeptide repeat protein  28.08 
 
 		 412 aa  85.1  0.000000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0335657 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2980  pentapeptide repeat-containing protein  29.82 
 
 		 285 aa  85.1  0.000000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.670799  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2221  pentapeptide repeat protein  31.05 
 
 		 262 aa  85.1  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0412036 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0225  pentapeptide repeat protein  26.74 
 
 		 447 aa  85.1  0.000000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  27.79 
 
 		 389 aa  84.7  0.000000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2015  pentapeptide repeat-containing protein  28.29 
 
 		 447 aa  84.3  0.000000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.869172  normal  0.493444 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2159  pentapeptide repeat protein  31.05 
 
 		 262 aa  84.7  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3507  pentapeptide repeat-containing protein  28.57 
 
 		 483 aa  84.3  0.000000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  28.71 
 
 		 319 aa  84  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0761  pentapeptide repeat-containing protein  26.54 
 
 		 1191 aa  84.3  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515894  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0870  pentapeptide repeat-containing protein  21.05 
 
 		 635 aa  83.2  0.00000000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  27.59 
 
 		 401 aa  82.8  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3402  pentapeptide repeat protein  27.59 
 
 		 401 aa  82.8  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0030  pentapeptide repeat-containing protein  23.7 
 
 		 359 aa  83.2  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.108145 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  32.95 
 
 		 286 aa  81.6  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0543  hypothetical protein  28.97 
 
 		 354 aa  81.6  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1682  hypothetical protein  28.97 
 
 		 354 aa  81.6  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0613  hypothetical protein  28.97 
 
 		 354 aa  81.6  0.00000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.205681  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0724  hypothetical protein  28.97 
 
 		 354 aa  81.6  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  29.49 
 
 		 493 aa  81.6  0.00000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0246  pentapeptide repeat-containing protein  28.9 
 
 		 412 aa  81.3  0.00000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.81066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  27.36 
 
 		 351 aa  80.5  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  29.37 
 
 		 441 aa  79.3  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3994  RDD domain containing protein  26.12 
 
 		 734 aa  79.3  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412081 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  29.96 
 
 		 489 aa  79.3  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2216  pentapeptide repeat protein  26.69 
 
 		 267 aa  79.3  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000619186  normal  0.061553 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2361  pentapeptide repeat protein  27.51 
 
 		 450 aa  78.6  0.0000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1237  pentapeptide repeat-containing protein  29.91 
 
 		 438 aa  78.6  0.0000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.234159 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0256  pentapeptide repeat protein  25.83 
 
 		 442 aa  78.6  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.306319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  39.46 
 
 		 225 aa  78.2  0.0000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2556  pentapeptide repeat protein  28.42 
 
 		 776 aa  78.2  0.0000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.684592 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  28.95 
 
 		 291 aa  78.2  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  29.05 
 
 		 268 aa  77.8  0.0000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0344  pentapeptide repeat-containing protein  26.9 
 
 		 360 aa  77  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.61884  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6261  pentapeptide repeat-containing protein  31.82 
 
 		 433 aa  76.3  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1785  pentapeptide repeat-containing protein  35.35 
 
 		 250 aa  76.6  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3619  pentapeptide repeat protein  30.26 
 
 		 234 aa  76.3  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0594601  decreased coverage  0.000131742 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>